GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 151 - 175 of 252 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
O-linked glycosylation
  • ago61
  • b3galnt2
  • b3gnt1
  • b4gat1
  • dag
  • dag1
  • gtdc2
  • gyltl1b
  • im:7151461
  • large
  • large1
  • large2
  • pomgnt1
  • pomgnt2
  • pomk
  • pomt1
  • pomt2
  • sgk196
  • wu:fb83d06
  • wu:fi25f06
  • wu:fi37b08
  • zPOMGnT1
  • zgc:109786
  • zgc:158130
Danio rerio (zebrafish)
O-linked glycosylation of mucins
  • B3GNT1
  • Galnt4
  • b3gnt2b
  • b3gnt3
  • b3gnt3.4
  • b3gnt5
  • b3gnt5a
  • b3gnt7
  • b3gntl1
  • b4galt5
  • b4galt6
  • cb543
  • fc23d02
  • fc56f12
  • galnt1
  • galnt11
  • galnt6
  • galnt7
  • galntl6
  • gcnt4
  • heg
  • im:7139488
  • poc1bl
  • qtgal
  • sb:cb921
  • si:ch211-15e22.3
  • ssp1
  • ssp5
  • wdr51bl
  • wu:fa55h04
  • wu:fc01a10
  • wu:fc23d02
  • wu:fc39c01
  • wu:fc56f12
  • wu:fk30b12
  • zgc:112011
  • zgc:113219
  • zgc:113947
  • zgc:153274
  • zgc:55730
Danio rerio (zebrafish)
Oleoyl-phe metabolism
  • pm20d1.2
Danio rerio (zebrafish)
Opsins
  • Opn5m
  • lws1
  • lws2
  • opn1lw1
  • opn1lw2
  • opn1sw1
  • opn1sw2
  • opn3
  • opn4
  • opn4a
  • opn4d
  • opn4m1
  • opn5
  • rdops
  • rgr
  • rgr1
  • rgra
  • rho
  • rrh
  • si:ch211-105n9.2
  • sws1
  • uvops
  • zfo2
  • zgc:103757
  • zgc:110660
Danio rerio (zebrafish)
Organic anion transporters
  • MGC163045
  • blu
  • cb229
  • fa07h09
  • sb:cb229
  • sb:cb809
  • si:ch211-200a16.4
  • slc17a5
  • slc17a6
  • slc17a6b
  • slc17a7
  • slc17a7a
  • slc17a8
  • slc25a10
  • slc25a10b
  • slc25a11
  • slc25a18
  • slc25a1b
  • slc25a22
  • slc25a55a
  • slc25a55b
  • slc5a5
  • slc5a8
  • slc5a8l
  • smcte
  • vglut1
  • vglut2.1
  • vglut2a
  • vglut3
  • wu:fa07h09
  • wu:fa12h05
  • wu:fb72h03
  • zgc:153077
  • zgc:56592
  • zgc:56614
  • zgc:86898
Danio rerio (zebrafish)
Other interleukin signaling
  • IL-34
  • STX4A
  • csf1-2
  • csf1b
  • csf1r
  • fc21b12
  • fms
  • il34
  • im:7039434
  • si:ch211-239j19.3
  • si:dkey-220f10.3
  • stx4
  • txlna
  • wu:fc08c10
  • wu:fc21b12
  • zgc:158436
  • zgc:56272
Danio rerio (zebrafish)
Ovarian tumor domain proteases
  • cdc48
  • drp53
  • esr
  • esr1
  • fa11a08
  • fb17f04
  • fb73f10
  • fc83f12
  • fd16b10
  • fk90e11
  • nr3a1
  • otub1a
  • otub1l
  • otud3
  • pten
  • ptenb
  • rhoac
  • rnf128
  • rnf128a
  • si:bz1g13.4
  • tp53
  • traf3
  • traf6
  • ube2d1
  • ube2d1b
  • vcp
  • wu:fa11a08
  • wu:fb17f04
  • wu:fb57h05
  • wu:fb73f10
  • wu:fc16h06
  • wu:fc83f12
  • wu:fd16b10
  • wu:fk90e11
  • yod1
  • zgc:73096
  • zgc:77843
  • zgc:85911
  • zgc:92367
  • zgc:92685
  • zranb1
  • zranb1b
Danio rerio (zebrafish)
Oxidative Stress Induced Senescence
  • ERK1
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • MKK4
  • MKK4A-l
  • MKK7
  • bmi1
  • bmi1a
  • c-Jun
  • cb1065
  • cbx2
  • cbx7a
  • cbx8b
  • drp53
  • edr2
  • eed
  • ezh2
  • fi06b09
  • fj36h07
  • fos
  • fosab
  • h2af1al
  • h2afvb
  • h2afvl
  • h2afx1
  • h2afza
  • h2av
  • h2ax1
  • h2az2a
  • h2az2b
