GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 126 - 150 of 252 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
FGFR2c ligand binding and activation
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr2
  • id:ibd5158
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
Sema4D mediated inhibition of cell attachment and migration
  • LOC100004299
  • arhgap35a
  • c-met
  • cmet
  • fb23a02
  • met
  • plxnb1b
  • rhoac
  • rnd1a
  • rnd1b
  • rnd1l
  • rras
  • wu:fb23a02
  • wu:fj98h09
  • wu:fk50c04
  • zgc:153089
  • zgc:92588
Danio rerio (zebrafish)
N-glycan trimming and elongation in the cis-Golgi
  • fi29h09
  • manea
  • mgat1b
  • si:ch211-152p11.3
  • wu:fi29h09
  • zgc:153912
  • zgc:92825
Danio rerio (zebrafish)
EGR2 and SOX10-mediated initiation of Schwann cell myelination
  • adgrg6
  • gpr126
Danio rerio (zebrafish)
Platelet homeostasis
  • P2X.514
  • P2X3
  • fb99b08
  • p2rx1
  • p2rx2
  • p2rx3
  • p2rx3a
  • p2rx5
  • p2rx7
  • p2rx8
  • p2x3
  • p2x5
  • p2xr1
  • p2xr2
  • p2xr514
  • p2xr7
  • wu:fb99b08
  • zP2X3
  • zfP2X3
Danio rerio (zebrafish)
RHOA GTPase cycle
  • ARHGDIB
  • CAV1
  • IQGAP1
  • IQGAP3
  • LOC100004299
  • OTTDARP00000003654
  • SI:dZ115O7.1
  • SI:dZ234G15.3
  • SI:dZ234G15.4
  • SI:dZ234G15.5
  • SI:dZ234G15.7
  • aaas
  • abcd3a
  • acbd5
  • acbd5a
  • actc2
  • arap2
  • arhgap1
  • arhgap10
  • arhgap28
  • arhgap29
  • arhgap35a
  • arhgap42a
  • arhgap4a
  • arhgap5
  • arhgdia
  • arhgdig
  • arhgef11
  • arhgef18
  • arhgef18a
  • cav1
  • cavin1b
  • cb80
  • dZ234G15.2
  • daam1b
  • daam1l
  • def6
  • faf2
  • fb59g09
  • fc83b10
  • fd20g07
  • fd60b04
  • fj78h09
  • fj86f05
  • fk03b12
  • fk61c06
  • flot1
  • flot1a
  • flot2a
  • fmnl3
  • frl2
  • hmox2b
  • im:7148063
  • im:7152854
  • im:7156663
  • iqgap1
  • iqgap3
  • jup
  • jupa
  • myo9aa
  • myo9al1
  • ogr
  • ogre
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pkn1b
  • pkn2
  • pkn3
  • prk2
  • prkcl2
  • ptrf
  • ptrfb
  • racgap1
  • rasgrf2
  • reggie2
  • rhoac
  • rhpn2
  • rock2
  • rock2a
  • rok2
  • scfd1
  • si:busm1-234g15.2
  • si:ch211-124k10.2
  • si:ch211-125a15.2
  • si:ch211-87i20.1
  • si:dz234g15.2
  • si:dz44o19.1
  • sly1
  • srgap1b
  • srgap2b
  • stard8
  • stb2
  • stk10
  • stoml3
  • stoml3a
  • stoml3b
  • tagapa
  • tfr1a
  • trio
  • vamp3
  • vangl1
  • wu:cegs2891
  • wu:fa96g11
  • wu:fb11c07
  • wu:fb59g09
  • wu:fb65b05
  • wu:fb92c08
  • wu:fc07c04
  • wu:fc21e04
  • wu:fc83b10
  • wu:fd20g07
  • wu:fd60b04
  • wu:fj05f11
  • wu:fj45g11
  • wu:fj78h09
  • wu:fj86f05
  • wu:fk03b12
  • wu:fk61c06
  • zgc:101668
  • zgc:110200
  • zgc:110361
  • zgc:136983
  • zgc:162917
  • zgc:55554
  • zgc:55740
  • zgc:63672
  • zgc:65966
  • zgc:77681
  • zgc:77799
  • zgc:77839
  • zgc:85686
  • zgc:85873
