GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 226 - 250 of 263 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Regulation of insulin secretion
  • CACNA1D
  • CACNB2
  • KCNJ11
  • LOC107050029
  • PRKACB
  • RAPGEF4
Gallus gallus (chicken)
Ion homeostasis
  • ATP1B3
  • ATP2A2
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • CAMK2A
  • COX16
  • ITPR2
  • KCNJ11
  • NCX1
  • PLN
  • PMCA1
  • RCJMB04_3a16
  • SLC8A1
  • SLC8A2
  • STIM1
  • TRPC1
Gallus gallus (chicken)
Glycolysis
  • ALDOB
  • ALDOC
  • ENO2
  • ENO4
  • GAPD
  • GAPDH
  • GNPDA1
  • GNPDA2
  • GPI
  • PFKL
  • PGAM1
  • PGM2L1
  • PKM
  • RCJMB04_32o10
  • TPI1
Gallus gallus (chicken)
Interferon alpha/beta signaling
  • ABCE1
  • IFN-gamma
  • IFN2
  • IFNA
  • IFNA1
  • IFNA2
  • IFNA3
  • IFNB
  • JAK1
  • KPNB1
  • LOC100857947
  • LOC100858506
  • LOC100859414
  • LOC768614
  • RCJMB04_17i9
  • RPS27A
  • SOCS1
  • SOCS3
  • UBA80
  • UBB
Gallus gallus (chicken)
Platelet degranulation
  • ABCC4
  • ACTG1
  • ACTN1
  • ACTN2
  • ALB
  • ANX5
  • ANXA5
  • APLP2
  • APOA1
  • CD9
  • CDC37L1
  • CLEC3B
  • F13A1
  • FAM3C
  • FAM49B
  • FN1
  • GTPBP2
  • HABP4
  • IGF1
  • IGF2
  • IMP-3
  • ITGB3
  • LHFPL2
  • OGCHI
  • OLA1
  • ORM1
  • PDGF-A (L)
  • PDGFA
  • PLG
  • QSCN6
  • QSOX
  • QSOX1
  • RARRES2
  • RCJMB04_1m12
  • SOX
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TIMP3
  • TOR4A
  • VCL
  • VEGFD
  • VINC1
  • VTI1B
  • mage
  • ogchi
Gallus gallus (chicken)
VLDLR internalisation and degradation
  • AP2A2
  • AP2M1
  • CLTA
  • NR1H3
  • RCJMB04_3l2
  • RPS27A
  • UBA80
  • UBB
  • VLDLR
  • VTGR
Gallus gallus (chicken)
Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis
  • AGFG1
  • AP2A2
  • AP2M1
  • AREG
  • BTC
  • CLTA
  • COPS2
  • COPS3
  • COPS7A
  • COPS8
  • CSN3
  • EGFR
  • EPGN
  • EPN2
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • IL7R
  • M6PR
  • RCJMB04_15i11
  • RCJMB04_1g20
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL2
  • SH3GL3
  • SH3P4
  • SLC2A8
  • SYBL1
  • SYT1
  • TOR1B
  • UBA80
  • UBB
  • VAMP3
  • VAMP7
Gallus gallus (chicken)
Clathrin-mediated endocytosis
  • ACTR2
  • ACTR3
  • AGFG1
  • AP2A2
  • AP2M1
  • AREG
  • ARP2
  • ARP3
  • ARPC1A
  • ARPC3
  • ARPC5
  • BIN1
  • BTC
  • CLTA
  • CLTB
  • EGFR
  • EPGN
  • EPN2
  • EREG
  • GAPVD1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HSPA8
  • IL7R
  • M6PR
  • NECAP2
  • PACSIN2
  • PACSIN3
  • PIK3C2A
  • PIP5K1C
  • RAB5A
  • RAB5B
  • RAB5C
  • RCJMB04_1g20
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL2
  • SH3GL3
  • SH3P4
  • SLC2A8
  • SNX18
  • SNX9
  • SYBL1
  • SYT1
  • UBA80
  • UBB
  • VAMP3
  • VAMP7
  • WASL
