GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 151 - 175 of 252 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Hedgehog 'on' state
  • CH211-265P12.8
  • LMP7
  • PA28-gamma
  • PSMA5
  • PSMB9A
  • PSMD10
  • Psma2
  • Su(fu)
  • Y
  • beta1
  • beta1ia
  • beta2i
  • beta5
  • beta5ia
  • cos2
  • cul3
  • cul3b
  • dre
  • dzip1
  • etID309919.2
  • fa93g07
  • fb17c09
  • fb20g04
  • fb49a10
  • fc34f08
  • fc85b05
  • fi39e05
  • fj42d12
  • fk89d05
  • gankyrin
  • gli2
  • gli2a
  • gli3
  • gpr161
  • hm:zeh0386
  • igu
  • ik:tdsubc_1f2
  • im:6909944
  • im:7137515
  • im:7142603
  • itch
  • itcha
  • itchb
  • kif7
  • lmp2
  • lmp7
  • macropain
  • numb
  • prosome
  • psma1
  • psma2
  • psma2a
  • psma2b
  • psma3
  • psma4
  • psma5
  • psma6b
  • psmb1
  • psmb10
  • psmb12
  • psmb13a
  • psmb2
  • psmb3
  • psmb5
  • psmb6
  • psmb8
  • psmb8a
  • psmb9
  • psmb9a
  • psmc1
  • psmc1a
  • psmc1b
  • psmc2
  • psmc4
  • psmc5
  • psmc6
  • psmd1
  • psmd10
  • psmd11b
  • psmd12
  • psmd13
  • psmd14
  • psmd3
  • psmd4
  • psmd4a
  • psmd6
  • psmd7
  • psmd8
  • psme1
  • psme2
  • psme3
  • rbx1
  • rps27a
  • sb:eu762
  • si:rp71-45k5.4
  • si:zc14a17.13
  • spop
  • spopl
  • spopla
  • sufu
  • tdsubc_1f2
  • uba52
  • ulk3
  • unp309
  • unp310
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  • wu:fa66f04
  • wu:fa91f08
  • wu:fa93g07
  • wu:faa49c06
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  • wu:fb11d10
  • wu:fb17c09
  • wu:fb19c08
  • wu:fb20g04
  • wu:fb23a11
  • wu:fb38a06
  • wu:fb49a10
  • wu:fb59c07
  • wu:fb98h03
  • wu:fc34f08
  • wu:fc49f02
  • wu:fc85b05
  • wu:fc85c10
  • wu:fe05d10
  • wu:fe38b10
  • wu:fi03c01
  • wu:fi39e05
  • wu:fj14c10
  • wu:fj22d05
  • wu:fj42d12
  • wu:fk89d05
  • wu:fu88b08
  • x
  • xx:tdsubc_1f2
  • y
  • yot
  • you-too
  • zgc:109707
  • zgc:109823
  • zgc:110363
  • zgc:110710
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  • zgc:56471
  • zgc:56516
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  • zgc:63995
  • zgc:65867
  • zgc:66168
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  • zgc:77482
  • zgc:86762
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  • zgc:86833
  • zgc:86851
  • zgc:86923
  • zgc:91842
  • zgc:92282
  • zgc:92464
  • zgc:92596
  • zgc:92716
  • zgc:92726
  • zgc:92791
Danio rerio (zebrafish)
HS-GAG degradation
  • Gpc2
  • Gpc5a
  • Gpc6a
  • SDC4
  • cb440
  • chunp6920
  • fc47a08
  • fe05f10
  • gal3st4
  • gpc1
  • gpc2
  • gpc3
  • gpc4
  • gpc4/6
  • gpc5
  • gpc5a
  • gpc6
  • gpc6a
  • gpc6l
  • hpse
  • ids
  • im:6970974
  • im:7144134
  • kny
  • knypek
  • sdc2
  • sdc4
  • sdc4l
  • si:ch1073-86a3.1
  • wu:fc47a08
  • wu:fc47g09
  • wu:fe05f10
  • zgc:103676
  • zgc:158245
  • zgc:194854
Danio rerio (zebrafish)
HS-GAG biosynthesis
  • 2-OST
  • 2OST
  • 3-OST-6
  • 3OST6
  • Gpc2
  • Gpc5a
  • Gpc6a
  • HS2st
  • HS2st1
  • HS3st2
