GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 626 - 650 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
HS-GAG degradation
  • AGRIN
  • AGRN
  • ELNR1
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • GUSB
  • HEP
  • HPA
  • HPA1
  • HPA2
  • HPR1
  • HPSE
  • HPSE1
  • HPSE2
  • HSE1
  • HSPG1
  • HSPG2
  • HSS
  • IDS
  • IDUA
  • KIAA0468
  • NAGLU
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SGSH
  • SIDS
  • UFHSD1
Homo sapiens (human)
Attachment and Entry
  • 3a
  • 7a
  • ACE2
  • AGRIN
  • AGRN
  • CTSL
  • CTSL1
  • E
  • FUR
  • FURIN
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HAVCR1
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • HSPG1
  • HSPG2
  • KIAA0468
  • KIM1
  • M
  • N
  • NRP
  • NRP1
  • OCI5
  • PACE
  • PCSK3
  • PRSS10
  • S
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • TIM1
  • TIMD1
  • TMPRSS2
  • VCP
  • VEGF165R
Homo sapiens (human)
Integrin cell surface interactions
  • AGRIN
  • AGRN
  • BNSP
  • BSG
  • C21orf43
  • CD11A
  • CD11B
  • CD11C
  • CD18
  • CD44
  • CD47
  • CD49B
  • CD49D
  • CDH1
  • CDHE
  • COL13A1
  • COL16A1
  • COL18A1
  • COL23A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COMP
  • CR3A
  • F11R
  • FBN
  • FBN1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FLK1
  • FN
  • FN1
  • FNRA
  • FNRB
  • GP2B
  • GP3A
  • HSPG2
  • HXB
  • IBSP
  • ICAM1
  • ICAM2
  • ICAM3
  • ICAM4
  • ICAM5
  • ITGA1
  • ITGA10
  • ITGA11
  • ITGA2
  • ITGA2B
  • ITGA3
  • ITGA4
  • ITGA5
  • ITGA6
  • ITGA7
  • ITGA8
  • ITGA9
  • ITGAB
  • ITGAD
  • ITGAE
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAV
  • ITGAX
  • ITGB1
  • ITGB2
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB7
  • ITGB8
  • JAM1
  • JAM2
  • JAM3
  • JCAM
  • KDR
  • LDC
  • LHR
  • LUM
  • LW
  • MDF2
  • MDU2
  • MDU3
  • MER6
  • MFI7
  • MIC4
  • MSK12
  • MSK18
  • MSK8
  • OPN
  • PECAM1
  • SLRR2D
  • SPP1
  • THBS1
  • TLCN
  • TLN
  • TNC
  • TSP
  • TSP1
  • UVO
  • VCAM1
  • VEGFR2
  • VEJAM
  • VNRA
  • VTN
  • VTNR
Homo sapiens (human)
A tetrasaccharide linker sequence is required for GAG synthesis
  • AGRIN
  • AGRN
  • B3GALT6
  • B3GAT1
  • B3GAT2
  • B3GAT3
  • B4GALT7
  • BCAN
  • BEHAB
  • BGN
  • CALEB
  • CSPG2
  • CSPG3
  • CSPG4
  • CSPG5
  • CSPG7
  • DCN
  • GLCATP
  • GLCATS
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HSPG1
  • HSPG2
  • KIAA0468
  • KIAA1963
  • MCSP
  • NCAN
  • NEUR
  • NGC
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SLRR1A
  • SLRR1B
  • VCAN
  • XGALT1
  • XT1
  • XT2
  • XYLT1
  • XYLT2
Homo sapiens (human)
Defective B3GALT6 causes EDSP2 and SEMDJL1
  • AGRIN
  • AGRN
  • B3GALT6
  • BCAN
  • BEHAB
  • BGN
  • CALEB
  • CSPG2
  • CSPG3
  • CSPG4
  • CSPG5
  • CSPG7
  • DCN
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HSPG1
  • HSPG2
  • KIAA0468
  • MCSP
  • NCAN
  • NEUR
  • NGC
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SLRR1A
  • SLRR1B
  • VCAN
Homo sapiens (human)
Defective B4GALT7 causes EDS, progeroid type
  • AGRIN
  • AGRN
  • B4GALT7
  • BCAN
  • BEHAB
  • BGN
  • CALEB
  • CSPG2
  • CSPG3
  • CSPG4
  • CSPG5
  • CSPG7
  • DCN
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HSPG1
  • HSPG2
  • KIAA0468
  • MCSP
  • NCAN
  • NEUR
  • NGC
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SLRR1A
  • SLRR1B
  • VCAN
