GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 876 - 900 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Netrin mediated repulsion signals
  • DCC
  • IGDCC1
  • KIAA1777
  • KIAA1976
  • NTN1
  • NTN1L
  • P53RDL1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • SRC
  • SRC1
  • UNC5A
  • UNC5B
  • UNC5C
  • UNC5D
  • UNC5H1
  • UNC5H2
  • UNC5H3
  • UNC5H4
Homo sapiens (human)
Pregnenolone biosynthesis
  • ADX
  • ADXR
  • AKR1B1
  • ALDR1
  • ALR2
  • BZRAP1
  • BZRP
  • CAB1
  • CYP11A
  • CYP11A1
  • FDX1
  • FDX1L
  • FDX2
  • FDXR
  • KIAA0612
  • MBR
  • MENTHO
  • MLN64
  • RBP1
  • RIMBP1
  • STAR
  • STARD1
  • STARD3
  • STARD3NL
  • STARD4
  • STARD6
  • TSPO
  • TSPOAP1
Homo sapiens (human)
Lysosphingolipid and LPA receptors
  • C9orf108
  • C9orf47
  • CHEDG1
  • EDG1
  • EDG2
  • EDG3
  • EDG4
  • EDG5
  • EDG6
  • EDG7
  • EDG8
  • GPR92
  • GPR93
  • KIAA0455
  • LPA1
  • LPA2
  • LPA3
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR5
  • LPPR1
  • LPPR2
  • LPPR3
  • LPPR4
  • LPPR5
  • PAP2D
  • PHP1
  • PHP2
  • PLPPR1
  • PLPPR2
  • PLPPR3
  • PLPPR4
  • PLPPR5
  • PRG1
  • PRG2
  • PRG3
  • PRG4
  • PRG5
  • S1PR1
  • S1PR2
  • S1PR3
  • S1PR4
  • S1PR5
Homo sapiens (human)
Regulation of gene expression in beta cells
  • AN2
  • BHLHA3
  • FKHR
  • FOXA2
  • FOXA3
  • FOXO1
  • FOXO1A
  • GCK
  • GLUT2
  • HNF1A
  • HNF3B
  • HNF3G
  • HNF4G
  • IAPP
  • INS
  • IPF1
  • MAFA
  • NEUROD
  • NEUROD1
  • NKX2-2
  • NKX2.2
  • NKX2B
  • NKX6-1
  • NKX6A
  • NR2A2
  • PAX6
  • PDX1
  • RFX6
  • RFXDC1
  • SLC2A2
  • STF1
  • TCF1
  • TCF3B
  • TCF3G
Homo sapiens (human)
TWIK related potassium channel (TREK)
  • KCNK10
  • KCNK2
  • KCNK4
  • TRAAK
  • TREK
  • TREK1
  • TREK2
Homo sapiens (human)
Polo-like kinase mediated events
  • BARA
  • BMYB
  • C14orf46
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC25A
  • CDC25C
  • CENPF
  • CXCDC1
  • EP300
  • FKHL16
  • FOXM1
  • HFH11
  • KIAA2037
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • MPP2
  • MYBL2
  • MYT1
  • P300
  • PKMYT1
  • PLK
  • PLK1
  • RBAP48
  • RBBP4
  • TGS
  • WEE1
  • WIN
Homo sapiens (human)
Activation of NIMA Kinases NEK9, NEK6, NEK7
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • KIAA1995
  • NEK6
  • NEK7
  • NEK8
  • NEK9
  • NERCC
  • P34CDC2
  • PLK
  • PLK1
Homo sapiens (human)
G2/M DNA replication checkpoint
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • MYT1
  • P34CDC2
  • PKMYT1
  • WEE1
Homo sapiens (human)
Condensation of Prometaphase Chromosomes
  • BRRN
  • BRRN1
  • CAPC
  • CAPD2
  • CAPE
  • CAPG
  • CAPH
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CNAP1
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • G5A
  • KIAA0074
  • KIAA0159
  • NCAPD2
  • NCAPG
  • NCAPH
  • NYMEL3
  • P34CDC2
  • SMC2
  • SMC2L1
  • SMC4
  • SMC4L1
Homo sapiens (human)
Pyrimidine catabolism
  • AGT2
  • AGXT2
  • BUP1
  • DNT1
  • DNT2
  • DPYD
  • DPYS
  • ECGF1
  • NT5
  • NT5C
  • NT5C1A
  • NT5E
  • NT5M
  • NTE
  • TYMP
  • UMPH2
  • UP
  • UPB1
  • UPP1
  • UPP2
Homo sapiens (human)
VLDLR internalisation and degradation
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • BZF1
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTC
  • CLTCL2
  • HIP9
  • HYPJ
  • IDOL
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • LXRA
  • LXRB
  • MYLIP
  • NARC1
  • NER
  • NR1H2
  • NR1H3
  • PCSK9
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UNR
  • VLDLR
Homo sapiens (human)
WNT5A-dependent internalization of FZD2, FZD5 and ROR2
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • C2orf31
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL2
  • FZD2
  • FZD5
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • NTRKR1
  • NTRKR2
  • ROR1
  • ROR2
  • WNT5A
Homo sapiens (human)
Nef Mediated CD8 Down-regulation
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ATP6V1H
  • CD8B
  • CD8B1
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • nef
Homo sapiens (human)
Nef Mediated CD4 Down-regulation
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARF1
  • ATP6V1H
  • CD4
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • LCK
  • nef
Homo sapiens (human)
