GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 252 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Platelet homeostasis
  • P2X.514
  • P2X3
  • fb99b08
  • p2rx1
  • p2rx2
  • p2rx3
  • p2rx3a
  • p2rx5
  • p2rx7
  • p2rx8
  • p2x3
  • p2x5
  • p2xr1
  • p2xr2
  • p2xr514
  • p2xr7
  • wu:fb99b08
  • zP2X3
  • zfP2X3
Danio rerio (zebrafish)
Progressive trimming of alpha-1,2-linked mannose residues from Man9/8/7GlcNAc2 to produce Man5GlcNAc2
  • fj20e02
  • man1a2
  • si:dkey-174k18.8
  • wu:fj20e02
Danio rerio (zebrafish)
Proton/oligopeptide cotransporters
  • PEPT1
  • fd47f07
  • slc15a1
  • slc15a1b
  • slc15a2
  • wu:fd47f07
Danio rerio (zebrafish)
RAC2 GTPase cycle
  • CAV1
  • IQGAP1
  • LOC100004299
  • arhgap1
  • arhgap35a
  • arhgap42a
  • arhgdia
  • cav1
  • cb422
  • cb810
  • cb893
  • cdc42
  • cdc42a
  • cdc42ep4
  • cdc42ep4a
  • cyba
  • cybb
  • def6
  • dlg3
  • dock1
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • epha2
  • epha2a
  • fb55a05
  • fc45f07
  • fj62g06
  • fk03b12
  • fk61c06
  • hmp
  • id:ibd5152
  • im:7152854
  • im:7156663
  • iqgap1
  • itgb1
  • itgb1b
  • itgb1b.1
  • itgb1b.2
  • kinase
  • mpp7
  • mtx1
  • mtx1b
  • ncf1
  • ncf2
  • nckap1
  • ogr
  • ogre
  • pak2
  • pak2a
  • pik3ca
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pik3r3a
  • rab-7
  • rab7
  • rab7a
  • rac2
  • racgap1
  • rtk6
  • samm50
  • samm50a
  • si:dkey-8l13.4
  • si:dz198m22.1
  • stb2
  • swap70b
  • swp70
  • tfr1a
  • trio
  • vamp3
  • vangl1
  • wu:cegs2891
  • wu:fa96g11
  • wu:fb07d08
  • wu:fb16a12
  • wu:fb55a05
  • wu:fb65b05
  • wu:fb71h01
  • wu:fb92c08
  • wu:fc07c04
  • wu:fc45f07
  • wu:fj62g06
  • wu:fk03b12
  • wu:fk56b03
  • wu:fk61c06
  • zgc:101675
  • zgc:110361
  • zgc:158405
  • zgc:55554
  • zgc:63918
  • zgc:64058
  • zgc:64144
  • zgc:66077
  • zgc:73230
  • zgc:77681
  • zgc:77839
  • zgc:85632
  • zgc:86686
  • zgc:86726
  • zgc:91798
  • zgc:91889
Danio rerio (zebrafish)
RAF/MAP kinase cascade
  • EGFR12
  • EGFR15
  • ERK1
  • NRG2b
  • ang1
  • angpt1
  • btc
  • c-met
  • cmet
  • dob
  • egfr
  • egfra
  • epgn
  • erbb2
  • erbb3
  • erbb3b
  • erbb4
  • erbb4a
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf7
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fgfr2
  • fgfr3
  • fgfr4
  • fi06b09
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hbegfa
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • kl
  • mapk1
  • mapk3
  • met
  • nras
  • nrg2b
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • pdgfra
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3r1
  • pik3r2
  • ranbp9
  • rasgrf2
  • rasgrp3
  • rgl1
  • si:ch211-227n20.1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • sparse
  • tek
  • tie-2
  • tie2
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb65b05
  • wu:fc32c12
  • wu:fc76g06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fi06b09
