GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 901 - 925 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Defective SLC22A5 causes systemic primary carnitine deficiency (CDSP)
  • OCTN2
  • SLC22A5
Homo sapiens (human)
Cholesterol biosynthesis
  • 17HSD7
  • ACAT2
  • ACTL
  • ANG1
  • ARV1
  • BHLHD1
  • BHLHD2
  • CYP51
  • CYP51A1
  • DESP4
  • DHCR24
  • ERG1
  • ERG25
  • FDFT1
  • FDPS
  • FPS
  • GGPS1
  • H105E3
  • HMGCS
  • HMGCS1
  • HSD17B7
  • IDI1
  • IDI2
  • KIAA0018
  • KIAA1293
  • LBR
  • LSS
  • MPD
  • MSMO1
  • MVD
  • MVK
  • NSDHL
  • OSC
  • PDP1
  • PLPP6
  • PMKI
  • PMVK
  • PPAPDC2
  • SC4MOL
  • SDR37C1
  • SQLE
  • SREBF1
  • SREBF2
  • SREBP1
  • SREBP2
  • TM7SF2
Homo sapiens (human)
Iron uptake and transport
  • ABCG2
  • ABCP
  • ACO1
  • BCRP
  • BCRP1
  • BOCT
  • BOIT
  • CAND1
  • CP
  • CUL1
  • CYBRD1
  • DCT1
  • DCYTB
  • DMT1
  • EMC19
  • FBL4
  • FBL5
  • FBXL5
  • FLR1
  • FPN
  • FPN1
  • FRRS3
  • FTH
  • FTH1
  • FTHL6
  • FTL
  • FTMT
  • G21
  • GLRX3
  • HCP1
  • HEPH
  • HMOX1
  • HMOX2
  • HNL
  • HO
  • HO1
  • HO2
  • IREB1
  • IREB2
  • IREG1
  • KIAA0698
  • KIAA0829
  • LCN2
  • MXR
  • NEDD8
  • NGAL
  • NRAMP2
  • OCP2
  • PCFT
  • PICOT
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SLC11A2
  • SLC11A3
  • SLC22A17
  • SLC40A1
  • SLC46A1
  • TCEB1L
  • TF
  • TIP120
  • TIP120A
  • TXNL2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Formation of ATP by chemiosmotic coupling
  • ATP5A
  • ATP5A1
  • ATP5AL2
  • ATP5B
  • ATP5C
  • ATP5C1
  • ATP5CL1
  • ATP5D
  • ATP5E
  • ATP5F1
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5F1D
  • ATP5F1E
  • ATP5G1
  • ATP5G2
  • ATP5G3
  • ATP5H
  • ATP5I
  • ATP5J
  • ATP5J2
  • ATP5JL
  • ATP5K
  • ATP5L
  • ATP5MC1
  • ATP5MC2
  • ATP5MC3
  • ATP5ME
  • ATP5MF
  • ATP5MG
  • ATP5O
  • ATP5PB
  • ATP5PD
  • ATP5PF
  • ATP5PO
  • ATP5S
  • ATP6
  • ATP8
  • ATPASE6
  • ATPASE8
  • ATPM
  • ATPMB
  • ATPO
  • ATPSB
  • ATPW
  • DMAC2L
  • MT-ATP6
  • MT-ATP8
  • MTATP6
  • MTATP8
Homo sapiens (human)
Carnitine synthesis
  • ALDH4
  • ALDH7
  • ALDH9
  • ALDH9A1
  • BBH
  • BBOX
  • BBOX1
  • SHMT1
  • TMLH
  • TMLHE
Homo sapiens (human)
Formation of Incision Complex in GG-NER
  • ADPRT
  • ADPRT2
  • ADPRTL2
  • ALC1
  • BLU
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CALT
  • CAP35
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • CEN2
  • CETN2
  • CHD1L
  • CUL4A
  • CUL4B
  • DDB1
  • DDB2
  • DDXBP1
  • ERCC1
  • ERCC11
  • ERCC2
  • ERCC3
  • ERCC4
  • ERCC5
  • ERCM2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • KIAA0695
  • MAT1
  • MMS2
  • MNAT1
  • MO15
  • PARP1
  • PARP2
  • PIAS1
  • PIAS3
  • PPOL
  • RAD23A
  • RAD23B
  • RBX1
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RNF111
  • RNF66
  • RNF75
  • ROC1
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • SMT3A
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • STK1
