GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1401 - 1425 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
Defective ALG11 causes CDG-1p
  • ALG11
  • GT8
Homo sapiens (human)
Defective ALG1 causes CDG-1k
  • ALG1
  • HMAT1
  • HMT1
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein
  • ALG1
  • ALG10
  • ALG10A
  • ALG10B
  • ALG11
  • ALG12
  • ALG13
  • ALG14
  • ALG2
  • ALG3
  • ALG6
  • ALG8
  • ALG9
  • CXorf45
  • DIBD1
  • DPAGT1
  • DPAGT2
  • GLT28D1
  • GT8
  • HMAT1
  • HMT1
  • KCR1
  • MPDU1
  • NOT
  • NOT56L
  • RFT1
Homo sapiens (human)
Choline catabolism
  • ALDH7A1
  • ATQ1
  • BHMT
  • CD92
  • CDW92
  • CHDH
  • CTL1
  • DMGDH
  • DMGDHL1
  • SARDH
  • SLC44A1
Homo sapiens (human)
Carnitine synthesis
  • ALDH4
  • ALDH7
  • ALDH9
  • ALDH9A1
  • BBH
  • BBOX
  • BBOX1
  • SHMT1
  • TMLH
  • TMLHE
Homo sapiens (human)
Proline catabolism
  • ALDH4
  • ALDH4A1
  • HSPOX1
  • HYPDH
  • P5CDH
  • PIG6
  • POX2
  • PRODH
  • PRODH2
Homo sapiens (human)
Metabolism of serotonin
  • ALDH2
  • ALDM
  • MAOA
Homo sapiens (human)
Metabolism of folate and pterines
  • ALDH1L1
  • ALDH1L2
  • DHFR
  • DHFR2
  • DHFRL1
  • DHFRP4
  • FLOT1
  • FOLR2
  • FTHFD
  • FTHFSDC1
  • G21
  • HCP1
  • MFT
  • MFTC
  • MTHFC
  • MTHFD
  • MTHFD1
  • MTHFD1L
  • MTHFD2
  • MTHFD2L
  • MTHFR
  • MTHFS
  • NMDMC
  • PCFT
  • RFC1
  • SHMT1
  • SHMT2
  • SLC19A1
  • SLC25A32
  • SLC46A1
Homo sapiens (human)
RND2 GTPase cycle
  • ALDH10
  • ALDH3A2
  • ANKRD26
  • ARHGAP1
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARHN
  • ARMS
  • BACURD1
  • BACURD2
  • BLTP3B
  • BP230
  • BP240
  • BPAG1
  • C6orf143
  • CAV
  • CAV1
  • CDC42GAP
  • CDHF4
  • CG1
  • CKAP4
  • CRIB1
  • DEPDC1B
  • DLG5
  • DMH
  • DRCC1
  • DSG1
  • DST
  • DT
  • ECK
  • EDP1
  • EPHA2
  • FALDH
  • FAM83B
  • FBP17
  • FNBP1
  • FRS2
  • FRS3
  • GOLGA3
  • GRB1
  • GRF1
  • GRLF1
  • HNRPG
  • IRAS
  • KCTD13
  • KIAA0004
  • KIAA0042
  • KIAA0147
  • KIAA0554
  • KIAA0583
  • KIAA0620
  • KIAA0701
  • KIAA0728
  • KIAA0975
  • KIAA1074
  • KIAA1215
  • KIAA1250
  • KIAA1722
  • KIDINS220
  • KIF14
  • KTN1
  • LANO
  • LAP4
  • LEMD3
  • LRRC1
  • MAN1
  • MUC13
  • NISCH
  • NUDC
  • P190A
  • PDIP1
  • PDLG
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKP4
  • PLXND1
  • PNP1
  • POLDIP1
  • PRAG1
  • PTP1E
  • PTPL1
  • PTPN13
  • RBMX
  • RBMXP1
  • RECC
  • RHO7
  • RHOGAP1
  • RHOGAP5
  • RND2
  • SCRB1
  • SCRIB
  • SGK223
  • SHIP164
  • SOC
  • STB1
  • STB2
  • TFRC
  • TNFAIP1
  • TRP32
  • TXL
  • TXNL
  • TXNL1
  • UBXD5
  • UBXN11
  • UHRF1BP1L
  • VANGL1
  • VANGL2
  • VARTUL
  • WDR6
  • XTP8
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
RND1 GTPase cycle
  • ALDH10
  • ALDH3A2
  • ANKRD26
  • APE
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARMS
