GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 576 - 600 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Defective ABCA1 causes TGD
  • ABC1
  • ABCA1
  • APOA1
  • CERP
Homo sapiens (human)
Surfactant metabolism
  • ABC3
  • ABCA3
  • ADA2
  • ADGF
  • ADGRF5
  • ADORA2
  • ADORA2A
  • ADORA2B
  • ADRA2A
  • ADRA2C
  • ADRA2L2
  • ADRA2R
  • ADRA2RL2
  • ADRAR
  • BR22
  • CCDC59
  • CECR1
  • CKAP4
  • COLEC4
  • COLEC5
  • COLEC7
  • CPSB
  • CSF2R
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • CSF2RY
  • CTSH
  • DMBT1
  • GATA6
  • GP340
  • GPR116
  • IDGFL
  • IL3RB
  • IL5RB
  • KIAA0758
  • LMCD1
  • NAP1
  • NAPA
  • NAPSA
  • NPT2
  • P2RU1
  • P2RY2
  • PGA3
  • PGA4
  • PGA5
  • PSAP
  • PSPD
  • REAM
  • REC
  • SFTA3
  • SFTP1
  • SFTP2
  • SFTP3
  • SFTP4
  • SFTPA
  • SFTPA1
  • SFTPA1B
  • SFTPA2
  • SFTPA2B
  • SFTPB
  • SFTPC
  • SFTPD
  • SFTPH
  • SLC17A2
  • SLC34A1
  • SLC34A2
  • TAP26
  • TTF1
  • ZDHHC2
  • ZNF372
Homo sapiens (human)
Defective CFTR causes cystic fibrosis
  • ABCC7
  • C10orf69
  • C22orf14
  • C2orf30
  • C7orf76
  • C8orf2
  • CFTR
  • DER1
  • DER2
  • DER3
  • DERL1
  • DERL2
  • DERL3
  • DSS1
  • ERLEC1
  • ERLIN1
  • ERLIN2
  • FLANA
  • G16
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • HSPC
  • IFI5111
  • KE04
  • KEO4
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • LLN2
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NG2
  • NU
  • OS9
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RING10
  • RING12
  • RMA1
  • RNF185
  • RNF5
  • RPS27A
  • SEL1L
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SPFH1
  • SPFH2
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • TSA305
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VCP
  • X
  • XTP3TPB
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
Defective SLC40A1 causes hemochromatosis 4 (HFE4) (duodenum)
  • FPN
  • FPN1
  • HEPH
  • IREG1
  • KIAA0698
  • SLC11A3
  • SLC40A1
Homo sapiens (human)
MET interacts with TNS proteins
  • CTEN
  • FNRB
  • HGF
  • HPTA
  • ITGB1
  • MDF2
  • MET
  • MSK12
  • TEM6
  • TENS1
  • TNS3
  • TNS4
  • TPP
Homo sapiens (human)
PI-3K cascade:FGFR4
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR4
  • FRS2
  • GAB1
  • GRB1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • JTK2
  • KLB
  • KS3
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • TKF
Homo sapiens (human)
Role of second messengers in netrin-1 signaling
  • DCC
  • IGDCC1
  • NTN1
  • NTN1L
  • PITPN
  • PITPNA
  • PLC1
  • PLCG1
  • TRP1
  • TRP3
  • TRP5
  • TRP6
  • TRP7
  • TRPC1
  • TRPC3
  • TRPC4
  • TRPC5
  • TRPC6
  • TRPC7
Homo sapiens (human)
Synthesis of UDP-N-acetyl-glucosamine
  • AGM1
  • AMDHD2
  • GFAT
  • GFPT
  • GFPT1
  • GFPT2
  • GNA1
  • GNPNAT1
  • NAGK
  • PGM3
  • RENBP
  • SPAG2
  • UAP1
Homo sapiens (human)
LXRs regulate gene expression linked to lipogenesis
  • ANGPT5
  • ANGPTL3
  • FADS5
  • FAS
  • FASN
  • LXRA
  • LXRB
  • NER
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR2B1
  • NR2B2
  • NRIP1
  • RXRA
  • RXRB
  • SCD
  • SCD1
  • SCDOS
  • UNR
Homo sapiens (human)
G beta:gamma signalling through CDC42
  • ARHGEF6
  • CDC42
  • COOL2
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • KIAA0006
  • PAK1
  • PIXA
Homo sapiens (human)
Defective SLC22A5 causes systemic primary carnitine deficiency (CDSP)
  • OCTN2
  • SLC22A5
Homo sapiens (human)
TRIF-mediated programmed cell death
  • CASP8
  • CD14
  • ESOP1
  • FADD
  • LY96
  • MCH5
  • MD2
  • MORT1
  • PRVTIRB
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAM
