GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 801 - 825 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Regulation of RUNX1 Expression and Activity
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • AML1
  • BCL1
  • CAGH26
  • CBFA2
  • CBFB
  • CCND1
  • CCND2
  • CCND3
  • CDK6
  • CDKN6
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • MOV10
  • MYL
  • PML
  • PP8675
  • PRAD1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RNF71
  • RUNX1
  • SHPTP2
  • SRC
  • SRC1
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
  • TRIM19
Homo sapiens (human)
Ion influx/efflux at host-pathogen interface
  • AIPP1
  • ATOX1
  • ATP7A
  • HAH1
  • LSH
  • MC1
  • MNK
  • NRAMP
  • NRAMP1
  • PDZD11
  • PDZK11
  • PISP
  • SLC11A1
Homo sapiens (human)
NOTCH2 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus
  • AD3
  • AD4
  • ADAM10
  • APH1A
  • APH1B
  • CNTN1
  • DIP1
  • DLL1
  • DLL4
  • JAG1
  • JAG2
  • JAGL1
  • KIAA0253
  • KIAA1323
  • KUZ
  • MADM
  • MDK
  • MIB1
  • MIB2
  • MK1
  • NCSTN
  • NEGF2
  • NEURL
  • NEURL1
  • NEURL1A
  • NEURL1B
  • NEURL3
  • NOTCH2
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • RNF67
  • RPS27A
  • SKD
  • STM2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • ZZANK1
  • ZZANK2
Homo sapiens (human)
Condensation of Prophase Chromosomes
  • CAPC
  • CAPD3
  • CAPE
  • CAPH2
  • CCNB
  • CCNB1
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3-4
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H3FT
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST3H3
  • HIST4H4
  • KIAA0056
  • KMT5A
  • LUZP5
  • MCPH1
  • NCAPD3
  • NCAPG2
  • NCAPH2
  • P34CDC2
  • PLK
  • PLK1
  • PRSET7
  • RB1
  • SET
  • SET07
  • SET8
  • SETD8
  • SMC2
  • SMC2L1
  • SMC4
  • SMC4L1
  • TSH2B
Homo sapiens (human)
Serotonin Neurotransmitter Release Cycle
  • BZRAP1
  • CPLX1
  • KIAA0340
  • KIAA0612
  • KIAA0654
  • KIAA0897
  • LIP1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RAB3IP2
  • RBP1
  • RIM1
  • RIMBP1
  • RIMS1
  • SLC18A2
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • SVMT
  • SVP65
  • SYB2
  • SYN1
  • SYN2
  • SYN3
  • SYT
  • SYT1
  • TSPOAP1
  • UNC13
  • UNC13B
  • VAMP2
  • VMAT2
Homo sapiens (human)
Glutamate Neurotransmitter Release Cycle
  • ARL6IP5
  • ATA2
  • BNPI
  • BZRAP1
  • CPLX1
  • DERP11
  • EAAC1
  • EAAT1
  • EAAT2
  • EAAT3
  • EAAT4
  • EAAT5
  • GA
  • GLAST
  • GLAST1
  • GLS
  • GLS1
  • GLS2
  • GLT1
  • HEAAC1
  • JWA
  • KIAA0340
  • KIAA0612
  • KIAA0654
  • KIAA0838
  • KIAA0897
  • KIAA1382
  • LIP1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • PRA2
  • PRAF3
  • RAB3A
  • RAB3IP2
  • RBP1
  • RIM1
  • RIMBP1
  • RIMS1
  • SAT2
  • SLC17A7
  • SLC1A1
  • SLC1A2
  • SLC1A3
  • SLC1A6
  • SLC1A7
  • SLC38A2
  • SNAP
  • SNAP25
  • SNAT2
  • STX1
  • STX1A
  • SVP65
  • SYB2
  • SYT
  • SYT1
  • TSPOAP1
  • UNC13
  • UNC13B
  • VAMP2
  • VGLUT1
Homo sapiens (human)
GABA synthesis, release, reuptake and degradation
  • CLN4
  • CPLX1
  • DNAJC5
  • GAD
  • GAD1
  • GAD2
  • GAD65
  • GAD67
  • HSC70
  • HSP73
  • HSPA10
  • HSPA8
  • KIAA0340
  • RAB3A
  • RAB3IP2
  • RIM1
  • RIMS1
  • SLC32A1
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • SVP65
  • SYB2
  • SYT
  • SYT1
  • VAMP2
  • VGAT
  • VIAAT
Homo sapiens (human)
RUNX1 and FOXP3 control the development of regulatory T lymphocytes (Tregs)
  • AITR
  • AML1
  • C3BR
  • CBFA2
  • CBFB
  • CD152
  • CR1
  • CTLA4