  • wu:fj59e07
  • wu:fv70f10
  • zERK1
  • zERK2
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:153249
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:63601
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
RHO GTPases Activate Formins
  • actba
  • actbb
  • bact
  • bactin1
  • bactin2
  • bactzf
  • daam1b
  • daam1l
  • dvl2
  • fa91a03
  • fc83b10
  • fmnl1a
  • hm:zeh0341
  • pfn1
  • pfn2
  • pfn2a
  • pfn2b
  • pfn2l
  • rac1
  • rac1a
  • rhoac
  • sb:cb813
  • sb:eu471
  • si:ch211-87i20.1
  • srgap2
  • wu:fa91a03
  • wu:fb01g08
  • wu:fb02e10
  • wu:fb54f09
  • wu:fc05d12
  • wu:fc83b10
  • wu:fd16e02
  • wu:fd58f06
  • wu:fi35b08
  • wu:fo71e09
  • wu:fp54a02
  • zgc:55372
  • zgc:55823
  • zgc:55917
  • zgc:86790
  • zgc:86934
Danio rerio (zebrafish)
RHO GTPases Activate ROCKs
  • rhoac
  • rock2
  • rock2a
  • rok2
Danio rerio (zebrafish)
RHO GTPases Activate Rhotekin and Rhophilins
  • rhoac
  • rhpn2
Danio rerio (zebrafish)
RHO GTPases activate PKNs
  • CPI-17
  • Pp1alpha-96A
  • im:7147597
  • mbs
  • mypt1
  • pdpk1b
  • pkn1b
  • pkn2
  • pkn3
  • ppp1cbl
  • ppp1r12a
  • ppp1r14a
  • ppp1r14aa
  • prk2
  • prkcl2
  • rac1
  • rac1a
  • rhoac
  • wu:fa14b10
  • wu:fd16e02
  • zgc:110700
  • zgc:55823
  • zgc:55917
  • zgc:64169
  • zgc:77318
  • zgc:86934
Danio rerio (zebrafish)
RHO GTPases regulate CFTR trafficking
  • cftr
  • fe38f01
  • gopc
  • rhoq
  • wu:fe38f01
  • wu:fi15a09
  • zgc:55997
  • zgc:56254
  • zgc:65853
Danio rerio (zebrafish)
RHOA GTPase cycle
  • ARHGDIB
  • CAV1
  • IQGAP1
  • IQGAP3
  • LOC100004299
  • OTTDARP00000003654
  • SI:dZ115O7.1
  • SI:dZ234G15.3
  • SI:dZ234G15.4
  • SI:dZ234G15.5
  • SI:dZ234G15.7
  • aaas
  • abcd3a
  • acbd5
  • acbd5a
  • actc2
  • arap2
  • arhgap1
  • arhgap10
  • arhgap28
  • arhgap29
  • arhgap35a
  • arhgap42a
  • arhgap4a
  • arhgap5
  • arhgdia
  • arhgdig
  • arhgef11
  • arhgef18
  • arhgef18a
  • cav1
  • cavin1b
  • cb80
  • dZ234G15.2
  • daam1b
  • daam1l
  • def6
  • faf2
  • fb59g09
  • fc83b10
  • fd20g07
  • fd60b04
  • fj78h09
  • fj86f05
  • fk03b12
  • fk61c06
  • flot1
  • flot1a
  • flot2a
  • fmnl3
  • frl2
  • hmox2b
  • im:7148063
  • im:7152854
  • im:7156663
  • iqgap1
  • iqgap3
  • jup
  • jupa
  • myo9aa
  • myo9al1
  • ogr
  • ogre
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pkn1b
  • pkn2
  • pkn3
  • prk2
  • prkcl2
  • ptrf
  • ptrfb
  • racgap1
  • rasgrf2
  • reggie2
  • rhoac
  • rhpn2
  • rock2
  • rock2a
  • rok2
  • scfd1
  • si:busm1-234g15.2
  • si:ch211-124k10.2
  • si:ch211-125a15.2
  • si:ch211-87i20.1
  • si:dz234g15.2
  • si:dz44o19.1
  • sly1
  • srgap1b
  • srgap2b
  • stard8
  • stb2
  • stk10
  • stoml3
  • stoml3a
  • stoml3b
  • tagapa
  • tfr1a
  • trio
  • vamp3
  • vangl1
  • wu:cegs2891
  • wu:fa96g11
  • wu:fb11c07
  • wu:fb59g09
  • wu:fb65b05
  • wu:fb92c08
  • wu:fc07c04
  • wu:fc21e04
  • wu:fc83b10
