GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 376 - 400 of 499 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC)
  • C16C8.14
  • C16C8.16
  • C16C8.20
  • C37A2.7
  • CELE_W01D2.1
  • CELE_Y37E3.8
  • cbp-20
  • cbp-80
  • erfa-1
  • erfa-3
  • etf-1
  • ifg-1
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • pab-1
  • rla-0
  • rla-1
  • rpa-0
  • rpa-1
  • rpl-1
  • rpl-10
  • rpl-10a
  • rpl-11.2
  • rpl-12
  • rpl-13
  • rpl-14
  • rpl-15
  • rpl-16
  • rpl-17
  • rpl-18
  • rpl-19
  • rpl-2
  • rpl-20
  • rpl-21
  • rpl-22
  • rpl-23
  • rpl-24.1
  • rpl-25.2
  • rpl-26
  • rpl-27
  • rpl-28
  • rpl-29
  • rpl-3
  • rpl-30
  • rpl-31
  • rpl-32
  • rpl-33
  • rpl-35
  • rpl-36
  • rpl-36.A
  • rpl-37a
  • rpl-38
  • rpl-39
  • rpl-4
  • rpl-41
  • rpl-43
  • rpl-5
  • rpl-6
  • rpl-7
  • rpl-7A
  • rpl-8
  • rpl-9
  • rps-0
  • rps-1
  • rps-10
  • rps-11
  • rps-12
  • rps-13
  • rps-14
  • rps-15
  • rps-16
  • rps-17
  • rps-18
  • rps-19
  • rps-2
  • rps-20
  • rps-21
  • rps-22
  • rps-23
  • rps-24
  • rps-25
  • rps-26
  • rps-27
  • rps-28
  • rps-29
  • rps-3
  • rps-4
  • rps-5
  • rps-6
  • rps-7
  • rps-8
  • rps-9
  • smg-2
  • ubl-1
Caenorhabditis elegans
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC)
  • C16C8.14
  • C16C8.16
  • C16C8.20
  • C37A2.7
  • CELE_W01D2.1
  • CELE_Y37E3.8
  • RBM8
  • Y14
  • casc-3
  • cbp-20
  • cbp-80
  • eif-4A3
  • erfa-1
  • erfa-3
  • etf-1
  • ifg-1
  • let-92
  • mag-1
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • paa-1
  • pab-1
  • rla-0
  • rla-1
  • rnp-4
  • rnp-5
  • rpa-0
  • rpa-1
  • rpl-1
  • rpl-10
  • rpl-10a
  • rpl-11.2
  • rpl-12
  • rpl-13
  • rpl-14
  • rpl-15
  • rpl-16
  • rpl-17
  • rpl-18
  • rpl-19
  • rpl-2
  • rpl-20
  • rpl-21
  • rpl-22
  • rpl-23
  • rpl-24.1
  • rpl-25.2
  • rpl-26
  • rpl-27
  • rpl-28
  • rpl-29
  • rpl-3
  • rpl-30
  • rpl-31
  • rpl-32
  • rpl-33
  • rpl-35
  • rpl-36
  • rpl-36.A
  • rpl-37a
  • rpl-38
  • rpl-39
  • rpl-4
  • rpl-41
  • rpl-43
  • rpl-5
  • rpl-6
  • rpl-7
  • rpl-7A
  • rpl-8
  • rpl-9
  • rps-0
  • rps-1
  • rps-10
  • rps-11
  • rps-12
  • rps-13
  • rps-14
  • rps-15
  • rps-16
  • rps-17
  • rps-18
  • rps-19
  • rps-2
  • rps-20
  • rps-21
  • rps-22
  • rps-23
  • rps-24
  • rps-25
  • rps-26
  • rps-27
  • rps-28
  • rps-29
  • rps-3
  • rps-4
  • rps-5
  • rps-6
  • rps-7
  • rps-8
  • rps-9
