GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 263 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
  • AREG
  • BCAP
  • BTC
  • CEK1
  • CEK2
  • CEK3
  • EGFR
  • EPGN
  • EREG
  • FGF-18
  • FGF-3
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF8
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FRS2
  • FYN
  • Fgf16
  • Fgf7
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • KIT
  • KITLG
  • NRG2
  • PDGF-A (L)
  • PDGFA
  • PIK3AP1
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIP4K2B
  • PIP5K1B
  • PIP5K1C
  • PTPN11
  • RCJMB04_38b23
  • RHOG
  • SCF
  • SRC
  • TRAT1
  • cRac1A
Gallus gallus (chicken)
PRC2 methylates histones and DNA
  • AEBP2
  • DNMT3A
  • Dnmt3a
  • EED
  • H2A-IX
  • H2AF
  • H2AFX
  • H2AZ2
  • H2B-I
  • H2B-II
  • H2B-III
  • H2B-IV
  • H2B-V
  • H2B-VI
  • H2B-VII
  • H2B-VIII
  • H3-I
  • H3-II
  • H3-III
  • H3-IV
  • H3-IX
  • H3-V
  • H3-VI
  • H3-VII
  • H3-VIII
  • H3-X
  • H4-I
  • H4-II
  • H4-III
  • H4-IV
  • H4-V
  • H4-VI
  • H4-VII
  • HIST1H2B5L
  • LOC100859381
  • LOC426037
  • RBBP4
Gallus gallus (chicken)
Pentose phosphate pathway
  • RBKS
  • RCJMB04_14h20
  • RCJMB04_22k15
  • TALDO1
  • TKTL1
Gallus gallus (chicken)
Peptide ligand-binding receptors
  • AGTR1
  • APLN
  • APLNR
  • APLNR1
  • BDKRB1
  • BRS3.5
  • CCK1R
  • CCKAR
  • ECE-1
  • EDN2
  • EDNRA
  • F2RL1
  • F2RL2
  • GAL
  • GALR
  • GPER1
  • GPR37L1
  • GRP
  • MC1R
  • MC4R
  • MC5R
  • MLNR
  • Mc1r
  • NMB
  • NMBR
  • NMS
  • NMU
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPBWR1
  • NPSR1
  • NPW
  • NPY
  • NPY1R
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • NTSR1
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • PENK
  • PMCH
  • PNOC
  • PPY
  • PROK2
  • PYY
  • SS1R
  • SS2
  • SS2R
  • SS3R
  • SST
  • SSTR1
  • SSTR2
  • SSTR4
  • SSTR5
  • TRH
  • TRHR
  • UTS2
  • UTS2R
  • XK
Gallus gallus (chicken)
Phospholipase C-mediated cascade: FGFR1
  • CEK1
  • FGF-3
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGFR1
Gallus gallus (chicken)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR2
  • CEK3
  • FGF-18
  • FGF-3
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF8
  • FGFR2
  • Fgf16
  • Fgf7
Gallus gallus (chicken)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR3
  • CEK2
  • FGF-18
  • FGF1
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF8
  • FGFR3
  • Fgf16
Gallus gallus (chicken)
Platelet Adhesion to exposed collagen
  • GP1BB
  • GP9
  • LRRC54
  • TSK
  • TSKU
Gallus gallus (chicken)
Platelet Aggregation (Plug Formation)
  • GP1BB
  • GP9
  • LRRC54
  • TSK
  • TSKU
Gallus gallus (chicken)
Platelet degranulation
  • ABCC4
  • ACTG1
  • ACTN1
  • ACTN2
  • ALB
  • ANX5
  • ANXA5
  • APLP2
  • APOA1
  • CD9
  • CDC37L1
  • CLEC3B
  • F13A1
  • FAM3C
  • FAM49B
  • FN1
  • GTPBP2
  • HABP4
  • IGF1
  • IGF2
  • IMP-3
  • ITGB3
  • LHFPL2
  • OGCHI
  • OLA1
  • ORM1
  • PDGF-A (L)
  • PDGFA
  • PLG
  • QSCN6
  • QSOX
  • QSOX1
  • RARRES2
  • RCJMB04_1m12
  • SOX
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TIMP3
  • TOR4A
  • VCL
  • VEGFD
  • VINC1
  • VTI1B
  • mage
  • ogchi
Gallus gallus (chicken)
Post-translational modification: synthesis of GPI-anchored proteins
  • ALPL
  • B-FIV
  • BF1
  • BF2
  • BFIV21
  • BST1
  • CNTN5
  • CPM
  • FAR2
  • LOC101747868
  • LY6CLEL
  • LYPD1
  • LYPD6B
  • NRN1
  • NRN1L
  • OPCML
  • PRN-P
  • PRNP
  • RECK
  • RTN4R
  • SPRN
  • TECTB
  • THY1
Gallus gallus (chicken)
Post-translational protein phosphorylation
  • ALB
  • APLP2
  • APOA1
  • BMP4
  • CCN1
  • CDH2
  • CG-1B
  • CST3
  • CYR61
  • DNAJC3
  • FGF23
  • FN1
  • FUCA2
  • HSP90B1
  • IGFBP5
  • IL6
  • MATN3
  • MFGE8
  • MGAT4A
  • MXRA8
  • PENK
  • PNPLA2
  • PRSS23
  • QSCN6
  • QSOX
  • QSOX1
  • RCJMB04_11h1
  • RCN1
  • SDC2
  • SERPIND1
  • SOX
  • STC2
Gallus gallus (chicken)
Processing of DNA double-strand break ends
  • BABAM2
  • BRE
  • BRIP1
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CDK2
  • DNA2
  • DNA2L
