Danio rerio (zebrafish)

Summary
Taxonomy ID
7955
PubChem Taxonomy
7955
Displaying entries 226 - 250 of 261 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol GlyTouCan ID
Collagen biosynthesis and modifying enzymes
  • COL11A1b
  • COL5A3a
  • LOC100003546x
  • LOC794872
  • alpha2(I)
  • alpha3(I)
  • bmp1a
  • cb216
  • cb479
  • cb816
  • col11a1
  • col11a1b
  • col1a1b
  • col1a2
  • col1a3
  • col27a1
  • col27a1b
  • col28a1
  • col28a1a
  • col28a1b
  • col28a1c
  • col28a1d
  • col2a1
  • col2a1a
  • col5a3
  • col5a3a
  • col8a1b
  • colgalt1
  • colgalt2
  • colgalt2b
  • coll2a1
  • diwanka
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  • fb72h05
  • fc10c01
  • fc56b02
  • fj59a10
  • glt25d1
  • glt25d2
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  • hsp
  • hsp47
  • id:ibd5060
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  • lh2
  • mfn
  • p4ha1
  • p4ha1b
  • p4hb
  • pcolce2b
  • pcolceb
  • plod2
  • plod3
  • psmb3
  • serpinh1b
  • si:ch211-174d12.1
  • si:ch211-174d12.4
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  • slc35c2
  • tld
  • tll1
  • tolloid
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  • wu:fc49g11
  • wu:fc56b02
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  • zehn2357
  • zgc:101868
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  • zgc:56058
  • zgc:63590
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  • zgc:92596
Cellular hexose transport
  • fc29a02
  • glut1
  • glut10
  • glut12
  • glut1a
  • glut1b
  • glut2
  • mfsd4b
  • naglt1
  • rag1ap1
  • sb:cb753
  • sb:cb808
  • slc2a1
  • slc2a10
  • slc2a12
  • slc2a1a
  • slc2a2
  • slc2a3b
  • slc2a8
  • slc2a8l
  • slc45a3
  • slc50a1
  • slc5a1
  • slc5a2
  • slc5a9
  • wu:fb62h10
  • wu:fc29a02
  • zgc:56364
  • zgc:66074
  • zgc:85782
  • zgc:85792
RND1 GTPase cycle
  • Aldh-III
  • CAV1
  • LOC100004299
  • aldh3a2
  • aldh3a2a
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • arms
  • cav1
  • cpda
  • dspa
  • epha2
  • epha2a
  • fam83b
  • fb36h09
  • fi33b05
  • flot2a
  • frs3
  • heg
  • id:ibd5152
  • im:6911394
  • kidins220
  • kidins220b
  • pik3r1
  • pik3r2
  • plxna1
  • plxna1b
  • rbm39a
  • rbm39b
  • rnd1a
  • rnd1b
  • rnd1l
  • rnpc2
  • rnpc2l
  • rras2
  • rtk6
  • scg10
  • scgn10
  • si:dkey-181m9.10
  • stb2
  • stbm
  • stip1
  • stmn2
  • stmn2b
  • tfr1a
  • tmem59
  • tri
  • vangl1
  • vangl2
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  • zgc:55780
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  • zgc:92133
Sema3A PAK dependent Axon repulsion
  • cb422
  • cb820
  • fynb
  • hsp90a.2
  • hsp90a2
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  • hsp90ab1
  • hsp90b
  • hspc3
  • kinase
  • limk1
  • limk1a
  • np-1
  • nrp1
  • nrp1a
  • pak2
  • pak2a
  • plxna1
  • plxna1b
  • plxna2
  • plxna3
  • plxna4
  • rac1
  • rac1a
  • sema3ab
  • semaz1b
  • si:dz198m22.1
  • wu:fb71h01
  • wu:fd16e02
  • zgc:55823
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  • zgc:91798
CS/DS degradation
  • DC
  • bcan
  • bgn
  • bgna
  • cspg2b
  • dcan
  • dcn
  • decorin
  • fb99b07
  • fi32a12
  • hyal1
  • ids
  • ncanb
  • vcanb
  • wu:fb99b07
  • wu:fi32a12
  • zgc:158245
  • zgc:91989
CRMPs in Sema3A signaling
  • CRMP-5a
  • DPYSL5
  • LOC568402
  • cdk5
  • cdk5r1a
  • crmp5.1
  • dpysl3
  • dpysl5a
  • fc28b06
  • fynb
  • im:7146614
  • np-1
  • nrp1
  • nrp1a
  • plxna1
  • plxna1b
  • plxna2
  • plxna3
  • plxna4
  • sema3ab
  • semaz1b
  • wu:fc28b06
  • zgc:101604
  • zgc:194104
  • zgc:194109
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR4
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr4
