GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 851 - 875 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
RUNX1 regulates expression of components of tight junctions
  • AML1
  • AWAL
  • CBFA2
  • CBFB
  • CLDN5
  • OCLN
  • RUNX1
  • TJP1
  • TMVCF
  • ZO1
Homo sapiens (human)
Tight junction interactions
  • AWAL
  • C7orf1
  • CEPTRL2
  • CIPP
  • CLD1
  • CLDN1
  • CLDN10
  • CLDN11
  • CLDN12
  • CLDN14
  • CLDN15
  • CLDN16
  • CLDN17
  • CLDN18
  • CLDN19
  • CLDN2
  • CLDN20
  • CLDN22
  • CLDN23
  • CLDN3
  • CLDN4
  • CLDN5
  • CLDN6
  • CLDN7
  • CLDN8
  • CLDN9
  • CPER
  • CPETR1
  • CPETR2
  • CPETRL2
  • CRB3
  • DXS1179E
  • E
  • F11R
  • INADL
  • JAM1
  • JCAM
  • MPP5
  • OSP
  • OTM
  • PALS1
  • PAR3
  • PAR3A
  • PAR6A
  • PAR6B
  • PAR6G
  • PARD3
  • PARD6A
  • PARD6B
  • PARD6G
  • PATJ
  • PCLN1
  • PRKCI
  • SEMP1
  • TMVCF
  • WBSCR8
Homo sapiens (human)
Entry of Influenza Virion into Host Cell via Endocytosis
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTC
  • CLTCL2
  • HA
  • KIAA0034
  • M
  • NA
  • NP
  • NS
  • PA
  • PB1
  • PB2
Homo sapiens (human)
Regulation of CDH11 gene transcription
  • BHLHB33
  • BHLHB5
  • BHLHE22
  • DRBF
  • FKHL5
  • FOXF1
  • FREAC1
  • HEYL
  • HOX3A
  • HOXC8
  • HRT3
  • ILF3
  • KIAA0569
  • MPHOSPH4
  • NF90
  • PFM5
  • PRDM8
  • SIP1
  • SNAH
  • SNAI1
  • SP1
  • TNRC20
  • TSFP1
  • ZEB2
  • ZFHX1B
  • ZFX1B
Homo sapiens (human)
RHO GTPases activate CIT
  • ARH12
  • ARH6
  • ARH9
  • ARHA
  • ARHB
  • ARHC
  • CDKN1B
  • CIT
  • CRIK
  • DLG4
  • KIAA0042
  • KIAA0866
  • KIAA0949
  • KIAA2034
  • KIF14
  • KIP1
  • MBS
  • MLC2
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MYH10
  • MYH11
  • MYH14
  • MYH9
  • MYL12B
  • MYL6
  • MYL9
  • MYLC2B
  • MYPT1
  • MYPT2
  • MYRL2
  • PPP1CB
  • PPP1R12A
  • PPP1R12B
  • PRC1
  • PSD95
  • RAC1
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • STK21
  • TC25
  • p27
Homo sapiens (human)
TGF-beta receptor signaling in EMT (epithelial to mesenchymal transition)
  • ALK5
  • ARH12
  • ARHA
  • ARHGEF18
  • CGN
  • F11R
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • JAM1
  • JCAM
  • KIAA0521
  • KIAA1319
  • KIAA1625
  • PAR3
  • PAR3A
  • PAR6A
  • PARD3
  • PARD6A
  • PKC2
  • PRKCZ
  • RHO12
  • RHOA
  • RPS27A
  • SKR4
  • SMURF1
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Uptake of dietary cobalamins into enterocytes
  • ABCD4
  • AMN
  • C6orf209
  • CBLIF
  • CTRB
  • CTRB1
  • CTRB2
  • CUBN
  • GIF
  • IFCR
  • IFMH
  • LMBRD1
  • NESI
  • PRSS1
  • PRSS3
  • PRSS4
  • PXMP1L
  • TC1
  • TCN1
  • TRP1
  • TRY1
  • TRY3
  • TRY4
  • TRYP1
Homo sapiens (human)
Signaling by SCF-KIT
  • APRF
  • CHEK1
  • CHK1
  • CLG4B
  • CMA1
  • CYH
  • CYM
  • FER
  • FES
  • FMI
  • FPS
  • FYN
  • GAB2
  • GADS
  • GRAP
  • GRAP2
  • GRB1
  • GRB10
  • GRB2L
  • GRB7
  • GRBIR
  • GRID
  • HRAS
  • HRAS1
  • JAK2
  • JTK8
  • KIAA0207
  • KIAA0571
  • KIT
  • LCK
  • LYN
  • MMP9
  • NRAS
  • PCP2
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PKCA
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PSCTK4
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPRO
  • PTPRU
  • RAC1
  • SCFR
  • SHPTP2
  • SOS1
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TC25
  • TEC
  • TYK3
  • VAV
  • VAV1
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Dual Incision in GG-NER
  • ADPRT
  • ADPRT2
  • ADPRTL2
  • ALC1
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CHD1L
  • CHRAC17
  • CUL4A
  • CUL4B
