GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 651 - 675 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▲ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
SARS-CoV-2 modulates host translation machinery
  • CCG2
  • COD
  • D6S218E
  • DDX20
  • DP103
  • FAM51A1
  • FAU
  • FTE1
  • GEMIN2
  • GEMIN3
  • GEMIN4
  • GEMIN5
  • GEMIN6
  • GEMIN7
  • GEMIN8
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • PBSCF
  • PBSCG
  • RIG
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • SCAR
  • SIP1
  • SMN
  • SMN1
  • SMN2
  • SMNC
  • SMNT
  • SNRPB
  • SNRPB1
  • SNRPD1
  • SNRPD2
  • SNRPD3
  • SNRPE
  • SNRPF
  • SNRPG
  • UBA80
  • UBCEP1
  • rep
Homo sapiens (human)
Negative regulation of TCF-dependent signaling by WNT ligand antagonists
  • DKK1
  • DKK2
  • DKK4
  • FRP
  • FRP1
  • FRP2
  • KREMEN
  • KREMEN1
  • KREMEN2
  • KRM1
  • KRM2
  • LR3
  • LRP5
  • LRP6
  • LRP7
  • SARP1
  • SARP2
  • SFRP1
  • SFRP2
  • SOST
  • WIF1
  • WNT14
  • WNT3A
  • WNT4
  • WNT5A
  • WNT9A
Homo sapiens (human)
RHO GTPases Activate Rhotekin and Rhophilins
  • ARH12
  • ARH6
  • ARH9
  • ARHA
  • ARHB
  • ARHC
  • KIAA1929
  • LIN7B
  • MALS2
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • RHPN1
  • RHPN2
  • ROPN1
  • ROPN1A
  • RTKN
  • RTKN1
  • TAX1BP3
  • TIP1
  • VELI2
Homo sapiens (human)
FGFR1b ligand binding and activation
  • C19orf3
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF22
  • FGF3
  • FGFA
  • FGFB
  • GIPC
  • GIPC1
  • INT2
  • RGS19IP1
  • TGFBR3
Homo sapiens (human)
FGFR1c ligand binding and activation
  • ADMLX
  • ANOS1
  • C19orf3
  • FGF1
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • GIPC
  • GIPC1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • KAL
  • KAL1
  • KALIG1
  • KS3
  • RGS19IP1
  • TGFBR3
Homo sapiens (human)
Assembly and cell surface presentation of NMDA receptors
  • ACTN2
  • APBA1
  • BCL8B
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CASK
  • DLG1
  • DLG2
  • DLG3
  • DLG4
  • GRIN1
  • GRIN2A
  • GRIN2B
  • GRIN2C
  • GRIN2D
  • GRIN3A
  • GRIN3B
  • GluN2D
  • KIAA0968
  • KIAA1232
  • KIAA1365
  • KIAA1405
  • KIAA1544
  • KIAA1973
  • KIF17
  • KIF3X
  • LAP1
  • LIN2
  • LIN7A
  • LIN7B
  • LIN7C
  • LRRC7
  • LYST2
  • MALS1
  • MALS2
  • MALS3
  • MINT1
  • NBEA
  • NEFL
  • NF68
  • NFL
  • NMDAR1
  • NMDAR2A
  • NMDAR2B
  • NMDAR2C
  • NMDAR2D
  • PSD95
  • VELI1
  • VELI2
  • VELI3
  • X11
Homo sapiens (human)
NOD1/2 Signaling Pathway
  • AAMP
  • API1
  • API2
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BLU
  • CARD15
  • CARD4
  • CARD9
  • CARDIAK
  • CASP1
  • CASP2
  • CASP4
  • CASP8
  • CASP9
  • CHUK
  • CROC1
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • CYLD
  • CYLD1
  • ERK6
  • FIP3
  • ICH1
  • ICH2
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • ITCH
  • KIAA0733
  • KIAA0849
  • MAP2K6
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MAPK11
  • MAPK12
  • MAPK13
  • MAPK14
  • MCH5
  • MCH6
  • MEK6
  • MIHB
  • MIHC
  • MKK6
  • MXI2
  • N
  • NEDD2
  • NEMO
  • NOD1
  • NOD2
  • OTUD7C
  • PRKM11
  • PRKM13
  • PRKMK6
  • RICK
  • RIP2
  • RIPK2
  • RNF48
  • RNF49
  • RNF85
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SAPK3
  • SAPK4
  • SKK3
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TCF16
  • TNFAIP3
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
TICAM1, RIP1-mediated IKK complex recruitment
  • API1
  • API2
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BLU
  • CHUK
  • CROC1
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • MIHB
  • MIHC
  • NEMO
  • PRVTIRB
  • PUBC1
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • RNF48
  • RNF49
  • RNF85
  • RPS27A
  • SFT
  • TCF16
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRAF6
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBC5A
  • UBC5B
  • UBC5C
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5B
  • UBCH5C
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
RIP-mediated NFkB activation via ZBP1
  • C20orf183
  • CHUK
  • DDX9
  • DHX9
  • DLM1
  • FIP3
  • IKBA
  • IKBB
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • KBRAS1