  • wu:fd20g07
  • wu:fd60b04
  • wu:fj05f11
  • wu:fj45g11
  • wu:fj78h09
  • wu:fj86f05
  • wu:fk03b12
  • wu:fk61c06
  • zgc:101668
  • zgc:110200
  • zgc:110361
  • zgc:136983
  • zgc:162917
  • zgc:55554
  • zgc:55740
  • zgc:63672
  • zgc:65966
  • zgc:77681
  • zgc:77799
  • zgc:77839
  • zgc:85686
  • zgc:85873
  • zgc:86726
  • zmp:0000000660
Danio rerio (zebrafish)
RHOG GTPase cycle
  • ARFGAP3
  • ARHG
  • ARHGDIB
  • CAV1
  • LOC100004299
  • arfgap3
  • arhgap1
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • arhgdia
  • arhgdig
  • cav1
  • cb422
  • cb810
  • cdc42
  • cdc42a
  • cpn10
  • cyfip1
  • dlg3
  • dock1
  • dock5
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • epha2
  • epha2a
  • fj62g06
  • fk03b12
  • fk61c06
  • hmp
  • hspe1
  • id:ibd5152
  • itgb1
  • itgb1b
  • itgb1b.1
  • itgb1b.2
  • kinase
  • mpp7
  • ndufs3
  • pak2
  • pak2a
  • pik3r1
  • rab-7
  • rab7
  • rab7a
  • rhog
  • rhogb
  • rtk6
  • shmt2
  • si:dz198m22.1
  • stb2
  • tfr1a
  • trio
  • vamp3
  • vangl1
  • wu:cegs2891
  • wu:fa96g11
  • wu:fb07d08
  • wu:fb65b05
  • wu:fb71h01
  • wu:fc07c04
  • wu:fj62g06
  • wu:fk03b12
  • wu:fk30f01
  • wu:fk61c06
  • zgc:110361
  • zgc:112520
  • zgc:55554
  • zgc:55848
  • zgc:63918
  • zgc:64058
  • zgc:65966
  • zgc:77681
  • zgc:85632
  • zgc:85765
  • zgc:86726
  • zgc:86747
  • zgc:91798
Danio rerio (zebrafish)
RHOQ GTPase cycle
  • CAV1
  • IQGAP1
  • IQGAP3
  • LOC100004299
  • arhgap1
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • arl13b
  • arl2l1
  • cav1
  • cb422
  • cb80
  • cdc42
  • cdc42a
  • cdc42ep2
  • cdc42ep3
  • cdc42ep4
  • cdc42ep4a
  • cftr
  • cip4
  • cx43
  • dlg3
  • fb55a05
  • fe38f01
  • fj62g06
  • fk03b12
  • fk61c06
  • gja1
  • gopc
  • hmp
  • im:7152854
  • im:7156663
  • iqgap1
  • iqgap3
  • jup
  • jupa
  • kinase
  • llk
  • mpp7
  • pak2
  • pak2a
  • rab-7
  • rab7
  • rab7a
  • rhoq
  • scrb1
  • scrib
  • shf
  • si:dz198m22.1
  • slc1a5
  • sof
  • srgap2
  • stb2
  • stoml3
  • stoml3a
  • stoml3b
  • tfr1a
  • trip10
  • vamp3
  • vangl1
  • wasla
  • wu:cegs2891
  • wu:fb07d08
  • wu:fb55a05
  • wu:fb71h01
  • wu:fc07c04
  • wu:fe38f01
  • wu:fi15a09
  • wu:fj62g06
  • wu:fk03b12
  • wu:fk61c06
  • zgc:103557
  • zgc:110200
  • zgc:110361
  • zgc:158395
  • zgc:55997
  • zgc:56254
  • zgc:63918
  • zgc:64058
  • zgc:65853
  • zgc:86726
  • zgc:91798
  • zgc:91889
  • zgc:92806
Danio rerio (zebrafish)
RNA Polymerase I Promoter Opening
  • ERK1
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • MBD3
  • fi06b09
  • h2af1al
  • h2afvb
  • h2afvl
  • h2afx1
  • h2afza
  • h2av
  • h2ax1
  • h2az2a
  • h2az2b
  • h3-5
  • h3f3a
  • h3f3b.1
  • h3f3c
  • h3f3d
  • hist2h2l
  • im:6896397
  • mapk3
  • mbd1
  • mbd1b
  • mbd2
  • mbd3a
  • si:ch211-113a14.17
  • si:ch211-113a14.29
  • si:ch211-113a14.6
  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
  • si:dkey-108k21.18