  • BP230
  • BP240
  • BPAG1
  • C1orf8
  • C6orf143
  • CAV
  • CAV1
  • CCDC88A
  • CPD
  • DEPDC1B
  • DLG5
  • DMH
  • DRCC1
  • DSP
  • DST
  • DT
  • ECK
  • EPHA2
  • EPSTI1
  • ESA1
  • FALDH
  • FAM135A
  • FAM83B
  • FLOT2
  • FRS2
  • FRS3
  • GRB1
  • GRB7
  • GRDN
  • GRF1
  • GRLF1
  • HNRPG
  • KIAA0042
  • KIAA0583
  • KIAA0720
  • KIAA0728
  • KIAA1074
  • KIAA1212
  • KIAA1215
  • KIAA1250
  • KIAA1411
  • KIAA1722
  • KIDINS220
  • KIF14
  • LEMD3
  • M17S1
  • MAN1
  • MUC13
  • NGAP
  • NOV
  • P190A
  • PDLG
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKP4
  • PLEKHG5
  • PLXN1
  • PLXNA1
  • PNP1
  • PTP1E
  • PTPL1
  • PTPN13
  • RASAL2
  • RBMX
  • RBMXP1
  • RECC
  • RHO6
  • RHOGAP5
  • RND1
  • RRAS2
  • SCG10
  • SCGN10
  • SOC
  • STB1
  • STB2
  • STIP1
  • STMN2
  • TC21
  • TFRC
  • TMEM59
  • TRP32
  • TXL
  • TXNL
  • TXNL1
  • UBXD5
  • UBXN11
  • VANGL1
  • VANGL2
  • WDR6
  • XTP8
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
Hereditary fructose intolerance
  • ALDB
  • ALDOB
Homo sapiens (human)
Fructose catabolism
  • ALDB
  • ALDC
  • ALDH1
  • ALDH1A1
  • ALDOB
  • DAK
  • GLYCTK
  • HBEBP4
  • KHK
  • PUMB1
  • TKFC
Homo sapiens (human)
Gluconeogenesis
  • ALDA
  • ALDB
  • ALDC
  • ALDOA
  • ALDOB
  • ALDOC
  • C10orf134
  • ENO1
  • ENO1L1
  • ENO2
  • ENO3
  • ENO4
  • FBP
  • FBP1
  • FBP2
  • G3PP
  • G6PC
  • G6PC1
  • G6PC2
  • G6PC3
  • G6PT
  • G6PT1
  • GAPD
  • GAPD2
  • GAPDH
  • GAPDH2
  • GAPDHS
  • GAPDS
  • GPI
  • IGRP
  • MBPB1
  • MPB1
  • PC
  • PCK1
  • PCK2
  • PEPCK1
  • PEPCK2
  • PGAM1
  • PGAM2
  • PGAMA
  • PGAMM
  • PGK1
  • PGK2
  • PGKA
  • PGKB
  • SLC37A1
  • SLC37A4
  • TPI
  • TPI1
  • UGRP
Homo sapiens (human)
L1CAM interactions
  • ALCAM
  • APT2
  • AXT
  • CAML1
  • CD24
  • CD24A
  • CNTN1
  • CNTN2
  • CSPG3
  • DRT
  • EPHB2
  • EPHT3
  • EPTH3
  • ERK
  • GAP43
  • HEK5
  • L1CAM
  • LAMA
  • LAMA1
  • LAMB1
  • LAMB2
  • LAMC1
  • LYPLA2
  • MEMD
  • MIC5
  • NCAN
  • NEUR
  • RANBP9
  • RANBPM
  • TAG1
  • TAX1
  • TYRO5
Homo sapiens (human)
PDE3B signalling
  • AKT2
  • PDE3B
Homo sapiens (human)
Inhibition of TSC complex formation by PKB
  • AKT2
  • KIAA0243
  • TSC
  • TSC1
  • TSC2
  • TSC4
Homo sapiens (human)
Activation of PKB
  • AKT2
  • C20orf97
  • CTMP
  • NIPK
  • PDK1
  • PDPK1
  • SKIP3
  • THEM4
  • TRB3
  • TRIB3
Homo sapiens (human)
HSF1-dependent transactivation
  • AKT1S1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CRYA2
  • CRYAB
  • CRYAC
  • DNAJ1
  • DNAJB1
  • E2IG1
  • FRAP
  • FRAP1
  • FRAP2
  • GBL
  • HDJ1
  • HSBP1
  • HSC70
  • HSF1
  • HSF1BP
  • HSP22
  • HSP72
  • HSP73
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPA1
  • HSPA10
  • HSPA1A
  • HSPA1B
  • HSPA1L
  • HSPA8
  • HSPB5
  • HSPB8
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • HSPF1