  • fj46f04
  • id:ibd5158
  • plcg1
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fj46f04
  • wu:fj57a05
  • zgc:194535
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors)
  • CB1R
  • cb1
  • cb2a
  • cb2b
  • cnr1
  • cnr2
  • gpr183
  • gpr183a
  • gpr35.1
  • gpr39
  • hcar1-4
  • mel1ar
  • mel1br
  • mtnr1aa
  • mtnr1ar
  • mtnr1bb
  • mtnr1br
  • mtnr1br-2
  • oxgr1a.1
  • ptafr
  • zgc:136854
  • zgc:64187
Detoxification of Reactive Oxygen Species
  • TXN
  • cat
  • cb356
  • cb463
  • cb58
  • cb718
  • cb893
  • cuzn
  • cyba
  • cybb
  • cyc
  • ero1a
  • ero1l
  • fa02f07
  • fb15h09
  • gpx7
  • gpx8
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  • gstp1
  • gstp1.2
  • hm:zehl0637
  • im:6902827
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  • ncf1
  • ncf2
  • nudt2
  • p4hb
  • prdx1
  • prdx2
  • prdx3
  • prdx5
  • prdx6
  • psmb3
  • si:ch73-111m19.2
  • sod1
  • sod2
  • sod3a
  • txn
  • txn2
  • txna
  • txnb
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  • zgc:77127
  • zgc:91915
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  • zgc:92891
  • zgc:92903
Glycosphingolipid catabolism
  • NSMase
  • asah2
  • gba2
  • gba3
  • im:6912336
  • im:6912508
  • nSMase2
  • neu3.2
  • neu3.3
  • neu3.5
  • neu4
  • neuc.1
  • sb:eu489
  • si:ch73-316n6.2
  • si:dkey-11j5.6
  • smpd2
  • smpd2a
  • smpd3
  • smpd4
  • zgc:100806
  • zgc:109998
  • zgc:153998
VEGFR2 mediated cell proliferation
  • fb09d10
  • fj46f04
  • flk1b
  • fv43b11
  • kdr
  • kdrb
  • pdpk1b
  • plcg1
  • prkcb1
  • prkcbb
  • prkcd
  • prkcda
  • src
  • vegf
  • vegfa
  • vegfaa
  • wu:fb09d10
  • wu:fj46f04
  • wu:fj57a05
  • wu:fv43b11
  • zgc:56558
  • zgc:77318
Tandem of pore domain in a weak inwardly rectifying K+ channels (TWIK)
  • im:7150627
  • kcnk1
  • kcnk1a
Class B/2 (Secretin family receptors)
  • PTH
  • crf
  • crh
  • crhb
  • crhbp
  • pth1
  • pth1a
  • pth1r
  • pth1ra
  • pth2
  • pth2r
  • pth2ra
  • pthlh
  • pthlha
  • pthr1
  • pthr2
  • pthrp
  • si:ch211-286m4.5
  • tip39
  • zPTH1R
  • zgc:101864
  • zgc:123155
  • zgc:91905
Neurotransmitter clearance
  • cbe
  • ces2
  • ces2a
  • im:6908784
  • oct1
  • si:dkey-38l12.2
  • slc22a2
  • wu:fc01b11
  • zgc:153863
  • zgc:64076
Interleukin-38 signaling
  • il-1FMA
  • il1fma
  • il1rapl1b
  • jnk1
  • mapk8
  • zmp:0000001271
Intestinal hexose absorption
  • glut2
  • slc2a2
  • slc5a1
  • wu:fb62h10
  • zgc:66074
  • zgc:85782
HDACs deacetylate histones
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • h2af1al
  • h2afx1
  • h2ax1
  • hdac10
  • hdac8
  • hist1h4l
  • hist2h2l
  • si:ch211-113a14.17
  • si:ch211-113a14.22
  • si:ch211-113a14.29
  • si:ch211-113a14.6
  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
  • si:dkey-108k21.18
  • si:dkey-108k21.28
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  • zgc:165555
  • zgc:173585
  • zgc:173587
  • zgc:194998
  • zgc:56685
SHC-mediated cascade:FGFR2
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf7
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr2
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
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  • zgc:194535
  • zgc:73077
NGF processing
  • PCSK5
  • furin
  • furina
  • ngf
  • ngfb
  • pcsk5
  • pcsk5b
  • si:dkey-281a24.5
  • zgc:165659
RHOA GTPase cycle
  • ARHGDIB
  • CAV1
  • IQGAP1
  • IQGAP3
  • LOC100004299
  • OTTDARP00000003654
  • SI:dZ115O7.1
  • SI:dZ234G15.3
  • SI:dZ234G15.4
  • SI:dZ234G15.5
  • SI:dZ234G15.7
  • aaas
  • abcd3a
  • acbd5
  • acbd5a
  • actc2
  • arap2
  • arhgap1
  • arhgap10
  • arhgap28
  • arhgap29
  • arhgap35a
  • arhgap42a