  • XGALT1
Homo sapiens (human)
HS-GAG biosynthesis
  • 3OST
  • 3OST1
  • 3OST2
  • 3OST3A1
  • 3OST3B1
  • 3OST4
  • 3OST5
  • AGRIN
  • AGRN
  • EXT1
  • EXT2
  • GLCE
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HFRC
  • HS2ST
  • HS2ST1
  • HS3OST5
  • HS3ST1
  • HS3ST2
  • HS3ST3A
  • HS3ST3A1
  • HS3ST3B
  • HS3ST3B1
  • HS3ST4
  • HS3ST5
  • HS3ST6
  • HS6ST
  • HS6ST1
  • HS6ST2
  • HS6ST3
  • HSPG1
  • HSPG2
  • HSST
  • HSST1
  • HSST2
  • HSST3
  • HSST4
  • KIAA0448
  • KIAA0468
  • KIAA0836
  • NDST1
  • NDST2
  • NDST3
  • NDST4
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SLC35D2
  • UGTREL8
Homo sapiens (human)
Defective B3GAT3 causes JDSSDHD
  • AGRIN
  • AGRN
  • B3GAT3
  • BCAN
  • BEHAB
  • BGN
  • CALEB
  • CSPG2
  • CSPG3
  • CSPG4
  • CSPG5
  • CSPG7
  • DCN
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HSPG1
  • HSPG2
  • KIAA0468
  • MCSP
  • NCAN
  • NEUR
  • NGC
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SLRR1A
  • SLRR1B
  • VCAN
Homo sapiens (human)
Respiratory syncytial virus (RSV) attachment and entry
  • AGRIN
  • AGRN
  • CD14
  • CMKBRL1
  • CX3CR1
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ESOP1
  • F
  • FUR
  • FURIN
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • GPR13
  • HER1
  • HSPG1
  • HSPG2
  • IGF1R
  • KIAA0468
  • L
  • LY96
  • M
  • M2-1
  • MD2
  • N
  • NCL
  • OCI5
  • P
  • PACE
  • PCSK3
  • RAB5
  • RAB5A
  • RAB5B
  • RAB5C
  • RABL
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • TLR4
Homo sapiens (human)
Non-integrin membrane-ECM interactions
  • AGRIN
  • AGRN
  • CAK
  • DAG1
  • DDR1
  • DDR2
  • DMD
  • EDDR1
  • FGF2
  • FGFB
  • HSPG2
  • KIAA0533
  • KIAA0578
  • KIAA1907
  • LAMA
  • LAMA1
  • LAMA2
  • LAMA3
  • LAMA4
  • LAMA5
  • LAMB1
  • LAMB2
  • LAMB2T
  • LAMB3
  • LAMC1
  • LAMC2
  • LAMC3
  • LAMM
  • LAMNA
  • LAMNB1
  • LAMNB2
  • LAMS
  • NEP
  • NRXN1
  • NTN4
  • NTRK4
  • NTRKR3
  • PALB
  • PDGF1
  • PDGF2
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PTK3A
  • RTK6
  • SIS
  • TKT
  • TRKE
  • TTR
  • TYRO10
Homo sapiens (human)
Defective EXT1 causes exostoses 1, TRPS2 and CHDS
  • AGRIN
  • AGRN
  • EXT1
  • EXT2
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HSPG1
  • HSPG2
  • KIAA0468
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
Homo sapiens (human)
Defective EXT2 causes exostoses 2
  • AGRIN
  • AGRN
  • EXT1
  • EXT2
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HSPG1
  • HSPG2
  • KIAA0468
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-2 activates/modulates innate and adaptive immune responses
  • 3a
  • 6
  • 7a
  • 8
  • 9b
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ATG14
  • ATG14L
  • B2M
  • BECN1
  • BLU
  • C1orf7
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CAP-1
  • CARD15
  • CARD4
  • CARDIAK
  • CBP
  • CG1
  • CHUK
  • CIAS1
  • CNBP
  • COLEC1
  • COLEC7
  • CRAF1
  • CRARF
  • CRARF1
  • CREBBP
  • CROC1
  • CTLA8
  • D3S1231E
  • DAK
  • DDX58
  • E
  • EFP
  • ERIS
  • FIP3
  • G1P2
  • G3BP
  • G3BP1
  • G3BP2
  • GT197
  • HCP
  • HLA-5.4
  • HLA-6.0
  • HLA-6.2
  • HLA-A
  • HLA-B
  • HLA-C
  • HLA-E
  • HLA-F
  • HLA-G
  • HLA-H
  • HLAA
  • HLAB
  • HLAC
  • HLAE
  • HLAF
  • HLAG
  • HLAH
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • IFB
  • IFIH1
  • IFNA1
  • IFNA10
  • IFNA13