  • DDB1
  • DDB2
  • DINB1
  • DPE2
  • ERCC1
  • ERCC11
  • ERCC2
  • ERCC3
  • ERCC4
  • ERCC5
  • ERCM2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • KIAA0039
  • KIAA0695
  • PARP1
  • PARP2
  • PCNA
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POLE
  • POLE1
  • POLE2
  • POLE3
  • POLE4
  • POLK
  • PPOL
  • RBX1
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RNF75
  • ROC1
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • TTDA
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • XAP1
  • XPA
  • XPAC
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • XPF
  • XPG
  • XPGC
Homo sapiens (human)
Activation of rRNA Expression by ERCC6 (CSB) and EHMT2 (G9a)
  • BAT8
  • C6orf30
  • CBX3
  • CHD3
  • CHD4
  • CSB
  • EHMT2
  • ERCC6
  • G9A
  • GATAD2A
  • GATAD2B
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HDAC1
  • HDAC2
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST4H4
  • KIAA1150
  • KIAA1266
  • KMT1C
  • MBD3
  • MTA1
  • MTA1L1
  • MTA2
  • MTA3
  • NG36
  • PID
  • RBAP46
  • RBAP48
  • RBBP4
  • RBBP7
  • RPD3L1
  • TSH2B
  • TTF1
Homo sapiens (human)
SUMOylation of DNA methylation proteins
  • AIM
  • BAP1
  • BMI1
  • CBX2
  • CBX4
  • CBX8
  • CXXC9
  • DING
  • DNMT
  • DNMT1
  • DNMT3A
  • DNMT3B
  • EDR1
  • EDR2
  • EDR3
  • HIPI3
  • MEL18
  • PC3
  • PCGF2
  • PCGF4
  • PH1
  • PH2
  • PH3
  • PHC1
  • PHC2
  • PHC3
  • RC1
  • RING1
  • RING1A
  • RING1B
  • RNF1
  • RNF110
  • RNF2
  • RNF51
  • SMT3C
  • SMT3H3
  • SUMO1
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
  • ZNF144
Homo sapiens (human)
Na+/Cl- dependent neurotransmitter transporters
  • B0AT1
  • B0AT2
  • B0AT3
  • BGT1
  • DAT1
  • GABATR
  • GABT1
  • GABT3
  • GAT1
  • GAT2
  • GAT3
  • GLYT2
  • NAT1
  • NET1
  • NTT73
  • OCT1
  • OCT2
  • PROT
  • SBAT1
  • SIT1
  • SLC18A1
  • SLC18A2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SLC6A1
  • SLC6A11
  • SLC6A12
  • SLC6A13
  • SLC6A14
  • SLC6A15
  • SLC6A18
  • SLC6A19
  • SLC6A2
  • SLC6A20
  • SLC6A3
  • SLC6A5
  • SLC6A6
  • SLC6A7
  • SLC6A9
  • SVMT
  • VAT1
  • VMAT1
  • VMAT2
  • XT3
  • XTRP2
  • XTRP3
Homo sapiens (human)
Growth hormone receptor signaling
  • ADAM17
  • APRF
  • CIS2
  • CIS3
  • CISH
  • CSH1
  • CSVP
  • ERK1
  • ERK2
  • G18
  • GH1
  • GH2
  • GHR
  • HCP
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK2
  • JTK8
  • LYN
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRL
  • PRLR
  • PTP1B
  • PTP1C
  • PTPN1
  • PTPN6
  • SOCS1
  • SOCS2
  • SOCS3
  • SSI1
  • SSI2
  • SSI3
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • STATI2
  • TACE
  • TIP3
Homo sapiens (human)
Prolactin receptor signaling
  • BTRC
  • BTRCP
  • CSH1
  • CUL1
  • EMC19
  • FBW1A
  • FBXW1A
  • GH1
  • GH2
  • GHR
  • JAK2
  • OCP2
  • PRL
  • PRLR
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RBX1
  • RNF75
  • ROC1
  • SHPTP2
  • SKP1
  • SKP1A
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TCEB1L
Homo sapiens (human)
Glycoprotein hormones
  • CGA
  • CGB
  • CGB3
  • CGB5
  • CGB8
  • FSHB
  • INHA
  • INHBA
  • INHBB
  • INHBC
  • INHBE
  • LHB
  • TSHB
Homo sapiens (human)
Transport of bile salts and organic acids, metal ions and amine compounds
  • C6orf29
  • CD92
  • CDW92
  • CHT1
  • CTL1
  • CTL2
  • CTL3
  • CTL4
  • CTL5
  • HUT11
  • HUT2
  • JK
  • MATE1
  • MATE2
  • NG22
  • RACH1
  • SLC10A6
  • SLC14A1
  • SLC14A2
  • SLC44A1
  • SLC44A2
  • SLC44A3
  • SLC44A4
  • SLC44A5
  • SLC47A1
  • SLC47A2
  • SLC5A7
  • SOAT