  • HS3st3X
  • HS3st3Z
  • HS3st6
  • SDC4
  • cb440
  • chunp6920
  • ext1b
  • ext2
  • fc14g07
  • fc47a08
  • fe05f10
  • fj47c03
  • gal3st4
  • gpc1
  • gpc2
  • gpc3
  • gpc4
  • gpc4/6
  • gpc5
  • gpc5a
  • gpc6
  • gpc6a
  • gpc6l
  • hs2st1
  • hs2st1a
  • hs3st2
  • hs3st3b1a
  • hs3st3b1b
  • hs3st3l
  • hs6st
  • hs6st1
  • hs6st1a
  • hs6st2
  • hs6st3b
  • im:6970974
  • im:7147474
  • kny
  • knypek
  • ndst1
  • ndst1b
  • ndst2b
  • sdc2
  • sdc4
  • sdc4l
  • si:ch1073-86a3.1
  • wu:fc14g07
  • wu:fc47a08
  • wu:fc47g09
  • wu:fe05f10
  • wu:fj47c03
  • zgc:103676
  • zgc:152967
  • zgc:158230
  • zgc:194854
Danio rerio (zebrafish)
HDACs deacetylate histones
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • h2af1al
  • h2afx1
  • h2ax1
  • hdac10
  • hdac8
  • hist2h2l
  • si:ch211-113a14.17
  • si:ch211-113a14.29
  • si:ch211-113a14.6
  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
  • si:dkey-108k21.18
  • si:dkey-108k21.28
  • si:dkey-23a13.7
  • zgc:112234
  • zgc:113984
  • zgc:173585
  • zgc:173587
  • zgc:194998
  • zgc:56685
Danio rerio (zebrafish)
Glycosphingolipid catabolism
  • NSMase
  • asah2
  • gba2
  • gba3
  • im:6912336
  • im:6912508
  • nSMase2
  • neu3.2
  • neu3.3
  • neu3.5
  • neu4
  • neuc.1
  • sb:eu489
  • si:ch73-316n6.2
  • si:dkey-11j5.6
  • smpd2
  • smpd2a
  • smpd3
  • smpd4
  • zgc:100806
  • zgc:109998
  • zgc:153998
Danio rerio (zebrafish)
Glycosphingolipid biosynthesis
  • B4GALNT1
  • b3gnt5
  • b3gnt5a
  • b4galnt1a
  • b4galt5
  • b4galt6
  • cb539
  • gal3st1
  • gal3st1a
  • sb:cb539
  • si:dkey-189j19.2
  • si:dkeyp-86g2.2
  • st3Gal-V
  • st3gal5
  • ugcg
  • ugt8
  • wu:fc08a12
  • zgc:112506
  • zgc:158609
  • zgc:55730
Danio rerio (zebrafish)
Glycolysis
  • ENO1
  • PGI
  • adpgk
  • aldoa
  • aldoaa
  • aldob
  • aldoc
  • aldocb
  • bpgm
  • cb1029
  • cb79
  • cb883
  • eno1
  • eno1a
  • eno2
  • eno3
  • eno4
  • fc09h05
  • fi09d05
  • fi17h06
  • fj24f12
  • fj33f03
  • gapdh
  • gapdh-2
  • gnpda1
  • gpi
  • gpib
  • hk1
  • hk2
  • im:7140576
  • im:7148527
  • pfkm
  • pfkma
  • pgam1
  • pgam1a
  • pgam2
  • pgi-2
  • pgk1
  • pgm2l1
  • pklr
  • pkm2
  • pkm2a
  • pkma
  • sb:cb79
  • tpi1b
  • wu:fa28b10
  • wu:fb10b11
  • wu:fb81h05
  • wu:fc09d08
  • wu:fc09h05
  • wu:fc16e02
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  • wu:fd15e01
  • wu:fd59b07
  • wu:fi09d05
  • wu:fi17h06
  • wu:fi31b04
  • wu:fi32b03
  • wu:fi37e08
  • wu:fj24f12
  • wu:fj33f03
  • wu:fj36g06
  • wu:fk58e02
  • wu:fq14b11
  • zgc:110691
  • zgc:153956
  • zgc:198285
  • zgc:55790
  • zgc:55926
  • zgc:56252
  • zgc:63876
  • zgc:73152
  • zgc:77618
  • zgc:77899
  • zgc:92230
  • zgc:92344
  • zgc:92418
Danio rerio (zebrafish)
Glycerophospholipid catabolism
  • enpp6
  • gde1
  • zgc:56068
  • zgc:77135
Danio rerio (zebrafish)
Glycerophospholipid biosynthesis
  • agk
  • cpne7
  • mulk
Danio rerio (zebrafish)
