GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 51 - 75 of 252 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
G alpha (i) signalling events
  • ACTH
  • CB1R
  • DOR2
  • Drd4c
  • GNB1x
  • GNG5
  • LOC100005461
  • LOC561647
  • LOC794924
  • Lpar3
  • MSH
  • NPYRYC
  • Npy1r
  • Opn5m
  • PPSS1
  • PPSS3
  • RFLA1
  • RFLC2
  • RGS12TS
  • RGS12TS-I
  • RGS12TS-L
  • RGS12TS-S
  • RGS4
  • SDF-1
  • SI:bZ36D5.1
  • SI:bZ36D5.4
  • SS1
  • SS2
  • T2R2
  • TAS1R1
  • TAS1R2a
  • TAS1R3
  • TAS2R1a
  • TAS2R1b
  • Tas1R2b
  • [g]3
  • ackr3b
  • adra2a
  • adra2b
  • adra2c
  • agt
  • agtr2
  • agtrl1
  • agtrl1a
  • agtrl1b
  • apln
  • aplnr2
  • aplnr3
  • aplnra
  • aplnrb
  • cb1
  • cb2a
  • cb2b
  • cb436
  • cb824
  • cb958
  • ccl-c11b
  • ccl-c5a
  • ccl19a.1
  • ccl27b
  • ccl44
  • ccr10
  • ccr7
  • chrm2
  • chrm2a
  • cnr1
  • cnr2
  • cort
  • cxcl-c13d
  • cxcl-c1c
  • cxcl-c5c
  • cxcl11.1
  • cxcl11.6
  • cxcl11aa
  • cxcl11af
  • cxcl12
  • cxcl12a
  • cxcl18b
  • cxcl20
  • cxcl8b.1
  • cxcl8b.3
  • cxcr3.1
  • cxcr4a
  • cxcr7b
  • drd4b
  • drd4c
  • edg2
  • edg5
  • fb12g05
  • fb39f01
  • fd16a06
  • fd57e04
  • fi21e06
  • fj30h05
  • fk56e06
  • gal
  • galn
  • galr2a
  • gb:kf234084
  • gnai1
  • gnai2
  • gnai2b
  • gnai3
  • gnat1
  • gnat2
  • gnb1b
  • gnb1l
  • gnb3a
  • gnb3l
  • gnb5a
  • gng1
  • gng12b
  • gng13b
  • gng3
  • gng5
  • gng7
  • gng8
  • gngt1
  • gngt2
  • gngt2a
  • gper1
  • gpr183
  • gpr183a
  • gpr35.1
  • gpsm1
  • gpsm1b
  • grm2b
  • grm3
  • grm6a
  • grm7
  • grm8a
  • grn
  • hcar1-4
  • hm:zeh0300
  • htr1b
  • htr1bd
  • htr1d
  • htr5a
  • htr5aa
  • id:ibd1139
  • ik:tdsubc_2c12
  • il8l1
  • insl5
  • insl5a
  • lpar1
  • lpar2a
  • lpar3
  • lpar5a
  • lpar6
  • lpar6l
  • lws1
  • lws2
  • mel1ar
  • mel1br
  • mtnr1aa
  • mtnr1ar
  • mtnr1bb
  • mtnr1br
  • mtnr1br-2
  • npy
  • npy1r
  • npy4r
  • npy8ar
  • npy8br
  • npyrya
  • npyryb
  • npyryc
  • opn1lw1
  • opn1lw2
  • opn1sw1
  • opn1sw2
  • opn3
  • opn5
  • oprd1b
  • or4
  • oxgr1a.1
  • p2ry12
  • p2ry13
  • p2ry5
  • penk
  • penkb
  • pomc
  • pomca
  • ppg
  • pyy
  • pyya
  • rdops
  • rgr
  • rgr1
  • rgra
  • rgs12
  • rgs12b
  • rgs13
  • rgs4
  • rgs5
  • rgs5a
  • rgs6
  • rgs8
  • rho
  • rln3
  • rln3a
  • rlx 3a
  • rlx3a
  • rlx3b
  • rrh
  • rxfp3
  • rxfp3-2b
  • rxfp3.2b
  • s1pr2
  • s1pr5b
  • sb:cb436
  • sb:cb900
  • sb:eu249
  • sb:eu378
  • sdf-1a
  • sdf1a
  • si:bz36d5.2
  • si:ch211-105n9.2
  • si:ch211-152p11.4
  • si:ch211-233h19.1
  • si:ch211-268e23.2
  • si:ch211-89f7.4
  • si:ch73-6k14.1
  • si:dkey-110c1.1
  • si:dkey-253i9.3
  • si:dkey-265a7.5
  • si:dkey-44g17.6
  • si:dkey-52h10.3
  • si:dkey-96h14.2
  • si:dz22b13.1
  • si:dz46m7.1
  • src
  • sst1
  • sst1.1
  • sst3
  • sst7
  • sstr1b
  • sstr5
  • sws1
  • t1rc1
  • tas1r1
  • tas1r2.1
  • tas1r2.2
  • tas1r2a
  • tas1r2b
  • tas1r3
  • tas2r1a
  • tas2r200.1