  • HSTF1
  • HSX70
  • KIAA0968
  • KIAA1303
  • LST8
  • MLST8
  • MTOR
  • PRAS40
  • RAFT1
  • RAPT1
  • RAPTOR
  • RPTOR
Homo sapiens (human)
mTORC1-mediated signalling
  • AKT1S1
  • C11orf59
  • C7orf59
  • EEF2K
  • EIF4B
  • EIF4E
  • EIF4EBP1
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • FRAP
  • FRAP1
  • FRAP2
  • GBL
  • HBXIP
  • KIAA1303
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • LST8
  • MAP2K1IP1
  • MAPBPIP
  • MAPKSP1
  • MLST8
  • MTOR
  • PDRO
  • PRAS40
  • RAFT1
  • RAPT1
  • RAPTOR
  • RHEB
  • RHEB2
  • ROBLD3
  • RPS6
  • RPS6KB1
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SLC38A9
  • STK14A
  • URLC11
  • XIP
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
KSRP (KHSRP) binds and destabilizes mRNA
  • AKT1
  • CML28
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSL4
  • CSPB1
  • DAN
  • DCP2
  • DIS3
  • EXOSC1
  • EXOSC2
  • EXOSC3
  • EXOSC4
  • EXOSC5
  • EXOSC6
  • EXOSC7
  • EXOSC8
  • EXOSC9
  • FUBP2
  • KHSRP
  • KIAA0116
  • KIAA1008
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MTR3
  • MXI2
  • NUDT20
  • OIP2
  • PARN
  • PKB
  • PMSCL1
  • PRKM11
  • RAC
  • RRP4
  • RRP40
  • RRP41
  • RRP42
  • RRP43
  • RRP44
  • RRP46
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SKI6
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
Tetrahydrobiopterin (BH4) synthesis, recycling, salvage and regulation
  • AKT1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • DHFR
  • DYT5
  • GCH
  • GCH1
  • GCHFR
  • GFRP
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • NOS3
  • PKB
  • PRKG2
  • PRKGR2
  • PTS
  • RAC
  • SPR
Homo sapiens (human)
Negative regulation of NOTCH4 signaling
  • AKT1
  • C7orf76
  • CUL1
  • DSS1
  • EMC19
  • ERIC1
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IFI5111
  • INT3
  • KIAA0072
  • KIAA0107
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NOTCH4
  • NU
  • OCP2
  • PFAAP4
  • PKB
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSMF1
  • RAC
  • RBX1
  • RING10
  • RING12
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • SUG2
  • TACC3
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1L
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Y2
  • YWHAZ
  • Z
Homo sapiens (human)
Butyrate Response Factor 1 (BRF1) binds and destabilizes mRNA
  • AKT1
  • BERG36
  • BRF1
  • CML28
  • CSL4
  • DCP1A
  • DCP2
  • DIS3
  • ERF1
  • EXOSC1
  • EXOSC2
  • EXOSC3
  • EXOSC4
  • EXOSC5
  • EXOSC6
  • EXOSC7
  • EXOSC8
  • EXOSC9
  • KIAA0116
  • KIAA1008
  • MAPKAPK2
  • MTR3
  • NUDT20
  • OIP2
  • PKB
  • PMSCL1
  • RAC
  • RNF162B
  • RRP4
  • RRP40
  • RRP41
  • RRP42
  • RRP43
  • RRP44
  • RRP46
  • SEP1
  • SKI6
  • SMIF
  • TIS11B
  • XRN1
  • YWHAB
  • ZFP36L1
Homo sapiens (human)
Extra-nuclear estrogen signaling
