GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 201 - 225 of 250 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA
  • CBC1
  • CBC2
  • CBP20
  • CBP80
  • GCR3
  • HMD1
  • MUD13
  • NAB3
  • RPA7
  • RPB1
  • RPB10
  • RPB11
  • RPB12
  • RPB150
  • RPB2
  • RPB220
  • RPB3
  • RPB4
  • RPB5
  • RPB6
  • RPB7
  • RPB8
  • RPB9
  • RPC10
  • RPC9
  • RPO21
  • RPO22
  • RPO26
  • SAE1
  • SSU71
  • STO1
  • SUA8
  • SUT1
  • TFG1
  • TFG2
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
RNA polymerase II transcribes snRNA genes
  • BTF1
  • BUR2
  • CRZ1
  • CST4
  • CTK1
  • CTK2
  • FUN81
  • HAL8
  • KIN28
  • RPA7
  • RPB1
  • RPB10
  • RPB11
  • RPB12
  • RPB150
  • RPB2
  • RPB220
  • RPB3
  • RPB4
  • RPB5
  • RPB6
  • RPB7
  • RPB8
  • RPB9
  • RPC10
  • RPC9
  • RPO21
  • RPO22
  • RPO26
  • RTR1
  • RTT103
  • SPT15
  • SPT3
  • SSU71
  • SUA7
  • SUA8
  • TAF11
  • TAF13
  • TAF17
  • TAF19
  • TAF40
  • TAF5
  • TAF6
  • TAF60
  • TAF9
  • TAF90
  • TBP1
  • TCN1
  • TFA1
  • TFA2
  • TFG1
  • TFG2
  • TOA1
  • TOA2
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Formation of the Early Elongation Complex
  • CBC1
  • CBC2
  • CBP20
  • CBP80
  • CCL1
  • FCP1
  • GCR3
  • KIN28
  • LOM3
  • MUD13
  • RAD25
  • RAD3
  • REM1
  • RIG2
  • RPA7
  • RPB1
  • RPB10
  • RPB11
  • RPB12
  • RPB150
  • RPB2
  • RPB220
  • RPB3
  • RPB4
  • RPB5
  • RPB6
  • RPB7
  • RPB8
  • RPB9
  • RPC10
  • RPC9
  • RPO21
  • RPO22
  • RPO26
  • SAE1
  • SPT4
  • SPT5
  • SSL1
  • SSL2
  • SSU71
  • STO1
  • SUA8
  • SUT1
  • TFB1
  • TFB2
  • TFB3
  • TFB4
  • TFB5
  • TFG1
  • TFG2
  • UVS112
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE
  • ABD1
  • CCL1
  • CEG1
  • KIN28
  • LOM3
  • RAD25
  • RAD3
  • REM1
  • RIG2
  • RPA7
  • RPB1
  • RPB10
  • RPB11
  • RPB12
  • RPB150
  • RPB2
  • RPB220
  • RPB3
  • RPB4
  • RPB5
  • RPB6
  • RPB7
  • RPB8
  • RPB9
  • RPC10
  • RPC9
  • RPO21
  • RPO22
  • RPO26
  • SPT5
  • SSL1
  • SSL2
  • SSU71
  • SUA8
  • TFB1
  • TFB2
  • TFB3
  • TFB4
  • TFB5
  • TFG1
  • TFG2
  • UVS112
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
mRNA Capping
  • ABD1
  • CBC1
  • CBC2
  • CBP20
  • CBP80
  • CCL1
  • CEG1
  • GCR3
  • KIN28
  • LOM3
  • MUD13
  • RAD25
  • RAD3
  • REM1
  • RIG2
  • RPA7
  • RPB1
  • RPB10
  • RPB11
  • RPB12
  • RPB150
  • RPB2
  • RPB220
  • RPB3
  • RPB4
  • RPB5
  • RPB6
  • RPB7
  • RPB8
  • RPB9
  • RPC10
  • RPC9
  • RPO21
  • RPO22
  • RPO26
  • SAE1
  • SPT5
  • SSL1
  • SSL2
  • SSU71
  • STO1
  • SUA8
  • SUT1
  • TFB1
  • TFB2
  • TFB3
  • TFB4
  • TFB5