Retrograde neurotrophin signalling
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTC
  • CLTCL2
  • CNSA2
  • DNAL4
  • DNM
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DYN2
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0820
  • KIAA0899
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NTRK1
  • SH3D2A
  • SH3GL2
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
Transport of organic anions
  • ARVP
  • AVP
  • KIAA0880
  • LST1
  • LST2
  • MCT7
  • MCT8
  • OATP
  • OATP1
  • OATP14
  • OATP1A2
  • OATP1B1
  • OATP1B3
  • OATP1C1
  • OATP2
  • OATP2A1
  • OATP2B1
  • OATP4A1
  • OATP4C1
  • OATP8
  • OATPB
  • OATPC
  • OATPE
  • OATPF
  • OATPX
  • SLC16A2
  • SLC21A12
  • SLC21A14
  • SLC21A2
  • SLC21A20
  • SLC21A3
  • SLC21A6
  • SLC21A8
  • SLC21A9
  • SLCO1A2
  • SLCO1B1
  • SLCO1B3
  • SLCO1C1
  • SLCO2A1
  • SLCO2B1
  • SLCO4A1
  • SLCO4C1
  • VP
  • XPCT
Homo sapiens (human)
Glutamate and glutamine metabolism
  • CCBL1
  • FAM80A
  • FAM80B
  • GA
  • GLNS
  • GLS
  • GLS1
  • GLS2
  • GLUD
  • GLUD1
  • GLUD2
  • GLUDP1
  • GLUL
  • GOT2
  • KIAA0838
  • KIAA1238
  • KYAT1
  • KYAT4
  • OAT
  • PYCR1
  • PYCR2
  • PYCR3
  • PYCRL
  • RIMKLA
  • RIMKLB
Homo sapiens (human)
Signaling by plasma membrane FGFR1 fusions
  • BAG4
  • BFGFR
  • C8orf2
  • CEK
  • ERLIN2
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FLG
  • FLT2
  • HBGFR
  • SODD
  • SPFH2
Homo sapiens (human)
SLIT2:ROBO1 increases RHOA activity
  • ARH12
  • ARHA
  • DUTT1
  • MYO9B
  • MYR5
  • RHO12
  • RHOA
  • ROBO1
  • SLIL3
  • SLIT2
Homo sapiens (human)
Synthesis of UDP-N-acetyl-glucosamine
  • AGM1
  • AMDHD2
  • GFAT
  • GFPT
  • GFPT1
  • GFPT2
  • GNA1
  • GNPNAT1
  • NAGK
  • PGM3
  • RENBP
  • SPAG2
  • UAP1
Homo sapiens (human)
Recognition of DNA damage by PCNA-containing replication complex
  • CDT2
  • CDW1
  • CHRAC17
  • CUL4A
  • CUL4B
  • DCAF2
  • DDB1
  • DPE2
  • DTL
  • KIAA0039
  • KIAA0695
  • KIAA1449
  • L2DTL
  • PCNA
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POLE
  • POLE1
  • POLE2
  • POLE3
  • POLE4
  • RAD18
  • RAD6B
  • RAMP
  • RBX1
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RNF73
  • RNF75
  • ROC1
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • UAF1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH1
  • UBE2B
  • USP1
  • WDR48
  • XAP1
Homo sapiens (human)
Synthesis of glycosylphosphatidylinositol (GPI)
  • DCRC
  • DPM2
  • DSCR5
  • DSCRC
  • GPI2
  • GPI7
  • MCD4
  • PIGA
  • PIGB
  • PIGC
  • PIGF
  • PIGG
  • PIGH
  • PIGL
  • PIGM
  • PIGN
  • PIGO
  • PIGP
  • PIGV
  • PIGW
  • PIGX
  • PIGY
  • PIGZ
  • SMP3
Homo sapiens (human)
Regulation of TP53 Activity through Acetylation
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • BP75
  • BR140
  • BRD1
  • BRD7
  • BRL
  • BRPF1
  • BRPF2
  • BRPF3
  • C1orf149
  • CELTIX1
  • CENP-28
  • CHD3
  • CHD4
  • EAF6
  • EP300
  • GATAD2A
  • GATAD2B
  • HDAC1
  • HDAC2
  • ING5
  • KAT6A
  • KIAA1150
  • KIAA1286
  • MBD3
  • MEAF6
  • MOZ
  • MTA1L1
  • MTA2
  • MYL
  • MYST3
  • P300
  • P53
  • PID
  • PKB
  • PKBG
  • PML
  • PP8675
  • RAC
  • RBAP46
  • RBAP48
  • RBBP4
  • RBBP7
  • RNF71
  • RPD3L1
  • RUNXBP2
  • TP53
  • TRIM19
  • ZNF220
Homo sapiens (human)
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
  • BBC1
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DDOST
  • DXS648E
  • EC45
  • FAU
  • FTE1
  • KIAA0102
  • KIAA0115
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • NEDD6
  • OST48
  • QM
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPN1
  • RPN2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SEC11A
  • SEC11C
  • SEC11L1
  • SEC11L3
  • SEC61A
  • SEC61A1
  • SEC61A2
  • SEC61B
  • SEC61G
  • SPC12
  • SPC18
  • SPC21
  • SPC22
  • SPC25
  • SPCS1
  • SPCS2
  • SPCS3
  • SPCS4A
  • SPCS4C
  • SRP14
  • SRP19
  • SRP54
  • SRP68
  • SRP72
  • SRP9
  • SRPR
  • SRPRA
  • SRPRB
  • SSR1
  • SSR2
  • SSR3
  • SSR4
  • SURF-3
  • SURF3
  • TRAM
  • TRAM1
  • TRAPA
  • TRAPB
  • TRAPD
  • TRAPG
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
FGFR3b ligand binding and activation
  • FGF1
  • FGF18
  • FGF20
  • FGF9
  • FGFA
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024