GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 226 - 250 of 263 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
O-linked glycosylation
  • AGO61
  • GTDC2
  • POMGNT2
  • POMT1
Gallus gallus (chicken)
Transcriptional regulation by small RNAs
  • AGO1
  • H2A-IX
  • H2AF
  • H2AFX
  • H2AZ2
  • H2B-I
  • H2B-II
  • H2B-III
  • H2B-IV
  • H2B-V
  • H2B-VI
  • H2B-VII
  • H2B-VIII
  • H3-I
  • H3-II
  • H3-III
  • H3-IV
  • H3-IX
  • H3-V
  • H3-VI
  • H3-VII
  • H3-VIII
  • H3-X
  • H4-I
  • H4-II
  • H4-III
  • H4-IV
  • H4-V
  • H4-VI
  • H4-VII
  • HIST1H2B5L
  • LOC100859381
  • LOC426037
  • NUP155
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP54
  • NUP58
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2E
  • POLR2L
  • RAN
  • RPB6
Gallus gallus (chicken)
Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis
  • AGFG1
  • AP2A2
  • AP2M1
  • AREG
  • BTC
  • CLTA
  • COPS2
  • COPS3
  • COPS7A
  • COPS8
  • CSN3
  • EGFR
  • EPGN
  • EPN2
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • IL7R
  • M6PR
  • RCJMB04_15i11
  • RCJMB04_1g20
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL2
  • SH3GL3
  • SH3P4
  • SLC2A8
  • SYBL1
  • SYT1
  • TOR1B
  • UBA80
  • UBB
  • VAMP3
  • VAMP7
Gallus gallus (chicken)
PRC2 methylates histones and DNA
  • AEBP2
  • DNMT3A
  • Dnmt3a
  • EED
  • H2A-IX
  • H2AF
  • H2AFX
  • H2AZ2
  • H2B-I
  • H2B-II
  • H2B-III
  • H2B-IV
  • H2B-V
  • H2B-VI
  • H2B-VII
  • H2B-VIII
  • H3-I
  • H3-II
  • H3-III
  • H3-IV
  • H3-IX
  • H3-V
  • H3-VI
  • H3-VII
  • H3-VIII
  • H3-X
  • H4-I
  • H4-II
  • H4-III
  • H4-IV
  • H4-V
  • H4-VI
  • H4-VII
  • HIST1H2B5L
  • LOC100859381
  • LOC426037
  • RBBP4
Gallus gallus (chicken)
Ub-specific processing proteases
  • ADRB2
  • AR
  • AXIN1
  • AXIN2
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CDC20
  • ChALK5
  • DDB2
  • H2A-IX
  • H2AFX
  • H2B-I
  • H2B-II
  • H2B-III
  • H2B-IV
  • H2B-V
  • H2B-VI
  • H2B-VII
  • H2B-VIII
  • HIST1H2B5L
  • LOC426037
  • LOC769000
  • MADH2
  • MADH3
  • MDM2
  • MYC
  • PTRH2
  • RPS27A
  • RUVBL1
  • SIAH2
  • SKP2
  • SMAD1
  • SMAD3
  • SMAD7
  • SNX3
  • TGFBR1
  • TOMM20
  • TOMM70
  • TRAF6
  • UAF1
  • UBA80
  • UBB
  • USP12
  • USP15
  • USP34
  • USP44
  • Ufd1l
  • WDR20
  • WDR48
Gallus gallus (chicken)
G alpha (q) signalling events
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1D
  • AGTR1
  • ASPR
  • BDKRB1
  • BRS3.5
  • CCK1R
  • CCKAR
  • CCL26
  • CCL4
  • CCLL4
  • CCLi10
  • CCLi7
  • CCLi8
  • CCLi9
  • CCXCR1-L
  • CHRM5
  • CX3CL1
  • CYSLTR1
  • CYSLTR2
  • EDN2
  • EDNRA
  • F2RL1
  • F2RL2
  • GCG
  • GHRL
  • GNA11
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB3
  • GNB4
  • GNG10
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG5
  • GNGT2
  • GNRH1
  • GNRHR1/III
  • GPR103
  • GPR132
  • GPR39
  • GPR65
  • GRM1
  • GRM5
  • GRP
  • HCRT
  • HRH1
  • HTR2A
  • HTR2B
  • HTR2C
  • HTR2b
  • LPAR1
  • LPAR3