  • IFNA14
  • IFNA16
  • IFNA17
  • IFNA2
  • IFNA21
  • IFNA2A
  • IFNA2B
  • IFNA2C
  • IFNA4
  • IFNA5
  • IFNA6
  • IFNA7
  • IFNA8
  • IFNAR
  • IFNAR1
  • IFNB
  • IFNB1
  • IKBKB
  • IKBKE
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IKKE
  • IKKI
  • IL17
  • IL17A
  • IL17F
  • IL17R
  • IL17RA
  • IL17RC
  • IPS1
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRF3
  • IRF7
  • ISG15
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • KIAA0012
  • KIAA0023
  • KIAA0079
  • KIAA0095
  • KIAA0151
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0660
  • KIAA0719
  • KIAA0731
  • KIAA0733
  • KIAA0755
  • KIAA0791
  • KIAA0831
  • KIAA0906
  • KIAA1271
  • KPNA2
  • LARP
  • LARP1
  • M
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MASP1
  • MAVS
  • MBL
  • MBL2
  • MDA5
  • MITA
  • MP44
  • MRNP41
  • N
  • NAK
  • NALP12
  • NALP3
  • NDC1
  • NEMO
  • NLRP12
  • NLRP3
  • NOD1
  • NOD2
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • PRSS5
  • PSPD
  • PTP1C
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPN6
  • PYPAF1
  • PYPAF7
  • RAE1
  • RANBP2
  • RCH1
  • RH116
  • RICK
  • RIGI
  • RIP2
  • RIPK2
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF163
  • RNF85
  • RNF87
  • RNO
  • S
  • SAR1B
  • SARA2
  • SARB
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SFTP4
  • SFTPD
  • SHPTP2
  • SIKE
  • SIKE1
  • SRP1
  • STAT1
  • STAT2
  • STING
  • STING1
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TBK1
  • TCF16
  • TIL4
  • TKFC
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR7
  • TLR8
  • TMEM173
  • TMEM48
  • TOM70
  • TOMM70
  • TOMM70A
  • TPR
  • TRAF3
  • TRAF6
  • TRAFAMN
  • TRIM25
  • TRIM4
  • TYK2
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UCRP
  • UEV1
  • VISA
  • VPS15
  • VPS34
  • ZNF147
  • ZNF9
  • rep
Homo sapiens (human)
SUMOylation of DNA replication proteins
  • AAAS
  • ADRACALA
  • AIK
  • AIK2
  • AIM1
  • AIRK1
  • AIRK2
  • API4
  • ARK1
  • ARK2
  • AURA
  • AURKA
  • AURKB
  • AYK1
  • BIRC5
  • BTAK
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CDCA8
  • CG1
  • D3S1231E
  • IAK1
  • IAP4
  • INCENP
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KIAA1835
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNA
  • PCNT1
  • PESCRG3
  • PIAS3
  • PIAS4
  • PIASG
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • RANGAP1
  • SD
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SMT3A
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • STK1
  • STK12
  • STK15
  • STK5
  • STK6
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • TMEM48
  • TOP1
  • TOP2
  • TOP2A
  • TOP2B
  • TPR
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
Homo sapiens (human)
Vpr-mediated nuclear import of PICs
  • AAAS
  • ADRACALA
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • D3S1231E
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KPNA1
  • LEDGF
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • PSIP1
  • PSIP2
  • RAE1
  • RANBP2
  • RCH2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TMEM48
  • TPR
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
SUMOylation of DNA damage response and repair proteins
  • AAAS
  • ADPRT
  • ADRACALA
  • BAM
  • BAP1
  • BLM
  • BMH
  • BMI1
  • BRCA1
  • C10orf86
  • C7orf14
  • C8orf36
  • CAIN
  • CALT
  • CAN
  • CBX2
  • CBX4
