GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 801 - 825 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▲ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
NFE2L2 regulating MDR associated enzymes
  • ABCC1
  • ABCC3
  • ABCF2
  • ABCG2
  • ABCP
  • BCRP
  • BCRP1
  • CBP
  • CMOAT2
  • CREBBP
  • EP300
  • MAFK
  • MLP2
  • MRP
  • MRP1
  • MRP3
  • MXR
  • NFE2L2
  • NRF2
  • P300
Homo sapiens (human)
Recycling of bile acids and salts
  • ABCB11
  • ABCC3
  • ACSB
  • ACSVL6
  • ALB
  • ASBT
  • BAAT
  • BAR
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • BSEP
  • CMOAT2
  • FABP6
  • FACVL3
  • FATP5
  • FXR
  • HRR1
  • ILBP
  • ILLBP
  • ISBT
  • LST1
  • LST2
  • MLP2
  • MRP3
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • NR2B1
  • NTCP
  • NTCP2
  • OATP
  • OATP1
  • OATP1A2
  • OATP1B1
  • OATP1B3
  • OATP2
  • OATP8
  • OATPC
  • OSTA
  • OSTB
  • RIP14
  • RXRA
  • SLC10A1
  • SLC10A2
  • SLC21A3
  • SLC21A6
  • SLC21A8
  • SLC27A5
  • SLC51A
  • SLC51B
  • SLCO1A2
  • SLCO1B1
  • SLCO1B3
  • SRC1
  • SRC2
  • STARD5
  • TIF2
Homo sapiens (human)
Azathioprine ADME
  • ABCC4
  • ABCC5
  • CNT2
  • CNT3
  • DER12
  • ENT1
  • ENT2
  • GMK
  • GMPK
  • GMPS
  • GST1
  • GST2
  • GSTA1
  • GSTA2
  • GSTM1
  • GUK1
  • HNP36
  • HPRT
  • HPRT1
  • IMPD1
  • IMPD2
  • IMPDH1
  • IMPDH2
  • MOATB
  • MRP4
  • MRP5
  • MTH2
  • NDPKA
  • NM23
  • NM23B
  • NME1
  • NME2
  • NUDT15
  • RAC1
  • SLC28A2
  • SLC28A3
  • SLC29A1
  • SLC29A2
  • TC25
  • TPMT
  • VAV
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • XDH
  • XDHA
Homo sapiens (human)
TICAM1,TRAF6-dependent induction of TAK1 complex
  • KIAA0733
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • PRVTIRB
  • RNF85
  • RPS27A
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRAF6
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Trafficking and processing of endosomal TLR
  • CATL2
  • CNPY3
  • CPSB
  • CTG4A
  • CTSB
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSL2
  • CTSO
  • CTSO2
  • CTSS
  • CTSU
  • CTSV
  • ERDA5
  • GRP94
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • LGMN
  • PRAT4A
  • PRSC1
  • TLR3
  • TLR7
  • TLR8
  • TLR9
  • TNRC5
  • TRA1
  • UNC93
  • UNC93B
  • UNC93B1
Homo sapiens (human)
TICAM1-dependent activation of IRF3/IRF7
  • CAP-1
  • CRAF1
  • FIP2
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IRF3
  • IRF7
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • NAK
  • NRP
  • OPTN
  • PRVTIRB
  • RPS27A
  • TANK
  • TBK1
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Regulation of TBK1, IKKε-mediated activation of IRF3, IRF7 upon TLR3 ligation
  • CAP-1
  • CRAF1
  • FIP2
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • NAK
  • NRP
  • OPTN
  • PRVTIRB
  • RPS27A
  • TANK
  • TBK1
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
TRAF3 deficiency - HSE
  • CAP-1
  • CRAF1
  • PRVTIRB
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRIF
Homo sapiens (human)
TLR3-mediated TICAM1-dependent programmed cell death
  • CASP8
  • FADD
  • MCH5
  • MORT1
  • PRVTIRB
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRIF
Homo sapiens (human)
TICAM1 deficiency - HSE
  • PRVTIRB