  • LPAR4
  • MLNR
  • MT
  • NMB
  • NMBR
  • NMS
  • NMU
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPFF1
  • NPSR1
  • NTSR1
  • OXT
  • OXTR
  • P2RY1
  • P2RY3
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLCB1
  • PLCB4
  • PMCH
  • PROK2
  • PTAFR
  • PTGFR
  • QRFPR
  • RGS17
  • RGS18
  • RGS2
  • RGS4
  • RGS5
  • SCYA4
  • TAC1
  • TACR1
  • TACR3
  • TBXA2R
  • TRH
  • TRHR
  • TRIO
  • UTS2
  • UTS2R
  • ghr
  • ghre
  • tac1
Gallus gallus (chicken)
Surfactant metabolism
  • ADORA2B
  • ADRA2A
  • ADRA2C
  • GATA6
  • LL
  • LMCD1
  • SFTPA1
  • SLC34A1
  • SP-A
  • TTF1
Gallus gallus (chicken)
G alpha (i) signalling events
  • ADORA1
  • ADRA2A
  • ADRA2C
  • APLN
  • APLNR
  • APLNR1
  • BDKRB1
  • CCL19
  • CCL20
  • CCL26
  • CCL4
  • CCLL4
  • CCLi10
  • CCLi6
  • CCLi7
  • CCLi8
  • CCLi9
  • CCR5
  • CCR7
  • CCR8
  • CCRa
  • CEF4
  • CHRM2
  • CM2
  • CX3CL1
  • CX3CR1
  • CXCL13
  • CXCL8
  • CXCR1
  • CXCR4
  • CXCR5
  • DRD3
  • DRD4
  • EMF1
  • EP3
  • GABBR2
  • GAL
  • GALR
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI3
  • GNAT2
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB3
  • GNB4
  • GNG10
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG5
  • GNGT2
  • GPER1
  • GPR1
  • GPR18
  • GPR37L1
  • GPR55
  • GPSM2
  • GRM3
  • Galphai3
  • HTR1B
  • HTR1D
  • HTR1E
  • HTR1F
  • IL8
  • LOC100857191
  • LOC101747503
  • LOC428525
  • LPAR1
  • LPAR3
  • MIP-3alpha
  • MTNR1B
  • NMS
  • NMU
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPBWR1
  • NPW
  • NPY
  • NPY1R
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • OPN3
  • OPN5
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • PENK
  • PMCH
  • PNOC
  • PPY
  • PTGER3
  • PYY
  • RGR
  • RGS17
  • RGS18
  • RGS20
  • RGS4
  • RGS5
  • RGS7
  • RGS8
  • RHO
  • RRH
  • S1PR2
  • SCYA4
  • SRC
  • SS1R
  • SS2
  • SS2R
  • SS3R
  • SST
  • SSTR1
  • SSTR2
  • SSTR4
  • SSTR5
  • SUCNR1
  • TAS2R1
  • TAS2R40
  • TAS2R7
  • UTS2R
  • XCL1
  • cOpn3m
  • k60
  • scyc1
Gallus gallus (chicken)
Adenosine P1 receptors
  • ADORA1
  • ADORA2B
Gallus gallus (chicken)
G alpha (s) signalling events
  • ADCYAP1
  • ADCYAP1R1
  • ADORA2B
  • ADRB2
  • ADRB3
  • CALCA
  • CALCRL
  • CGA
  • CRH
  • CRHR1
  • EP4
  • FSH beta
  • FSHB
  • FSHb
  • GCG
  • GHRH
  • GHRHR
  • GLP-1R
  • GLP2R
  • GNAS
  • GNASXL
  • GNB1
  • GNB3
  • GNB4
  • GNG10
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG5
  • GNGT2
  • GPR27
  • GPR39
  • GRK5
  • HRH2
  • HTR4
  • HTR7
  • IAPP
  • LOC107051813
  • MC1R
  • MC4R
  • MC5R
  • Mc1r
  • NPSR1
  • PACAP
  • PDE4D
  • PDE7B
  • PTGER2
  • PTGER4
  • PTH
  • PTH1R
  • PTH2R
  • PTHLH
  • RAMP2
  • RAMP3
  • TSHB
  • VIP
  • VPAC2
Gallus gallus (chicken)
Degradation of the extracellular matrix
  • ADAMTS5
  • BSG
  • CTSV
  • DCN
  • MMP1
  • MMP10
  • MMP2
  • RCJMB04_11h1
Gallus gallus (chicken)
Collagen biosynthesis and modifying enzymes
  • ADAMTS3
  • BP180
