GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1 - 25 of 261 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Electric Transmission Across Gap Junctions
  • PANX
  • connexin35
  • cx35
  • cx35b
  • cx52.7
  • gja10a
  • gja9
  • gjd2b
  • panx1
  • panx1a
  • panx2
  • si:ch211-192n14.2
  • zgc:194445
  • zgc:194451
  • zgc:55631
Danio rerio (zebrafish)
Downstream signaling of activated FGFR1
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • flrt1b
  • flrt2
  • id:ibd5158
  • kl
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkey-87k14.1
  • si:dkeyp-74c5.3
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • zgc:109774
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade
  • GRK1A
  • GUCA1D
  • METAP2
  • fk56b01
  • fk56e06
  • fnta
  • fntb
  • gcap1
  • gcap2
  • gcap3
  • gcap4
  • gcap5
  • gnat1
  • gng1
  • gngt1
  • grk1
  • grk1a
  • grk7-2
  • grk7b
  • guca1a
  • guca1aa
  • guca1ab.1
  • guca1b
  • guca1c
  • guca1d
  • guca1e
  • im:2601337
  • im:6909421
  • metap1
  • metap2
  • metap2b
  • nmt-1
  • nmt1
  • nmt1a
  • nmt2
  • rcv1a
  • rcvrna
  • rho
  • saga
  • si:rp71-1p14.1
  • wu:fb51d12
  • wu:fb98h06
  • wu:fb99h09
  • wu:fc15d01
  • wu:fc18a04
  • wu:fk53d06
  • wu:fk56b01
  • wu:fk56e06
  • wu:fz92f09
  • zfo2
  • zgc:110714
  • zgc:114180
  • zgc:158397
  • zgc:66109
  • zgc:66243
  • zgc:66250
  • zgc:73318
  • zgc:85885
  • zgc:86774
Danio rerio (zebrafish)
Class C/3 (Metabotropic glutamate/pheromone receptors)
  • T2R2
  • TAS1R1
  • TAS1R2a
  • TAS1R3
  • TAS2R1a
  • TAS2R1b
  • Tas1R2b
  • gb:kf234084
  • gprc6a
  • grm1
  • grm1b
  • grm2b
  • grm3
  • grm5a
  • grm5b
  • grm6a
  • grm7
  • grm8a
  • si:ch211-233h19.1
  • si:ch211-278p9.5
  • si:dkey-52h10.3
  • t1rc1
  • tas1r1
  • tas1r2.1
  • tas1r2.2
  • tas1r2a
  • tas1r2b
  • tas1r3
  • tas2r1a
  • tas2r200.1
  • tas2r200.2
  • tas2r2l
Danio rerio (zebrafish)
Apoptotic cleavage of cellular proteins
  • IAP1
  • bcap31
  • birc2
  • birc3
  • casp10
  • casp3
  • casp3a
  • casp6
  • casp6a
  • casp7
  • casp8l2
  • fb09d10
  • fnta
  • fv43b11
  • im:6909421
  • mst4
  • prkcd
  • prkcda
  • satb1a
  • sb:cb955
  • si:bz30i22.4
  • si:ch211-195k18.2
  • si:rp71-30i22.4
  • stk24a
  • stk26
  • wu:fb09d10
  • wu:fb51d12
  • wu:fv43b11
  • wu:fz92f09
  • zgc:100890
  • zgc:110595
  • zgc:112960
  • zgc:158397
  • zgc:163071
  • zgc:175288
  • zgc:56389
  • zgc:56558
Danio rerio (zebrafish)
Lewis blood group biosynthesis
  • LOC565422
  • LOC796410
  • LOC798349
  • b3galt10.1
  • b3galt11
  • b3galt2
  • fe05b03
  • fut10
  • fut11
  • fut7
  • fut9a
  • im:7151092
  • siat4c
  • st3gal4
  • wu:fe05b03
  • zgc:152705
  • zgc:158162
  • zgc:194168
  • zgc:194170
  • zgc:194313
  • zgc:194330
  • zgc:76904
Danio rerio (zebrafish)
Dermatan sulfate biosynthesis
  • DC
  • bcan