Glutamate Neurotransmitter Release Cycle
  • EAAT3
  • EAAT5A
  • MGC163045
  • SLC1A2a
  • SLC1A7
  • addicsin
  • arl6ip5b
  • fj55a04
  • glsl
  • rab3a
  • rab3ab
  • si:ch211-255d18.4
  • si:ch211-284b7.1
  • si:ch73-116b16.2
  • si:dkey-21n12.2
  • slc17a7
  • slc17a7a
  • slc1a1
  • slc1a2a
  • slc1a3b
  • slc1a7
  • slc1a7a
  • slc1a7b
  • slc38a2
  • snat2
  • syt1
  • syt1a
  • vamp2
  • vglut1
  • wu:fj41c01
  • wu:fj55a04
  • wu:fj61c06
  • wu:fk56d05
  • zgc:112516
  • zgc:73302
  • zgc:91959
  • zgc:92811
  • zgc:92899
  • zp22
Danio rerio (zebrafish)
Gluconeogenesis
  • ENO1
  • PGI
  • PYCa
  • aldoa
  • aldoaa
  • aldob
  • aldoc
  • aldocb
  • cb598
  • cb79
  • cb856
  • cb883
  • cb924
  • eno1
  • eno1a
  • eno2
  • eno3
  • eno4
  • fb17g10
  • fb57b01
  • fbp1
  • fbp1b
  • fc09h05
  • fc25d06
  • fj24f12
  • fj93h11
  • g6pc3
  • gapdh
  • gapdh-2
  • gpi
  • gpib
  • id:ibd1091
  • id:ibd5157
  • pck
  • pck1
  • pck2
  • pcl
  • pcxa
  • pgam1
  • pgam1a
  • pgam2
  • pgi-2
  • pgk1
  • sb:cb79
  • slc37a1
  • slc37a2
  • slc37a4
  • slc37a4a
  • tpi1b
  • wu:fa28b10
  • wu:fb10b11
  • wu:fb17g10
  • wu:fb57b01
  • wu:fb81h05
  • wu:fc09h05
  • wu:fc25d06
  • wu:fc51c05
  • wu:fd59b07
  • wu:fi32b03
  • wu:fj24f12
  • wu:fj36g06
  • wu:fj93h11
  • wu:fk58e02
  • zgc:101659
  • zgc:123047
  • zgc:56252
  • zgc:63869
  • zgc:63876
  • zgc:64127
  • zgc:73152
  • zgc:77098
  • zgc:77867
  • zgc:77899
  • zgc:92418
Danio rerio (zebrafish)
Galactose catabolism
  • gale
  • galk1
  • im:7147391
  • pgm1
  • wu:fb05f01
  • zgc:101541
  • zgc:136578
  • zgc:63718
Danio rerio (zebrafish)
GP1b-IX-V activation signalling
  • LOC100004428
  • VWF
  • gp1bb
  • hm:zehn0976
  • lrcc54
  • nyx
  • pik3r1
  • si:ch1073-474e24.1
  • si:dkey-285c2.8
  • src
  • tsk
  • tsku
  • vasn
  • vasnb
  • vwf
  • wu:fb33b01
  • wu:fb65b05
  • ywhabl
  • zgc:73065
  • zgc:77351
Danio rerio (zebrafish)
GDP-fucose biosynthesis
  • fuom
  • gfus
  • gfus.1
  • si:dkey-235d18none
  • tsta3
  • zgc:101805
Danio rerio (zebrafish)
G beta:gamma signalling through PI3Kgamma
  • akt2
  • akt3b
  • cb945
  • pdpk1b
  • rhoac
  • zgc:77318
Danio rerio (zebrafish)
G alpha (q) signalling events
  • 5-ht2cr
  • 5ht2b
  • EDN3
  • EDN3a
  • Ednra2
  • FP
  • GNB1x
  • GNG5
  • GnRH-II
  • IT-NP
  • LOC794123
  • LOC798233
  • LTB4R
  • Lpar3
  • NPFF
  • RGS4
  • VT-NP
  • [g]3
  • adra1bb
  • agt
  • agtr1b
  • avp
  • avpl
  • avpr1a
  • avpr1aa
  • avpr1ab
  • avpr1b
  • cGnRH-II
  • cb436
  • chrm5
  • chrm5a
  • cysltr1
  • edg2
  • edn1
  • edn3
  • edn3b
  • ednr-a
  • ednra
  • ednraa
  • ednrb1
  • ednrb1a
  • ednrba
  • et-1
  • fb14d01
  • fb39f01
  • fj30h05
  • fj33a01
  • fp
  • gna11b
  • gna15.1
  • gnb1b
  • gnb1l
  • gnb3a
  • gnb3l
  • gnb5a
  • gng1
  • gng12b
  • gng13b
  • gng3
  • gng5
  • gng7
  • gng8
  • gngt1
  • gngt2
  • gngt2a
  • gnrh2
  • gnrhr2
  • gnrhr4
  • gpr39
  • gprc6a
  • grm1
  • grm1b
  • grm5a
