GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1201 - 1225 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
MyD88 dependent cascade initiated on endosome
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK4
  • MYD88
  • RNF85
  • TLR7
  • TLR9
  • TRAF6
Homo sapiens (human)
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation
  • ECSIT
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK4
  • MAP3K1
  • MAPKKK1
  • MEKK
  • MEKK1
  • MYD88
  • RNF85
  • TLR7
  • TLR9
  • TRAF6
Homo sapiens (human)
MyD88 cascade initiated on plasma membrane
  • ECSIT
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK4
  • MAP3K1
  • MAPKKK1
  • MEKK
  • MEKK1
  • MYD88
  • RNF85
  • TIL3
  • TLR10
  • TLR5
  • TRAF6
  • flaF
  • fliC
  • hag
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-1 activates/modulates innate immune responses
  • 1a
  • 3a
  • 3b
  • 6
  • 7a
  • 8b
  • 9b
  • AML1
  • ASC
  • BST2
  • C1orf7
  • CAP-1
  • CARD5
  • CASP1
  • CBFA2
  • CIAS1
  • COLEC7
  • CRAF1
  • CYP20
  • CYPA
  • CYPB
  • CYPH
  • DAK
  • DDX58
  • DSCR1L2
  • E
  • EFP
  • ERIS
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • IFIH1
  • IKBA
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • IPS1
  • IRAK2
  • IRF3
  • ITCH
  • KIAA0151
  • KIAA0220
  • KIAA0719
  • KIAA1271
  • KPNA2
  • KPNB1
  • M
  • MAD3
  • MAVS
  • MDA5
  • MITA
  • N
  • NAK
  • NALP3
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NLRP3
  • NMI
  • NPIPB3
  • NPIPL3
  • NTF97
  • PCBP2
  • PPIA
  • PPIB
  • PPIG
  • PPIH
  • PSPD
  • PYCARD
  • PYPAF1
  • RCAN3
  • RCH1
  • RELA
  • RH116
  • RIGI
  • RIP3
  • RIPK3
  • RNF147
  • RNF85
  • RPS27A
  • RUNX1
  • S
  • SFTP4
  • SFTPD
  • SIKE
  • SIKE1
  • SRP1
  • STING
  • STING1
  • TBK1
  • TKFC
  • TLR7
  • TMEM173
  • TMS1
  • TOM70
  • TOMM70
  • TOMM70A
  • TRAF3
  • TRAF6
  • TRAFAMN
  • TRIM25
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VISA
  • ZNF147
  • rep
  • sM
Homo sapiens (human)
IRAK2 mediated activation of TAK1 complex
  • IRAK2
  • KIAA0733
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • RNF85
  • RPS27A
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
activated TAK1 mediates p38 MAPK activation
  • BLU
  • CARD15
  • CARD4
  • CARDIAK
  • CROC1
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • FIP3
  • IKBKG
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • KIAA0733
  • MAP2K3
  • MAP2K6
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPKAPK2
  • MAPKAPK3
  • MEK3
  • MEK6
  • MKK3
  • MKK6
  • MXI2
  • NEMO
  • NOD1
  • NOD2
  • PRKM11
  • PRKMK3
  • PRKMK6
  • RICK
  • RIP2
  • RIPK2
  • RNF85
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SKK2
  • SKK3
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
Invadopodia formation
  • ADAM12
  • ADAM15
  • ADAM19
  • FISH
  • KIAA0418
  • MDC15
  • MLTN
  • MLTNB
  • SH3MD1
  • SH3PXD2A
  • TKS5
Homo sapiens (human)
RA biosynthesis pathway
  • ADH1
  • ADH1A
  • ADH1C
  • ADH2
  • ADH3
  • ADH4
  • AKR1C3
  • ALDC
  • ALDH1
  • ALDH12
  • ALDH1A1
  • ALDH1A2
  • ALDH1A3
  • ALDH6
  • ALDH8A1
  • ARSDR1
  • CRABP1
  • CYP26
  • CYP26A1
  • CYP26A2
  • CYP26B1
  • CYP26C1
  • DDH1
  • DHRS3
  • DHRS4
  • DHRS9
  • HSD17B5
  • HSD17B9
  • KIAA0119
  • P450RAI1
  • P450RAI2
  • PAN2
  • PGFS
  • PSDR1
  • PUMB1
  • RALDH2
  • RBP5
  • RDH1
  • RDH10
  • RDH11
  • RDH13
  • RDH14