  • TFG1
  • TFG2
  • UVS112
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
TP53 Regulates Transcription of DNA Repair Genes
  • BUR1
  • BUR2
  • CCL1
  • CDC68
  • CST4
  • CTK1
  • CTK2
  • DST1
  • ELA1
  • ELC1
  • FCP1
  • KIN28
  • LOM3
  • POB3
  • PPR2
  • RAD25
  • RAD3
  • REM1
  • RIG2
  • RPA7
  • RPB1
  • RPB10
  • RPB11
  • RPB12
  • RPB150
  • RPB2
  • RPB220
  • RPB3
  • RPB4
  • RPB5
  • RPB6
  • RPB7
  • RPB8
  • RPB9
  • RPC10
  • RPC9
  • RPO21
  • RPO22
  • RPO26
  • SGV1
  • SPT16
  • SPT4
  • SPT5
  • SSF1
  • SSL1
  • SSL2
  • SSU71
  • SUA8
  • TFB1
  • TFB2
  • TFB3
  • TFB4
  • TFB5
  • TFG1
  • TFG2
  • UVS112
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
RNA Polymerase II Transcription Initiation And Promoter Clearance
  • BTF1
  • CCL1
  • FUN81
  • KIN28
  • LOM3
  • MPT1
  • RAD25
  • RAD3
  • REM1
  • RIG2
  • RPA7
  • RPB1
  • RPB10
  • RPB11
  • RPB12
  • RPB150
  • RPB2
  • RPB220
  • RPB3
  • RPB4
  • RPB5
  • RPB6
  • RPB7
  • RPB8
  • RPB9
  • RPC10
  • RPC9
  • RPO21
  • RPO22
  • RPO26
  • SPT15
  • SPT3
  • SSL1
  • SSL2
  • SSU71
  • SUA7
  • SUA8
  • TAF1
  • TAF10
  • TAF11
  • TAF12
  • TAF13
  • TAF130
  • TAF145
  • TAF150
  • TAF17
  • TAF19
  • TAF2
  • TAF23
  • TAF25
  • TAF4
  • TAF40
  • TAF48
  • TAF5
  • TAF6
  • TAF60
  • TAF61
  • TAF67
  • TAF68
  • TAF7
  • TAF9
  • TAF90
  • TBP1
  • TFA1
  • TFA2
  • TFB1
  • TFB2
  • TFB3
  • TFB4
  • TFB5
  • TFG1
  • TFG2
  • TOA1
  • TOA2
  • TSG2
  • TSM1
  • UVS112
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
RNA Polymerase II Transcription Initiation
  • BTF1
  • CCL1
  • FUN81
  • KIN28
  • LOM3
  • MPT1
  • RAD25
  • RAD3
  • REM1
  • RIG2
  • RPA7
  • RPB1
  • RPB10
  • RPB11
  • RPB12
  • RPB150
  • RPB2
  • RPB220
  • RPB3
  • RPB4
  • RPB5
  • RPB6
  • RPB7
  • RPB8
  • RPB9
  • RPC10
  • RPC9
  • RPO21
  • RPO22
  • RPO26
  • SPT15
  • SPT3
  • SSL1
  • SSL2
  • SSU71
  • SUA7
  • SUA8
  • TAF1
  • TAF10
  • TAF11
  • TAF12
  • TAF13
  • TAF130
  • TAF145
  • TAF150
  • TAF17
  • TAF19
  • TAF2
  • TAF23
  • TAF25
  • TAF4
  • TAF40
  • TAF48
  • TAF5
  • TAF6
  • TAF60
  • TAF61
  • TAF67
  • TAF68
  • TAF7
  • TAF9
  • TAF90
  • TBP1
  • TFA1
  • TFA2
  • TFB1
  • TFB2
  • TFB3
  • TFB4
  • TFB5
  • TFG1
  • TFG2
  • TOA1
  • TOA2
  • TSG2
  • TSM1
  • UVS112
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
RNA Polymerase II Transcription Pre-Initiation And Promoter Opening
  • BTF1
  • CCL1
  • FUN81
  • KIN28
  • LOM3
  • MPT1
  • RAD25
  • RAD3
  • REM1
  • RIG2
  • RPA7
  • RPB1
  • RPB10
  • RPB11
  • RPB12
