GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 126 - 150 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
APEX1-Independent Resolution of AP Sites via the Single Nucleotide Replacement Pathway
  • LIG3
  • MMH
  • MUTM
  • NEIL1
  • NEIL2
  • OGG1
  • OGH1
  • PNKP
  • POLB
  • XRCC1
Homo sapiens (human)
Inhibition of nitric oxide production
  • KPNA1
  • KPNB1
  • NOS2
  • NOS2A
  • NTF97
  • PPE2
  • RCH2
Homo sapiens (human)
RHOJ GTPase cycle
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARHGEF7
  • ARHJ
  • ARL13B
  • ARL2L1
  • ASCT2
  • BND7
  • BORG5
  • BT
  • C11orf59
  • C1orf39
  • CAV
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPA
  • CDC42BPB
  • CDC42EP1
  • CDC42GAP
  • CEP1
  • COOL1
  • CPNE8
  • CRIB1
  • CTNNG
  • DEPDC1B
  • DIAP3
  • DIAPH3
  • DOCK8
  • DP3
  • EPB72
  • FBP17
  • FHOD3
  • FMNL3
  • FNBP1
  • FNBP1L
  • FRL2
  • GBAS
  • GIT1
  • GIT2
  • GJA1
  • GJAL
  • GRAF
  • GRB1
  • GRF1
  • GRIT
  • GRLF1
  • IMD2
  • IQGAP3
  • JUP
  • KIAA0142
  • KIAA0147
  • KIAA0148
  • KIAA0451
  • KIAA0554
  • KIAA0621
  • KIAA0712
  • KIAA1124
  • KIAA1142
  • KIAA1415
  • KIAA1424
  • KIAA1722
  • KIAA2014
  • LAMTOR1
  • LAP2
  • LAP4
  • M7V1
  • MPP7
  • MSE55
  • NBC2
  • NBC2B
  • NBC3
  • NBCn1
  • NIPSNAP2
  • OCRL
  • OCRL1
  • OPHN1
  • OPHN1L
  • OPHN3
  • P190A
  • P85SPR
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PAK3BP
  • PAK4
  • PDRO
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIXB
  • PREX1
  • RAB7
  • RAB7A
  • RASL7B
  • RDR
  • RDRC
  • RHOGAP1
  • RHOGAP5
  • RHOI
  • RHOJ
  • RICS
  • SBC2
  • SCRB1
  • SCRIB
  • SLC1A5
  • SLC4A6
  • SLC4A7
  • SNAP23
  • STB2
  • STEAP3
  • STOM
  • SYB3
  • SYDE1
  • TCL
  • TFRC
  • TMPO
  • TOCA1
  • TRIO
  • TSAP6
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VARTUL
  • WAS
  • WASL
  • WBP3
  • WICH
  • WIPF2
  • WIRE
  • WWP2
  • XTP8
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
Processing of SMDT1
  • AFG3L2
  • BAP
  • C10orf42
  • C22orf32
  • C2orf47
  • CALC
  • CAR
  • CBARA1
  • CCDC109A
  • CCDC109B
  • CMAR
  • EFHA1
  • EFHA2
  • EMRE
  • FTSH1
  • INPP5E
  • KIAA0123
  • MAIP1
  • MCU
  • MCUB
  • MICU1
  • MICU2
  • MICU3
  • MPPA
  • MPPB
  • PARL
  • PGN
  • PHB
  • PHB1
  • PHB2
  • PMPCA
  • PMPCB
  • PSARL
  • REA
  • SLP2
  • SMDT1
  • SPG7
  • STOML2
  • YME1L
  • YME1L1
Homo sapiens (human)
IKK complex recruitment mediated by RIP1
  • API1
  • API2
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BLU
  • CD14
  • CHUK
  • CROC1
  • ESOP1
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • LY96
  • MD2
  • MIHB
  • MIHC
  • NEMO
  • PRVTIRB
  • PUBC1
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • RNF48
  • RNF49
  • RNF85
  • RPS27A
  • SFT
  • TCF16
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAF6
  • TRAM
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBC5A
  • UBC5B
  • UBC5C
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5B
  • UBCH5C
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
Regulation of actin dynamics for phagocytic cup formation