  • arhgap4a
  • arhgap5
  • arhgdia
  • arhgdig
  • arhgef11
  • arhgef18
  • arhgef18a
  • cav1
  • cavin1b
  • cb80
  • dZ234G15.2
  • daam1b
  • daam1l
  • def6
  • faf2
  • fb59g09
  • fc83b10
  • fd20g07
  • fd60b04
  • fj78h09
  • fj86f05
  • fk03b12
  • fk61c06
  • flot1
  • flot1a
  • flot2a
  • fmnl3
  • frl2
  • hmox2b
  • im:7148063
  • im:7152854
  • im:7156663
  • iqgap1
  • iqgap3
  • jup
  • jupa
  • myo9aa
  • myo9al1
  • ogr
  • ogre
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pkn1b
  • pkn2
  • pkn3
  • prk2
  • prkcl2
  • ptrf
  • ptrfb
  • racgap1
  • rasgrf2
  • reggie2
  • rhoac
  • rhpn2
  • rock2
  • rock2a
  • rok2
  • scfd1
  • si:busm1-234g15.2
  • si:ch211-124k10.2
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  • si:ch211-87i20.1
  • si:dz234g15.2
  • si:dz44o19.1
  • sly1
  • srgap1b
  • srgap2b
  • stard8
  • stb2
  • stk10
  • stoml3
  • stoml3a
  • stoml3b
  • tagapa
  • tfr1a
  • trio
  • vamp3
  • vangl1
  • wu:cegs2891
  • wu:fa96g11
  • wu:fb11c07
  • wu:fb59g09
  • wu:fb65b05
  • wu:fb92c08
  • wu:fc07c04
  • wu:fc21e04
  • wu:fc83b10
  • wu:fd20g07
  • wu:fd60b04
  • wu:fj05f11
  • wu:fj45g11
  • wu:fj78h09
  • wu:fj86f05
  • wu:fk03b12
  • wu:fk61c06
  • zgc:101668
  • zgc:110200
  • zgc:110361
  • zgc:136983
  • zgc:162917
  • zgc:55554
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  • zgc:63672
  • zgc:65966
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  • zgc:77839
  • zgc:85686
  • zgc:85873
  • zgc:86726
  • zmp:0000000660
LDL clearance
  • LOC565099
  • cbe
  • ces2
  • ces2a
  • im:6908784
  • ldlr
  • ldlra
  • nceh1a
  • npc2
  • npc2.2
  • si:dkey-21p1.4
  • si:dkey-38l12.2
  • soat1
  • zgc:153863
  • zgc:193713
  • zgc:193725
  • zgc:92416
Degradation of the extracellular matrix
  • Capn1
  • DC
  • E-cad
  • MMPLf
  • ZFMMP-9
  • bcan
  • capn1
  • capn1a
  • capn2a
  • capn5a
  • capn7
  • capn9
  • capns1
  • capns1a
  • capns1b
  • cb386
  • cb536
  • cb545
  • cb616
  • cdh1
  • ctsk
  • ctsl
  • ctsl.1
  • dcn
  • decorin
  • fa18a08
  • fb77d06
  • fi32a12
  • fj05a08
  • fj67g01
  • im:6910535
  • mmp14a
  • mmp2
  • mmp30
  • mmp9
  • sb:cb386
  • si:ch211-202f3.4
  • si:dkey-239j18.2
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  • si:dkey-46g23.4
  • spp1
  • wu:fa18a08
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  • wu:fb02g06
  • wu:fb07b05
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  • wu:fb72b09
  • wu:fb77d06
  • wu:fb81g08
  • wu:fi32a12
  • wu:fi98c09
  • wu:fj05a08
  • wu:fj67g01
  • wu:fk89d01
  • wu:fl09e04
  • zgc:110367
  • zgc:110603
  • zgc:111821
  • zgc:113590
  • zgc:136396
  • zgc:136872
  • zgc:153446
  • zgc:162184
  • zgc:171446
  • zgc:171735
  • zgc:63788
  • zgc:64165
  • zgc:92089
  • zgc:92451
Acyl chain remodelling of PG
  • aytl2
  • cpla2
  • crls1
  • fc21c12
  • fj66b10
  • lpcat1
  • lpgat1
  • pla2g10
  • pla2g12a
  • pla2g3
  • pla2g4
  • pla2g4a
  • si:dkey-30h14.2
  • wu:fc21c12
  • wu:fj66b10
  • zgc:112278
  • zgc:162119
  • zgc:85909
Synthesis of PC
  • CH1073-272H17.1
  • LOC566726
  • PEMT
  • abhd3
  • aytl2
  • cbe
  • cept1
  • cept1b
  • ces2
  • ces2a
  • chat
  • chkb
  • chpt1
  • ctl2
  • ctl4
  • fc21g05
  • im:6908784
  • lpcat1
  • mfsd2ab
  • nls1b
  • pctp
  • pcyt1aa
  • pcyt1b
  • pcyt1ba
  • pemt
  • phospho1
  • si:ch211-218c17.2
  • si:dkey-38l12.2
  • slc44a2
  • slc44a4
  • stard10
  • wu:fc21g05
  • zgc:110237
  • zgc:123305
  • zgc:153863
  • zgc:195139
  • zgc:195150
  • zgc:55479
  • zgc:92800
Receptor-type tyrosine-protein phosphatases
  • ppfia1
  • ptprf

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Last updated: December 8, 2025