  • zgc:86726
  • zmp:0000000660
Danio rerio (zebrafish)
Opsins
  • Opn5m
  • lws1
  • lws2
  • opn1lw1
  • opn1lw2
  • opn1sw1
  • opn1sw2
  • opn3
  • opn4
  • opn4a
  • opn4d
  • opn4m1
  • opn5
  • rdops
  • rgr
  • rgr1
  • rgra
  • rho
  • rrh
  • si:ch211-105n9.2
  • sws1
  • uvops
  • zfo2
  • zgc:103757
  • zgc:110660
Danio rerio (zebrafish)
RUNX1 regulates genes involved in megakaryocyte differentiation and platelet function
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • fj63d08
  • h2af1al
  • h2afvb
  • h2afvl
  • h2afx1
  • h2afza
  • h2av
  • h2ax1
  • h2az2a
  • h2az2b
  • h3-5
  • h3f3a
  • h3f3b.1
  • h3f3c
  • h3f3d
  • hist2h2l
  • im:6896397
  • prmt6
  • runx1
  • runxa
  • si:ch211-113a14.17
  • si:ch211-113a14.29
  • si:ch211-113a14.6
  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
  • si:dkey-108k21.18
  • si:dkey-108k21.28
  • si:dkey-23a13.7
  • si:dkey-6n6.6
  • sin3aa
  • sin3b
  • wu:fj63d08
  • zgc:112234
  • zgc:113984
  • zgc:173585
  • zgc:173587
  • zgc:194998
  • zgc:56685
Danio rerio (zebrafish)
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+
  • prkcb1
  • prkcbb
Danio rerio (zebrafish)
Interleukin-38 signaling
  • il-1FMA
  • il1fma
  • il1rapl1b
  • jnk1
  • mapk8
  • zmp:0000001271
Danio rerio (zebrafish)
Digestion of dietary carbohydrate
  • amy2a
  • amy3
  • chia.2
  • chia.3
  • chioIa
  • chioIb
  • wu:fb61c11
  • wu:fb64c06
  • wu:fd61a02
  • wu:fi13f01
  • zgc:55406
  • zgc:55941
  • zgc:66270
  • zgc:77877
  • zgc:77889
  • zgc:77912
Danio rerio (zebrafish)
Collagen degradation
  • MMPLf
  • ZFMMP-9
  • col27a1
  • col27a1b
  • fj05a08
  • mmp2
  • mmp30
  • mmp9
  • phykpl
  • prss1
  • prss2a
  • prss59.1
  • prss59.2
  • si:ch73-103b2.3
  • si:dkey-33m11.8
  • try
  • tryl
  • wu:fa99h12
  • wu:fb02g06
  • wu:fb07b05
  • wu:fb57g08
  • wu:fb61f11
  • wu:fd14c02
  • wu:fi98c09
  • wu:fj05a08
  • wu:fk89d01
  • zgc:109701
  • zgc:136396
  • zgc:64165
  • zgc:66382
Danio rerio (zebrafish)
CRMPs in Sema3A signaling
  • CRMP-5a
  • DPYSL5
  • LOC568402
  • cdk5
  • cdk5r1a
  • crmp5.1
  • dpysl3
  • dpysl5a
  • fc28b06
  • fynb
  • im:7146614
  • np-1
  • nrp1
  • nrp1a
  • plxna1
  • plxna1b
  • plxna2
  • plxna3
  • plxna4
  • sema3ab
  • semaz1b
  • wu:fc28b06
  • zgc:101604
  • zgc:194104
  • zgc:194109
Danio rerio (zebrafish)
Serine biosynthesis
  • fi15b02
  • psat1
  • psph
  • serinc1
  • serinc5
  • tde2
  • wu:fd02g01
  • wu:fd02g07
  • wu:fi15b02
  • zgc:112414
  • zgc:55738
  • zgc:77597
  • zgc:77622
Danio rerio (zebrafish)
MTOR signalling
  • RRAGB
  • akt3b
  • frap1
  • gbl
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • mapksp1
  • mlst8
  • mtor
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • si:dkey-176g4.2
  • slc38a9
  • tor
  • wu:fc22h08
  • wu:fc68h09
  • ywhab