Gallus gallus (chicken)
Miscellaneous transport and binding events
  • ANKH
  • LOC107056693
  • LRRC8A
  • LRRC8C
  • LRRC8D
  • NIPA2
  • NIPAL3
  • PQLC2
  • SLC66A1
Gallus gallus (chicken)
PRC2 methylates histones and DNA
  • AEBP2
  • DNMT3A
  • Dnmt3a
  • EED
  • H2A-IX
  • H2AF
  • H2AFX
  • H2AZ2
  • H2B-I
  • H2B-II
  • H2B-III
  • H2B-IV
  • H2B-V
  • H2B-VI
  • H2B-VII
  • H2B-VIII
  • H3-I
  • H3-II
  • H3-III
  • H3-IV
  • H3-IX
  • H3-V
  • H3-VI
  • H3-VII
  • H3-VIII
  • H3-X
  • H4-I
  • H4-II
  • H4-III
  • H4-IV
  • H4-V
  • H4-VI
  • H4-VII
  • HIST1H2B5L
  • LOC100859381
  • LOC426037
  • RBBP4
Gallus gallus (chicken)
VxPx cargo-targeting to cilium
  • ARF4
  • EXOC2
  • EXOC3
  • EXOC7
  • EXOC8
  • RAB11A
  • RAB8A
  • RHO
Gallus gallus (chicken)
MHC class II antigen presentation
  • AP1G1
  • AP1M1
  • AP1S2
  • AP2A2
  • AP2M1
  • ARF1
  • BLB1
  • BLB2
  • CLTA
  • CTSD
  • CTSV
  • Ii
  • RCJMB04_1m17
  • SH3GL2
  • SH3P4
Gallus gallus (chicken)
Post-translational modification: synthesis of GPI-anchored proteins
  • ALPL
  • B-FIV
  • BF1
  • BF2
  • BFIV21
  • BST1
  • CNTN5
  • CPM
  • FAR2
  • LOC101747868
  • LY6CLEL
  • LYPD1
  • LYPD6B
  • NRN1
  • NRN1L
  • OPCML
  • PRN-P
  • PRNP
  • RECK
  • RTN4R
  • SPRN
  • TECTB
  • THY1
Gallus gallus (chicken)
Nicotinate metabolism
  • BST1
  • CD38
  • NADK
  • NMNAT1
  • NMNAT2
Gallus gallus (chicken)
Collagen biosynthesis and modifying enzymes
  • ADAMTS3
  • BP180
  • BPAG2
  • COL12A1
  • COL17A1
  • COL1A1
  • COL1A2
  • COL3A1
  • COL4A1
  • COL6A2
  • HSP47
  • LEPREL1
  • P3H2
  • SERPINH1
Gallus gallus (chicken)
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
  • ADAMTS10
  • ADAMTS15
  • ADAMTS3
  • ADAMTS5
  • ADAMTS6
  • SEMA5A
Gallus gallus (chicken)
Aspirin ADME
  • ABCC3
  • ALB
  • BSG
  • CYP2D6
  • RCJMB04_4e8
Gallus gallus (chicken)
Extra-nuclear estrogen signaling
  • AKT1
  • AREG
  • BTC
  • CAV1
  • EGFR
  • EPGN
  • EREG
  • FAK
  • FAK1
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI3
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB3
  • GNB4
  • GNG10
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG5
  • GNGT2
  • Galphai3
  • HBEGF
  • HEGFL
  • MMP10
  • MMP2
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTK2
  • SHC1
  • SPHK1
  • SRC
  • ZDHHC21
  • ZDHHC7
Gallus gallus (chicken)
Degradation of the extracellular matrix
  • ADAMTS5
  • BSG
  • CTSV
  • DCN
  • MMP1
  • MMP10
  • MMP2
  • RCJMB04_11h1
Gallus gallus (chicken)
Pentose phosphate pathway
  • RBKS
  • RCJMB04_14h20
  • RCJMB04_22k15
  • TALDO1
  • TKTL1
Gallus gallus (chicken)
G alpha (i) signalling events
  • ADORA1
  • ADRA2A
  • ADRA2C
  • APLN
  • APLNR
  • APLNR1
  • BDKRB1
