GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 826 - 850 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
STAT6-mediated induction of chemokines
  • ERIS
  • MITA
  • NAK
  • STAT6
  • STING
  • STING1
  • TBK1
  • TMEM173
Homo sapiens (human)
Translesion Synthesis by POLH
  • ARNIP
  • C1orf124
  • CHIMP
  • DVC1
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • KIAA1499
  • NPL4
  • NPLOC4
  • PCNA
  • PIRH2
  • POLH
  • RAD30
  • RAD30A
  • RCHY1
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RNF199
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • SPRTN
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UFD1
  • UFD1L
  • VCP
  • XPV
  • ZNF363
Homo sapiens (human)
Purine ribonucleoside monophosphate biosynthesis
  • ADE2
  • ADSL
  • ADSS
  • ADSS1
  • ADSS2
  • ADSSL1
  • AIRC
  • AMPS
  • ATIC
  • GART
  • GMPS
  • GPAT
  • IMPD1
  • IMPD2
  • IMPDH1
  • IMPDH2
  • KIAA0361
  • PAICS
  • PAIS
  • PFAS
  • PGFT
  • PPAT
  • PRGS
  • PURH
Homo sapiens (human)
Regulation of PAK-2p34 activity by PS-GAP/RHG10
  • ARHGAP10
  • GRAF2
  • PAK2
Homo sapiens (human)
alpha-linolenic acid (ALA) metabolism
  • ABCD1
  • ACAA
  • ACAA1
  • ACOT8
  • ACSL1
  • ACTEIII
  • ALD
  • CIG30
  • EDH17B4
  • ELG3
  • ELOVL1
  • ELOVL2
  • ELOVL3
  • ELOVL5
  • FACL1
  • FACL2
  • FADS1
  • FADS2
  • FADSD5
  • HSD17B4
  • LACS
  • LACS1
  • LACS2
  • PTE1
  • PTHIO
  • SCP2
  • SDR8C1
  • SSC1
  • SSC2
Homo sapiens (human)
Attenuation phase
  • CBP
  • CREBBP
  • DNAJ1
  • DNAJB1
  • EP300
  • FKBP4
  • FKBP52
  • HDJ1
  • HSBP1
  • HSC70
  • HSF1
  • HSF1BP
  • HSP72
  • HSP73
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPA1
  • HSPA10
  • HSPA1A
  • HSPA1B
  • HSPA1L
  • HSPA2
  • HSPA8
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • HSPF1
  • HSTF1
  • HSX70
  • P23
  • P300
  • PTGES3
  • TEBP
Homo sapiens (human)
Effects of PIP2 hydrolysis
  • CDC25L
  • DAGK
  • DAGK1
  • DAGK2
  • DAGK3
  • DAGK4
  • DAGK5
  • DAGK6
  • DGKA
  • DGKB
  • DGKD
  • DGKE
  • DGKG
  • DGKH
  • DGKI
  • DGKK
  • DGKQ
  • DGKZ
  • INSP3R1
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KIAA0145
  • KIAA0718
  • MCG7
  • PKCD
  • PKCE
  • PKCL
  • PRKCD
  • PRKCE
  • PRKCH
  • PRKCL
  • PRKCQ
  • PRKCT
  • RASGRP
  • RASGRP1
  • RASGRP2
  • TRP3
  • TRP6
  • TRP7
  • TRPC3
  • TRPC6
  • TRPC7
Homo sapiens (human)
Pre-NOTCH Processing in Golgi
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B
  • B4GALT1
  • CGS23
  • FUR
  • FURIN
  • GGTB2
  • INT3
  • LFNG
  • MFNG
  • NANTA3
  • NOTCH1
  • NOTCH2
  • NOTCH3
  • NOTCH4
  • PACE
  • PCSK3
  • RAB6
  • RAB6A
  • RFNG
  • RNP24
  • SEL1L
  • SIAT10
  • SIAT4C
  • SIAT6
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
  • STZ
  • TAN1
  • TMED2
  • TSA305
Homo sapiens (human)
Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK
  • BMK1
  • CCKBR
  • CCKRB
  • ERK1
  • ERK2
  • ERK5
  • GAS
  • GAST
  • ISPK1
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPK7
  • MAPKAPK1A
  • MAPKAPK1B
  • MAPKAPK1C
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKM7
  • RPS6KA1
  • RPS6KA2
  • RPS6KA3
  • RSK1
  • RSK2
  • RSK3
Homo sapiens (human)
Homologous DNA Pairing and Strand Exchange
  • ATM
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C16orf75
  • C7orf76
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • DSS1
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FANCN
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KIAA0083
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • PALB2
  • PIR51
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51AP1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RBBP8
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • WRN
  • XRCC2
  • XRCC3
Homo sapiens (human)
Cyclin A/B1/B2 associated events during G2/M transition
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CCNH
  • CDC2
  • CDC25A
  • CDC25B
  • CDC25C
  • CDC25HU2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDK2
  • CDK7
  • CDKN1
  • CDKN2
  • CDKN7
  • CRM1
  • FKHL16
  • FOXM1
  • HFH11
  • LCMT
  • LCMT1
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • MPP2
  • MYT1
  • P34CDC2
  • PKMYT1
  • PLK
  • PLK1
  • PME1
  • PPME1
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R2A
  • PPP2R3B
  • PPP2R3L
  • RNF66
  • STK1
  • WEE1
  • WIN
  • XPO1
Homo sapiens (human)
Notch-HLH transcription pathway
  • CBP
  • CG1
  • CREBBP
  • CTG26
  • CXorf6
  • GCN5
  • GCN5L2
  • HDAC1
  • HDAC10
  • HDAC11
  • HDAC2
  • HDAC3
  • HDAC4
  • HDAC5
  • HDAC6
  • HDAC7
  • HDAC7A
  • HDAC7B
  • HDAC8
  • HDAC9
  • HDACL1
  • HDRP
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • INT3
  • IRA1