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRIF
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade
  • PRVTIRB
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRIF
Homo sapiens (human)
UNC93B1 deficiency - HSE
  • TLR3
  • UNC93
  • UNC93B
  • UNC93B1
Homo sapiens (human)
TLR3 deficiency - HSE
  • TLR3
Homo sapiens (human)
Meiotic recombination
  • ATM
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • CDK2
  • CDK4
  • CDKN2
  • COCA2
  • CTIP
  • DMC1
  • DMC1H
  • FACD
  • FANCD1
  • GAJ
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3-4
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H3FT
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST3H3
  • HIST4H4
  • HNGS1
  • HOP2
  • LIM15
  • MLH1
  • MLH3
  • MND1
  • MRE11
  • MRE11A
  • MSH4
  • MSH5
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • PFM6
  • PRDM9
  • PSMC3IP
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51C
  • RAD51L2
  • RBBP8
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQL3
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RNF53
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • SPO11
  • TBPIP
  • TEX15
  • TOP3
  • TOP3A
  • TSH2B
Homo sapiens (human)
Sialic acid metabolism
  • C1orf13
  • C20orf147
  • CGS23
  • CMAS
  • CTSA
  • ELNR1
  • GLB1
  • GLCNE
  • GNE
  • HDHD4
  • IBM2
  • KIAA1877
  • NANH
  • NANP
  • NANS
  • NANTA3
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • NPL
  • PPGB
  • PST
  • PST1
  • SAS
  • SIAT1
  • SIAT10
  • SIAT2
  • SIAT3C
  • SIAT4
  • SIAT4A
  • SIAT4B
  • SIAT4C
  • SIAT6
  • SIAT7A
  • SIAT7B
  • SIAT7C
  • SIAT7D
  • SIAT7E
  • SIAT7F
  • SIAT8
  • SIAT8A
  • SIAT8B
  • SIAT8C
  • SIAT8D
  • SIAT8E
  • SIAT8F
  • SIAT9
  • SIATL1
  • SLC17A5
  • SLC35A1
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL5
  • ST3GAL6
  • ST6GAL1
  • ST6GAL2
  • ST6GALNAC1
  • ST6GALNAC2
  • ST6GALNAC3
  • ST6GALNAC4
  • ST6GALNAC5
  • ST6GALNAC6
  • ST8SIA1
  • ST8SIA2
  • ST8SIA3
  • ST8SIA4
  • ST8SIA5
  • ST8SIA6
  • STHM
  • STX
  • STZ
Homo sapiens (human)
Glycosphingolipid biosynthesis
  • A14GALT
  • A4GALT
  • A4GALT1
  • B3GALNT1
  • B3GALT3
  • B3GALT4
  • B3GNT5
  • B4GALNT1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • CERK
  • CGT
  • CST
  • FUT1
  • FUT2
  • GAL3ST1
  • GALGT
  • GALT4
  • H
  • HSC
  • KIAA1646
  • SEC2
  • SIAT2
  • SIAT4B
  • SIAT6
  • SIAT7E
  • SIAT7F
  • SIAT8E
  • SIAT9
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL5
  • ST6GALNAC5
  • ST6GALNAC6
  • ST8SIA5
  • UGCG
  • UGT4
  • UGT8
Homo sapiens (human)
Glycogen synthesis
  • EPM2A
  • EPM2B
  • GBE1
  • GYG
  • GYG1
  • GYG2
  • GYS
  • GYS1
  • GYS2
  • NHLRC1
  • PGM1
  • PPP1R3C
  • PPP1R5
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UGP1
  • UGP2
Homo sapiens (human)
Glycogen breakdown (glycogenolysis)
  • AGL
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • GAA
  • GDE
  • GYG
  • GYG1
  • GYG2
  • PGM1
  • PHKA
  • PHKA1
  • PHKA2
  • PHKB
  • PHKG
  • PHKG1
  • PHKG2
  • PHKLA
  • PYGB
  • PYGL
  • PYGM
  • PYK
Homo sapiens (human)
GSD IV
  • GBE1
  • GYG2
  • GYS2
Homo sapiens (human)
GSD 0
  • GYG2
  • GYS2
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodelling of PC