  • smg-1
  • smg-2
  • smg-3
  • smg-4
  • smg-6
  • smg-8
  • smg-9
  • sur-6
  • ubl-1
Caenorhabditis elegans
Sphingolipid catabolism
  • W02F12.2
  • alh-4
  • alh-5
  • plpp-1.1
  • plpp-1.2
  • plpp-1.3
  • spl-1
Caenorhabditis elegans
Peroxisomal protein import
  • B0272.4
  • B0395.3
  • C15B12.1
  • C17C3.1
  • C24A3.4
  • C31H5.6
  • C32D5.11
  • CELE_F41E6.5
  • CELE_F44E7.4
  • CELE_F58A6.1
  • CELE_K05B2.4
  • CELE_T05E7.1
  • CELE_T20B3.1
  • CELE_T24B8.7
  • CELE_W03D8.8
  • CELE_Y71G12B.10
  • T18D3.9
  • acl-7
  • acox-1
  • acox-1.1
  • acox-1.2
  • acox-1.3
  • acox-1.4
  • acox-1.5
  • acox-1.6
  • acox-2
  • acox-3
  • acox-4
  • acox-5
  • acox-6
  • acs-20
  • acs-22
  • agxt-1
  • ctl-3
  • daao-1
  • dapat
  • ddo-1
  • ddo-2
  • ddo-3
  • dhrs-4
  • ech-8
  • gstk-2
  • hacl-1
  • hpo-15
  • idh-1
  • let-70
  • lonp-2
  • maoc-1
  • mlcd-1
  • ndx-7
  • ndx-8
  • prx-12
  • prx-13
  • prx-14
  • prx-5
  • ubc-2
  • ubia
  • ubib
  • ubl-1
  • ubq-1
  • ubq-2
Caenorhabditis elegans
Synthesis of Leukotrienes (LT) and Eoxins (EX)
  • C53D5.5
  • CELE_H14N18.4
  • CELE_T03D8.6
  • CELE_T19H12.6
  • CELE_Y7A9A.1
  • CELE_Y97E10AR.2
  • ltah-1.1
  • mrp-1
Caenorhabditis elegans
Glutathione synthesis and recycling
  • C44B7.7
  • C53D5.5
  • CELE_E01A2.1
  • CELE_F22F7.7
  • CELE_H14N18.4
  • CELE_T03D8.6
  • CELE_T19H12.6
  • CELE_Y38F2AR.12
  • CELE_Y7A9A.1
  • CELE_Y97E10AR.2
  • gcs-1
  • gss-1
  • pes-9
Caenorhabditis elegans
RHO GTPases Activate WASPs and WAVEs
  • CELE_Y55F3AM.5
  • CELE_Y57G11C.1147
  • abi-1
  • abl-1
  • act-1
  • act-2
  • act-3
  • act-4
  • arp-2
  • arx-1
  • arx-2
  • arx-3
  • arx-4
  • arx-5
  • arx-6
  • arx-7
  • cdc-42
  • ced-10
  • ddl-2
  • gex-2
  • gex-3
  • kin-32
  • mpk-1
  • nck-1
  • rac-1
  • sem-5
  • sur-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
Regulation of actin dynamics for phagocytic cup formation
  • CELE_Y55F3AM.5
  • CELE_Y57G11C.1147
  • abi-1
  • abl-1
  • act-1
  • act-2
  • act-3
  • act-4
  • arp-2
  • arx-1
  • arx-2
  • arx-3
  • arx-4
  • arx-5
  • arx-6
  • arx-7
  • cdc-42
  • ced-10
  • ddl-2
  • gex-2
  • gex-3
  • kin-32
  • mpk-1
  • nck-1
  • nfm-1
  • pak-1
  • rac-1
  • sem-5
  • sur-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors
  • acr-12
  • acr-2
  • acr-20
  • acr-21
  • acr-22
  • acr-23
  • acr-24
  • acr-25
  • acr-3
  • acr-4
  • acr-5