  • bgn
  • bgna
  • chst14
  • cspg2b
  • d4st1
  • dcan
  • dcn
  • decorin
  • dse
  • fb99b07
  • fi32a12
  • ncanb
  • si:dkey-121j17.2
  • vcanb
  • wu:fb99b07
  • wu:fi32a12
  • zgc:91989
Danio rerio (zebrafish)
Multifunctional anion exchangers
  • SLC26A6
  • si:dkey-31f5.2
  • slc26a11
  • slc26a2
  • slc26a3
  • slc26a3.1
  • slc26a6l
  • slc26a6l1
  • slc5a12
  • smctn
  • wu:fd14d06
  • zgc:64158
Danio rerio (zebrafish)
LDL remodeling
  • mtp
  • mttp
  • p4hb
  • psmb3
  • zgc:92596
Danio rerio (zebrafish)
Hedgehog 'on' state
  • CH211-265P12.8
  • PSMA5
  • Psma2
  • Su(fu)
  • Y
  • adrm1b
  • beta1
  • beta5
  • cos2
  • cul3
  • cul3b
  • dre
  • dzip1
  • etID309919.2
  • fa93g07
  • fb17c09
  • fb20g04
  • fb49a10
  • fc34f08
  • fc85b05
  • fi39e05
  • gli2
  • gli2a
  • gli3
  • gpr161
  • hm:zeh0386
  • igu
  • ik:tdsubc_1f2
  • im:6909944
  • im:7137515
  • im:7142603
  • itch
  • itcha
  • itchb
  • kif7
  • numb
  • psma1
  • psma2
  • psma2a
  • psma2b
  • psma3
  • psma4
  • psma5
  • psma6b
  • psmb1
  • psmb10
  • psmb12
  • psmb13a
  • psmb2
  • psmb3
  • psmb5
  • psmb6
  • psmc1
  • psmc1a
  • psmc1b
  • psmc2
  • psmc4
  • psmc5
  • psmc6
  • psmd1
  • psmd11b
  • psmd12
  • psmd13
  • psmd14
  • psmd3
  • psmd6
  • psmd7
  • psmd8
  • rbx1
  • rps27a
  • sb:eu762
  • si:rp71-45k5.4
  • si:zc14a17.13
  • spop
  • spopl
  • spopla
  • sufu
  • tdsubc_1f2
  • uba52
  • ulk3
  • wu:fa14g03
  • wu:fa91f08
  • wu:fa93g07
  • wu:faa49c06
  • wu:fb05d04
  • wu:fb11d10
  • wu:fb17c09
  • wu:fb20g04
  • wu:fb23a11
  • wu:fb38a06
  • wu:fb49a10
  • wu:fb59c07
  • wu:fb98h03
  • wu:fc34f08
  • wu:fc49f02
  • wu:fc85b05
  • wu:fc85c10
  • wu:fe05d10
  • wu:fe38b10
  • wu:fi03c01
  • wu:fi39e05
  • wu:fj14c10
  • wu:fu88b08
  • x
  • xx:tdsubc_1f2
  • y
  • yot
  • you-too
  • zgc:109823
  • zgc:110363
  • zgc:110710
  • zgc:114044
  • zgc:123344
  • zgc:136444
  • zgc:162272
  • zgc:55284
  • zgc:55818
  • zgc:56176
  • zgc:56374
  • zgc:56377
  • zgc:56471
  • zgc:56516
  • zgc:63709
  • zgc:63995
  • zgc:65867
  • zgc:66168
  • zgc:77369
  • zgc:77482
  • zgc:86762
  • zgc:86820
  • zgc:86851
  • zgc:86923
  • zgc:92282
  • zgc:92464
  • zgc:92596
  • zgc:92716
  • zgc:92726
Danio rerio (zebrafish)
Arachidonate metabolism
  • cpla2
  • dgat2
  • faah2a
  • pla2g4
  • pla2g4a
Danio rerio (zebrafish)
Epigenetic regulation of gene expression by MLL3 and MLL4 complexes
  • c16orf53
  • pagr1
  • paxip1
  • wu:fd61a05
Danio rerio (zebrafish)
N-glycan trimming and elongation in the cis-Golgi
  • fi29h09
  • manea
  • mgat1b
  • si:ch211-152p11.3
  • wu:fi29h09
  • zgc:153912
  • zgc:92825
Danio rerio (zebrafish)
VEGF binds to VEGFR leading to receptor dimerization
  • figf
  • flk1b
  • flt-4
  • flt4
  • kdr
  • kdrb
  • vegf
  • vegf-d
  • vegfa
  • vegfaa
  • vegfc
