GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 151 - 175 of 499 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▲ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC
  • AC3.5
  • CELE_F49B2.6
  • CELE_R03G8.6
  • CELE_T12E12.6
  • CELE_Y42A5A.1
  • CELE_Y53F4B.20
  • CELE_Y67D8C.9
  • T16G12.1
  • anp-1
  • haf-2
  • haf-4
  • haf-7
  • haf-8
  • haf-9
  • pam-1
  • sar-1
  • sec-23
  • sec-24.1
  • sec-24.2
Caenorhabditis elegans
Dopamine Neurotransmitter Release Cycle
  • aex-4
  • cat-1
  • cpx-1
  • lan-2
  • lin-10
  • lin-2
  • lin-7
  • rab-3
  • ric-4
  • rimb-1
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • snn-1
  • snt-1
  • syd-2
  • tag-168
  • tag-81
  • unc-10
  • unc-13
  • unc-18
  • unc-64
  • vamp-7
Caenorhabditis elegans
GABA synthesis, release, reuptake and degradation
  • aex-4
  • cpx-1
  • dnj-14
  • hsp-1
  • hsp70a
  • lan-2
  • rab-3
  • ric-4
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • snt-1
  • tag-81
  • unc-10
  • unc-18
  • unc-25
  • unc-47
  • unc-64
  • vamp-7
Caenorhabditis elegans
Glutamate Neurotransmitter Release Cycle
  • aex-4
  • cpx-1
  • eat-4
  • glna-1
  • glna-2
  • glna-3
  • glt-1
  • glt-3
  • glt-4
  • glt-5
  • glt-6
  • glt-7
  • lan-2
  • praf-3
  • rab-3
  • ric-4
  • rimb-1
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • snt-1
  • syd-2
  • tag-168
  • tag-81
  • unc-10
  • unc-13
  • unc-18
  • unc-64
  • vamp-7
  • vglu-2
  • vglu-3
Caenorhabditis elegans
trans-Golgi Network Vesicle Budding
  • aex-4
  • arc-1
  • arf-1
  • arf-1.1
  • arf-1.2
  • arl-4
  • arl-6
  • gbf-1
  • phi-34
  • ric-4
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • syn-2
  • syx-2
  • tag-81
  • unc-64
  • vamp-7
Caenorhabditis elegans
Acetylcholine Neurotransmitter Release Cycle
  • aex-4
  • cha-1
  • cho-1
  • cpx-1
  • lan-2
  • rab-3
  • ric-4
  • rimb-1
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • snt-1
  • syd-2
  • tag-168
  • tag-81
  • unc-10
  • unc-13
  • unc-17
  • unc-18
  • unc-64
  • vamp-7
Caenorhabditis elegans
Serotonin Neurotransmitter Release Cycle
  • aex-4
  • cat-1
  • cpx-1
  • lan-2
  • rab-3
  • ric-4
  • rimb-1
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • snn-1
  • snt-1
  • syd-2
  • tag-168
  • tag-81
  • unc-10
  • unc-13
  • unc-18
  • unc-64
  • vamp-7
Caenorhabditis elegans
RNA polymerase II transcribes snRNA genes
  • C06G3.8
  • CELE_F53H1.4
  • CELE_T26A8.4
  • CELE_Y71H2B.2
  • E01A2.2
  • TFIIE-alpha
  • TFIIE-beta
  • ama-1
  • cbp-20
  • cbp-80
  • ccnk-1
  • cdk-7
  • cdk-9
