GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 51 - 75 of 252 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR2
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf7
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr2
  • fj46f04
  • id:ibd5158
  • plcg1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj46f04
  • wu:fj57a05
  • zgc:109774
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
FRS-mediated FGFR4 signaling
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr4
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
SHC-mediated cascade:FGFR3
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr3
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
FRS-mediated FGFR3 signaling
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr3
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
PI-3K cascade:FGFR1
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • id:ibd5158
  • kl
  • pik3ca
  • pik3r1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb65b05
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
SHC-mediated cascade:FGFR1
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • kl
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
FRS-mediated FGFR1 signaling
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • kl
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
SHC-mediated cascade:FGFR2
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf7
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr2
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
FRS-mediated FGFR2 signaling
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf7
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr2
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis of Dolichyl-phosphate
  • dhdds
  • dolk
  • dolpp1
  • mvd
  • mvda
  • ngbr
  • nus1
  • srd5a3
  • wu:fd56c06
  • zgc:101585
  • zgc:77088
Danio rerio (zebrafish)
Clearance of dopamine
  • dat
  • slc6a3
Danio rerio (zebrafish)
PCP/CE pathway
  • daam1b
  • daam1l
  • dvl2
  • fa91a03
  • fc83b10
  • frizzled3b
  • fz10
  • fz3
  • fz7
  • fzd1
  • fzd3b
  • fzd3l
  • fzd6
  • fzd7a
  • hm:zeh0341
  • id:ibd2735
  • int-1
  • pfn1
  • pfn2
  • pfn2a
  • pfn2b
  • pfn2l
  • rac1
  • rac1a
  • rac2
  • rac3
  • rac3a
  • rac3b
  • rhoac
  • sb:cb813
  • sb:eu471
  • si:ch211-87i20.1
  • wnt-1
  • wnt-4
  • wnt-5
  • wnt1
  • wnt4
  • wnt4a
  • wnt5
  • wnt5a
  • wnt5b
  • wu:fa91a03
  • wu:fb01g08
  • wu:fb02e10
  • wu:fb54f09
  • wu:fb95b01
  • wu:fc05d12
  • wu:fc17e10
  • wu:fc83b10
  • wu:fd16e02
  • wu:fd58f06
  • wu:fi35b08
  • wu:fo71e09
  • wu:fp54a02
  • zg03
  • zg07
  • zg10
  • zgc:100831
  • zgc:194774
  • zgc:55372
  • zgc:55823
  • zgc:55917
  • zgc:65879
  • zgc:77440
  • zgc:86686
  • zgc:86790
  • zgc:86934
Danio rerio (zebrafish)
TCF dependent signaling in response to WNT
  • ctnnb1
Danio rerio (zebrafish)
CREB3 factors activate genes
  • creb3l3
  • creb3l3b
  • fb72d02
  • goz1
  • mbtps1
  • mbtps2
  • s1p
  • s2p
  • wu:fb72d02
  • wu:fe06e05
  • wu:fk47a09
Danio rerio (zebrafish)
Acyl chain remodelling of PS
  • cpla2
  • pla1a
  • pla2g10
  • pla2g12a
  • pla2g4
  • pla2g4a
  • rarres3l
  • zgc:162119
Danio rerio (zebrafish)
Acyl chain remodelling of PI
  • cpla2
  • im:7138859
  • leng4
  • mboat7
  • oact7
  • pla2g10
  • pla2g12a
  • pla2g4
  • pla2g4a
  • plbd1
  • plbd1a
  • rarres3l
  • zgc:101699
  • zgc:162119
Danio rerio (zebrafish)
Arachidonic acid metabolism
  • cpla2
  • dgat2
  • faah2a
  • pla2g4
  • pla2g4a
Danio rerio (zebrafish)
Enzymatic degradation of Dopamine by monoamine oxidase
  • comta
Danio rerio (zebrafish)
Enzymatic degradation of dopamine by COMT
  • comta
  • mrc
  • tomt
Danio rerio (zebrafish)
Acetylcholine Neurotransmitter Release Cycle
  • chat
  • rab3a
  • rab3ab
  • si:ch211-255d18.4
  • slc18a3a
  • syt1
  • syt1a
  • vamp2
  • wu:fj41c01
  • wu:fj61c06
  • wu:fk56d05
  • zgc:112516
  • zgc:73302
  • zgc:92899
Danio rerio (zebrafish)
RHO GTPases regulate CFTR trafficking
  • cftr
  • fe38f01
  • gopc
  • rhoq
  • wu:fe38f01
  • wu:fi15a09
  • zgc:55997
  • zgc:56254
  • zgc:65853
Danio rerio (zebrafish)
Ovarian tumor domain proteases
  • cdc48
  • drp53
  • esr
  • esr1
  • fa11a08
  • fb17f04
  • fb73f10
  • fc83f12
  • fd16b10
  • fk90e11
  • nr3a1
  • otub1a
  • otub1l
  • otud3
  • pten
  • ptenb
  • rhoac
  • rnf128
  • rnf128a
  • si:bz1g13.4
  • tp53
  • traf3
  • traf6
  • ube2d1
  • ube2d1b
  • vcp
  • wu:fa11a08
  • wu:fb17f04
  • wu:fb57h05
  • wu:fb73f10
  • wu:fc16h06
  • wu:fc83f12
  • wu:fd16b10
  • wu:fk90e11
  • yod1
  • zgc:73096
  • zgc:77843
  • zgc:85911
  • zgc:92367
  • zgc:92685
  • zranb1
  • zranb1b
Danio rerio (zebrafish)
Regulation of KIT signaling
  • cbl
  • fb18e12
  • fj59e07
  • fynb
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • lck
  • sos1
  • sparse
  • src
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fd16a12
  • wu:fj59e07
  • yes
  • yes1
  • zgc:103549
  • zgc:136695
  • zgc:158274
  • zgc:73077
  • zgc:92560
Danio rerio (zebrafish)
Neurotransmitter clearance
  • cbe
  • ces2
  • ces2a
  • im:6908784
  • oct1
  • si:dkey-38l12.2
  • slc22a2
  • wu:fc01b11
  • zgc:153863
  • zgc:64076
Danio rerio (zebrafish)
Formation of the cornified envelope
  • cb80
  • dsc
  • dsc2
  • dsc2l
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • fb73g06
  • jup
  • jupa
  • lipf
  • pkp2
  • pkp3
  • pkp3a
  • wu:fa97f09
  • wu:fb73g06
  • wu:fk69a12
  • zgc:136656
  • zgc:56632
Danio rerio (zebrafish)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024