  • vegfd
  • vegfr3
Danio rerio (zebrafish)
FGFR1c and Klotho ligand binding and activation
  • fgf23
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • kl
Danio rerio (zebrafish)
Trafficking and processing of endosomal TLR
  • UNC93B1
  • lrrc33
  • nrros
  • unc93b1
Danio rerio (zebrafish)
Antagonism of Activin by Follistatin
  • actbb
  • actbetaB
  • fst
  • fst1
  • fsta
  • fstl3
  • inhbab
  • inhbal
  • inhbb
  • si:dkey-28h18.3
  • zgc:114170
  • zgc:158348
Danio rerio (zebrafish)
Regulation of KIT signaling
  • cbl
  • fb18e12
  • fj59e07
  • fynb
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • lck
  • sos1
  • sparse
  • src
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fd16a12
  • wu:fj59e07
  • yes
  • yes1
  • zgc:103549
  • zgc:136695
  • zgc:158274
  • zgc:73077
  • zgc:92560
Danio rerio (zebrafish)
Acyl chain remodelling of PC
  • aytl1
  • aytl2
  • cpla2
  • im:7137034
  • im:7138859
  • lpcat1
  • lpcat2
  • pla2g10
  • pla2g12a
  • pla2g3
  • pla2g4
  • pla2g4a
  • plbd1
  • plbd1a
  • rarres3l
  • tmem86a
  • tmem86b
  • zgc:101699
  • zgc:113571
  • zgc:153124
  • zgc:162119
Danio rerio (zebrafish)
EPH-ephrin mediated repulsion of cells
  • ZFMMP-9
  • aph1b
  • efnb1
  • efnb2b
  • efnb3
  • efnb3b
  • ephb4a
  • fc10d03
  • fj05a08
  • fynb
  • hm:zeh0344
  • id:ibd5049
  • mmp2
  • mmp9
  • pen2
  • psen1
  • psen2
  • psenen
  • psfl
  • rac1
  • rac1a
  • rtk5
  • src
  • wu:fa99h12
  • wu:fb02g06
  • wu:fb07b05
  • wu:fc10d03
  • wu:fd16e02
  • wu:fi98c09
  • wu:fj05a08
  • wu:fk89d01
  • yes
  • yes1
  • zeh0344
  • zgc:111938
  • zgc:114200
  • zgc:55823
  • zgc:55917
  • zgc:64165
  • zgc:86934
Danio rerio (zebrafish)
FRS-mediated FGFR3 signaling
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr3
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by ALK
  • alk
  • alkal1
  • alkal2b
  • cb518
  • fb79b05
  • fj33b02
  • fj46f04
  • fj48a12
  • mdk
  • mdk2
  • mdkb
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3r1
  • pik3r2
  • plcg1
  • plei2
  • ptn
  • wu:fb65b05
  • wu:fb79b05
  • wu:fj33b02
  • wu:fj46f04
  • wu:fj48a12
  • wu:fj57a05
  • zHBNF
  • zgc:111787
Danio rerio (zebrafish)
Organic anion transporters
  • MGC163045
  • blu
  • cb229
  • fa07h09
  • sb:cb229
  • sb:cb809
  • si:ch211-200a16.4
  • slc17a5
  • slc17a6
  • slc17a6b
  • slc17a7
  • slc17a7a
  • slc17a8
  • slc25a10
  • slc25a10b
  • slc25a11
  • slc25a18
  • slc25a1b
  • slc25a22
  • slc25a55a
  • slc25a55b
  • slc5a5
  • slc5a8
  • slc5a8l
  • smcte
  • vglut1
  • vglut2.1
  • vglut2a
  • vglut3
  • wu:fa07h09
  • wu:fa12h05
  • wu:fb72h03
  • zgc:153077
  • zgc:56592
  • zgc:56614
  • zgc:86898
Danio rerio (zebrafish)
Platelet degranulation
  • ANX V
  • CYB5R1
  • IGF-1
  • IGF-1L
  • IGF-1a
  • IGF-I
  • LOC792613
  • MRP
  • PAI
  • PAI-1
  • PAI1