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL
  • ABL1
  • ACTB
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTR2
  • ACTR3
  • AF3P21
  • AGMX1
  • ARC16
  • ARC20
  • ARC21
  • ARC34
  • ARC41
  • ARGBPIA
  • ARP2
  • ARP3
  • ARPC1A
  • ARPC1B
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC4
  • ARPC5
  • ATK
  • BAIAP2
  • BPK
  • BRK1
  • BTK
  • C3orf10
  • CD16A
  • CD32
  • CD3G
  • CDC42
  • CED12A
  • CFL
  • CFL1
  • CR16
  • CRK
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DOCK1
  • ELMO1
  • ELMO2
  • ERK1
  • ERK2
  • FAK
  • FAK1
  • FCG1
  • FCG2
  • FCG3
  • FCGR1
  • FCGR1A
  • FCGR2A
  • FCGR2A1
  • FCGR3
  • FCGR3A
  • HEM1
  • HEM2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • IGFR1
  • IGFR2
  • IGFR3
  • IGHG1
  • IGHG2
  • IGHG3
  • IGHG4
  • IGHV
  • IGHV1-2
  • IGHV1-46
  • IGHV1-69
  • IGHV2-5
  • IGHV2-70
  • IGHV3-11
  • IGHV3-13
  • IGHV3-23
  • IGHV3-30
  • IGHV3-33
  • IGHV3-48
  • IGHV3-53
  • IGHV3-7
  • IGHV3-9
  • IGHV4-34
  • IGHV4-39
  • IGHV4-59
  • IGHV7-81
  • IGKC
  • IGKV1-12
  • IGKV1-16
  • IGKV1-17
  • IGKV1-33
  • IGKV1-39
  • IGKV1-5
  • IGKV1D-12
  • IGKV1D-16
  • IGKV1D-33
  • IGKV1D-39
  • IGKV2-28
  • IGKV2-29
  • IGKV2-30
  • IGKV2D-28
  • IGKV2D-30
  • IGKV2D-40
  • IGKV3-11
  • IGKV3-15
  • IGKV3-20
  • IGKV3D-20
  • IGKV4-1
  • IGKV5-2
  • IGLC1
  • IGLC2
  • IGLC3
  • IGLC6
  • IGLC7
  • IGLV
  • IGLV1-40
  • IGLV1-44
  • IGLV1-47
  • IGLV1-51
  • IGLV2-11
  • IGLV2-14
  • IGLV2-23
  • IGLV2-8
  • IGLV3-1
  • IGLV3-19
  • IGLV3-21
  • IGLV3-25
  • IGLV3-27
  • IGLV6-57
  • IGLV7-43
  • IMD2
  • JTK7
  • KIAA0068
  • KIAA0269
  • KIAA0281
  • KIAA0587
  • KIAA0799
  • KIAA0900
  • KIAA1168
  • KIAA1834
  • LIMK
  • LIMK1
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MYH12
  • MYH2
  • MYH9
  • MYHSA2
  • MYO10
  • MYO1C
  • MYO5A
  • MYO9B
  • MYR5
  • NAP1
  • NCK
  • NCK1
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NCKIPSD
  • NF2
  • PAK1
  • PIR121
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTK2
  • RAC1
  • SCAR1
  • SCAR3
  • SCH
  • SOP2L
  • SPIN90
  • SSH3BP1
  • SYK
  • T3G
  • TC25
  • V1-11
  • V1-13
  • V1-16
  • V1-20
  • V1-3
  • V1-5
  • V1-7
  • V1-9
  • V2-11
  • V2-15
  • V2-17
  • V2-19
  • V2-8
  • V3-2
  • V3-3
  • V3-4
  • V4-1
  • V4-2
  • V4-6
  • V5-1
  • V5-4
  • V5-6
  • VAV
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • WAS
  • WASF1
  • WASF2
  • WASF3
  • WASL
  • WASPIP
  • WAVE1
  • WAVE2
  • WAVE3
  • WICH
  • WIP
  • WIPF1
  • WIPF2
  • WIPF3
  • WIRE
Homo sapiens (human)
RUNX1 regulates transcription of genes involved in BCR signaling
  • AML1
  • BLK
  • CBFA2
  • CBFB
  • ELF1
  • ELF2
  • NERF
  • PAX5
  • RUNX1
Homo sapiens (human)
FGFR2 alternative splicing
  • CBP20
  • CBP80
  • ESRP1
  • ESRP2
  • FOX2
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • HNRNPA1
  • HNRNPF
  • HNRNPH1
  • HNRNPM
  • HNRPA1
  • HNRPF
  • HNRPH
  • HNRPH1
  • HNRPM
  • HRNBP2
  • NAGR1
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • PTB
  • PTBP1
