GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 201 - 225 of 252 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+
  • prkcb1
  • prkcbb
Danio rerio (zebrafish)
Rhesus glycoproteins mediate ammonium transport.
  • rhag
  • rhbg
  • rhcg2a
  • rhcgl1
  • wu:fj61d12
  • zgc:171954
Danio rerio (zebrafish)
SHC-mediated cascade:FGFR1
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • kl
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
SHC-mediated cascade:FGFR2
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf7
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr2
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
SHC-mediated cascade:FGFR3
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr3
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
Sema3A PAK dependent Axon repulsion
  • cb422
  • cb820
  • fynb
  • hsp90a.2
  • hsp90a2
  • hsp90aa1.2
  • hsp90ab1
  • hsp90b
  • hspc3
  • kinase
  • limk1
  • limk1a
  • np-1
  • nrp1
  • nrp1a
  • pak2
  • pak2a
  • plxna1
  • plxna1b
  • plxna2
  • plxna3
  • plxna4
  • rac1
  • rac1a
  • sema3ab
  • semaz1b
  • si:dz198m22.1
  • wu:fb71h01
  • wu:fd16e02
  • zgc:55823
  • zgc:55917
  • zgc:86934
  • zgc:91798
Danio rerio (zebrafish)
Sema4D induced cell migration and growth-cone collapse
  • arhgef11
  • erbb2
  • plxnb1b
  • rhoac
  • rnd1a
  • rnd1b
  • rnd1l
  • rock2
  • rock2a
  • rok2
  • wu:fk50c04
  • wu:fv70f10
  • zgc:153089
  • zgc:63601
Danio rerio (zebrafish)
Sema4D mediated inhibition of cell attachment and migration
  • LOC100004299
  • arhgap35a
  • c-met
  • cmet
  • fb23a02
  • met
  • plxnb1b
  • rhoac
  • rnd1a
  • rnd1b
  • rnd1l
  • rras
  • wu:fb23a02
  • wu:fj98h09
  • wu:fk50c04
  • zgc:153089
  • zgc:92588
Danio rerio (zebrafish)
Sensory perception of sweet, bitter, and umami (glutamate) taste
  • GNB1x
  • T2R2
  • TAS1R1
  • TAS1R2a
  • TAS1R3
  • TAS2R1a
  • TAS2R1b
  • Tas1R2b
  • fb39f01
  • gnat2
  • gnb1b
  • gnb1l
  • gnb3a
  • gnb3l
  • gng13b
  • t1rc1
  • tas1r1
  • tas1r2.1
  • tas1r2.2
  • tas1r2a
  • tas1r2b
  • tas1r3
  • tas2r1a
  • tas2r200.1
  • tas2r200.2
  • tas2r2l
  • wu:fb39f01
  • wu:fb98e06
  • wu:fj09d12
  • zgc:55774
  • zgc:92641
  • zgc:92704
Danio rerio (zebrafish)
Serine biosynthesis
  • fi15b02
  • psat1
  • psph
  • serinc1
  • serinc5
  • tde2
  • wu:fd02g01
  • wu:fd02g07
  • wu:fi15b02
  • zgc:112414
  • zgc:55738
  • zgc:77597
  • zgc:77622
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by ALK
  • alk
  • alkal1
  • alkal2b
  • cb518
  • fb79b05
  • fj33b02
  • fj46f04
  • fj48a12
  • mdk
  • mdk2
  • mdkb
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3r1
  • pik3r2
  • plcg1
  • plei2
  • ptn
  • wu:fb65b05
  • wu:fb79b05
  • wu:fj33b02
  • wu:fj46f04
  • wu:fj48a12
  • wu:fj57a05
  • zHBNF
  • zgc:111787
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by Activin
  • ActrIIB