  • CBX8
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • CEN2
  • CETN2
  • CG1
  • CSPG6
  • D3S1231E
  • DDXBP1
  • DING
  • DXS423E
  • EDR1
  • EDR2
  • EDR3
  • EID3
  • HCA4
  • HDAC7
  • HDAC7A
  • HERC2
  • HIPI3
  • HR21
  • KIAA0023
  • KIAA0078
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0170
  • KIAA0178
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0594
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • MAGEG1
  • MDC1
  • MEL18
  • MLM
  • MMS21
  • MP44
  • MRNP41
  • MYL
  • NDC1
  • NDNL2
  • NFBD1
  • NPAP60L
  • NSMCE1
  • NSMCE2
  • NSMCE3
  • NSMCE4A
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • NXP1
  • PARP1
  • PC3
  • PCGF2
  • PCGF4
  • PCNT1
  • PH1
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Homo sapiens (human)
SUMOylation of chromatin organization proteins
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Homo sapiens (human)
SUMOylation of RNA binding proteins
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Homo sapiens (human)
Transport of Mature mRNA Derived from an Intronless Transcript
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Homo sapiens (human)
Nuclear Pore Complex (NPC) Disassembly
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  • TPR
Homo sapiens (human)
Transcriptional regulation by small RNAs
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  • ADRACALA
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  • H4FA
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  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
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  • H4FH
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  • HIST1H3I
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  • HIST1H4B
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  • HIST1H4E
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  • HIST1H4I
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Homo sapiens (human)
Viral Messenger RNA Synthesis
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  • POM121A
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  • TPR
Homo sapiens (human)
SUMOylation of ubiquitinylation proteins
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  • TRIM27
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  • UBCE9
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Homo sapiens (human)
SUMOylation of SUMOylation proteins
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  • ADRACALA
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • D3S1231E
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  • SMT3C
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  • TOPORS
  • TP53BPL
  • TPR
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
Homo sapiens (human)
Transport of the SLBP Dependant Mature mRNA
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ALY
  • ALYREF
  • BEF
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CBP20
  • CBP80
  • CG1
  • D3S1231E
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • HBP
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • MP44
  • MRNP41
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • NXF1
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SLBP
  • TAP
  • THOC4
  • TMEM48
  • TPR
Homo sapiens (human)

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Last updated: August 19, 2024