  • BPAG2
  • COL12A1
  • COL17A1
  • COL1A1
  • COL1A2
  • COL3A1
  • COL4A1
  • COL6A2
  • HSP47
  • LEPREL1
  • P3H2
  • SERPINH1
Gallus gallus (chicken)
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
  • ADAMTS10
  • ADAMTS15
  • ADAMTS3
  • ADAMTS5
  • ADAMTS6
  • SEMA5A
Gallus gallus (chicken)
Regulated proteolysis of p75NTR
  • ADAM17
  • NFKB1
  • NGFR
  • PSEN1
  • PSEN2
  • TNFRSF16
  • TRAF6
Gallus gallus (chicken)
Signaling by BMP
  • ACVR2A
  • BMP10
  • BMPR1A
  • BMPR1B
  • BRK-3
  • CER1
  • DSL1
  • GREM2
  • MADH5
  • SMAD1
  • SMAD5
  • SMAD6
  • SMAD7
  • TGFBR3
Gallus gallus (chicken)
Signaling by Activin
  • ACVR1C
  • ACVR2A
  • INHBB
  • LOC769000
  • MADH2
  • MADH3
  • SMAD3
  • TGFBR3
Gallus gallus (chicken)
Clathrin-mediated endocytosis
  • ACTR2
  • ACTR3
  • AGFG1
  • AP2A2
  • AP2M1
  • AREG
  • ARP2
  • ARP3
  • ARPC1A
  • ARPC3
  • ARPC5
  • BIN1
  • BTC
  • CLTA
  • CLTB
  • EGFR
  • EPGN
  • EPN2
  • EREG
  • GAPVD1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HSPA8
  • IL7R
  • M6PR
  • NECAP2
  • PACSIN2
  • PACSIN3
  • PIK3C2A
  • PIP5K1C
  • RAB5A
  • RAB5B
  • RAB5C
  • RCJMB04_1g20
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL2
  • SH3GL3
  • SH3P4
  • SLC2A8
  • SNX18
  • SNX9
  • SYBL1
  • SYT1
  • UBA80
  • UBB
  • VAMP3
  • VAMP7
  • WASL
Gallus gallus (chicken)
Regulation of PLK1 Activity at G2/M Transition
  • ACTR1A
  • BORA
  • CCNB2
  • CDK1
  • CEP41
  • CEP63
  • CEP78
  • CETN1
  • CKAP5
  • CSNK1E
  • CUL1
  • CYCB2
  • DBT
  • DYNC1H1
  • FGFR1OP
  • LIS1
  • LOC420480
  • MBS
  • MYPT1
  • NDE1
  • PAFAH1B1
  • PCM1
  • PLK1
  • PPP1CB
  • PPP1R12A
  • RAB8A
  • RCJMB04_13l14
  • RPS27A
  • SFI1
  • SKP1
  • SKP1A
  • TUBG1
  • UBA80
  • UBB
  • YWHAE
  • YWHAG
Gallus gallus (chicken)
RAF/MAP kinase cascade
  • ACTN2
  • ANGPT1
  • AREG
  • BTC
  • CAMK2A
  • CEK1
  • CEK2
  • CEK3
  • CSF2RA
  • DLG3
  • EGFR
  • EPGN
  • EREG
  • FAK
  • FAK1
  • FGF-18
  • FGF-3
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF8
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FRS2
  • FYN
  • Fgf16
  • Fgf7
  • GDNFRA
  • GFRA1
  • GRB2
  • GRIN1
  • GRIN2B
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • HRAS1
  • IL5
  • IL5RA
  • KIT
  • KITLG
  • KRAS
  • LOC107049501
  • NRAS
  • NRG2
  • PDGF-A (L)
  • PDGFA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTK2
  • PTPRA
  • RASGEF1A
  • RASGRP3
  • RCJMB04_6d2
  • SCF
  • SHC1
  • SOS1
  • SPTBN1
  • TEK
Gallus gallus (chicken)
B-WICH complex positively regulates rRNA expression
  • ACTB
  • DEK
  • H2A-IX
  • H2AF
  • H2AFX
  • H2AZ2
  • H2B-I
  • H2B-II
  • H2B-III
  • H2B-IV
  • H2B-V
  • H2B-VI
  • H2B-VII
  • H2B-VIII
  • H3-I
  • H3-II
  • H3-III
  • H3-IV
  • H3-IX
  • H3-V
  • H3-VI
  • H3-VII
  • H3-VIII
  • H3-X
  • H4-I
  • H4-II
  • H4-III
  • H4-IV
  • H4-V
  • H4-VI
  • H4-VII
  • HIST1H2B5L
  • LOC100859381
  • LOC426037
  • POLR1B
  • POLR2E
  • POLR2L
  • RPB6