  • cids-1
  • cids-2
  • cit-1.1
  • cit-1.2
  • dic-1
  • ell-1
  • gei-11
  • gtf-2A2
  • gtf-2E1
  • gtf-2E2
  • gtf-2F1
  • gtf-2F2
  • gtf-2e1
  • gtf-2e2
  • gtf-2f1
  • gtf-2f2
  • inst-1
  • ints-1
  • ints-11
  • ints-13
  • ints-2
  • ints-3
  • ints-4
  • ints-5
  • ints-6
  • ints-7
  • ints-8
  • ints-9
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • pcf-11
  • pqn-51
  • rpap-2
  • rpb-1
  • rpb-10
  • rpb-11
  • rpb-12
  • rpb-2
  • rpb-3
  • rpb-4
  • rpb-5
  • rpb-6
  • rpb-7
  • rpb-8
  • rpb-9
  • snpc-1.1
  • snpc-3.2
  • snpc-4
  • ssup-72
  • taf-10
  • taf-11.3
  • taf-13
  • taf-5
  • taf-6.1
  • taf-8
  • taf-9
  • tbp
  • tbp-1
  • ttb-1
Caenorhabditis elegans
RNA Polymerase II Pre-transcription Events
  • 3L686
  • CELE_F02E9.10
  • F13B12.1
  • T24H10.1
  • TFIIE-alpha
  • TFIIE-beta
  • ama-1
  • cbp-20
  • cbp-80
  • ccnk-1
  • cdc-73
  • cdk-7
  • cdk-9
  • cit-1.1
  • cit-1.2
  • ctr-9
  • eaf-1
  • elb-1
  • elc-1
  • ell-1
  • emb-5
  • fcp-1
  • fust-1
  • gtf-2A2
  • gtf-2E1
  • gtf-2E2
  • gtf-2F1
  • gtf-2F2
  • gtf-2H1
  • gtf-2H2C
  • gtf-2H3
  • gtf-2H4
  • gtf-2H5
  • gtf-2e1
  • gtf-2e2
  • gtf-2f1
  • gtf-2f2
  • gtf-2h1
  • gtf-2h3
  • hmg-4
  • leo-1
  • mnat-1
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • pafo-1
  • pqn-51
  • rpb-1
  • rpb-10
  • rpb-11
  • rpb-12
  • rpb-2
  • rpb-3
  • rpb-4
  • rpb-5
  • rpb-6
  • rpb-7
  • rpb-8
  • rpb-9
  • spt-16
  • spt-4
  • spt-5
  • taf-1
  • taf-10
  • taf-11
  • taf-11.3
  • taf-12
  • taf-13
  • taf-2
  • taf-3
  • taf-4
  • taf-5
  • taf-6.1
  • taf-7.1
  • taf-7.2
  • taf-9
  • tbp
  • tbp-1
  • tceb-3
  • tpr-3
  • ttb-1
  • xpb-1
  • xpd-1
Caenorhabditis elegans
RNA Polymerase II Transcription Elongation
  • 3L686
  • CELE_F02E9.10
  • F13B12.1
  • T24H10.1
  • ama-1
  • ccnk-1
  • cdc-73
  • cdk-7
  • cdk-9
  • cit-1.1
  • cit-1.2
  • ctr-9
  • eaf-1
  • elb-1
  • elc-1
  • ell-1
  • emb-5
  • fcp-1
  • gtf-2F1
  • gtf-2F2
  • gtf-2H1
  • gtf-2H2C
  • gtf-2H3
  • gtf-2H4
  • gtf-2H5
  • gtf-2f1
  • gtf-2f2
  • gtf-2h1
  • gtf-2h3
  • hmg-4
  • leo-1
  • mnat-1
  • pafo-1
  • rpb-1
  • rpb-10
  • rpb-11
  • rpb-12
  • rpb-2
  • rpb-3
  • rpb-4
  • rpb-5
  • rpb-6
  • rpb-7
  • rpb-8
  • rpb-9
  • spt-16
  • spt-4
  • spt-5
  • tceb-3
  • tpr-3
  • xpb-1
  • xpd-1
Caenorhabditis elegans
Formation of RNA Pol II elongation complex
  • 3L686
  • CELE_F02E9.10
  • F13B12.1
  • T24H10.1
  • ama-1
  • ccnk-1
  • cdc-73
  • cdk-7
  • cdk-9
  • cit-1.1
  • cit-1.2
  • ctr-9
  • eaf-1
  • elb-1
  • elc-1
  • ell-1
  • emb-5