  • RPB150
  • RPB2
  • RPB220
  • RPB3
  • RPB4
  • RPB5
  • RPB6
  • RPB7
  • RPB8
  • RPB9
  • RPC10
  • RPC9
  • RPO21
  • RPO22
  • RPO26
  • SPT15
  • SPT3
  • SSL1
  • SSL2
  • SSU71
  • SUA7
  • SUA8
  • TAF1
  • TAF10
  • TAF11
  • TAF12
  • TAF13
  • TAF130
  • TAF145
  • TAF150
  • TAF17
  • TAF19
  • TAF2
  • TAF23
  • TAF25
  • TAF4
  • TAF40
  • TAF48
  • TAF5
  • TAF6
  • TAF60
  • TAF61
  • TAF67
  • TAF68
  • TAF7
  • TAF9
  • TAF90
  • TBP1
  • TFA1
  • TFA2
  • TFB1
  • TFB2
  • TFB3
  • TFB4
  • TFB5
  • TFG1
  • TFG2
  • TOA1
  • TOA2
  • TSG2
  • TSM1
  • UVS112
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
RNA Polymerase II Promoter Escape
  • BTF1
  • CCL1
  • FUN81
  • KIN28
  • LOM3
  • MPT1
  • RAD25
  • RAD3
  • REM1
  • RIG2
  • RPA7
  • RPB1
  • RPB10
  • RPB11
  • RPB12
  • RPB150
  • RPB2
  • RPB220
  • RPB3
  • RPB4
  • RPB5
  • RPB6
  • RPB7
  • RPB8
  • RPB9
  • RPC10
  • RPC9
  • RPO21
  • RPO22
  • RPO26
  • SPT15
  • SPT3
  • SSL1
  • SSL2
  • SSU71
  • SUA7
  • SUA8
  • TAF1
  • TAF10
  • TAF11
  • TAF12
  • TAF13
  • TAF130
  • TAF145
  • TAF150
  • TAF17
  • TAF19
  • TAF2
  • TAF23
  • TAF25
  • TAF4
  • TAF40
  • TAF48
  • TAF5
  • TAF6
  • TAF60
  • TAF61
  • TAF67
  • TAF68
  • TAF7
  • TAF9
  • TAF90
  • TBP1
  • TFA1
  • TFA2
  • TFB1
  • TFB2
  • TFB3
  • TFB4
  • TFB5
  • TFG1
  • TFG2
  • TOA1
  • TOA2
  • TSG2
  • TSM1
  • UVS112
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
RNA Polymerase II Pre-transcription Events
  • BTF1
  • BUR2
  • CBC1
  • CBC2
  • CBP20
  • CBP80
  • CCL1
  • CDC68
  • CST4
  • CTK1
  • CTK2
  • FCP1
  • FUN81
  • GCR3
  • KIN28
  • LOM3
  • MPT1
  • MUD13
  • POB3
  • RAD25
  • RAD3
  • REM1
  • RIG2
  • RPA7
  • RPB1
  • RPB10
  • RPB11
  • RPB12
  • RPB150
  • RPB2
  • RPB220
  • RPB3
  • RPB4
  • RPB5
  • RPB6
  • RPB7
  • RPB8
  • RPB9
  • RPC10
  • RPC9
  • RPO21
  • RPO22
  • RPO26
  • SAE1
  • SPT15
  • SPT16
  • SPT3
  • SPT4
  • SPT5
  • SSF1
  • SSL1
  • SSL2
  • SSU71
  • STO1
  • SUA7
  • SUA8
  • SUT1
  • TAF1
  • TAF10
  • TAF11
  • TAF12
  • TAF13
  • TAF130
  • TAF145
  • TAF150
  • TAF17
  • TAF19
  • TAF2
  • TAF23
  • TAF25
  • TAF4
  • TAF40
  • TAF48
  • TAF5
  • TAF6
  • TAF60
  • TAF61
  • TAF67
  • TAF68
  • TAF7
  • TAF9
  • TAF90
  • TBP1
  • TFA1
  • TFA2
  • TFB1
  • TFB2
  • TFB3
  • TFB4
  • TFB5
  • TFG1
  • TFG2
  • TOA1
  • TOA2
  • TSG2
  • TSM1
  • UVS112
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Activation of the AP-1 family of transcription factors
  • AAS101
  • AAS3
  • ACA1
  • ACA2
  • ACR1
  • ARG9
  • CST6