  • tas2r200.2
  • tas2r2l
  • uvops
  • wu:fa55e10
  • wu:fb12g05
  • wu:fb39f01
  • wu:fb62d01
  • wu:fb62f06
  • wu:fb98e06
  • wu:fc06d08
  • wu:fc16h12
  • wu:fd16a06
  • wu:fd57e04
  • wu:fi21e06
  • wu:fj09d12
  • wu:fj30h05
  • wu:fj56b02
  • wu:fj84c02
  • wu:fj87b02
  • wu:fk53d05
  • wu:fk53d06
  • wu:fk56e06
  • xx:tdsubc_2c12
  • zfo2
  • zgc:100880
  • zgc:101053
  • zgc:103757
  • zgc:110316
  • zgc:110660
  • zgc:111892
  • zgc:113016
  • zgc:136854
  • zgc:153708
  • zgc:158362
  • zgc:163081
  • zgc:194211
  • zgc:194624
  • zgc:194648
  • zgc:194666
  • zgc:194690
  • zgc:194694
  • zgc:194705
  • zgc:194824
  • zgc:194855
  • zgc:195074
  • zgc:195090
  • zgc:55774
  • zgc:56690
  • zgc:63957
  • zgc:66034
  • zgc:73318
  • zgc:91924
  • zgc:92157
  • zgc:92641
  • zgc:92704
  • zgc:92709
  • zgc:92779
  • zgc:92852
  • zya
  • zyb
Danio rerio (zebrafish)
Oxidative Stress Induced Senescence
  • ERK1
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • MKK4
  • MKK4A-l
  • MKK7
  • bmi1
  • bmi1a
  • c-Jun
  • cb1065
  • cbx2
  • cbx7a
  • cbx8b
  • drp53
  • edr2
  • eed
  • ezh2
  • fi06b09
  • fj36h07
  • fos
  • fosab
  • h2af1al
  • h2afvb
  • h2afvl
  • h2afx1
  • h2afza
  • h2av
  • h2ax1
  • h2az2a
  • h2az2b
  • h3-5
  • h3f3a
  • h3f3b.1
  • h3f3c
  • h3f3d
  • hist2h2l
  • hm:zeh0386
  • ik:tdsubc_1f2
  • im:6896397
  • im:7138386
  • jnk1
  • jun
  • map2k3
  • map2k4
  • map2k4A
  • map2k4a
  • map2k6
  • map2k7
  • mapk1
  • mapk11
  • mapk14
  • mapk14b
  • mapk3
  • mapk8
  • mapkapk2
  • mapkapk2a
  • mapkapk3
  • mapkapk5
  • mdm2
  • mdm4
  • mdmx
  • pc1
  • pcgf4a
  • ph2
  • phc2
  • psc1
  • rbb4
  • rbb4l
  • rbbp4
  • rbbp7
  • ring1b
  • rnf2
  • rps27a
  • si:ch211-113a14.17
  • si:ch211-113a14.29
  • si:ch211-113a14.6
  • si:ch211-254d18.2
  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
  • si:dkey-108k21.18
  • si:dkey-108k21.28
  • si:dkey-23a13.7
  • suz12
  • suz12b
  • tdsubc_1f2
  • tp53
  • uba52
  • wu:fa91f08
  • wu:fb30e10
  • wu:fc56c10
  • wu:fd20e09
  • wu:fi03a01
  • wu:fi06b09
  • wu:fj36h07
  • xx:tdsubc_1f2
  • zERK1
  • zERK2
  • zgc:103563
  • zgc:110152
  • zgc:111978
  • zgc:112234
  • zgc:113984
  • zgc:123344
  • zgc:136500
  • zgc:152758
  • zgc:158342
  • zgc:173585
  • zgc:173587
  • zgc:194998
  • zgc:56685
  • zgc:65863
  • zgc:66168
  • zgc:77885
  • zgc:86905
  • zgc:92197
Danio rerio (zebrafish)
CS/DS degradation
  • DC
  • bcan
  • bgn
  • bgna
  • cspg2b
  • dcan
  • dcn
  • decorin
  • fb99b07
  • fi32a12
  • hyal1
  • ids
  • ncanb
  • vcanb
  • wu:fb99b07
  • wu:fi32a12
  • zgc:158245
  • zgc:91989
Danio rerio (zebrafish)
VEGF ligand-receptor interactions
  • figf
  • vegf
  • vegf-d
  • vegfa
  • vegfaa
  • vegfc
  • vegfd
Danio rerio (zebrafish)
Cellular hexose transport
  • fc29a02
  • glut1
  • glut10
  • glut12
  • glut1a
  • glut1b
  • glut2
  • mfsd4b
  • naglt1
  • rag1ap1
  • sb:cb753
  • sb:cb808