  • fcp-1
  • gtf-2F1
  • gtf-2F2
  • gtf-2H1
  • gtf-2H2C
  • gtf-2H3
  • gtf-2H4
  • gtf-2H5
  • gtf-2f1
  • gtf-2f2
  • gtf-2h1
  • gtf-2h3
  • hmg-4
  • leo-1
  • mnat-1
  • pafo-1
  • rpb-1
  • rpb-10
  • rpb-11
  • rpb-12
  • rpb-2
  • rpb-3
  • rpb-4
  • rpb-5
  • rpb-6
  • rpb-7
  • rpb-8
  • rpb-9
  • spt-16
  • spt-4
  • spt-5
  • tceb-3
  • tpr-3
  • xpb-1
  • xpd-1
Caenorhabditis elegans
G alpha (s) signalling events
  • CELE_F55D10.4
  • ador-1
  • dop-1
  • dop-2
  • dop-2L
  • eat-11
  • flr-2
  • fshr-1
  • gbp-2
  • gnrr-4
  • gpb-1
  • gpb-2
  • gpb5
  • gpc-1
  • gpc-2
  • gplb-1
  • gsa-1
  • gtr-1
  • npr-14
  • npr-25
  • npr-42
  • pde-1
  • pde-2
  • pde-3
  • pde-4
  • pde-5
  • pde-6
  • ser-4
  • ser-7
Caenorhabditis elegans
Synthesis of bile acids and bile salts
  • F35C8.5
  • obr-1
  • obr-2
  • obr-4
Caenorhabditis elegans
Protein methylation
  • C37A2.6
  • C42C1.13
  • CELE_F23C8.5
  • CELE_F29B9.1
  • M142.8
  • cdc-48.2
  • eft-3
  • eft-4
Caenorhabditis elegans
Adherens junctions interactions
  • afd-1
  • igcm-3
Caenorhabditis elegans
Nectin/Necl trans heterodimerization
  • igcm-3
Caenorhabditis elegans
Regulation of TLR by endogenous ligand
  • C05C9.1
  • C06E8.5
  • C06G1.1
  • C55C3.1
  • CELE_F01G10.10
  • CELE_F10D11.6
  • CELE_F44A2.3
  • CELE_ZC513.2
  • T19C3.5
  • hmg-1.2
  • nrf-5
Caenorhabditis elegans
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade
  • C05C9.1
  • C06E8.5
  • C06G1.1
  • C55C3.1
  • CELE_F01G10.10
  • CELE_F10D11.6
  • CELE_F44A2.3
  • CELE_ZC513.2
  • T19C3.5
  • nrf-5
Caenorhabditis elegans
VxPx cargo-targeting to cilium
  • CELE_F54C9.11
  • CELE_F57C9.6
  • che-6
  • cng-1
  • cng-2
  • cng-3
  • exoc-7
  • exoc-8
  • pdk-2
  • pkd-2
  • rab-11.1
  • rab-8
  • rab8
  • rabr-1
  • rfip-1
  • sec-10
  • sec-15
  • sec-3
  • sec-5
  • sec-6
  • sec-8
  • tax-2
  • tax-4
Caenorhabditis elegans
RAF activation
  • CELE_Y53F4B.1
  • Ras2
  • brap-2
  • ftt-1
  • ftt-2
  • gsp-1
  • ksr-1
  • let-60
  • let-92
  • lin-34
  • lin-45
  • paa-1
  • par-1
  • par-5
  • phb-1
  • pph-1
  • pptr-1
  • pptr-2
  • raf-1
  • ras-2
  • soc-2
  • sur-8
Caenorhabditis elegans
Degradation of beta-catenin by the destruction complex
  • C14C10.5
  • C44H4.6
  • CELE_F35G12.12
  • R03D7.5
  • apr-1
  • cul-1
  • gsk-3
  • hmp-2
  • kin-19
  • let-92
  • lin-19
  • paa-1
  • pas-1
  • pas-2
  • pas-3
  • pas-4
  • pas-5
  • pas-6
  • pbs-1
  • pbs-2
  • pbs-3
  • pbs-4
  • pbs-5
  • pbs-7
  • pptr-1
  • pptr-2
  • pry-1
  • psmd-9
  • psme-3
  • rbx-1
  • rpn-1