  • h3-5
  • h3f3a
  • h3f3b.1
  • h3f3c
  • h3f3d
  • hist2h2l
  • hm:zeh0386
  • ik:tdsubc_1f2
  • im:6896397
  • im:7138386
  • jnk1
  • jun
  • map2k3
  • map2k4
  • map2k4A
  • map2k4a
  • map2k6
  • map2k7
  • mapk1
  • mapk11
  • mapk14
  • mapk14b
  • mapk3
  • mapk8
  • mapkapk2
  • mapkapk2a
  • mapkapk3
  • mapkapk5
  • mdm2
  • mdm4
  • mdmx
  • pc1
  • pcgf4a
  • ph2
  • phc2
  • psc1
  • rbb4
  • rbb4l
  • rbbp4
  • rbbp7
  • ring1b
  • rnf2
  • rps27a
  • si:ch211-113a14.17
  • si:ch211-113a14.29
  • si:ch211-113a14.6
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  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
  • si:dkey-108k21.18
  • si:dkey-108k21.28
  • si:dkey-23a13.7
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  • suz12b
  • tdsubc_1f2
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  • wu:fi03a01
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  • wu:fj36h07
  • xx:tdsubc_1f2
  • zERK1
  • zERK2
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  • zgc:56685
  • zgc:65863
  • zgc:66168
  • zgc:77885
  • zgc:86905
  • zgc:92197
Danio rerio (zebrafish)
PCP/CE pathway
  • daam1b
  • daam1l
  • dvl2
  • fa91a03
  • fc83b10
  • frizzled3b
  • fz10
  • fz3
  • fz7
  • fzd1
  • fzd3b
  • fzd3l
  • fzd6
  • fzd7a
  • hm:zeh0341
  • id:ibd2735
  • int-1
  • pfn1
  • pfn2
  • pfn2a
  • pfn2b
  • pfn2l
  • rac1
  • rac1a
  • rac2
  • rac3
  • rac3a
  • rac3b
  • rhoac
  • sb:cb813
  • sb:eu471
  • si:ch211-87i20.1
  • wnt-1
  • wnt-4
  • wnt-5
  • wnt1
  • wnt4
  • wnt4a
  • wnt5
  • wnt5a
  • wnt5b
  • wu:fa91a03
  • wu:fb01g08
  • wu:fb02e10
  • wu:fb54f09
  • wu:fb95b01
  • wu:fc05d12
  • wu:fc17e10
  • wu:fc83b10
  • wu:fd16e02
  • wu:fd58f06
  • wu:fi35b08
  • wu:fo71e09
  • wu:fp54a02
  • zg03
  • zg07
  • zg10
  • zgc:100831
  • zgc:194774
  • zgc:55372
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  • zgc:55917
  • zgc:65879
  • zgc:77440
  • zgc:86686
  • zgc:86790
  • zgc:86934
Danio rerio (zebrafish)
PI Metabolism
  • tnfaip8
  • tnfaip8l
  • tnfaip8l1
  • tnfaip8l2
  • tnfaip8l2b
  • tnfaip8l3
Danio rerio (zebrafish)
PI-3K cascade:FGFR1
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • id:ibd5158
  • kl
  • pik3ca
  • pik3r1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb65b05
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
PI3K/AKT Signaling
  • ARHG
  • EGFR12
  • EGFR15
  • ER[b]2
  • ER[b]a
  • NRG2b
  • akt2
  • akt3b
  • btc
  • cb945
  • dob
  • egfr
  • egfra
  • epgn
  • erbb2
  • erbb3
  • erbb3b
  • erbb4
  • erbb4a
  • erbeta2
  • esr
  • esr1
  • esr2a
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hbegfa
  • id:ibd5158
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • kl
  • nr3a1
  • nrg2b
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • pdgfra
  • pdpk1b
  • pik3ap1
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3cd
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pik3r3a
  • rac1
  • rac1a
  • rac2
  • rhog
  • rhogb
  • sgk
  • sgk1
  • si:ch211-227n20.1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sparse