  • slc2a1
  • slc2a10
  • slc2a12
  • slc2a1a
  • slc2a2
  • slc2a3b
  • slc2a8
  • slc2a8l
  • slc45a3
  • slc50a1
  • slc5a1
  • slc5a2
  • slc5a9
  • wu:fb62h10
  • wu:fc29a02
  • zgc:56364
  • zgc:66074
  • zgc:85782
  • zgc:85792
Danio rerio (zebrafish)
Hedgehog ligand biogenesis
  • CH211-265P12.8
  • LMP7
  • PA28-gamma
  • PSMA5
  • PSMB9A
  • PSMD10
  • Psma2
  • Psmb11b
  • Y
  • beta1
  • beta1ia
  • beta2i
  • beta5
  • beta5ia
  • beta5tb
  • cdc48
  • derl2
  • erlec1
  • etID309919.2
  • fa93g07
  • fb17c09
  • fb20g04
  • fb49a10
  • fc34f08
  • fj42d12
  • fk89d05
  • gankyrin
  • hha
  • hm:zeh0386
  • hrd1
  • ihh
  • ihha
  • ik:tdsubc_1f2
  • im:6909944
  • lmp2
  • lmp7
  • macropain
  • os9
  • p4hb
  • prosome
  • psma1
  • psma2
  • psma2a
  • psma2b
  • psma3
  • psma4
  • psma5
  • psma6b
  • psma7
  • psma8
  • psmb1
  • psmb10
  • psmb11b
  • psmb12
  • psmb13a
  • psmb2
  • psmb3
  • psmb5
  • psmb6
  • psmb8
  • psmb8a
  • psmb9
  • psmb9a
  • psmc1
  • psmc1a
  • psmc1b
  • psmc2
  • psmc4
  • psmc5
  • psmc6
  • psmd1
  • psmd10
  • psmd11b
  • psmd12
  • psmd13
  • psmd14
  • psmd3
  • psmd4
  • psmd4a
  • psmd6
  • psmd7
  • psmd8
  • psme1
  • psme2
  • psme3
  • psme4b
  • rps27a
  • sb:cb309
  • shh
  • shha
  • shhb
  • si:rp71-45k5.4
  • si:zc14a17.13
  • syvn1
  • tdsubc_1f2
  • twhh
  • uba52
  • unp309
  • unp310
  • vcp
  • vhh1
  • wu:fa14g03
  • wu:fa66f04
  • wu:fa91f08
  • wu:fa93g07
  • wu:faa49c06
  • wu:fb05d04
  • wu:fb11d10
  • wu:fb17c09
  • wu:fb19c08
  • wu:fb20g04
  • wu:fb23a11
  • wu:fb38a06
  • wu:fb49a10
  • wu:fb59c07
  • wu:fb98h03
  • wu:fc34f08
  • wu:fc49f02
  • wu:fc85c10
  • wu:fe05d10
  • wu:fe38b10
  • wu:fi03c01
  • wu:fi15g10
  • wu:fj14c10
  • wu:fj22d05
  • wu:fj42d12
  • wu:fk28c01
  • wu:fk89d05
  • wu:fu88b08
  • x
  • xx:tdsubc_1f2
  • y
  • zgc:109707
  • zgc:109823
  • zgc:110363
  • zgc:110436
  • zgc:110710
  • zgc:114044
  • zgc:123344
  • zgc:153838
  • zgc:162272
  • zgc:55284
  • zgc:55818
  • zgc:56176
  • zgc:56374
  • zgc:56377
  • zgc:56471
  • zgc:56516
  • zgc:63709
  • zgc:63995
  • zgc:65867
  • zgc:66168
  • zgc:77139
  • zgc:77369
  • zgc:77482
  • zgc:86762
  • zgc:86820
  • zgc:86833
  • zgc:86851
  • zgc:86923
  • zgc:91842
  • zgc:92282
  • zgc:92464
  • zgc:92596
  • zgc:92716
  • zgc:92726
  • zgc:92791
Danio rerio (zebrafish)
Arachidonate production from DAG
  • MGLL
  • abhd12
  • cb909
  • dagla
  • mgll
  • wu:fc66g01
  • zgc:56561
Danio rerio (zebrafish)
Hyaluronan uptake and degradation
  • hyal1
Danio rerio (zebrafish)
PI-3K cascade:FGFR1
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • id:ibd5158
  • kl
  • pik3ca
  • pik3r1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb65b05
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
Heme signaling
  • HBA2r
  • HBAA1
  • LOC100334599
  • MGC173646
  • OTTDARP00000001843
  • OTTDARP00000001844
  • OTTDARP00000001846
  • OTTDARP00000002003