  • KBRAS2
  • LKP
  • LYT10
  • MAD3
  • MYD88
  • NDH2
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NFKBIB
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • PRVTIRB
  • RELA
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • TCF16
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRIF
  • TRIP9
  • ZBP1
Homo sapiens (human)
TAK1-dependent IKK and NF-kappa-B activation
  • A4
  • AD1
  • AGER
  • ALPK1
  • APP
  • BLU
  • CARD15
  • CARD4
  • CARDIAK
  • CHUK
  • CROC1
  • FIP3
  • HMG1
  • HMGB1
  • IKBA
  • IKBB
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • ISG43
  • KBRAS1
  • KBRAS2
  • KIAA0733
  • KIAA1527
  • LAK
  • LYT10
  • MAD3
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • N
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NFKBIB
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • NOD1
  • NOD2
  • RAGE
  • RELA
  • RICK
  • RIP2
  • RIPK2
  • RNF85
  • RPS27A
  • S100A12
  • S100B
  • SAA1
  • T2BP
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TCF16
  • TIFA
  • TRAF6
  • TRIP9
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
  • USP18
Homo sapiens (human)
TNFR1-induced NF-kappa-B signaling pathway
  • API1
  • API2
  • API3
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BIRC4
  • C20orf18
  • CHUK
  • CYLD
  • CYLD1
  • DUBA7
  • EBI6
  • FIP2
  • FIP3
  • GLC1E
  • GNB2L1
  • HIP7
  • HYPL
  • IAP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • KIAA0733
  • KIAA0757
  • KIAA0849
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MIHB
  • MIHC
  • NEMO
  • NRP
  • OPTN
  • OTDC1
  • OTUD1
  • OTUD7B
  • OTUD7C
  • PD1
  • RACK1
  • RBCK1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • RNF31
  • RNF48
  • RNF49
  • RNF54
  • SHARPIN
  • SIPL1
  • SPATA2
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TCF16
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAIP3
  • TNFAR
  • TNFR1
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF1
  • TRAF2
  • TRAP3
  • UBCE7IP3
  • UBP41
  • UNP
  • UNPH
  • USP2
  • USP21
  • USP23
  • USP4
  • XAP3
  • XAP4
  • XIAP
  • ZA20D1
  • ZIBRA
Homo sapiens (human)
Regulation of NF-kappa B signaling
  • CASP8
  • CHUK
  • FIP3
  • IKBIP
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKIP
  • IKKA
  • IKKB
  • ISG43
  • KIAA0014
  • KIAA0615
  • LRRC14
  • MCH5
  • N4BP1
  • NEMO
  • NLRC5
  • NLRX1
  • NOD27
  • NOD4
  • NOD5
  • NOD9
  • P53
  • RNF85
  • RPS27A
  • TCF16
  • TGT
  • TP53
  • TRAF2
  • TRAF6
  • TRAP3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP14
  • USP18
Homo sapiens (human)
Regulation of TNFR1 signaling
  • API1
  • API2
  • API3
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BIRC4
  • C20orf18
  • CASP8
  • CHIP
  • CHUK
  • CLIP3
  • CLIPR59
  • CYLD
  • CYLD1
  • DUBA7
  • EBI6
  • FADD
  • FAM105B
  • FIP2
  • FIP3
  • GLC1E
  • GNB2L1
  • HIP7
  • HYPL
  • IAP3
  • IKBKB
  • IKBKE
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IKKE
  • IKKI
  • IMP3
  • IMP4
  • KIAA0151
  • KIAA0722
  • KIAA0757
  • KIAA0849
  • KIAA1532
  • MAPKAPK2
  • MCH5
  • MIB2
  • MIHB
  • MIHC
  • MORT1
  • NAK
  • NEMO
  • NRP
  • OPG199
  • OPTN
  • OTDC1
  • OTUD1
  • OTUD7B
  • OTUD7C
  • OTULIN
  • PD1
  • PSL1
  • PSL2
  • PUBC1
  • RACK1
  • RBCK1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • RNF31
  • RNF48
  • RNF49
  • RNF54
  • RPS27A
  • SFT
  • SHARPIN
  • SIPL1
  • SKD
  • SPATA2
  • SPI-2
  • SPPL2A
  • SPPL2B
  • STUB1
  • T6BP
  • TAX1BP1
  • TBK1
  • TCF16
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAIP3
  • TNFAR
  • TNFR1
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF1
  • TRAF2
  • TRAP3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBC5A
  • UBC5B
  • UBC5C
  • UBCE7
  • UBCE7IP3
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5B
  • UBCH5C
  • UBCH7
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • UBE2L3
  • UBP41
  • UL36
  • ULK1
  • UNP
  • UNPH
  • USP2
  • USP21
  • USP23
  • USP4
  • XAP3
  • XAP4
  • XIAP
  • ZA20D1
  • ZIBRA
  • ZZANK1
Homo sapiens (human)
TRAF6 mediated NF-kB activation
  • A4
  • AD1
  • AGER
  • APP
  • CHUK