  • src
  • strn
  • wu:fb05c08
  • wu:fb16a12
  • wu:fb18e12
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  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fd16e02
  • wu:fk30f01
  • wu:fk56b03
  • wu:fv70f10
  • zfER-beta2
  • zfER[b]2
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:153249
  • zgc:194535
  • zgc:55823
  • zgc:55848
  • zgc:55917
  • zgc:63473
  • zgc:63601
  • zgc:73077
  • zgc:73230
  • zgc:77318
  • zgc:86686
  • zgc:86934
Danio rerio (zebrafish)
PI3K/AKT activation
  • rhoac
Danio rerio (zebrafish)
PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
  • ARHG
  • EGFR12
  • EGFR15
  • ERK1
  • ER[b]2
  • ER[b]a
  • LOC560360
  • NRG2b
  • akt3b
  • btc
  • dob
  • egfr
  • egfra
  • epgn
  • erbb2
  • erbb3
  • erbb3b
  • erbb4
  • erbb4a
  • erbeta2
  • esr
  • esr1
  • esr2a
  • fb17h07
  • fb18e12
  • fc05c02
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fi06b09
  • fk24a01
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hbegfa
  • id:ibd5158
  • ik:tdsubc_2h3
  • im:7139868
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • kl
  • mapk1
  • mapk3
  • nr3a1
  • nrg2b
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • pdgfra
  • pik3ap1
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3cd
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pik3r3a
  • pip4k2a
  • pip4k2aa
  • pip4k2c
  • pip5k1a
  • pip5k1aa
  • pip5k2
  • pip5k2c
  • ppp2ca
  • ppp2caa
  • ppp2cb
  • ppp2r1b
  • ppp2r1bb
  • ppp2r5c
  • ppp2r5cb
  • rac1
  • rac1a
  • rac2
  • rhog
  • rhogb
  • si:ch211-227n20.1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkey-241l7.9
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sparse
  • src
  • strn
  • tdsubc_2h3
  • wu:fa11a11
  • wu:fb05c08
  • wu:fb16a12
  • wu:fb17h07
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
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  • wu:fb65b05
  • wu:fc05c02
  • wu:fc32c12
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fd16e02
  • wu:fi06b09
  • wu:fk24a01
  • wu:fk30f01
  • wu:fk56b03
  • wu:fv70f10
  • xx:tdsubc_2h3
  • zERK1
  • zERK2
  • zfER-beta2
  • zfER[b]2
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110576
  • zgc:110641
  • zgc:153249
  • zgc:194535
  • zgc:194746
  • zgc:194777
  • zgc:55808
  • zgc:55823
  • zgc:55848
  • zgc:55917
  • zgc:63473
  • zgc:63601
  • zgc:73077
  • zgc:73230
  • zgc:77172
  • zgc:86686
  • zgc:86934
  • zgc:92493
Danio rerio (zebrafish)
PRC2 methylates histones and DNA
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • aebp2
  • cb633
  • dnmt3b
  • dnmt3bb.1
  • dnmt4
  • eed
  • ezh2
  • h2af1al
  • h2afvb
  • h2afvl
  • h2afx1
  • h2afza
  • h2av
  • h2ax1
  • h2az2a
  • h2az2b
  • h3-5
  • h3f3a
  • h3f3b.1
  • h3f3c
  • h3f3d
  • hist2h2l
  • im:6896397
  • jarid2b
  • jmj
  • mtf2
  • rbb4
  • rbb4l
  • rbbp4
  • rbbp7
  • si:ch211-113a14.17
  • si:ch211-113a14.29
  • si:ch211-113a14.6
  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
  • si:dkey-108k21.18
  • si:dkey-108k21.28