  • TRIF
Homo sapiens (human)
Processive synthesis on the C-strand of the telomere
  • ACD
  • BLM
  • DRIP5
  • KIAA0039
  • LIG1
  • PCNA
  • PIN2
  • PIP1
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POT1
  • PTOP
  • RAP1
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
  • WRN
Homo sapiens (human)
Defective ABCB11 causes PFIC2 and BRIC2
  • ABCB11
  • BSEP
Homo sapiens (human)
Signal transduction by L1
  • CAML1
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERK1
  • ERK2
  • FNRA
  • FNRB
  • G5A
  • GP2B
  • GP3A
  • HER1
  • ITGA2B
  • ITGA5
  • ITGA9
  • ITGAB
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • L1CAM
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MDF2
  • MEK1
  • MEK2
  • MIC5
  • MKK2
  • MSK12
  • MSK8
  • NCAM
  • NCAM1
  • NRP
  • NRP1
  • PAK1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • RAC1
  • TC25
  • VAV2
  • VEGF165R
  • VNRA
  • VTNR
Homo sapiens (human)
Alpha-oxidation of phytanate
  • ACSVL1
  • FACVL1
  • FATP2
  • HACL1
  • HPCL
  • HPCL2
  • PAHX
  • PECR
  • PHYH
  • PHYH2
  • PMP34
  • SDR29C1
  • SLC25A17
  • SLC27A2
  • VLACS
Homo sapiens (human)
Signaling by activated point mutants of FGFR3
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR3
  • HST
  • HSTF1
  • HYPF
  • JTK4
  • KS3
Homo sapiens (human)
Signaling by LTK
  • ACK1
  • ALKAL1
  • ALKAL2
  • ASH
  • FAM150A
  • FAM150B
  • GRB1
  • GRB2
  • IRS1
  • LTK
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • SOS1
  • TNK2
  • TYK1
Homo sapiens (human)
Defective TBXAS1 causes GHDD
  • CYP5
  • CYP5A1
  • TBXAS1
  • TXAS
Homo sapiens (human)
mRNA decay by 5' to 3' exoribonuclease
  • C6orf28
  • CASM
  • DCP1A
  • DCP1B
  • DCP2
  • DDX6
  • EDC3
  • EDC4
  • G7B
  • HEDLS
  • HLR2
  • LSM1
  • LSM16
  • LSM2
  • LSM3
  • LSM4
  • LSM5
  • LSM6
  • LSM7
  • NUDT20
  • PATL1
  • RCK
  • SEP1
  • SMIF
  • XRN1
  • YJDC
  • YJEFN2
Homo sapiens (human)
IRE1alpha activates chaperones
  • ERN1
  • GRP78
  • HSPA5
  • IRE1
Homo sapiens (human)
Signaling by phosphorylated juxtamembrane, extracellular and kinase domain KIT mutants
  • APRF
  • FYN
  • GRB1
  • HRAS
  • HRAS1
  • JAK2
  • JTK8
  • KIT
  • LCK
  • LYN
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • SCFR
  • SOS1
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Regulation of TP53 Degradation
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • ATM
  • BING2
  • C20orf104
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCNG
  • CCNG1
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDK2
  • CDKN1
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • CDS1
  • CHEK2
  • CHK2
  • CYCG1
  • DAP6
  • DAXX
  • FRAP
  • FRAP1
  • FRAP2
  • GBL
  • GLEA2
  • HAUSP
  • HCA58
  • KIAA0044
  • KIAA1999
  • LST8
  • MAPKAP1
  • MDM2
  • MDM4
  • MDMX
  • MIP1
  • MLM
  • MLST8
  • MTOR
  • NZF
  • P34CDC2
  • P53
  • PDK1
  • PDPK1
  • PHF20
  • PKB
  • PKBG
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5C
  • PROTOR1
  • PRR5
  • RAC
  • RAD53
  • RAFT1
  • RAPT1
  • RFFL
  • RICTOR
  • RNF189
  • RNF34
  • RNF34L
  • RPS27A
  • SGK
  • SGK1
  • SIN1
  • TP53
  • TZP
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBP41
  • USP2
  • USP7
Homo sapiens (human)
RUNX3 regulates RUNX1-mediated transcription
  • AML2
  • CBFA3
  • CBFB
  • PEBP2A3
  • RUNX3
Homo sapiens (human)
PLCG1 events in ERBB2 signaling
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERBB2
  • HER1
  • HER2
  • MLN19
  • NEU
  • NGL
  • PLC1
  • PLCG1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024