  • si:dkey-108k21.28
  • si:dkey-23a13.7
  • si:dz180g5.3
  • ubtf
  • wu:fa97f06
  • wu:fa98f07
  • wu:fi06b09
  • wu:fi45g12
  • wu:fj38c10
  • zERK1
  • zK13A21.11
  • zK13A21.17
  • zgc:111862
  • zgc:112234
  • zgc:113984
  • zgc:173585
  • zgc:173587
  • zgc:194998
  • zgc:56685
Danio rerio (zebrafish)
RND1 GTPase cycle
  • Aldh-III
  • CAV1
  • LOC100004299
  • aldh3a2
  • aldh3a2a
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • arms
  • cav1
  • cpda
  • dspa
  • epha2
  • epha2a
  • fam83b
  • fb36h09
  • fi33b05
  • flot2a
  • frs3
  • heg
  • id:ibd5152
  • im:6911394
  • kidins220
  • kidins220b
  • pik3r1
  • pik3r2
  • plxna1
  • plxna1b
  • rbm39a
  • rbm39b
  • rnd1a
  • rnd1b
  • rnd1l
  • rnpc2
  • rnpc2l
  • rras2
  • rtk6
  • scg10
  • scgn10
  • si:dkey-181m9.10
  • stb2
  • stbm
  • stip1
  • stmn2
  • stmn2b
  • tfr1a
  • tmem59
  • tri
  • vangl1
  • vangl2
  • wu:fa97g07
  • wu:fb09c08
  • wu:fb36h09
  • wu:fb65b05
  • wu:fc06b11
  • wu:fc07c04
  • wu:fc47b08
  • wu:fi33b05
  • wu:fk50c04
  • zgc:110132
  • zgc:110215
  • zgc:112139
  • zgc:113117
  • zgc:153089
  • zgc:194621
  • zgc:55780
  • zgc:92064
  • zgc:92133
Danio rerio (zebrafish)
RND2 GTPase cycle
  • Aldh-III
  • CAV1
  • LOC100004299
  • Rho
  • aldh3a2
  • aldh3a2a
  • arhgap1
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • arhn
  • arms
  • cav1
  • ckap4
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • epha2
  • epha2a
  • fam83b
  • fk03b12
  • fk61c06
  • frs3
  • heg
  • id:ibd5152
  • kctd13
  • kidins220
  • kidins220b
  • llk
  • lrrc1
  • nudc
  • pik3r1
  • pik3r2
  • plxnd1
  • rbm39a
  • rbm39b
  • rnd2
  • rnpc2
  • rnpc2l
  • rtk6
  • scrb1
  • scrib
  • si:dz163l24.1
  • stb2
  • stbm
  • tfr1a
  • tnfaip1
  • tri
  • vangl1
  • vangl2
  • wu:cegs2891
  • wu:fa97g07
  • wu:fb09c08
  • wu:fb65b05
  • wu:fc06b11
  • wu:fc07c04
  • wu:fi06b02
  • wu:fk03b12
  • wu:fk61c06
  • zgc:101523
  • zgc:110361
  • zgc:112139
  • zgc:113117
  • zgc:153204
  • zgc:55302
  • zgc:55780
  • zgc:56099
  • zgc:77379
  • zgc:85670
  • zgc:92064
Danio rerio (zebrafish)
RND3 GTPase cycle
  • CAV1
  • LOC100004299
  • arhe
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • bck
  • cav1
  • cb594
  • ckap4
  • ckb
  • ckbb
  • cpda
  • ddx4
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • epha2
  • epha2a
  • fam83b
  • fc39h07
  • flot2a
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  • stb2
  • stbm
  • tmod2
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  • tri
  • vangl1
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  • vlg
  • wu:fa97g07
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  • wu:fc39h07
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  • wu:fj36f10
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  • zgc:55302
  • zgc:55780
  • zgc:73080
  • zgc:86648
Danio rerio (zebrafish)