  • RDH15
  • RDH16
  • RDH17
  • RDH5
  • RDHE2
  • RODH4
  • SDR16C1
  • SDR16C4
  • SDR16C5
  • SDR25C2
  • SDR7C1
  • SDR7C3
  • SDR7C4
  • SDR9C4
  • SDR9C5
  • SDR9C8
Homo sapiens (human)
N-Glycan antennae elongation
  • B4GALT1
  • B4GALT2
  • B4GALT3
  • B4GALT4
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • CGS23
  • GGNT5
  • GGTB2
  • MGAT4A
  • MGAT4B
  • MGAT4C
  • MGAT5
  • NANTA3
  • SIAT1
  • SIAT4C
  • SIAT8B
  • SIAT8C
  • SIAT8F
  • ST3GAL4
  • ST6GAL1
  • ST8SIA2
  • ST8SIA3
  • ST8SIA6
  • STX
  • STZ
Homo sapiens (human)
SIRT1 negatively regulates rRNA expression
  • GTF2D1
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST4H4
  • JOSD3
  • KIAA0409
  • KMT1A
  • NML
  • RRP8
  • SIR2L1
  • SIRT1
  • SUV39H
  • SUV39H1
  • TAF1A
  • TAF1B
  • TAF1C
  • TAF1D
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TSH2B
Homo sapiens (human)
Sema4D mediated inhibition of cell attachment and migration
  • ARH12
  • ARHA
  • ARHGAP35
  • C9orf164
  • CD100
  • GRF1
  • GRLF1
  • KIAA0407
  • KIAA1722
  • MET
  • P190A
  • PLXN5
  • PLXNB1
  • RAC1
  • RHO12
  • RHO6
  • RHOA
  • RND1
  • RRAS
  • SEMA4D
  • SEMAJ
  • SEP
  • TC25
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
Oxidative demethylation of DNA
  • CXXC6
  • KIAA0401
  • KIAA1546
  • KIAA1676
  • LCX
  • TDG
  • TET1
  • TET2
  • TET3
Homo sapiens (human)
Modulation by Mtb of host immune system
  • B2M
  • CLEC13D
  • CLEC13DL
  • MRC1
  • MRC1L1
  • RPS27A
  • Rv2779c
  • TIL4
  • TLR2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • esaT6
  • esxA
  • mptpA
  • phoS1
  • pstS1
  • ptpA
Homo sapiens (human)
Ca activated K+ channels
  • IK1
  • IKCA1
  • K3
  • KCA4
  • KCNMA
  • KCNMA1
  • KCNMB1
  • KCNMB2
  • KCNMB3
  • KCNMB4
  • KCNMBL
  • KCNN1
  • KCNN2
  • KCNN3
  • KCNN4
  • SK
  • SK4
  • SLO
Homo sapiens (human)
The NLRP3 inflammasome
  • A4
  • AD1
  • APP
  • ASC
  • C1orf7
  • CARD5
  • CASP1
  • CD2BP1
  • CIAS1
  • HMOX1
  • HO
  • HO1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCB
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • LYT10
  • MEF
  • MEFV
  • MRS1
  • NALP3
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • NLRP3
  • P2RX7
  • PANX1
  • PSTPIP1
  • PYCARD
  • PYPAF1
  • RELA
  • SUGT1
  • TMS1
  • TRDX
  • TRIM20
  • TRX
  • TRX1
  • TXN
  • TXNIP
  • VDUP1
  • hla
  • hly
Homo sapiens (human)
Purinergic signaling in leishmaniasis infection
  • ASC
  • AZ3B
  • C1orf7
  • C3
  • C3AR1
  • C3R1
  • CARD5
  • CASP1
  • CD2BP1
  • CD39
  • CD39L4
  • CIAS1
  • CPAMD1
  • CTSG
  • DFNA5L
  • ENTPD1
  • ENTPD5
  • GSDMD
  • GSDMDC1
  • HMOX1
  • HNFAG09
  • HO
  • HO1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCB
  • IGIF
  • IL18
  • IL1A
  • IL1B
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • IL1F1
  • IL1F2
  • IL1F4
  • LYT10
  • MEF
  • MEFV
  • NALP3
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • NLRP3
  • NT5
  • NT5E
  • NTE
  • P2RX4
  • P2RX7
  • PCPH
  • PSTPIP1
  • PYCARD
  • PYPAF1
  • RELA
  • SUGT1
  • TMS1
  • TRDX
  • TRIM20
  • TRX
  • TRX1
  • TXN
  • TXNIP
  • VDUP1
Homo sapiens (human)
Platelet homeostasis
  • P2RX1
  • P2RX2
  • P2RX3
  • P2RX4
  • P2RX5
  • P2RX6
  • P2RX7
  • P2RXL1
  • P2X1
  • P2X2
  • P2X5
  • P2X5FL
  • P2X6
  • PAFAH2
Homo sapiens (human)
Elevation of cytosolic Ca2+ levels
  • C7orf19
  • CBCIP2
  • CRACM1
  • GOK
  • INSP3R1