  • SI:dZ118J2.10
  • SI:dZ118J2.7
  • SI:dZ118J2.8
  • SI:dZ118J2.9
  • bE1
  • ba1
  • ba1l
  • be1c
  • dZ118J2.6
  • hba2
  • hbae1
  • hbae1.1
  • hbae1.2
  • hbae1.3
  • hbba2
  • hbbe1
  • hbbe1.1
  • hbbe1.2
  • hbbe1.3
  • hbbe1c
  • hbbe2
  • hbbe3
  • pcft
  • pgrmc2
  • si:busm1-118j2.5
  • si:by119c3.1
  • si:by119c3.2
  • si:by119c3.3
  • si:ch211-5k11.12
  • si:xx-119c3.3
  • slc46a1
  • wu:fa12a11
  • wu:fb25g12
  • wu:fb74f06
  • wu:fd12f11
  • zgc:110736
  • zgc:56692
  • zgc:86936
Danio rerio (zebrafish)
A tetrasaccharide linker sequence is required for GAG synthesis
  • DC
  • Gpc2
  • Gpc5a
  • Gpc6a
  • SDC4
  • b3galt6
  • b3gat2
  • bcan
  • bgn
  • bgna
  • cb440
  • chunp6920
  • cspg2b
  • dcan
  • dcn
  • decorin
  • fb99b07
  • fc47a08
  • fe05f10
  • fi32a12
  • gal3st4
  • gpc1
  • gpc2
  • gpc3
  • gpc4
  • gpc4/6
  • gpc5
  • gpc5a
  • gpc6
  • gpc6a
  • gpc6l
  • im:6970974
  • kny
  • knypek
  • ncanb
  • sdc2
  • sdc4
  • sdc4l
  • si:ch1073-86a3.1
  • vcanb
  • wu:fb99b07
  • wu:fc47a08
  • wu:fc47g09
  • wu:fe05f10
  • wu:fi32a12
  • xylt1
  • zgc:103676
  • zgc:194854
  • zgc:91925
  • zgc:91989
Danio rerio (zebrafish)
Receptor-type tyrosine-protein phosphatases
  • ppfia1
  • ptprf
Danio rerio (zebrafish)
Estrogen-dependent gene expression
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • carm1
  • cited1
  • erbb4
  • erbb4a
  • esr
  • esr1
  • fc15h02
  • fi05d05
  • fj36b10
  • fkd7
  • forkhead-7
  • foxa1
  • gata3
  • gb:dq017620
  • gro1
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Danio rerio (zebrafish)
NoRC negatively regulates rRNA expression
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Danio rerio (zebrafish)
Sema4D induced cell migration and growth-cone collapse
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Danio rerio (zebrafish)
Glycerophospholipid biosynthesis
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Danio rerio (zebrafish)
FGFR3c ligand binding and activation
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Danio rerio (zebrafish)
FGFRL1 modulation of FGFR1 signaling
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Danio rerio (zebrafish)
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Danio rerio (zebrafish)
VEGFR2 mediated cell proliferation
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Danio rerio (zebrafish)
TCF dependent signaling in response to WNT
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Danio rerio (zebrafish)
Keratan sulfate degradation
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Danio rerio (zebrafish)
Regulation of FZD by ubiquitination
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Danio rerio (zebrafish)
Lactose synthesis
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Danio rerio (zebrafish)
PRC2 methylates histones and DNA
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Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024