  • si:dkey-23a13.7
  • suz12
  • suz12b
  • wu:cegs2813
  • zgc:112234
  • zgc:113984
  • zgc:136399
  • zgc:152758
  • zgc:173585
  • zgc:173587
  • zgc:194998
  • zgc:56685
Danio rerio (zebrafish)
PTK6 Regulates RHO GTPases, RAS GTPase and MAP kinases
  • LOC100004299
  • arhgap35a
  • crk
  • dock1
  • fb34h10
  • fc05a01
  • fi19g05
  • hrasb
  • hrasl
  • nras
  • ptk6b
  • pxn
  • pxna
  • rac1
  • rac1a
  • rasa1b
  • rhoac
  • wu:fb34h10
  • wu:fc05a01
  • wu:fc54a04
  • wu:fd16e02
  • wu:fi19g05
  • wu:fw71f12
  • zgc:100936
  • zgc:110734
  • zgc:153964
  • zgc:55823
  • zgc:55917
  • zgc:86934
Danio rerio (zebrafish)
Pentose phosphate pathway
  • RBKS
  • Tal
  • dera
  • fi03d03
  • ik:tdsubc_2c8
  • pgd
  • pgm2
  • rbks
  • rpe
  • rpia
  • taldo1
  • wu:fa07h08
  • wu:fb93d11
  • wu:fc20b11
  • wu:fc32g02
  • wu:fi03d03
  • xx:tdsubc_2c8
  • zgc:101610
  • zgc:103524
  • zgc:111848
  • zgc:55585
  • zgc:66054
  • zgc:77113
  • zgc:86813
Danio rerio (zebrafish)
Peptide ligand-binding receptors
  • ACTH
  • DOR2
  • EDN3
  • EDN3a
  • Ednra2
  • MSH
  • NPYRYC
  • Npy1r
  • PPSS1
  • PPSS3
  • SI:bZ36D5.1
  • SI:bZ36D5.4
  • SS1
  • SS2
  • agt
  • agtr1b
  • agtr2
  • agtrl1
  • agtrl1a
  • agtrl1b
  • apln
  • aplnr2
  • aplnr3
  • aplnra
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  • cort
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Danio rerio (zebrafish)
Phase 4 - resting membrane potential
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Danio rerio (zebrafish)
Phospholipase C-mediated cascade: FGFR1
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Danio rerio (zebrafish)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR2
  • dob
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Danio rerio (zebrafish)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR3
  • dob
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  • wu:fc89b01
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  • wu:fj57a05
Danio rerio (zebrafish)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR4
  • dob
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  • fgf8a
  • fgfr4
  • fj46f04
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  • plcg1
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fj46f04
  • wu:fj57a05
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
Platelet Adhesion to exposed collagen
  • LOC100004428
  • VWF
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  • nyx
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  • si:dkey-285c2.8
  • tsk
  • tsku
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  • vasnb
  • vwf
Danio rerio (zebrafish)
Platelet degranulation
  • ANX V
  • CYB5R1
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  • IGF-1L
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  • IGF-I
  • LOC792613
  • MRP
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  • PAI1
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  • VWF
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Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024