  • FANCJ
  • H2AFX
  • H2B-I
  • H2B-II
  • H2B-III
  • H2B-IV
  • H2B-V
  • H2B-VI
  • H2B-VII
  • H2B-VIII
  • H4-I
  • H4-II
  • H4-III
  • H4-IV
  • H4-V
  • H4-VI
  • H4-VII
  • HIST1H2B5L
  • HUS1
  • LOC100859381
  • LOC426037
  • PIAS4
  • PPP4R2
  • RAD1
  • RAD9A
  • RCJMB04_6d17
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RMI2
  • RPA1
  • RPA3
  • SUMO2
  • TOPBP1
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • rad9
Gallus gallus (chicken)
Progressive trimming of alpha-1,2-linked mannose residues from Man9/8/7GlcNAc2 to produce Man5GlcNAc2
  • MAN1C1
Gallus gallus (chicken)
Proton-coupled monocarboxylate transport
  • BSG
  • RCJMB04_4e8
  • SLC16A7
Gallus gallus (chicken)
RAF/MAP kinase cascade
  • ACTN2
  • ANGPT1
  • AREG
  • BTC
  • CAMK2A
  • CEK1
  • CEK2
  • CEK3
  • CSF2RA
  • DLG3
  • EGFR
  • EPGN
  • EREG
  • FAK
  • FAK1
  • FGF-18
  • FGF-3
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF8
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FRS2
  • FYN
  • Fgf16
  • Fgf7
  • GDNFRA
  • GFRA1
  • GRB2
  • GRIN1
  • GRIN2B
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • HRAS1
  • IL5
  • IL5RA
  • KIT
  • KITLG
  • KRAS
  • LOC107049501
  • NRAS
  • NRG2
  • PDGF-A (L)
  • PDGFA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTK2
  • PTPRA
  • RASGEF1A
  • RASGRP3
  • RCJMB04_6d2
  • SCF
  • SHC1
  • SOS1
  • SPTBN1
  • TEK
Gallus gallus (chicken)
RET signaling
  • DOK1
  • FRS2
  • GDNFRA
  • GFRA1
  • GRB10
  • GRB2
  • PDLIM7
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRKCA
  • PTPN11
  • SHC1
  • SOS1
  • SRC
Gallus gallus (chicken)
RHO GTPases activate PAKs
  • CDC42
  • LIMK1
  • MBS
  • MYH9
  • MYL12B
  • MYPT1
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PPP1CB
  • PPP1R12A
  • RCJMB04_19i21
  • cRac1A
Gallus gallus (chicken)
RHO GTPases activate PKNs
  • ARHC
  • PKN2
  • PKN3
  • RCJMB04_6p10
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • cRac1A
  • cRhoA
  • cRhoB
  • rhoA
  • rhoB
Gallus gallus (chicken)
RNA Polymerase I Promoter Escape
  • CBX3
  • ERCC3
  • GTF2H2
  • GTF2H5
  • H2A-IX
  • H2AF
  • H2AFX
  • H2AZ2
  • H2B-I
  • H2B-II
  • H2B-III
  • H2B-IV
  • H2B-V
  • H2B-VI
  • H2B-VII
  • H2B-VIII
  • H3-I
  • H3-II
  • H3-III
  • H3-IV
  • H3-IX
  • H3-V
  • H3-VI
  • H3-VII
  • H3-VIII
  • H3-X
  • H4-I
  • H4-II
  • H4-III
  • H4-IV
  • H4-V
  • H4-VI
  • H4-VII
  • HIST1H2B5L
  • LOC100859381
  • LOC426037
  • MNAT1
  • POLR1B
  • POLR2E
  • POLR2L
  • RPB6
  • TAF1B
  • TBP
Gallus gallus (chicken)
RNA Polymerase I Promoter Opening
  • H2A-IX
  • H2AF
  • H2AFX
  • H2AZ2
  • H2B-I
  • H2B-II
  • H2B-III
  • H2B-IV
  • H2B-V
  • H2B-VI
  • H2B-VII
  • H2B-VIII
  • H3-I
  • H3-II
  • H3-III
  • H3-IV
  • H3-IX
  • H3-V
  • H3-VI
  • H3-VII
  • H3-VIII
  • H3-X
  • H4-I
  • H4-II
  • H4-III
  • H4-IV
  • H4-V
  • H4-VI
  • H4-VII
  • HIST1H2B5L
  • LOC100859381
  • LOC426037
Gallus gallus (chicken)
ROS and RNS production in phagocytes
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E1
  • ATP6V1A
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1G3
  • NCF4
  • NOS2
  • NRAMP1
  • RCJMB04_10e23
  • RCJMB04_38b23
  • RCJMB04_9e23
  • SLC11A1
Gallus gallus (chicken)
RUNX1 regulates genes involved in megakaryocyte differentiation and platelet function
  • CBFB
  • H2A-IX
  • H2AF
  • H2AFX
  • H2AZ2
  • H2B-I
  • H2B-II
  • H2B-III
  • H2B-IV
  • H2B-V
  • H2B-VI
  • H2B-VII
  • H2B-VIII
  • H3-I
  • H3-II
  • H3-III
  • H3-IV
  • H3-IX
  • H3-V
  • H3-VI
  • H3-VII
  • H3-VIII
  • H3-X
  • H4-I
  • H4-II
  • H4-III
  • H4-IV
  • H4-V
  • H4-VI
  • H4-VII
  • HDAC1
  • HDAC1A
  • HIST1H2B5L
  • LOC100859381
  • LOC426037
  • RBBP5
  • RCJMB04_25e24
  • RUNX1
  • SIN3A
  • SIN3B
Gallus gallus (chicken)
RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of keratinocytes
  • CTSV
  • SERPINB14
Gallus gallus (chicken)
Reactions specific to the complex N-glycan synthesis pathway
Gallus gallus (chicken)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024