  • FOXP3
  • GITR
  • IFNG
  • IL2
  • IL2RA
  • IPEX
  • NFAT1
  • NFATC2
  • NFATP
  • RUNX1
  • TNFRSF18
Homo sapiens (human)
Defective Intrinsic Pathway for Apoptosis Due to p14ARF Loss of Function
  • C1QBP
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • GC1QBP
  • HABP1
  • MLM
  • SF2P32
Homo sapiens (human)
Apoptotic factor-mediated response
  • C1QBP
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • GC1QBP
  • HABP1
  • MLM
  • SF2P32
Homo sapiens (human)
Alternative complement activation
  • BF
  • BFD
  • C3
  • CFB
  • CFD
  • CPAMD1
  • DF
  • GZMM
  • MET1
  • PFD
Homo sapiens (human)
Activation of C3 and C5
  • BF
  • BFD
  • C2
  • C3
  • C4A
  • C4B
  • C4B_2
  • C5
  • CFB
  • CO4
  • CPAMD1
  • CPAMD2
  • CPAMD3
  • CPAMD4
Homo sapiens (human)
Lectin pathway of complement activation
  • CLL1
  • COLEC1
  • COLEC10
  • COLEC11
  • CRARF
  • CRARF1
  • FCN1
  • FCN2
  • FCN3
  • FCNH
  • FCNL
  • FCNM
  • HAKA1
  • MASP1
  • MBL
  • MBL2
  • PRSS5
Homo sapiens (human)
Initial triggering of complement
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1QG
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C4A
  • C4B
  • C4B_2
  • CLL1
  • CO4
  • COLEC1
  • COLEC10
  • COLEC11
  • CPAMD2
  • CPAMD3
  • CRARF
  • CRARF1
  • FCN1
  • FCN2
  • FCN3
  • FCNH
  • FCNL
  • FCNM
  • HAKA1
  • IGHG1
  • IGHG2
  • IGHG3
  • IGHG4
  • IGHV
  • IGHV1-2
  • IGHV1-46
  • IGHV1-69
  • IGHV2-5
  • IGHV2-70
  • IGHV3-11
  • IGHV3-13
  • IGHV3-23
  • IGHV3-30
  • IGHV3-33
  • IGHV3-48
  • IGHV3-53
  • IGHV3-7
  • IGHV3-9
  • IGHV4-34
  • IGHV4-39
  • IGHV4-59
  • IGHV7-81
  • IGKC
  • IGKV1-12
  • IGKV1-16
  • IGKV1-17
  • IGKV1-33
  • IGKV1-39
  • IGKV1-5
  • IGKV1D-12
  • IGKV1D-16
  • IGKV1D-33
  • IGKV1D-39
  • IGKV2-28
  • IGKV2-29
  • IGKV2-30
  • IGKV2D-28
  • IGKV2D-30
  • IGKV2D-40
  • IGKV3-11
  • IGKV3-15
  • IGKV3-20
  • IGKV3D-20
  • IGKV4-1
  • IGKV5-2
  • IGLC1
  • IGLC2
  • IGLC3
  • IGLC6
  • IGLC7
  • IGLV
  • IGLV1-40
  • IGLV1-44
  • IGLV1-47
  • IGLV1-51
  • IGLV2-11
  • IGLV2-14
  • IGLV2-23
  • IGLV2-8
  • IGLV3-1
  • IGLV3-19
  • IGLV3-21
  • IGLV3-25
  • IGLV3-27
  • IGLV6-57
  • IGLV7-43
  • MASP1
  • MBL
  • MBL2
  • PRSS5
  • V1-11
  • V1-13
  • V1-16
  • V1-20
  • V1-3
  • V1-5
  • V1-7
  • V1-9
  • V2-11
  • V2-15
  • V2-17
  • V2-19
  • V2-8
  • V3-2
  • V3-3
  • V3-4
  • V4-1
  • V4-2
  • V4-6
  • V5-1
  • V5-4
  • V5-6
Homo sapiens (human)
RUNX2 regulates genes involved in cell migration
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • CBFB
  • FNRA
  • ITGA5
  • ITGBL1
  • MMP13
  • OSCP
  • PKB
  • PKBG
  • RAC
  • TIED
Homo sapiens (human)
SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription
  • BHLHE39
  • CCNC
  • CCNK
  • CCNT1
  • CCNT2
  • CDC2L4
  • CDK8
  • CDK9
  • CDKN2B
  • COL1A2
  • CPR4
  • DP1
  • DP2
  • DPC4
  • E2F4
  • E2F5
  • EP300
  • ERK1
  • ERK2
  • FUR
  • FURIN
  • HDAC1
  • JUNB
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADH7
  • MADH8
  • MADR2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MEN1
  • MTS2
  • MYC
  • NSEP1
  • P300
  • PACE
  • PAI1
  • PCSK3
  • PLANH1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RBL1
  • RNF111
  • RPD3L1
  • RPS27A
  • SCG2
  • SERPINE1
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • SMAD7
  • SP1
  • TAK
  • TAZ
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGIF
  • TGIF1
  • TGIF2
  • TSFP1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WWTR1
  • YB1