  • TPPT1
  • UT1
  • UT2
  • UTE
Homo sapiens (human)
Synthesis of PE
  • AGXT2L1
  • CEPT1
  • CHETK
  • CHK
  • CHKA
  • CHKB
  • CHKL
  • CKI
  • EKI1
  • EKI2
  • EPT1
  • ETNK1
  • ETNK2
  • ETNPPL
  • KIAA0188
  • KIAA0249
  • KIAA1724
  • LIPN3L
  • LPIN1
  • LPIN2
  • LPIN3
  • PCYT2
  • PHOSPHO1
  • PISD
  • SELENOI
  • SELI
Homo sapiens (human)
Acetylcholine Neurotransmitter Release Cycle
  • BZRAP1
  • CHAT
  • CHT1
  • CPLX1
  • KIAA0340
  • KIAA0612
  • KIAA0654
  • KIAA0897
  • LIP1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RAB3IP2
  • RBP1
  • RIM1
  • RIMBP1
  • RIMS1
  • SLC18A3
  • SLC5A7
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • SVP65
  • SYB2
  • SYT
  • SYT1
  • TSPOAP1
  • UNC13
  • UNC13B
  • VACHT
  • VAMP2
Homo sapiens (human)
Defective SLC26A3 causes congenital secretory chloride diarrhea 1 (DIAR1)
  • DRA
  • SLC26A3
Homo sapiens (human)
Defective ALG1 causes CDG-1k
  • ALG1
  • HMAT1
  • HMT1
Homo sapiens (human)
Sealing of the nuclear envelope (NE) by ESCRT-III
  • ADPSP
  • BC2
  • C14orf123
  • C20orf178
  • CC2D1B
  • CGI149
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • FSP2
  • IST1
  • KIAA0174
  • KIAA1083
  • KIAA1836
  • LEMD2
  • LGD1
  • NEDF
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • SPAST
  • SPG4
  • TUBA1
  • TUBA1A
  • TUBA1B
  • TUBA1C
  • TUBA2
  • TUBA3
  • TUBA3C
  • TUBA3D
  • TUBA3E
  • TUBA4
  • TUBA4A
  • TUBA4B
  • TUBA6
  • TUBA8
  • TUBAL2
  • TUBAL3
  • TUBB1
  • TUBB2
  • TUBB2A
  • TUBB2B
  • TUBB2C
  • TUBB3
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBB6
  • TUBB8
  • TUBB8B
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS4
  • VPS4A
Homo sapiens (human)
Endosomal Sorting Complex Required For Transport (ESCRT)
  • BC2
  • C13orf9
  • C14orf123
  • C20orf178
  • C6orf55
  • C9orf28
  • C9orf83
  • CFBP
  • CGI149
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP5
  • CHMP6
  • CHMP7
  • DERP9
  • EAP20
  • EAP30
  • EAP45
  • FAM125A
  • FAM125B
  • HBP
  • HCRP1
  • HGS
  • HRS
  • MVB12A
  • MVB12B
  • NEDF
  • PML39
  • RPS27A
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • SKD1
  • SNF7DC2
  • SNF8
  • STAM
  • STAM1
  • STAM2
  • TSG101
  • UBA52
  • UBA80
  • UBAP1
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS25
  • VPS28
  • VPS36
  • VPS37A
  • VPS37B
  • VPS37C
  • VPS37D
  • VPS4
  • VPS42
  • VPS4A
  • VPS4B
  • VTA1
  • WBSCR24
Homo sapiens (human)
Budding and maturation of HIV virion
  • AIP1
  • ALIX
  • BC2
  • C14orf123
  • C20orf178
  • C6orf55
  • C9orf28
  • C9orf83
  • CFBP
  • CGI149
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP5
  • CHMP6
  • CHMP7
  • CYPA
  • FAM125A
  • FAM125B
  • HCRP1
  • KIAA0439
  • KIAA1375
  • MVB12A
  • MVB12B
  • NEDD4L
  • NEDF
  • NEDL3
  • PDCD6IP
  • PML39
  • PPIA
  • RPS27A
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • SKD1
  • SNF7DC2
  • TSG101
  • UBA52
  • UBA80
  • UBAP1
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS28
  • VPS37A
  • VPS37B
  • VPS37C
  • VPS37D
  • VPS4
  • VPS42
  • VPS4A
  • VPS4B
  • VTA1
  • WBSCR24
  • env
  • gag
  • gag-pol
  • nef
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Defective SLC40A1 causes hemochromatosis 4 (HFE4) (macrophages)
  • CP
  • FPN
  • FPN1
  • IREG1
  • SLC11A3
  • SLC40A1
Homo sapiens (human)
Defective CP causes aceruloplasminemia (ACERULOP)
  • CP
  • FPN
  • FPN1
  • IREG1
  • SLC11A3
  • SLC40A1
Homo sapiens (human)

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Last updated: August 19, 2024