  • RAP30
  • RAP74
  • RBFOX2
  • RBM35A
  • RBM35B
  • RBM9
  • RPB7
  • RTA
  • TIA1
  • TIAL1
Homo sapiens (human)
Conjugation of phenylacetate with glutamine
  • ACSM1
  • ACSM2
  • ACSM2B
  • BUCS1
  • LAE
  • MACS1
Homo sapiens (human)
Defective DPM1 causes CDG-1e
  • DPM1
  • DPM2
  • DPM3
Homo sapiens (human)
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA
  • AIM2
  • BN51
  • BN51T
  • CRCP
  • G22P1
  • G22P2
  • HNGS1
  • HYRC
  • HYRC1
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • MRE11
  • MRE11A
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • PRKDC
  • RPC11
  • RPC8
  • XRCC5
  • XRCC6
Homo sapiens (human)
Synthesis of diphthamide-EEF2
  • ATPBD4
  • C9orf112
  • DESR1
  • DNAJC24
  • DPH1
  • DPH2
  • DPH2L
  • DPH2L1
  • DPH2L2
  • DPH3
  • DPH4
  • DPH5
  • DPH6
  • DPH7
  • EEF2
  • EF2
  • OVCA1
  • WDR85
  • ZCSL2
  • ZCSL3
Homo sapiens (human)
Reelin signalling pathway
  • CIN85
  • DAB1
  • FYN
  • RELN
  • SH3KBP1
  • VLDLR
Homo sapiens (human)
PTK6 Expression
  • BHLHE73
  • BHLHE78
  • BRK
  • EPAS1
  • GRL
  • HIF1A
  • HIF2A
  • HMX3
  • MNAR
  • MOP1
  • MOP2
  • NR3C1
  • PASD2
  • PASD8
  • PELP1
  • PTK6
Homo sapiens (human)
Calcitonin-like ligand receptors
  • ADM
  • ADM2
  • AM
  • AM2
  • CALC1
  • CALC2
  • CALCA
  • CALCB
  • CALCR
  • CALCRL
  • CGRPR
  • IAPP
  • RAMP1
  • RAMP2
  • RAMP3
Homo sapiens (human)
Defective translocation of RB1 mutants to the nucleus
  • RB1
Homo sapiens (human)
RUNX2 regulates genes involved in cell migration
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • CBFB
  • FNRA
  • ITGA5
  • ITGBL1
  • MMP13
  • OSCP
  • PKB
  • PKBG
  • RAC
  • TIED
Homo sapiens (human)
Acrosome Reaction and Sperm:Oocyte Membrane Binding
  • ACR
  • ACRS
  • C19orf36
  • C19orf41
  • C9orf134
  • CD9
  • IZUMO1
  • IZUMO2
  • IZUMO3
  • IZUMO4
  • MIC3
  • SCRL
  • TSPAN29
Homo sapiens (human)
PDGFR mutants bind TKIs
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • RHEPDGFRA
Homo sapiens (human)
Activation of Matrix Metalloproteinases
  • C8orf57
  • CATL2
  • CLG
  • CLG1
  • CLG4A
  • CLG4B
  • CLGI
  • CMA1
  • COL18A1
  • CTRB
  • CTRB1
  • CTRB2
  • CTSG
  • CTSK
  • CTSL2
  • CTSO
  • CTSO2
  • CTSU
  • CTSV
  • CYH
  • CYM
  • ELA2
  • ELANE
  • FUR
  • FURIN
  • KLK2
  • KLK3
  • KLKB1
  • MMP1
  • MMP10
  • MMP11
  • MMP13
  • MMP14
  • MMP15
  • MMP16
  • MMP17
  • MMP2
  • MMP20
  • MMP24
  • MMP25
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP8
  • MMP9
  • MMPL1
  • MMPX2
  • MPSL1
  • MT4MMP
  • MT5MMP
  • MT6MMP
  • PACE
  • PCSK3
  • PLG
  • PRSS1
  • PRSS2
  • PUMP1
  • SPOCK3
  • STMY1
  • STMY2
  • STMY3
  • TICN3
  • TIMP
  • TIMP1
  • TIMP2
  • TPS1
  • TPS2
  • TPSAB1
  • TPSB1
  • TRP1
  • TRY1
  • TRY2
  • TRYP1
  • TRYP2
Homo sapiens (human)
FGFR1c ligand binding and activation
  • ADMLX
  • ANOS1
  • C19orf3
  • FGF1
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • GIPC
  • GIPC1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • KAL
  • KAL1
  • KALIG1
  • KS3
  • RGS19IP1
  • TGFBR3
Homo sapiens (human)