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0200
  • KIAA0288
  • KIAA0600
  • KIAA0744
  • KIAA0901
  • KIAA1047
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • MITR
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NOTCH1
  • NOTCH2
  • NOTCH3
  • NOTCH4
  • PCAF
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • RPD3L1
  • SKIIP
  • SKIP
  • SNW1
  • TAN1
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
Homo sapiens (human)
Defective B4GALT1 causes CDG-2d
  • B4GALT1
  • GGTB2
Homo sapiens (human)
Transcription of E2F targets under negative control by DREAM complex
  • BARA
  • BHLHD4
  • BHLHE39
  • C14orf46
  • CDC18L
  • CDC25A
  • CDC6
  • CXCDC1
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • E2F4
  • E2F5
  • HDAC1
  • KIAA2037
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • MAX
  • MYC
  • PCNA
  • RB2
  • RBAP48
  • RBBP3
  • RBBP4
  • RBL1
  • RBL2
  • RPD3L1
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGS
  • TOP2
  • TOP2A
Homo sapiens (human)
MAPK3 (ERK1) activation
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • ERK1
  • IFNB2
  • IL6
  • IL6R
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • MAP2K1
  • MAPK3
  • MEK1
  • P34CDC2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • TYK2
Homo sapiens (human)
Insulin receptor signalling cascade
  • GRB10
  • GRBIR
  • HRAS
  • HRAS1
  • INS
  • INSR
  • KIAA0207
  • NRAS
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SOS1
Homo sapiens (human)
ATF6 (ATF6-alpha) activates chaperone genes
  • ATF4
  • ATF6
  • CALR
  • CHOP
  • CHOP10
  • CREB2
  • CRTC
  • DDIT3
  • GADD153
  • GRP78
  • GRP94
  • HAP3
  • HSP90B1
  • HSPA5
  • HSPC4
  • NFYA
  • NFYB
  • NFYC
  • TRA1
  • TXREB
Homo sapiens (human)
GSD Ia
  • G6PC
  • G6PC1
  • G6PT
Homo sapiens (human)
SLBP Dependent Processing of Replication-Dependent Histone Pre-mRNAs
  • CBP20
  • CBP80
  • COD
  • HBP
  • KIAA1141
  • LSM10
  • LSM11
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • PBSCF
  • PBSCG
  • SLBP
  • SNRPB
  • SNRPB1
  • SNRPD3
  • SNRPE
  • SNRPF
  • SNRPG
  • ZFP100
  • ZNF473
Homo sapiens (human)
CLEC7A (Dectin-1) signaling
  • BCL10
  • BGR
  • BLU
  • BTRC
  • BTRCP
  • BTRCP2
  • C7orf76
  • CARD11
  • CARD9
  • CARMA1
  • CDC34
  • CHUK
  • CIPER
  • CLAP
  • CLEC7A
  • CLECSF12
  • CROC1
  • CUL1
  • DECTIN1
  • DSS1
  • EMC19
  • FBW1A
  • FBW1B
  • FBXW11
  • FBXW1A
  • FBXW1B
  • FIP3
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IFI5111
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • KIAA0696
  • KIAA0733
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MAD3
  • MALT1
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MLT
  • MOV34L
  • MSS1
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NU
  • OCP2
  • PDK1
  • PDPK1
  • PFAAP4
  • PKCD
  • PLCG2
  • POH1
  • PRKCD
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • PUBC1
  • RELA
  • RING10
  • RING12
  • RNF85
  • RPS27A
  • SEM1
  • SFT
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • SUG2
  • SYK
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1L
  • TCF16
  • TRAF6
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBC5A
  • UBC5B
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH3
  • UBCH4
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5B
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2N
  • UBE2R1
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
Defective factor XII causes hereditary angioedema
  • F12
  • F2
  • KLK3
  • KLKB1
Homo sapiens (human)
Degradation of GLI1 by the proteasome
  • BTRC
  • BTRCP
  • C14orf41
  • C7orf76
  • CUL1
  • DSS1
  • EMC19
  • FBW1A
  • FBXW1A
  • GLI
  • GLI1
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IFI5111
  • ITCH
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • NUMB
  • OCP2
  • PFAAP4
  • PKACA
  • POH1
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RBX1
  • RING10
  • RING12
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUFU
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1L
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of other transcription factors
  • AP2TF
  • ARP1
  • CITED2
  • MRG1
  • PITX2
  • RGS
  • RIEG
  • RIEG1
  • TFAP2
  • TFAP2A
  • TFAP2C
Homo sapiens (human)
HHAT G278V doesn't palmitoylate Hh-Np
  • DHH
  • HHAT
  • IHH
  • MART2
  • SHH
  • SKI1
Homo sapiens (human)
Selenoamino acid metabolism
  • AIMP1
  • AIMP2
  • AIMP3
  • DARS
  • DARS1
  • EEF1E1
  • EMAP2
  • EPRS
  • EPRS1
  • GLNS
  • IARS
  • IARS1
  • JTV1
  • KARS
  • KARS1
  • KIAA0070
  • KIAA1352
  • LARS
  • LARS1
  • MARS
  • MARS1
  • P18
  • PARS
  • QARS
  • QARS1
  • QPRS
  • RARS
  • RARS1
  • SCYE1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024