RUNX1 regulates genes involved in megakaryocyte differentiation and platelet function
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
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  • LOC570661
  • LOC794549
  • fj63d08
  • h2af1al
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  • h2az2a
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  • h3-5
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  • h3f3d
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  • im:6896397
  • prmt6
  • runx1
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  • si:ch211-113a14.17
  • si:ch211-113a14.29
  • si:ch211-113a14.6
  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
  • si:dkey-108k21.18
  • si:dkey-108k21.28
  • si:dkey-23a13.7
  • si:dkey-6n6.6
  • sin3aa
  • sin3b
  • wu:fj63d08
  • zgc:112234
  • zgc:113984
  • zgc:173585
  • zgc:173587
  • zgc:194998
  • zgc:56685
Danio rerio (zebrafish)
Reactions specific to the complex N-glycan synthesis pathway
  • CH73-301C19.1
  • chst10
  • fuca1.2
  • fut8a
  • mgat2
  • wu:fb02a09
  • zgc:162268
Danio rerio (zebrafish)
Receptor-type tyrosine-protein phosphatases
  • ppfia1
  • ptprf
Danio rerio (zebrafish)
Regulation of FZD by ubiquitination
  • NgR
  • ZG06
  • Zfz8b
  • Zwnt[a]
  • fz2
  • fz5
  • fz6
  • fz8a
  • fz8b
  • fz8c
  • fzA
  • fzc
  • fzd5
  • fzd6
  • fzd8a
  • fzd8b
  • fzd8c
  • hm:zeh0386
  • ik:tdsubc_1e1
  • ik:tdsubc_1f2
  • lrp6
  • ngr
  • rps27a
  • rspo1
  • rspo2
  • rspo3
  • rspo4
  • rtn4r
  • si:ch211-149p10.1
  • si:dkey-107i16.4
  • tdsubc_1f2
  • uba52
  • wnt3
  • wnt3 l
  • wnt3a
  • wnt3l
  • wnt[a]
  • wu:fa91f08
  • wu:fd02c05
  • xx:tdsubc_1e1
  • xx:tdsubc_1f2
  • zfzA
  • zg02
  • zg05
  • zgc:123344
  • zgc:65879
  • zgc:66168
  • zgc:77440
  • znrf3
Danio rerio (zebrafish)
Regulation of KIT signaling
  • cbl
  • fb18e12
  • fj59e07
  • fynb
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • lck
  • sos1
  • sparse
  • src
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fd16a12
  • wu:fj59e07
  • yes
  • yes1
  • zgc:103549
  • zgc:136695
  • zgc:158274
  • zgc:73077
  • zgc:92560
Danio rerio (zebrafish)
Regulation of PTEN gene transcription
  • RRAGB
  • frap1
  • gbl
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • maf1b
  • mapksp1
  • mlst8
  • mtor
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • si:ch73-174h16.3
  • si:dkey-176g4.2
  • slc38a9
  • tor
  • wu:fc22h08
  • wu:fc68h09
  • wu:fi23d09
  • zgc:111971
  • zgc:56499
  • zgc:73144
Danio rerio (zebrafish)
Regulation of insulin secretion
  • fc29a02
  • glut1
  • glut1a
  • glut1b
  • glut2
  • slc2a1
  • slc2a1a
  • slc2a2
  • wu:fb62h10
  • wu:fc29a02
Danio rerio (zebrafish)
Release of Hh-Np from the secreting cell
  • Gpc5a
  • disp2
  • gpc5
  • gpc5a
  • hha
  • ihh
  • ihha
  • notum1a
  • scube2
  • shh
  • shha
  • shhb
  • twhh
  • vhh1
  • you
Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024