  • actbb
  • actbetaB
  • actr2b
  • actrIIb
  • acvr2b
  • acvr2ba
  • inhbab
  • inhbal
  • inhbb
  • madh2
  • madh3
  • madh3a
  • smad2
  • smad3
  • smad3a
  • wu:fa99e03
  • wu:fj97d11
  • zgc:158348
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by BMP
  • ActrIIB
  • BMP2b
  • BMPR-IA
  • BMPR-IB
  • BR1a
  • BR1b
  • LOC564395
  • actr2b
  • actrIIb
  • acvr2b
  • acvr2ba
  • alk3
  • alk3tr
  • alk6tr
  • amh
  • bmp-2
  • bmp2
  • bmp2-4
  • bmp2b
  • bmpr-IB
  • bmpr1a
  • bmpr1aa
  • bmpr1b
  • bmpr1ba
  • bmpr2b
  • cb670
  • cha
  • charon
  • dand5
  • fa95c03
  • fc25c04
  • fj60c10
  • fstl1b
  • madh1
  • madh5
  • madh7
  • nog3
  • sbn
  • si:dkey-288j18.1
  • sma8
  • smad1
  • smad5
  • smad6b
  • smad7
  • smad9
  • smurf1
  • smurf2
  • swr
  • wu:fa95c03
  • wu:fb30b12
  • wu:fc25c04
  • wu:fj60c10
  • wu:fj97d11
  • wwp1
  • zALK-6
  • zbmp-2
  • zbmp2
  • zfyve16
  • zgc:103407
  • zgc:136731
  • zgc:66401
  • zgc:92220
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by LTK
  • alkal1
  • alkal2b
  • ltk
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3r1
  • pik3r2
  • wu:fb65b05
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by PDGF
  • furin
  • furina
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • pdgfra
  • ptpn12
  • si:dkey-281a24.5
  • wu:fc32c12
  • zgc:153249
  • zgc:65856
  • zgc:77437
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by SCF-KIT
  • JAK2bCA
  • Stat5
  • ZFMMP-9
  • fb18e12
  • fj05a08
  • fj21h04
  • fj59e07
  • fynb
  • grap
  • grap2a
  • grapa
  • grb10
  • grb10a
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • jak2
  • jak2b
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • lck
  • mmp9
  • nras
  • pik3ca
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pik3r3a
  • ptpru
  • rptppsi
  • sb:eu508
  • sb:eu615
  • sos1
  • sparse
  • src
  • stat1
  • stat1a
  • stat5
  • stat5.1
  • stat5.2
  • stat5a
  • stat5b
  • stat6
  • stat7
  • tec
  • wu:fb02g06
  • wu:fb07b05
  • wu:fb16a12
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb65b05
  • wu:fi98c09
  • wu:fj05a08
  • wu:fj21h04
  • wu:fj59e07
  • wu:fj66g07
  • wu:fk56b03
  • yes
  • yes1
  • zgc:103549
  • zgc:110202
  • zgc:110734
  • zgc:112091
  • zgc:136695
  • zgc:158274
  • zgc:64165
  • zgc:73077
  • zgc:73230
  • zgc:91987
Danio rerio (zebrafish)
Stimuli-sensing channels
  • accn1
  • accn2a
  • accn2b
  • accn2c
  • accn4a
  • ano10
  • asic1a
  • asic1b
  • asic1c
  • asic2
  • asic4a
  • clcn2c
  • clcn4
  • im:6903943
  • si:ch211-229n1.3
  • stoml3
  • stoml3a
  • stoml3b
  • tmem16k
  • tpc2
  • tpcn2
  • ttyh2l
  • ttyh3b
  • zgc:110200
Danio rerio (zebrafish)
Surfactant metabolism
  • NaPi-IIb2
  • a2aa
  • ada2a
  • adora2a.1
  • adora2aa
  • adora2b
  • cecr1
  • cecr1a
  • ckap4
  • dhhc2
  • etID42583.2
  • fb68b07
  • hbl3
  • hbl4