  • DDX58
  • EFP
  • FIP3
  • HMG1
  • HMGB1
  • IFIH1
  • IKBA
  • IKBB
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IPS1
  • KBRAS1
  • KBRAS2
  • KIAA1271
  • LYT10
  • MAD3
  • MAP3K1
  • MAPKKK1
  • MAVS
  • MDA5
  • MEKK
  • MEKK1
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NFKBIB
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • RAGE
  • RELA
  • RH116
  • RIGI
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF85
  • RNF87
  • S100A12
  • S100B
  • SAA1
  • TCF16
  • TRAF2
  • TRAF6
  • TRAP3
  • TRIM25
  • TRIM4
  • TRIP9
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
NF-kB activation through FADD/RIP-1 pathway mediated by caspase-8 and -10
  • CASP10
  • CASP8
  • CHUK
  • DDX58
  • EFP
  • FADD
  • FIP3
  • IFIH1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IPS1
  • KIAA1271
  • MAVS
  • MCH4
  • MCH5
  • MDA5
  • MORT1
  • NEMO
  • RH116
  • RIGI
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF87
  • TCF16
  • TRIM25
  • TRIM4
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
MAP3K8 (TPL2)-dependent MAPK1/3 activation
  • ABIN2
  • BTRC
  • BTRCP
  • BTRCP2
  • CHUK
  • COT
  • CUL1
  • EMC19
  • ESTF
  • FBW1A
  • FBW1B
  • FBXW11
  • FBXW1A
  • FBXW1B
  • FIP3
  • FLIP1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • JNKK1
  • KIAA0696
  • MAP2K1
  • MAP2K4
  • MAP3K8
  • MEK1
  • MEK4
  • MKK4
  • NEMO
  • NFKB1
  • OCP2
  • PRKMK1
  • PRKMK4
  • RPS27A
  • SEK1
  • SERK1
  • SKK1
  • SKP1
  • SKP1A
  • TCEB1L
  • TCF16
  • TNIP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
IkBA variant leads to EDA-ID
  • CHUK
  • FIP3
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • LYT10
  • MAD3
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • RELA
  • TCF16
Homo sapiens (human)
IRAK1 recruits IKK complex
  • BLU
  • CHUK
  • CROC1
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IRAK
  • IRAK1
  • NEMO
  • PELI1
  • PELI2
  • PELI3
  • PRISM
  • RNF85
  • TCF16
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
IRAK1 recruits IKK complex upon TLR7/8 or 9 stimulation
  • BLU
  • CHUK
  • CROC1
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IRAK
  • IRAK1
  • NEMO
  • PELI1
  • PELI2
  • PELI3
  • PRISM
  • RNF85
  • TCF16
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
IKBKB deficiency causes SCID
  • CHUK
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • NEMO
  • TCF16
Homo sapiens (human)
IKBKG deficiency causes anhidrotic ectodermal dysplasia with immunodeficiency (EDA-ID) (via TLR)
  • CHUK
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • NEMO
  • TCF16
Homo sapiens (human)
p75NTR recruits signalling complexes
  • CARDIAK
  • DXS1179E
  • IKBKB
  • IKKB
  • IRAK
  • IRAK1
  • MYD88
  • NGF
  • NGFB
  • NGFR
  • ORCA
  • OSIL
  • PRKCI
  • RICK
  • RIP2
  • RIPK2
  • RNF85
  • RPS27A
  • SQSTM1
  • TNFRSF16
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
NF-kB is activated and signals survival
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKKB
  • IRAK
  • IRAK1
  • MAD3
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NGF
  • NGFB
  • NGFR
  • ORCA
  • OSIL
  • RELA
  • RNF85
  • RPS27A
  • SQSTM1
  • TNFRSF16
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Mitochondrial protein import
  • AAC1
  • AAC3
  • ACO2
  • AGC1
  • ALR
  • ANT1
  • ANT3
  • ARALAR1
  • ATP5A
  • ATP5A1
  • ATP5AL2
  • ATP5B
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5G1
  • ATP5MC1
  • ATPM
  • ATPMB
  • ATPSB
  • BCS1
  • BCS1L
  • C16orf61
  • C18orf55
  • C19orf1
  • C1orf31
  • C22orf16
  • C2orf9
  • C6.1B
  • C7orf17
  • C9orf105
  • CHCHD10
  • CHCHD2
  • CHCHD3
  • CHCHD4
  • CHCHD5
  • CHCHD7
  • CHCHD8
  • CL640
  • CMC2
  • CMC4
  • COA4
  • COA6
  • COQ2
  • COX17
  • COX19
  • CS
  • CYC1
  • DDP
  • DDP1
  • DDP2
  • DDPL
  • DNAJC19
  • DNAJC20
  • E2IG2
  • EFE2
  • FRDA
  • FXC1
  • FXN
  • G4.5
  • GFER
  • GREPEL1
  • GRP75
  • GRPEL1
  • GRPEL2
  • HERV1
  • HPO
  • HSC20
  • HSCB
  • HSP60
  • HSPA9
  • HSPA9B
  • HSPD1
  • IDH3G
  • INPP5E
  • KIAA0016
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Last updated: August 19, 2024