  • SF3B1
  • TAF1B
  • TBP
Gallus gallus (chicken)
Iron uptake and transport
  • ACO1
  • CAND1
  • CUL1
  • CYBRD1
  • FTH
  • IREB2
  • PCFT
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SLC40A1
  • SLC46A1
  • UBA80
  • UBB
Gallus gallus (chicken)
Neutrophil degranulation
  • ACLY
  • ACTR10
  • ACTR2
  • AGA
  • ALDOC
  • AMPD3
  • ANG
  • ANPEP
  • ANX2
  • ANXA2
  • AP1M1
  • AP2A2
  • APDE
  • APG7L
  • ARL8A
  • ARMC8
  • ARP2
  • ARPC5
  • ASAH1
  • ATG7
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0C
  • ATP8A1
  • B-FIV
  • B2M
  • BF1
  • BF2
  • BFIV21
  • BST1
  • C1R
  • C1orf35
  • C6orf120
  • CAB39
  • CAND1
  • CAP1
  • CATH
  • CATHB1
  • CATHL1
  • CATHL2
  • CATHL3
  • CCT2
  • CD300LG
  • CD47
  • CEF4
  • CHRNB4
  • CL2
  • CMAP27
  • CMTM6
  • CNN2
  • COMMD3
  • COPB
  • COPB1
  • COTL1
  • CPPED1
  • CREG1
  • CRISP2
  • CST3
  • CSTB
  • CTSD
  • CXCL8
  • CXCR1
  • CYFIP1
  • CYSTM1
  • DEGS1
  • DES1
  • DNAJC3
  • DNCLI1
  • DYNC1H1
  • DYNC1LI1
  • Dsn1/Q9H410
  • EEF1A
  • EEF2
  • EMF1
  • FABP5
  • FTH
  • FUCA2
  • GALNS
  • GNS
  • GPI
  • GUSB
  • GYG1
  • HBB
  • HBE1
  • HEXB
  • HMG1
  • HMGB1
  • HSPA8
  • IL8
  • IMPDH
  • IMPDH2
  • IQGAP3
  • JUP
  • KPNB1
  • KRABZFP
  • LAMP1
  • LGALS3
  • LOC107054567
  • LOC121107389
  • LOC431003
  • LYZ
  • MAPK14
  • MIF
  • MME
  • MMP1
  • NDUFC2
  • NFAM1
  • NFKB1
  • NRAMP1
  • NRAS
  • OGCHI
  • ORM1
  • ORMDL3
  • P2RX1
  • P2X1
  • PA2G4
  • PADI2
  • PFKL
  • PGAM1
  • PGM1
  • PGRMC1
  • PKM
  • PLD1
  • PRCP
  • PRDX4
  • PRKCD
  • PSEN1
  • PSMB1
  • PSMB7
  • PSMC2
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD7
  • PTAFR
  • PYGB
  • QSCN6
  • QSOX
  • QSOX1
  • RAB14
  • RAB18
  • RAB31
  • RAB5B
  • RAB5C
  • RAB6A
  • RAB7A
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RCJMB04_11h1
  • RCJMB04_14i9
  • RCJMB04_16g14
  • RCJMB04_23k2
  • RCJMB04_2a4
  • RCJMB04_35e13
  • RCJMB04_9e23
  • RHOA
  • RHOG
  • Rab27a
  • S100A10
  • S100A11
  • SERPINB14
  • SLC11A1
  • SLC2A14
  • SLC2A5
  • SLCO4C1
  • SNAP
  • SNAP23
  • SNAP25
  • SNAP29
  • SOX
  • SRP14
  • STBD1
  • STING
  • STING1
  • STK10
  • STOM
  • SURF4
  • SVIP
  • TIMP2
  • TMEM173
  • TMEM30A
  • TMEM63A
  • TNFAIP6
  • TNFIP6
  • TNFRSF1B
  • TOM1
  • TSPAN14
  • TTR
  • VCL
  • VCP
  • VINC1
  • YPEL5
  • YRK
  • cPAD2
  • cRac1A
  • cRhoA
  • cpsmb7
  • k60
  • ogchi
  • rhoA
  • vcp
Gallus gallus (chicken)
Stimuli-sensing channels
  • ACCN2
  • ANO10
  • ASIC1
  • BEST3
  • BEST4
  • CATSPER4
  • CLCN4
  • MIL
  • NALCN
  • OSTM1
  • RAF1
  • RCJMB04_16g8
  • RPS27A
  • SCNN1G
  • SGK
  • SGK1
  • SGK2
  • STOM
  • STOML3
  • UBA80
  • UBB
  • WWP1
Gallus gallus (chicken)
Synthesis of PC
  • ABHD3
  • CEPT1
  • CHAT
  • CHKA
  • CHPT1
  • MFSD2A
  • NLS1
  • SLC44A5
Gallus gallus (chicken)
Arachidonate production from DAG
  • ABHD12
  • ABHD6
Gallus gallus (chicken)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024