  • AGPAT11
  • AGPAT7
  • AYTL1
  • AYTL2
  • AYTL3
  • CLEC13C
  • CPLA2
  • HRASLS3
  • HREV107
  • IPLA22
  • IPLA2G
  • LPCAT1
  • LPCAT2
  • LPCAT3
  • LPCAT4
  • LPEAT2
  • MBOAT2
  • MBOAT5
  • OACT2
  • OACT5
  • PFAAP3
  • PLA2
  • PLA2A
  • PLA2B
  • PLA2G10
  • PLA2G12
  • PLA2G12A
  • PLA2G16
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D
  • PLA2G2E
  • PLA2G2F
  • PLA2G3
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4B
  • PLA2G4C
  • PLA2G4D
  • PLA2G4E
  • PLA2G4F
  • PLA2G5
  • PLA2G6
  • PLA2L
  • PLA2R1
  • PLAAT3
  • PLB
  • PLB1
  • PLBD1
  • PLPLA9
  • PNPLA8
  • PPLA2
  • RASF-A
  • SPLASH
  • TMEM86B
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodelling of PE
  • ABHD4
  • AGPAT7
  • AYTL3
  • CLEC13C
  • CPLA2
  • HRASLS
  • HRASLS2
  • HRASLS3
  • HRASLS5
  • HREV107
  • HRLP5
  • IPLA22
  • IPLA2G
  • LPCAT3
  • LPCAT4
  • LPEAT2
  • MBOAT1
  • MBOAT2
  • MBOAT5
  • OACT1
  • OACT2
  • OACT5
  • PLA2
  • PLA2A
  • PLA2B
  • PLA2G10
  • PLA2G12
  • PLA2G12A
  • PLA2G16
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D
  • PLA2G2E
  • PLA2G2F
  • PLA2G3
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4B
  • PLA2G4C
  • PLA2G4D
  • PLA2G4E
  • PLA2G4F
  • PLA2G5
  • PLA2G6
  • PLA2L
  • PLA2R1
  • PLAAT1
  • PLAAT2
  • PLAAT3
  • PLAAT4
  • PLAAT5
  • PLBD1
  • PLPLA9
  • PNPLA8
  • PPLA2
  • RARRES3
  • RASF-A
  • RIG1
  • SPLASH
  • TIG3
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodelling of PS
  • AGPAT7
  • AYTL3
  • CLEC13C
  • CPLA2
  • HRASLS3
  • HREV107
  • KIAA1451
  • KIAA1534
  • LPCAT3
  • LPCAT4
  • LPEAT2
  • MBOAT1
  • MBOAT5
  • NMD
  • OACT1
  • OACT5
  • OBPH1
  • ORP10
  • ORP5
  • ORP8
  • OSBP10
  • OSBP9
  • OSBPL10
  • OSBPL5
  • OSBPL8
  • PLA1A
  • PLA2
  • PLA2A
  • PLA2B
  • PLA2G10
  • PLA2G12
  • PLA2G12A
  • PLA2G16
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D
  • PLA2G2E
  • PLA2G2F
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4B
  • PLA2G4D
  • PLA2G4E
  • PLA2G4F
  • PLA2G5
  • PLA2L
  • PLA2R1
  • PLAAT3
  • PPLA2
  • PSPLA1
  • RASF-A
  • SPLASH
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodelling of PG
  • AGPAT7
  • AYTL2
  • AYTL3
  • C20orf155
  • CLEC13C
  • CLS1
  • CPLA2
  • CRLS1
  • FAM34A
  • KIAA0205
  • LPCAT1
  • LPCAT4
  • LPEAT2
  • LPGAT1
  • PFAAP3
  • PLA2
  • PLA2A
  • PLA2B
  • PLA2G10
  • PLA2G12
  • PLA2G12A
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D
  • PLA2G2E
  • PLA2G2F
  • PLA2G3
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4B
  • PLA2G4D
  • PLA2G4F
  • PLA2G5
  • PLA2L
  • PLA2R1
  • PPLA2
  • RASF-A
  • SPLASH
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodelling of PI
  • BB1
  • CLEC13C
  • CPLA2
  • HRASLS3
  • HREV107
  • LENG4
  • MBOAT7
  • OACT7
  • PLA2
  • PLA2A
  • PLA2B
  • PLA2G10
  • PLA2G12
  • PLA2G12A
  • PLA2G16
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D
  • PLA2G2E
  • PLA2G2F
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4C
  • PLA2G4D
  • PLA2G4E
  • PLA2G4F
  • PLA2G5
  • PLA2L
  • PLA2R1
  • PLAAT3
  • PLBD1
  • PPLA2
  • RASF-A
  • SPLASH
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024