  • rpn-10
  • rpn-11
  • rpn-12
  • rpn-2
  • rpn-3
  • rpn-5
  • rpn-6.1
  • rpn-7
  • rpn-8
  • rpn-9
  • rpt-1
  • rpt-2
  • rpt-3
  • rpt-4
  • rpt-5
  • rpt-6
  • sgg-1
  • skr-1
  • ubia
  • ubib
  • ubl-1
  • ubq-1
  • ubq-2
Caenorhabditis elegans
Negative regulation of MAPK pathway
  • C49C3.10
  • CELE_F21F3.2
  • CELE_W09H1.1
  • CELE_Y106G6D.4
  • CELE_Y106G6E.1
  • CELE_Y51B9A.9
  • F40A3.3
  • brap-2
  • ftt-1
  • ftt-2
  • gska-3
  • gskl-2
  • ksr-1
  • let-60
  • let-92
  • lin-34
  • lin-45
  • lip-1
  • mpk-1
  • paa-1
  • paqr-3
  • par-1
  • par-5
  • pmk-1
  • pmk-2
  • pmk-3
  • pph-5
  • pptr-1
  • pptr-2
  • ptp-1
  • raf-1
  • sur-1
  • ubia
  • ubib
  • ubl-1
  • ubq-1
  • ubq-2
  • vhp-1
Caenorhabditis elegans
ERK/MAPK targets
  • C49C3.10
  • CELE_F21F3.2
  • CELE_Y106G6D.4
  • CELE_Y106G6E.1
  • CELE_Y51B9A.9
  • gska-3
  • gskl-2
  • let-92
  • mpk-1
  • mpk-2
  • paa-1
  • pmk-1
  • pmk-2
  • pmk-3
  • pptr-2
  • rskn-1
  • rskn-2
  • sur-1
Caenorhabditis elegans
Regulation of IGF Activity by IGFBP
  • B0524.2
  • C16E9.1
  • C18E9.7
  • C28G1.2
  • CELE_D1054.1
  • CELE_F07F6.7
  • CELE_F07F6.8
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_F47B7.2
  • CELE_M04D5.1
  • CELE_W01A8.8
  • CELE_Y64G10A.7
  • CELE_ZK1307.8
  • W03G11.3
  • Y71H2AM.10
  • anoh-2
  • apl-1
  • atgl-1
  • calu-1
  • cet-1
  • cpi-2
  • daf-7
  • dbl-1
  • dnj-7
  • egl-17
  • enpl-1
  • famk-1
  • lec-2
  • nid-1
  • nucb-1
  • ost-1
  • pdi-1
  • pdi-2
  • pdi-6
  • sdn-1
  • sparc
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-3
  • srp-6
  • srp-7
  • srp-8
  • sup-17
  • tag-225
  • tag-320
  • timp-1
  • unc-129
Caenorhabditis elegans
Post-translational protein phosphorylation
  • B0524.2
  • C16E9.1
  • C18E9.7
  • C28G1.2
  • CELE_D1054.1
  • CELE_F07F6.7
  • CELE_F07F6.8
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_F47B7.2
  • CELE_M04D5.1
  • CELE_W01A8.8
  • CELE_Y64G10A.7
  • CELE_ZK1307.8
  • W03G11.3
  • Y71H2AM.10
  • anoh-2
  • apl-1
  • atgl-1
  • calu-1
  • cet-1
  • cpi-2
  • daf-7
  • dbl-1
  • dnj-7
  • egl-17
  • enpl-1
  • famk-1
  • lec-2
  • nid-1
  • nucb-1
  • ost-1
  • pdi-1
  • pdi-2
  • pdi-6
  • sdn-1
  • sparc
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-3
  • srp-6
  • srp-7
  • srp-8
  • sup-17
  • tag-225
  • tag-320
  • timp-1
  • unc-129
Caenorhabditis elegans

About Release Notes Help Feedback

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Acknowledgements

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Last updated: August 19, 2024