  • DAC2
  • FUS3
  • GCN4
  • HOG1
  • KSS1
  • MPK1
  • SKO1
  • SLT2
  • SMK1
  • SSK3
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
The NLRP3 inflammasome
  • ALY1
  • ALY2
  • ART3
  • ART5
  • ART6
  • CSR2
  • ECM21
  • HSP82
  • HSP90
  • LDB19
  • MRG19
  • PAL3
  • RIM8
  • ROD1
  • ROG3
  • SGT1
  • TRX1
  • TRX2
  • TRX3
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
VEGFR2 mediated vascular permeability
  • AVO1
  • AVO3
  • BIT2
  • BIT61
  • CPR1
  • DRR2
  • HSC82
  • HSP82
  • HSP90
  • KOM1
  • LST8
  • NCP1
  • NCPR1
  • PKH2
  • PRD1
  • SCH9
  • SLI2
  • TOR2
  • TSC11
  • TSC14
  • YPK1
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
HSP90 chaperone cycle for SHRs
  • APJ1
  • HSC82
  • HSP82
  • HSP90
  • MAS5
  • SSA1
  • SSA2
  • SSA3
  • SSA4
  • SSB1
  • SSB2
  • STI1
  • XDJ1
  • YDJ1
  • YG101
  • YG103
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
HSF1-dependent transactivation
  • DRR2
  • HSC82
  • HSF1
  • HSP82
  • HSP90
  • KOG1
  • LAS24
  • LST8
  • SSA1
  • SSA2
  • SSA3
  • SSA4
  • SSB1
  • SSB2
  • TOR2
  • TSC14
  • YG101
  • YG103
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
HSF1 activation
  • BMH2
  • CDC48
  • HBS1
  • HDA1
  • HSC82
  • HSF1
  • HSP82
  • HSP90
  • SBA1
  • TEF1
  • TEF2
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
SUMOylation of chromatin organization proteins
  • ANU3
  • ASM4
  • CST20
  • GLE2
  • HDA1
  • HHF1
  • HHF2
  • HTN1
  • MLP1
  • MOF6
  • NDC1
  • NIC96
  • NLE3
  • NSP1
  • NSP116
  • NUP1
  • NUP116
  • NUP120
  • NUP133
  • NUP170
  • NUP188
  • NUP192
  • NUP2
  • NUP42
  • NUP57
  • NUP59
  • NUP82
  • NUP84
  • NUP85
  • RAE1
  • RAT2
  • RAT3
  • RAT9
  • REC3
  • RIP1
  • RPD3
  • SDI2
  • SDS6
  • SEC13
  • SEH1
  • SFO1
  • SIZ1
  • SMT3
  • SWP82
  • UBC9
  • UIP1
  • ULL1
  • YRB1
  • YRB2
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
HATs acetylate histones
  • ACA1
  • ACA2
  • ACR1
  • CST6
  • H2B1
  • H2B2
  • HAT1
  • HAT2
  • HHF1
  • HHF2
  • HTB1
  • HTB2
  • SKO1
  • SPT12
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Recruitment and ATM-mediated phosphorylation of repair and signaling proteins at DNA double strand breaks
  • CHF2
  • CSE4
  • CSL2
  • DMA2
  • DUN1
  • ESA1
  • EZL1
  • GIS1
  • H2A1
  • H2A2
  • H2B1
  • H2B2
  • HHF1
  • HHF2
  • HTA1
  • HTA2
  • HTB1
  • HTB2
  • KMT3
  • MMS2
  • MRE11
  • NFI1
  • PPT1
  • RAD50
  • RAD9
  • RCK1
  • RPH1
  • SCD2
  • SET2
  • SIZ1
  • SIZ2
  • SMT3
  • SPT11
  • SPT12
  • TEL1
  • UBC13
  • UBC9
  • UBI4
  • ULL1