  • grm5b
  • hcrt
  • hcrtr
  • hcrtr2
  • htr2b
  • htr2cl1
  • id:ibd1139
  • ik:tdsubc_2c12
  • im:7160079
  • itnp
  • kiss1
  • kiss1rb
  • lpar1
  • lpar2a
  • lpar3
  • lpar5a
  • lpar5b
  • lpar6
  • lpar6a
  • lpar6l
  • ltb4r
  • nk1a
  • npffl
  • npffr2.1
  • npffr2a
  • nts
  • ntsr1
  • opn4
  • opn4a
  • opn4d
  • opn4m1
  • oxt
  • oxtl
  • oxtr
  • oxtra
  • p2ry1
  • p2ry10
  • p2ry5
  • pik3ca
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pik3r3a
  • pqrf
  • prok1
  • prok2
  • prokr1a
  • prokr1b
  • prokr1l
  • ptafr
  • ptger1a
  • ptger1b
  • ptgfr
  • rgs13
  • rgs4
  • rgs5
  • rgs5a
  • rgs8
  • sb:cb436
  • si:ch211-125a15.3
  • si:ch211-150f22.3
  • si:ch211-152p11.4
  • si:ch211-157p22.8
  • si:ch211-1n9.11
  • si:ch211-202p1.5
  • si:ch211-217k17.1
  • si:ch211-272h9.1
  • si:ch211-272h9.2
  • si:ch211-278p9.5
  • si:ch211-44l19.2
  • si:ch211-89m7.1
  • si:ch211-93b22.1
  • si:dkey-202e17.4
  • si:dkey-211g8.7
  • si:dkey-211h10.1
  • si:dkey-228g21.4
  • si:dkey-24g18.2
  • si:dkey-44g17.6
  • si:dkeyp-84g1.5
  • si:dz22b13.1
  • si:dz46m7.1
  • tac1
  • tac2a
  • tac3a
  • tacr1a
  • tacr2
  • tacr3b
  • tacr3l
  • tbxa2r
  • trio
  • vsnp
  • wu:fb12d06
  • wu:fb14d01
  • wu:fb16a12
  • wu:fb39f01
  • wu:fb62d01
  • wu:fb62f06
  • wu:fb65b05
  • wu:fb75g12
  • wu:fb98e06
  • wu:fc06d08
  • wu:fj09d12
  • wu:fj30h05
  • wu:fj33a01
  • wu:fj56b02
  • wu:fj87b02
  • wu:fk53d05
  • wu:fk53d06
  • wu:fk56b03
  • wu:fq40d10
  • xx:tdsubc_2c12
  • zgc:100880
  • zgc:100942
  • zgc:101053
  • zgc:101761
  • zgc:103685
  • zgc:110316
  • zgc:111892
  • zgc:112062
  • zgc:153784
  • zgc:162893
  • zgc:163081
  • zgc:194094
  • zgc:194119
  • zgc:194481
  • zgc:194493
  • zgc:194865
  • zgc:194868
  • zgc:55774
  • zgc:64187
  • zgc:66034
  • zgc:73230
  • zgc:73318
  • zgc:92157
  • zgc:92641
  • zgc:92704
  • zgc:92709
  • zgc:92852
Danio rerio (zebrafish)
G alpha (i) signalling events
  • ACTH
  • CB1R
  • DOR2
  • Drd4c
  • GNB1x
  • GNG5
  • LOC100005461
  • LOC561647
  • LOC794924
  • Lpar3
  • MSH
  • NPYRYC
  • Npy1r
  • Opn5m
  • PPSS1
  • PPSS3
  • RFLA1
  • RFLC2
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Danio rerio (zebrafish)
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Danio rerio (zebrafish)
Fructose biosynthesis
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Danio rerio (zebrafish)
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Danio rerio (zebrafish)
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Danio rerio (zebrafish)
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Danio rerio (zebrafish)
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Danio rerio (zebrafish)
FRS-mediated FGFR1 signaling
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Danio rerio (zebrafish)
FGFRL1 modulation of FGFR1 signaling
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Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024