  • PLANH1
  • TAGLN
  • Tbeta11
  • VWF
  • abcc4
  • actbb
  • actn2
  • actn2b
  • ahsg
  • ahsg1
  • ai39657
  • aldoa
  • aldoaa
  • antivin
  • anx
  • anx5
  • anxa5
  • anxa5b
  • apoa
  • apoa1
  • apoa1a
  • apool
  • app
  • appa
  • atv
  • atv2
  • bactin2
  • cb1019
  • cb223
  • cb420
  • cb720
  • cb73
  • cb79
  • cb989
  • cd163
  • cd36
  • cd63
  • cdc37l1
  • cfd
  • cfdl
  • chid1
  • clu
  • ctsf
  • cuzn
  • cxcl-c13d
  • cxcl8b.1
  • cxcl8b.3
  • cyb5r1
  • dZ52I16.4
  • dia1
  • etID32613.12
  • f13a1
  • f13a1b
  • f5
  • fa92e03
  • fa96h09
  • fam3c
  • fam49bb
  • fb08c07
  • fb11g09
  • fb52d02
  • fb61f12
  • fb63c02
  • fc21c08
  • fc21h08
  • fe38b03
  • fi27b02
  • figf
  • fj34a12
  • fj40h03
  • fo83d04
  • gas6
  • hm:zeh0062
  • hm:zehn2160
  • igf1
  • igf2
  • igf2a
  • igf2b
  • ik:tdsubc_2b12
  • il8l1
  • im:6902790
  • im:6909481
  • im:7044540
  • im:7144020
  • ino80e
  • itga2b
  • itgb3.1
  • itgb3b
  • itih3a
  • itih3a.1
  • lft1
  • lft2
  • lgals3bp
  • lgals3bpa
  • lhfpl2a
  • mage
  • manf
  • ndnl2
  • ola1
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • plek
  • pros1
  • sb:cb420
  • sb:cb79
  • sccpdha
  • sccpdha.1
  • scg3
  • selp
  • sepp1a
  • serpine1
  • serpinf2b
  • si:busm1-52i16.4
  • si:bz20i5.3
  • si:ch1073-474e24.1
  • si:ch211-133n4.4
  • si:ch211-138a11.1
  • si:ch211-165i18.2
  • si:ch211-186e20.7
  • si:ch211-229i10.3
  • si:ch211-260g14.4
  • si:ch211-284e20.8
  • si:ch73-54f23.2
  • si:dkey-243k1.3
  • si:dkey-27b3.6
  • si:dkey-46g23.4
  • si:dkeyp-105g12.2
  • si:dz202l16.5
  • si:dz52i16.4
  • sm22[a]
  • sod1
  • sparc
  • stxbp2
  • sytl4
  • tagln2
  • tagln3
  • tex264a
  • tgfb1
  • tgfb1a
  • tgfb2
  • tgfb3
  • timp2
  • timp2a
  • timp2b
  • timp2l
  • tmsb4x
  • tmx3b
  • tor4a
  • vcl
  • vcla
  • vegf
  • vegf-d
  • vegfa
  • vegfaa
  • vegfc
  • vegfd
  • vti1b
  • vwf
  • wu:fa28b10
  • wu:fa92e03
  • wu:fa96h09
  • wu:fa98f06
  • wu:fb08c07
  • wu:fb10b11
  • wu:fb11g09
  • wu:fb13a07
  • wu:fb13e02
  • wu:fb15h03
  • wu:fb16b08
  • wu:fb52d02
  • wu:fb61f12
  • wu:fb63c02
  • wu:fb63g02
  • wu:fc21c08
  • wu:fc21h08
  • wu:fc32c12
  • wu:fc34h12
  • wu:fc78g09
  • wu:fd21h06
  • wu:fd44c03
  • wu:fe38b03
  • wu:fi27b02
  • wu:fj08a12
  • wu:fj10f10
  • wu:fj34a12
  • wu:fj34d10
  • wu:fj40h03
  • wu:fk65e12
  • wu:fo83d04
  • xx:ai39657
  • xx:tdsubc_2b12
  • zgc:101850
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Danio rerio (zebrafish)
Metal ion SLC transporters
  • DMT1
  • cb426
  • cp
  • ctr-1
  • ctr1
  • fa07b10
  • fpn1
  • slc11a2
  • slc30a10
  • slc31a1
  • slc39a1
  • slc40a1
  • slc41a1
  • slc41a2b
  • wu:fa07b10
  • wu:fi23f10
  • zgc:136699
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Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: December 8, 2025