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • ORAI1
  • ORAI2
  • P2RX1
  • P2RX2
  • P2RX3
  • P2RX4
  • P2RX5
  • P2RX6
  • P2RX7
  • P2RXL1
  • P2X1
  • P2X2
  • P2X5
  • P2X5FL
  • P2X6
  • STIM1
  • TMEM142A
  • TMEM142B
  • TRP3
  • TRP6
  • TRP7
  • TRPC3
  • TRPC6
  • TRPC7
Homo sapiens (human)
NOTCH3 Intracellular Domain Regulates Transcription
  • BHLHB31
  • BHLHB32
  • BHLHB33
  • BHLHB38
  • BHLHB39
  • BLBP
  • CBP
  • CG1
  • CHF1
  • CHF2
  • CREBBP
  • CXorf6
  • DLG7
  • DLGAP5
  • EP300
  • FABP7
  • FABPB
  • GCN5
  • GCN5L2
  • GRL
  • HERP
  • HERP1
  • HERP2
  • HES1
  • HES5
  • HESR1
  • HEY1
  • HEY2
  • HEYL
  • HL
  • HRT1
  • HRT2
  • HRT3
  • HRY
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0008
  • KIAA0200
  • KIAA0620
  • KIAA0869
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • KIBRA
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • MRG
  • NOTCH1
  • NOTCH3
  • P300
  • PBX1
  • PCAF
  • PLXND1
  • PRL
  • PTCRA
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • SKIIP
  • SKIP
  • SNW1
  • STAT1
  • TAN1
  • WWC1
Homo sapiens (human)
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC
  • 8
  • ABCB2
  • ABCB3
  • APPILS
  • ARTS1
  • ATG14
  • ATG14L
  • B2M
  • BECN1
  • CALR
  • CANX
  • CRTC
  • D3S1231E
  • ERAP1
  • ERAP2
  • ERP57
  • ERP60
  • GRP58
  • GRP78
  • GT197
  • HLA-5.4
  • HLA-6.0
  • HLA-6.2
  • HLA-A
  • HLA-B
  • HLA-C
  • HLA-E
  • HLA-F
  • HLA-G
  • HLA-H
  • HLAA
  • HLAB
  • HLAC
  • HLAE
  • HLAF
  • HLAG
  • HLAH
  • HSPA5
  • KIAA0079
  • KIAA0525
  • KIAA0755
  • KIAA0831
  • KIAA0905
  • LRAP
  • NGS17
  • PDIA3
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PSF1
  • PSF2
  • RING11
  • RING4
  • SAR1B
  • SARA2
  • SARB
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SEC31L1
  • TAP1
  • TAP2
  • TAPA
  • TAPBP
  • VPS15
  • VPS34
  • Y1
  • Y3
Homo sapiens (human)
Activation of PKB
  • AKT2
  • C20orf97
  • CTMP
  • NIPK
  • PDK1
  • PDPK1
  • SKIP3
  • THEM4
  • TRB3
  • TRIB3
Homo sapiens (human)
RSK activation
  • ERK1
  • ERK2
  • ISPK1
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPKAPK1A
  • MAPKAPK1B
  • MAPKAPK1C
  • PDK1
  • PDPK1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RPS6KA1
  • RPS6KA2
  • RPS6KA3
  • RPS6KA6
  • RSK1
  • RSK2
  • RSK3
  • RSK4
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-2 targets host intracellular signalling and regulatory pathways
  • 3a
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • CAV
  • CAV1
  • HME1
  • M
  • N
  • PDK1
  • PDPK1
  • PKB
  • PKBG
  • RAC
  • SFN
  • YWHA1
  • YWHAB
  • YWHAE
  • YWHAG
  • YWHAH
  • YWHAQ
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-1 targets host intracellular signalling and regulatory pathways
  • 3a
  • CAV
  • CAV1
  • DPC4
  • EP300
  • HME1
  • M
  • MADH3
  • MADH4
  • N
  • P300
  • PDK1
  • PDPK1
  • PSMC6
  • SFN
  • SMAD3
  • SMAD4
  • SP1
  • SUG2
  • TSFP1
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • YWHA1
  • YWHAB
  • YWHAE
  • YWHAG
  • YWHAH
  • YWHAQ
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
Estrogen-stimulated signaling through PRKCZ
  • ERK2
  • HRAS
  • HRAS1
  • MAPK1
  • NRAS
  • PDK1
  • PDPK1
  • PKC2
  • PRKCZ
  • PRKM1
  • PRKM2
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

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Last updated: August 19, 2024