  • CCL19
  • CCL20
  • CCL26
  • CCL4
  • CCLL4
  • CCLi10
  • CCLi6
  • CCLi7
  • CCLi8
  • CCLi9
  • CCR5
  • CCR7
  • CCR8
  • CCRa
  • CEF4
  • CHRM2
  • CM2
  • CX3CL1
  • CX3CR1
  • CXCL13
  • CXCL8
  • CXCR1
  • CXCR4
  • CXCR5
  • DRD3
  • DRD4
  • EMF1
  • EP3
  • GABBR2
  • GAL
  • GALR
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI3
  • GNAT2
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB3
  • GNB4
  • GNG10
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG5
  • GNGT2
  • GPER1
  • GPR1
  • GPR18
  • GPR37L1
  • GPR55
  • GPSM2
  • GRM3
  • Galphai3
  • HTR1B
  • HTR1D
  • HTR1E
  • HTR1F
  • IL8
  • LOC100857191
  • LOC101747503
  • LOC428525
  • LPAR1
  • LPAR3
  • MIP-3alpha
  • MTNR1B
  • NMS
  • NMU
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPBWR1
  • NPW
  • NPY
  • NPY1R
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • OPN3
  • OPN5
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • PENK
  • PMCH
  • PNOC
  • PPY
  • PTGER3
  • PYY
  • RGR
  • RGS17
  • RGS18
  • RGS20
  • RGS4
  • RGS5
  • RGS7
  • RGS8
  • RHO
  • RRH
  • S1PR2
  • SCYA4
  • SRC
  • SS1R
  • SS2
  • SS2R
  • SS3R
  • SST
  • SSTR1
  • SSTR2
  • SSTR4
  • SSTR5
  • SUCNR1
  • TAS2R1
  • TAS2R40
  • TAS2R7
  • UTS2R
  • XCL1
  • cOpn3m
  • k60
  • scyc1
Gallus gallus (chicken)
G alpha (s) signalling events
  • ADCYAP1
  • ADCYAP1R1
  • ADORA2B
  • ADRB2
  • ADRB3
  • CALCA
  • CALCRL
  • CGA
  • CRH
  • CRHR1
  • EP4
  • FSH beta
  • FSHB
  • FSHb
  • GCG
  • GHRH
  • GHRHR
  • GLP-1R
  • GLP2R
  • GNAS
  • GNASXL
  • GNB1
  • GNB3
  • GNB4
  • GNG10
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG5
  • GNGT2
  • GPR27
  • GPR39
  • GRK5
  • HRH2
  • HTR4
  • HTR7
  • IAPP
  • LOC107051813
  • MC1R
  • MC4R
  • MC5R
  • Mc1r
  • NPSR1
  • PACAP
  • PDE4D
  • PDE7B
  • PTGER2
  • PTGER4
  • PTH
  • PTH1R
  • PTH2R
  • PTHLH
  • RAMP2
  • RAMP3
  • TSHB
  • VIP
  • VPAC2
Gallus gallus (chicken)
RHO GTPases activate PKNs
  • ARHC
  • PKN2
  • PKN3
  • RCJMB04_6p10
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • cRac1A
  • cRhoA
  • cRhoB
  • rhoA
  • rhoB
Gallus gallus (chicken)
Integrin signaling
  • AKT1
  • FAK
  • FAK1
  • FN1
  • ITGB3
  • PTK2
  • PTPN1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RAPGEF4
  • RCJMB04_6d2
  • RCJMB04_6p10
  • SHC1
  • SRC
  • SYK
Gallus gallus (chicken)
VEGFR2 mediated vascular permeability
  • AKT1
  • CAV1
  • CDH5
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • JUP
  • MAPKAP1
  • MTOR
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • RCJMB04_6p10
  • RICTOR
  • SIN1
  • THEM4
  • VAV3
  • cRac1A
Gallus gallus (chicken)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024