  • ywhab2
  • ywhabb
  • zgc:111971
  • zgc:56499
  • zgc:73144
Danio rerio (zebrafish)
Axonal growth stimulation
  • arhgdia
  • ngf
  • ngfb
  • ngfrb
  • ngfrl
  • rhoac
  • wu:fa96g11
  • zgc:55554
  • zgc:77681
Danio rerio (zebrafish)
Acyl chain remodelling of PI
  • cpla2
  • im:7138859
  • leng4
  • mboat7
  • oact7
  • pla2g10
  • pla2g12a
  • pla2g4
  • pla2g4a
  • plbd1
  • plbd1a
  • rarres3l
  • zgc:101699
  • zgc:162119
Danio rerio (zebrafish)
Formation of the cornified envelope
  • cb80
  • dsc
  • dsc2
  • dsc2l
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • fb73g06
  • jup
  • jupa
  • lipf
  • pkp2
  • pkp3
  • pkp3a
  • wu:fa97f09
  • wu:fb73g06
  • wu:fk69a12
  • zgc:136656
  • zgc:56632
Danio rerio (zebrafish)
EPHA-mediated growth cone collapse
  • fynb
  • rhoac
  • src
  • yes
  • yes1
Danio rerio (zebrafish)
Glycerophospholipid catabolism
  • enpp6
  • gde1
  • zgc:56068
  • zgc:77135
Danio rerio (zebrafish)
Neutrophil degranulation
  • ARHG
  • Actr1b
  • BIN2
  • C3-1
  • C3-2
  • CH73-203I15.1
  • CH73-211L2.2
  • CHIA
  • COTL1
  • CTSB
  • Capn1
  • DMT1
  • Drgal3
  • Gdi3
  • HMGB1
  • HSP70
  • IQGAP1
  • Ku70
  • LOC100329375
  • LOC110438871
  • LOC555483
  • LOC560210
  • LOC561073
  • LOC565099
  • LOC798290
  • MGC173646
  • MGC174082
  • MIF
  • NDPK-Z2
  • NM23-Z2
  • OTTDARP00000001844
  • OTTDARP00000002003
  • PGI
  • PGRP-SC1a
  • PSMA5
  • Ppgb
  • Psma2
  • R-PTP-beta
  • SI:dZ118J2.7
  • SI:dZ118J2.9
  • Snap
  • Tubb5
  • UBA*01
  • ZFMMP-9
  • abp1
  • acaa1
  • acly
  • aclya
  • acp2
  • actr1
  • actr10
  • actr1b
  • actr2
  • actr2a
  • actr2b
  • ada2a
  • adam8
  • adam8a
  • aga
  • agpat2
  • ahsg
  • ahsg1
  • alad
  • aldh3b1
  • aldh3d1
  • aldoa
  • aldoaa
  • aldoc
  • aldocb
  • alox5b.2
  • alox5b.3
  • ampd3
  • ampd3b
  • anpep
  • anpepb
  • anpepb.1
  • anx2a
  • anxa2
  • anxa2a
  • aoc1
  • apaf1
  • aprt
  • armc8
  • arp2a
  • arp2b
  • arpc5b
  • asah1b
  • asc
  • asc1
  • atad3
  • atad3b
  • atp6v0cb
  • atp6v1d
  • aytl2
  • b2m
  • b4galt1l
  • bE1
  • ba1
  • ba1l
  • be1c
  • bin2b
  • bin2l
  • c1s.2
  • c3a.2
  • c3b
  • cab39
  • cand1
  • cant1
  • cant1a
  • cap1
  • capn1
  • cat
  • catD
  • cb1029
  • cb141
  • cb193
  • cb356
  • cb426
  • cb508
  • cb722
  • cb731
  • cb79
  • cb80
  • cb820
  • cb876
  • cb912
  • cb995
  • cd163
  • cd247l
  • cd36
  • cd63
  • cda
  • cdab
  • cdc48
  • ceacam1
  • cecr1
  • cecr1a
  • cep290
  • cfd
  • cfdl
  • chia.1
  • chia.2
  • chia.3
  • chia.4
  • chia.5
  • chia.6
  • chioIIa
  • chioIa
  • chioIb
  • chit1
  • ck2b
  • ckap4
  • ckii
  • cmtm6
  • commd3
  • commd9
  • copb1
  • cotl1
  • cpped1
  • csnk2b
  • cst14a
  • cst14a.1
  • cst14a.2
  • cst14b.1
  • cstp1
  • ctl2
  • ctsa
  • ctsb
  • ctsba
  • ctsc
  • ctsd
  • ctsh