  • AKT1
  • AREG
  • AREGB
  • BTC
  • C9orf108
  • C9orf47
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAV
  • CAV1
  • CAV2
  • CLG4A
  • CLG4B
  • DTR
  • DTS
  • EDG3
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB
  • ERBB1
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESTRB
  • FAK
  • FAK1
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI2B
  • GNAI3
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • GRB1
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HMT2
  • HRMT1L2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • IGF1R
  • IR1B4
  • MMP2
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP9
  • MPSL1
  • NOS3
  • NR3A1
  • NR3A2
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PKB
  • PRMT1
  • PTK2
  • PUMP1
  • RAC
  • S1PR3
  • SDGF
  • SK1
  • SPHK
  • SPHK1
  • SPK
  • SRC
  • SRC1
  • STMY1
  • STRN
  • TGFA
  • ZDHHC21
  • ZDHHC7
Homo sapiens (human)
PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
  • AKT1
  • AREG
  • AREGB
  • ARHG
  • BCAP
  • BTC
  • C9orf26
  • CD135
  • CD19
  • CD28
  • CD28LG
  • CD28LG1
  • CD28LG2
  • CD80
  • CD86
  • DER4
  • DIF2
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERBB2
  • EREG
  • ERK1
  • ERK2
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESTRB
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR4
  • FLK2
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • FYN
  • GAB1
  • GAB2
  • GGF
  • GRB1
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HER2
  • HGF
  • HGL
  • HPTA
  • HRGA
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • IER3
  • IEX1
  • IL1F11
  • IL1RL1
  • IL33
  • INS
  • INSR
  • INT2
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • JTK2
  • KGF
  • KIAA0044
  • KIAA0571
  • KIAA0589
  • KIT
  • KLB
  • KS3
  • LAB7
  • LCK
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • MLN19
  • MYD88
  • NDF
  • NEU
  • NFHEV
  • NGL
  • NR3A1
  • NR3A2
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRG4
  • NTAK
  • PDGF2
  • PDGFB
  • PDGFR
  • PDGFR1
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PI5P4KA
  • PIK3AP1
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PIP4K2A
  • PIP4K2B
  • PIP4K2C
  • PIP5K1A
  • PIP5K1B
  • PIP5K1C
  • PIP5K2
  • PIP5K2A
  • PIP5K2B
  • PIP5K2C
  • PKB
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PRG1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RAC
  • RAC1
  • RAC2
  • RHEPDGFRA
  • RHOG
  • RNF85
  • SCFR
  • SDGF
  • SHPTP2
  • SIS
  • SMDF
  • SRC
  • SRC1
  • ST2
  • STK1
  • STM7
  • STRN
  • T1
  • TC25
  • TCRIM
  • TGFA
  • TKF
  • TRAF6
  • TRAT1
  • VAV
  • VAV1
Homo sapiens (human)

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Acknowledgements

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Last updated: August 19, 2024