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
HDACs deacetylate histones
  • ADR6
  • CAC3
  • CSE4
  • CSL2
  • DEP1
  • EMB1
  • FUN54
  • GAM3
  • H2A1
  • H2A2
  • H2B1
  • H2B2
  • HAT2
  • HDA1
  • HHF1
  • HHF2
  • HOS1
  • HOS2
  • HTA1
  • HTA2
  • HTB1
  • HTB2
  • MOF6
  • MSI1
  • REC3
  • RPD3
  • SAP30
  • SDI2
  • SDS3
  • SDS6
  • SIF2
  • SNT1
  • SPT11
  • SPT12
  • SWI1
  • UME1
  • WTM1
  • WTM2
  • WTM3
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
RNA Polymerase I Promoter Escape
  • BTF1
  • CCL1
  • CSE4
  • CSL2
  • H2A1
  • H2A2
  • H2AZ
  • H2B1
  • H2B2
  • HHF1
  • HHF2
  • HHT1
  • HHT2
  • HTA1
  • HTA2
  • HTA3
  • HTB1
  • HTB2
  • HTZ1
  • KIN28
  • LOM3
  • RAD25
  • RAD3
  • REM1
  • RIG2
  • RPA1
  • RPA12
  • RPA135
  • RPA190
  • RPA2
  • RPA43
  • RPA49
  • RPA7
  • RPB10
  • RPB12
  • RPB5
  • RPB6
  • RPB8
  • RPC10
  • RPC40
  • RPC5
  • RPC9
  • RPO26
  • RRN1
  • RRN12
  • RRN13
  • RRN2
  • RRN3
  • RRN4
  • RRN7
  • SIN2
  • SPT11
  • SPT12
  • SPT15
  • SRP3
  • SSL1
  • SSL2
  • TBP1
  • TFB1
  • TFB2
  • TFB3
  • TFB4
  • TFB5
  • UVS112
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Estrogen-dependent gene expression
  • ADA4
  • BTF1
  • BUR2
  • CSE4
  • CSL2
  • CST4
  • CTK1
  • CTK2
  • DAL80
  • DBP2
  • ESA1
  • FKH1
  • FMS1
  • GAT1
  • GCN5
  • GIS1
  • GLN3
  • GZF3
  • H2A1
  • H2A2
  • H2AZ
  • H2B1
  • H2B2
  • HCM1
  • HHF1
  • HHF2
  • HHT1
  • HHT2
  • HMT1
  • HTA1
  • HTA2
  • HTA3
  • HTB1
  • HTB2
  • HTZ1
  • MOF6
  • MSS1
  • NRG1
  • ODP1
  • REC3
  • RMT1
  • RPA7
  • RPB1
  • RPB10
  • RPB11
  • RPB12
  • RPB150
  • RPB2
  • RPB220
  • RPB3
  • RPB4
  • RPB5
  • RPB6
  • RPB7
  • RPB8
  • RPB9
  • RPC10
  • RPC9
  • RPD3
  • RPH1
  • RPO21
  • RPO22
  • RPO26
  • SDI2
  • SDS6
  • SIN2
  • SPT11
  • SPT12
  • SPT15
  • SSU71
  • SUA8
  • SWI9
  • TBP1
  • TFG1
  • TFG2
  • TOA1
  • TOA2
  • UGA43
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Oxidative Stress Induced Senescence
  • AAS101
  • AAS3
  • ARG9
  • CRT8
  • CSE4
  • CSL2
  • CYC8
  • GCN4
  • H2A1
  • H2A2
  • H2AZ
  • H2B1
  • H2B2
  • HHF1
  • HHF2
  • HHT1
  • HHT2
  • HOG1
  • HTA1
  • HTA2
  • HTA3
  • HTB1
  • HTB2
  • HTZ1
  • SIN2
  • SPT11
  • SPT12
  • SSK3
  • SSN6
  • STE11
  • TRX1
  • TRX2
  • TRX3
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Golgi Cisternae Pericentriolar Stack Reorganization
  • CDC5
  • GRH1
  • MSD2
  • PKX2
  • YP2
  • YPT1
  • YPT11
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)

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Last updated: August 19, 2024