  • YBX1
Homo sapiens (human)
Signaling by PDGF
  • BNSP
  • COL29A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL4A5
  • COL6A1
  • COL6A2
  • COL6A3
  • COL6A5
  • COL6A6
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • FUR
  • FURIN
  • IEGF
  • OPN
  • PACE
  • PCSK3
  • PDGF2
  • PDGFB
  • PDGFD
  • PDGFR
  • PDGFR1
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PLAT
  • PLG
  • PTPN12
  • RHEPDGFRA
  • SCDGFB
  • SIS
  • SPP1
  • THBS1
  • THBS2
  • THBS3
  • THBS4
  • TSP
  • TSP1
  • TSP2
  • TSP3
  • TSP4
  • VWA4
Homo sapiens (human)
Collagen chain trimerization
  • BP180
  • BPAG2
  • C3orf7
  • COL10A1
  • COL11A1
  • COL11A2
  • COL12A1
  • COL12A1L
  • COL13A1
  • COL14A1
  • COL15A1
  • COL16A1
  • COL17A1
  • COL18A1
  • COL19A1
  • COL1A1
  • COL1A2
  • COL1AL
  • COL20A1
  • COL21A1
  • COL22A1
  • COL23A1
  • COL24A1
  • COL25A1
  • COL26A1
  • COL27A1
  • COL28
  • COL28A1
  • COL29A1
  • COL2A1
  • COL3A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL4A5
  • COL4A6
  • COL5A1
  • COL5A2
  • COL5A3
  • COL6A1
  • COL6A2
  • COL6A3
  • COL6A5
  • COL6A6
  • COL7A1
  • COL8A1
  • COL8A2
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COLL6
  • EMID2
  • EMU2
  • KIAA1510
  • KIAA1870
  • UND
  • VWA4
Homo sapiens (human)
Establishment of Sister Chromatid Cohesion
  • APRIN
  • AS3
  • BAM
  • BMH
  • CDCA5
  • CSPG6
  • DXS423E
  • EFO1
  • ESCO1
  • ESCO2
  • FOE
  • HR21
  • KIAA0078
  • KIAA0178
  • KIAA0261
  • KIAA0648
  • KIAA0979
  • KIAA1911
  • NXP1
  • PDS5
  • PDS5A
  • PDS5B
  • RAD21
  • SA1
  • SA2
  • SB1.8
  • SCC1
  • SCC3
  • SMC1
  • SMC1A
  • SMC1L1
  • SMC3
  • SMC3L1
  • STAG1
  • STAG2
  • WAPAL
  • WAPL
Homo sapiens (human)
Cohesin Loading onto Chromatin
  • APRIN
  • AS3
  • BAM
  • BMH
  • CSPG6
  • DXS423E
  • FOE
  • HR21
  • IDN3
  • KIAA0078
  • KIAA0178
  • KIAA0261
  • KIAA0648
  • KIAA0892
  • KIAA0979
  • MAU2
  • NIPBL
  • NXP1
  • PDS5
  • PDS5A
  • PDS5B
  • RAD21
  • SA1
  • SA2
  • SB1.8
  • SCC1
  • SCC2
  • SCC3
  • SCC4
  • SMC1
  • SMC1A
  • SMC1L1
  • SMC3
  • SMC3L1
  • STAG1
  • STAG2
  • WAPAL
  • WAPL
Homo sapiens (human)
RHO GTPases Activate ROCKs
  • ARH12
  • ARH6
  • ARH9
  • ARHA
  • ARHB
  • ARHC
  • CFL
  • CFL1
  • KIAA0619
  • KIAA0866
  • KIAA2034
  • LIMK
  • LIMK1
  • LIMK2
  • MBS
  • MLC2
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MYH10
  • MYH11
  • MYH14
  • MYH9
  • MYL12B
  • MYL6
  • MYL9
  • MYLC2B
  • MYPT1
  • MYPT2
  • MYRL2
  • PAK1
  • PPP1CB
  • PPP1R12A
  • PPP1R12B
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • ROCK1
  • ROCK2
Homo sapiens (human)
Sema3A PAK dependent Axon repulsion
  • CFL
  • CFL1
  • FES
  • FPS
  • FYN
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • KIAA0463
  • KIAA1550
  • LIMK
  • LIMK1
  • NOV
  • NRP
  • NRP1
  • OCT
  • OPHN3
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PLXN1
  • PLXN2
  • PLXN4
  • PLXNA1
  • PLXNA2
  • PLXNA3
  • PLXNA4
  • PLXNA4A
  • PLXNA4B
  • RAC1
  • SEMA3A
  • SEMAD
  • SEX
  • TC25
  • VEGF165R
Homo sapiens (human)
Cobalamin (Cbl) metabolism
  • C2orf25
  • CL25022
  • MMAA
  • MMAB
  • MMACHC
  • MMADHC
  • MMUT
  • MTR
  • MTRR
  • MUT
Homo sapiens (human)
Defective CBLIF causes IFD
  • CBLIF
  • GIF
  • IFMH
Homo sapiens (human)
Defective AMN causes MGA1
  • AMN
  • CBLIF
  • CUBN
  • GIF
  • IFCR
  • IFMH
Homo sapiens (human)

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Last updated: August 19, 2024