  • mbl
  • mbl2
  • scara5
  • si:ch211-284o19.5
  • si:dkey-13b16.1
  • slc34a2b
  • wu:fb68b07
  • wu:fi68d06
  • zdhhc2
  • zgc:109836
Danio rerio (zebrafish)
Synaptic adhesion-like molecules
  • AMPA
  • GRIN3A
  • SI:zC231H1.1
  • ZfGluR1a
  • dlg1l
  • dlg4
  • flot1
  • flot1a
  • flot2a
  • glur1a
  • glur3b
  • glur4a
  • gria1.1
  • gria1a
  • gria3
  • gria3.2
  • gria3b
  • gria4
  • gria4a
  • iGluR4
  • lrfn1
  • lrfn2b
  • reggie2
  • si:bz1o18.1
  • si:cabz01090165.1
  • si:dz44o19.1
  • si:zc140k5.3
  • wu:fj45g11
  • zfGRIA1[a]
  • zfGRIA3[b]
  • zmp:0000001073
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis of 5-eicosatetraenoic acids
  • fk84f07
  • pon1
  • pon2
  • wu:fk84f07
  • zgc:77556
  • zgc:91887
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis of Dolichyl-phosphate
  • dhdds
  • dolk
  • dolpp1
  • mvd
  • mvda
  • ngbr
  • nus1
  • srd5a3
  • wu:fd56c06
  • zgc:101585
  • zgc:77088
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol
  • fa11a08
  • fb73f10
  • fc83f12
  • fd16b10
  • fj46f04
  • fk90e11
  • inppl1a
  • itpk1b
  • plcd1a
  • plcd3a
  • plcg1
  • pten
  • ptenb
  • ship2a
  • si:bz1g13.4
  • wu:fa11a08
  • wu:fb73f10
  • wu:fc83f12
  • wu:fd16b10
  • wu:fj46f04
  • wu:fj57a05
  • wu:fk90e11
  • zgc:165641
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis of PA
  • Gpd1
  • acp6
  • agpat2
  • agpat3
  • agpat4
  • agpat6
  • agpat8
  • agpat9
  • alp3
  • alpi
  • alpi.1
  • alpi.2
  • aytl2
  • cpla2
  • fam73a
  • fam73b
  • fb68b10
  • fc21c07
  • fd13g09
  • fj78c06
  • gpat2
  • gpat3
  • gpat4
  • gpd1b
  • gpd1h
  • gpd1l
  • im:7147584
  • im:7149526
  • im:7149588
  • lclat1
  • liph
  • lpcat1
  • lycat
  • miga1
  • miga2
  • pla2g10
  • pla2g12a
  • pla2g4
  • pla2g4a
  • pld6
  • si:ch211-262h13.1
  • si:ch211-262h13.2
  • wu:fa16h03
  • wu:fa95f04
  • wu:fb68b10
  • wu:fc21c07
  • wu:fc25a07
  • wu:fc58b05
  • wu:fd13g09
  • wu:fi89e03
  • wu:fj78c06
  • wu:fq33b10
  • zgc:110409
  • zgc:110794
  • zgc:136875
  • zgc:153984
  • zgc:162119
  • zgc:162485
  • zgc:56524
  • zgc:63605
  • zgc:66051
  • zgc:85742
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis of PC
  • CH1073-272H17.1
  • LOC566726
  • PEMT
  • abhd3
  • aytl2
  • cbe
  • cept1
  • cept1b
  • ces2
  • ces2a
  • chat
  • chkb
  • chpt1
  • ctl2
  • ctl4
  • fc21g05
  • im:6908784
  • lpcat1
  • mfsd2ab
  • nls1b
  • pctp
  • pcyt1aa
  • pcyt1b
  • pcyt1ba
  • pemt
  • phospho1
  • si:ch211-218c17.2
  • si:dkey-38l12.2
  • slc44a2
  • slc44a4
  • stard10
  • wu:fc21g05
  • zgc:110237
  • zgc:123305
  • zgc:153863
  • zgc:195139
  • zgc:195150
  • zgc:55479
  • zgc:92800
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis of glycosylphosphatidylinositol (GPI)
  • pigb
  • pign
  • zgc:172324
Danio rerio (zebrafish)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024