Nuclear events stimulated by ALK signaling in cancer
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • AILIM
  • AIM
  • APRF
  • BCL2A1
  • BCL2L5
  • BFL1
  • BHLHA38
  • CCNB
  • CCNB1
  • CEBPB
  • CGL1
  • CSPB
  • CTLA1
  • CUL1
  • CXXC9
  • DNMT
  • DNMT1
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • EMC19
  • ERK1
  • ERK2
  • FKHL16
  • FOXM1
  • GRB
  • GRS
  • GZMB
  • HBPA1
  • HCP
  • HDAC1
  • HFH11
  • ICOS
  • IL10R
  • IL10RA
  • IRF4
  • JUNB
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MOV10
  • MPP2
  • MUM1
  • NIPA
  • NPM
  • NPM1
  • OCP2
  • PFP
  • PRF1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTP1C
  • PTPN6
  • RB1
  • RBX1
  • RNF75
  • ROC1
  • RPD3L1
  • RPS6
  • SKP1
  • SKP1A
  • SRK
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • TCEB1L
  • TCF5
  • TNRC6C
  • TWIST
  • TWIST1
  • WIN
  • ZAP70
  • ZC3HC1
Homo sapiens (human)
Signaling downstream of RAS mutants
  • APBB1IP
  • ARAF
  • ARAF1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BRAF
  • BRAF1
  • BRAP
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CNK1
  • CNK2
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • CTAK1
  • EMK2
  • ERK1
  • ERK2
  • F8VWF
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • GP2B
  • GP3A
  • HRAS
  • HRAS1
  • IQGAP1
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • JAK2
  • KIAA0051
  • KIAA0902
  • KIAA0968
  • KIAA1027
  • KRAS
  • KRAS2
  • KREV1
  • KSR
  • KSR1
  • KSR2
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAP3K11
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • MLK3
  • NRAS
  • PBP
  • PEBP
  • PEBP1
  • PHB
  • PHB1
  • PKS
  • PKS2
  • PREL1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • PTK1
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RASK2
  • RIAM
  • RNF52
  • SPRK
  • SRC
  • SRC1
  • TLN
  • TLN1
  • VCL
  • VWF
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
Defective DPM2 causes CDG-1u
  • DPM1
  • DPM2
  • DPM3
Homo sapiens (human)
G alpha (q) signalling events
  • 1R20
  • A4
  • AD1
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1C
  • ADRA1D
  • ADRBK1
  • AGMX1
  • AGT
  • AGTR1
  • AGTR1A
  • AGTR1B
  • ANX1
  • ANXA1
  • APP
  • ARHGEF25
  • ARVP
  • AT2R1
  • AT2R1B
  • ATK
  • AVP
  • AVPR1
  • AVPR1A
  • AVPR1B
  • AVPR3
  • AXOR12
  • BARK
  • BARK1
  • BDK
  • BDKRB1
  • BDKRB2
  • BKR2
  • BL34
  • BLT
  • BLT1
  • BLT2R
  • BLTR
  • BLTR2
  • BPK
  • BRADYB1
  • BRS3
  • BTK
  • BV8
  • CASR
  • CCK
  • CCKAR
  • CCKBR
  • CCKRA
  • CCKRB
  • CCXCR1
  • CF2R
  • CHRM1
  • CHRM3
  • CHRM5
  • CMKRL1
  • CYSLT1
  • CYSLT2
  • CYSLT2R
  • CYSLTR1
  • CYSLTR2
  • DUET
  • DUO
  • EDG2
  • EDG4
  • EDG7
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • ETA
  • ETRA
  • ETRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • FFA2
  • FFAR1
  • FFAR2
  • FFAR3
  • FFAR4
  • FPR2
  • FPRH1
  • FPRL1
  • G0S8
  • G2A
  • GA11
  • GAIP
  • GAQ
  • GAS
  • GAST
  • GCG
  • GCGR
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Last updated: August 19, 2024