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • TTDA
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBE2I
  • UBE2N
  • UBE2V2
  • UBL1
  • UEV2
  • USP45
  • XAP1
  • XPA
  • XPAC
  • XPB
  • XPBC
  • XPC
  • XPCC
  • XPD
  • XPDC
  • XPF
  • XPG
  • XPGC
Homo sapiens (human)
SUMOylation of intracellular receptors
  • AD4BP
  • AR
  • DDXBP1
  • DHTR
  • ERBA2
  • ESR
  • ESR1
  • FTZF1
  • GRL
  • HDAC4
  • KIAA0288
  • LXRB
  • MCR
  • MLR
  • NER
  • NOT
  • NR1A2
  • NR1B1
  • NR1C1
  • NR1C3
  • NR1F1
  • NR1H2
  • NR1I1
  • NR2B1
  • NR2C1
  • NR3A1
  • NR3C1
  • NR3C2
  • NR3C3
  • NR3C4
  • NR4A2
  • NR5A1
  • NURR1
  • PGR
  • PIAS1
  • PIAS3
  • PIAS4
  • PIASG
  • PPAR
  • PPARA
  • PPARG
  • RARA
  • RORA
  • RXRA
  • RZRA
  • SF1
  • SMT3A
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • THR1
  • THRB
  • TINUR
  • TR2
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
  • UNR
  • VDR
Homo sapiens (human)
CD28 dependent Vav1 pathway
  • CD28
  • CD28LG
  • CD28LG1
  • CD28LG2
  • CD80
  • CD86
  • CDC42
  • FYN
  • LAB7
  • LCK
  • OPHN3
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • RAC1
  • TC25
  • VAV
  • VAV1
Homo sapiens (human)
Effects of PIP2 hydrolysis
  • CDC25L
  • DAGK
  • DAGK1
  • DAGK2
  • DAGK3
  • DAGK4
  • DAGK5
  • DAGK6
  • DGKA
  • DGKB
  • DGKD
  • DGKE
  • DGKG
  • DGKH
  • DGKI
  • DGKK
  • DGKQ
  • DGKZ
  • INSP3R1
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KIAA0145
  • KIAA0718
  • MCG7
  • PKCD
  • PKCE
  • PKCL
  • PRKCD
  • PRKCE
  • PRKCH
  • PRKCL
  • PRKCQ
  • PRKCT
  • RASGRP
  • RASGRP1
  • RASGRP2
  • TRP3
  • TRP6
  • TRP7
  • TRPC3
  • TRPC6
  • TRPC7
Homo sapiens (human)
The retinoid cycle in cones (daylight vision)
  • AWAT2
  • BCP
  • CRALBP
  • DC4
  • DGAT2L4
  • DHRS3
  • GCP
  • MFAT
  • OPN1LW
  • OPN1MW
  • OPN1SW
  • RBP3
  • RCP
  • RDH17
  • RLBP1
  • SDR16C1
  • WS
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodeling of DAG and TAG
  • ADPN
  • AGRP1
  • ATGL
  • AWAT2
  • C22orf20
  • DC3
  • DC4
  • DGAT
  • DGAT1
  • DGAT2
  • DGAT2L4
  • DGAT2L6
  • MFAT
  • MGLL
  • PNPLA2
  • PNPLA3
  • WS
Homo sapiens (human)
Triglyceride biosynthesis
  • AGMO
  • AGRP1
  • DC2
  • DC5
  • DC7
  • DGAT
  • DGAT1
  • DGAT2
  • DGAT2L1
  • DGAT2L5
  • DGAT2L7
  • GK
  • GK2
  • GK3
  • GK3P
  • GKP2
  • GKP3
  • GKTA
  • GKTB
  • GPAM
  • GPAT1
  • GPAT2
  • KIAA0188
  • KIAA0249
  • KIAA1560
  • LIPN3L
  • LPIN1
  • LPIN2
  • LPIN3
  • MOGAT1
  • MOGAT2
  • MOGAT3
  • TMEM195
Homo sapiens (human)
GABA B receptor activation
  • GABBR1
  • GABBR2
  • GPR51
  • GPRC3A
  • GPRC3B
Homo sapiens (human)
Metabolism of folate and pterines
  • ALDH1L1
  • ALDH1L2
  • DHFR
  • DHFR2
  • DHFRL1
  • DHFRP4
  • FLOT1
  • FOLR2
  • FTHFD
  • FTHFSDC1
  • G21
  • HCP1
  • MFT
  • MFTC
  • MTHFC
  • MTHFD
  • MTHFD1
  • MTHFD1L
  • MTHFD2
  • MTHFD2L
  • MTHFR
  • MTHFS
  • NMDMC