  • ctss2.1
  • ctssb.1
  • ctssb1
  • ctsz
  • cxcl-c13d
  • cxcl8b.1
  • cxcl8b.3
  • cyb5r3
  • cyba
  • cybb
  • cyfip1
  • cystatin
  • cystm1
  • dZ63M10.1
  • dZ63M10.3
  • ddost
  • ddx3b
  • ddx3xb
  • degs
  • degs1
  • dera
  • dgat1
  • dgat1a
  • dnajc3
  • dnajc3a
  • dnajc5
  • dnajc5aa
  • dncli2
  • dpp7
  • dre2
  • dsc
  • dsc2
  • dsc2l
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • dub
  • dync1li1
  • eef1a1a
  • eef2b
  • enpp4
  • entpd8
  • erp44
  • etID309900.24
  • etID32613.12
  • fa02f07
  • fa07b10
  • fa91f09
  • fa94d03
  • fa96h09
  • faf2
  • fb06g09
  • fb09d10
  • fb16b04
  • fb16e09
  • fb17d04
  • fb54a01
  • fb59c09
  • fb61f12
  • fb64c05
  • fb78a05
  • fb81d06
  • fc09e02
  • fc13d04
  • fc20c06
  • fc26g11
  • fc32h03
  • fc34f08
  • fc38f10
  • fc44c02
  • fc47h06
  • fc50e01
  • fc73a07
  • fc90g02
  • fd46c06
  • fgl2
  • fgl2a
  • fi23a10
  • fi23f07
  • fi25h10
  • fj01a11
  • fj05a08
  • fj14b08
  • fj24b11
  • fj33f03
  • fj47f07
  • fj53b07
  • fj64c02
  • fj67g01
  • fj68a01
  • fj84d04
  • fj98f01
  • fm90e09
  • folr
  • fth
  • fth1
  • fth1a
  • fthl
  • fthl27
  • fthl28
  • fthl29
  • fthl31
  • fuca1.2
  • fuca2
  • fv43b11
  • g22p1
  • gca
  • gdi2
  • ggh
  • gnsa
  • gpi
  • gpib
  • grnb
  • gsnb
  • gsnl
  • gsnl2
  • gstp1
  • gstp1.2
  • gyg
  • gyg1
  • gyg1a
  • gyg1b
  • gygl
  • hap
  • happy
  • hbba2
  • hbbe1
  • hbbe1.1
  • hbbe1.2
  • hbbe1.3
  • hbbe1c
  • hbbe2
  • hbbe3
  • hebp2
  • hk1
  • hlazel
  • hm:zeh0068
  • hm:zeh0800
  • hm:zeh1145
  • hm:zehn1110
  • hm:zehn1116
  • hm:zehn2160
  • hmgb1
  • hmgb1a
  • hmox2b
  • hpse
  • hsc70
  • hsp70
  • hsp70-4
  • hsp70.1
  • hsp70.3
  • hsp70l
  • hsp90a.2
  • hsp90a2
  • hsp90aa1.2
  • hsp90ab1
  • hsp90b
  • hspa1a
  • hspa8
  • hspc3
  • hvcn1
  • id:ibd1201
  • id:ibd5130
  • id:ibd5159
  • idh1
  • igf2r
  • ik:tdsubc_1a5
  • ik:tdsubc_1f11
  • ik:tdsubc_1h2
  • il8l1
  • ilf2
  • illr1
  • illr4
  • illrL
  • im:6797184
  • im:6902790
  • im:6909319
  • im:7142515
  • im:7142760
  • im:7143416
  • im:7144134
  • im:7148063
  • im:7148527
  • im:7152854
  • im:7155843
  • im:7156386
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  • im:7157190
  • im:7160217
  • impdh1a
  • impdh2
  • iqgap1
  • ist1
  • itgam.1
  • itgav
  • jup
  • jupa
  • kcmf1
  • krt2-8
  • krt5
  • krt8
  • lamp1a
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lcn15
  • lgals3b
  • lgals3l
  • lpcat1
  • lta4h
  • ly97.3
  • lys-C
  • lyz
  • mag
  • magt1
  • manba
  • mapk1
  • mapk14
  • mapk14b
  • mapksp1
  • mcm5
  • mgst1.2
  • mhc1laa
  • mhc1uba
  • mhc1uma
  • mhc1zba
  • mhc1zca
  • mhc1zda
  • mhc1zea
  • mhc1zfa
  • mif
  • mlec
  • mmp9
  • ms4a17a.11
  • ms4a17a.16
  • ms4a17a.17
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