  • PCFT
  • RFC1
  • SHMT1
  • SHMT2
  • SLC19A1
  • SLC25A32
  • SLC46A1
Homo sapiens (human)
Synthesis of bile acids and bile salts via 27-hydroxycholesterol
  • AKR1C1
  • AKR1C2
  • AKR1C3
  • AKR1C4
  • AKR1D1
  • BAR
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • CHDR
  • CYP12
  • CYP27
  • CYP27A1
  • CYP7
  • CYP7A1
  • CYP7B1
  • CYP8
  • CYP8A1
  • CYP8B1
  • DDH
  • DDH1
  • DDH2
  • FXR
  • HRR1
  • HSD17B5
  • HSD3B7
  • KIAA0119
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • NR2B1
  • PGFS
  • PTGIS
  • RIP14
  • RXRA
  • SRC1
  • SRC2
  • SRD5B1
  • TIF2
Homo sapiens (human)
Synthesis of bile acids and bile salts
  • BAR
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • CH25H
  • CYP7
  • CYP7A1
  • CYP7B1
  • FXR
  • HRR1
  • KIAA0704
  • KIAA0772
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • NR2B1
  • ORP1
  • ORP2
  • ORP3
  • ORP6
  • ORP7
  • ORP9
  • OSBP
  • OSBP1
  • OSBP3
  • OSBP4
  • OSBP8
  • OSBPL1
  • OSBPL1A
  • OSBPL1B
  • OSBPL2
  • OSBPL3
  • OSBPL6
  • OSBPL7
  • OSBPL9
  • RIP14
  • RXRA
  • SRC1
  • SRC2
  • TIF2
Homo sapiens (human)
Abnormal conversion of 2-oxoglutarate to 2-hydroxyglutarate
  • IDH1
  • PICD
Homo sapiens (human)
NFE2L2 regulating TCA cycle genes
  • IDH1
  • ME1
  • NFE2L2
  • NRF2
  • PICD
Homo sapiens (human)
NADPH regeneration
  • ACO1
  • IDH1
  • IREB1
  • PICD
Homo sapiens (human)
Kandutsch-Russell pathway
  • D7SR
  • DHCR24
  • DHCR7
  • EBP
  • KIAA0018
  • SC5D
  • SC5DL
Homo sapiens (human)
Bloch pathway
  • D7SR
  • DHCR24
  • DHCR7
  • EBP
  • KIAA0018
  • SC5D
  • SC5DL
Homo sapiens (human)
Response of EIF2AK1 (HRI) to heme deficiency
  • ASNS
  • ATF3
  • ATF4
  • ATF5
  • ATFX
  • BOTCH
  • C20orf97
  • CEBPB
  • CEBPG
  • CHAC1
  • CHOP
  • CHOP10
  • CREB2
  • DDIT3
  • EIF2A
  • EIF2AK1
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • GADD153
  • GADD34
  • GRB10
  • GRBIR
  • HRI
  • KIAA0207
  • KIAA1369
  • NIPK
  • PPP1R15A
  • SKIP3
  • TCF5
  • TRB3
  • TRIB3
  • TS11
  • TXREB
Homo sapiens (human)
Prednisone ADME
  • ABCB1
  • AKR1C1
  • ALB
  • CBG
  • CYP3A3
  • CYP3A4
  • DDH
  • DDH1
  • GNT1
  • HSD11
  • HSD11B1
  • HSD11B2
  • HSD11K
  • HSD11L
  • MDR1
  • PGY1
  • SDR26C1
  • SDR9C3
  • SERPINA6
  • UGT1
  • UGT1A3
  • UGT2B17
  • UGT2B7
  • UGTB2B9
Homo sapiens (human)
CD28 co-stimulation
  • CD28
  • CD28LG
  • CD28LG1
  • CD28LG2
  • CD80
  • CD86
  • FYN
  • GADS
  • GRAP2
  • GRB2L
  • GRID
  • JTK8
  • LAB7
  • LCK
  • LYN
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • ACE
  • ACE2
  • AGT
  • ANPEP
  • APN
  • ATP6AP2
  • ATP6IP2
  • CAPER
  • CD13
  • CES1
  • CES2
  • CGL2
  • CMA1
  • CPA3
  • CPB
  • CPB1
  • CPB2
  • CPSD
  • CTSD
  • CTSG
  • CTSGL2
  • CTSZ
  • CYH
  • CYM
  • DCP
  • DCP1
  • ELDF10
  • ENPEP
  • EPN
  • GZMH
  • MME
  • PCPB
  • PEPN
  • REN
  • SERPINA8
  • SES1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024