  • acr-6
  • acr-8
  • deg-3
  • des-2
  • lev-1
  • lev-7
  • lev-8
  • lgc-10
  • lgc-11
  • lgc-12
  • lgc-3
  • lgc-30
  • lgc-31
  • lgc-4
  • lgc-5
  • lgc-6
  • lgc-7
  • lgc-8
  • lgc-9
  • pbo-6
  • unc-29
  • unc-38
  • unc-63
Caenorhabditis elegans
GABA receptor activation
  • exp-1
  • gab-1
  • lgc-35
  • lgc-36
  • lgc-37
  • lgc-38
  • lgc-43
  • unc-49
  • unc-49B
Caenorhabditis elegans
pre-mRNA splicing
  • C16C10.4
  • C47E8.4
  • CELE_K01G5.8
  • CELE_T23G11.4
  • CELE_Y18H1A.2
  • CELE_Y57G11A.5
  • CELE_Y66D12A.8
  • CELE_ZK616.1
  • E01A2.2
  • F37A4.2
  • K07C5.6
  • R05D3.8
  • R07E5.1
  • RBM8
  • T27F2.1
  • Y14
  • acin-1
  • aly-3
  • ama-1
  • bcas-2
  • bud-31
  • cacn-1
  • casc-3
  • cbp-20
  • cbp-80
  • ccdc-12
  • ccdc-55
  • cdc-5L
  • cdc-5l
  • cey-1
  • cey-2
  • cey-3
  • cey-4
  • ctnb-1
  • cwc-15
  • cyn-10
  • cyn-12
  • cyn-15
  • cyn-4
  • cyp-10
  • cyp-4
  • ddx-15
  • ddx-17
  • ddx-35
  • ddx-46
  • eftu-2
  • eif-4A3
  • emb-4
  • fust-1
  • gad-1
  • gtf-2F1
  • gtf-2F2
  • gtf-2f1
  • gtf-2f2
  • hel-1
  • hrp-1
  • hrp-2
  • hrpf-1
  • hrpf-2
  • hrpk-1
  • hrpl-1
  • hrpr-1
  • hrpu-1
  • hsp-1
  • hsp70a
  • isy-1
  • let-504
  • let-858
  • mag-1
  • mog-1
  • mog-2
  • mog-3
  • mog-5
  • mog-6
  • mtr-4
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • pes-4
  • phf-5
  • plrg-1
  • pnn-1
  • pqbp-1.1
  • prcc-1
  • prp-17
  • prp-18
  • prp-19
  • prp-8
  • ptb-1
  • rbm-17
  • rbm-22
  • rbm-5
  • rbp-1
  • rnp-2
  • rnp-4
  • rnp-5
  • rnp-6
  • rpb-1
  • rpb-10
  • rpb-11
  • rpb-12
  • rpb-2
  • rpb-3
  • rpb-4
  • rpb-5
  • rpb-6
  • rpb-7
  • rpb-8
  • rpb-9
  • rsp-2
  • rsp-3
  • rsp-4
  • rsp-6
  • rsp-7
  • rsp-8
  • rsr-1
  • sacy-1
  • sap-1
  • sap-140
  • scaf-6
  • sde-2
  • sel-13
  • sig-7
  • smg-4
  • snr-1
  • snr-2
  • snr-3
  • snr-4
  • snr-5
  • snr-6
  • snr-7
  • snrp-200
  • snrp-40.1
  • snrp-40.2
  • sqd-1
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-4
  • syf-1
  • syf-2
  • syf-3
  • tag-65
  • tofu-2
  • yju-2
Caenorhabditis elegans
Sphingolipid de novo biosynthesis
  • CELE_F58B4.2
  • CELE_Y37E11AM.3
  • CELE_Y82E9BR.14
  • F33D4.4
  • F53B1.2
  • abcx-1
  • bed-2
  • csnk-1
  • cytb-5.1
  • dkf-1
  • dkf-2
  • fath-1
  • hyl-1
  • hyl-2
  • lagr-1
  • mrp-1
  • obr-1
  • sms-1
  • sms-2
  • sms-3
  • sms-5
  • sphk-1
  • spin-1
  • spin-2
  • spin-3
  • spin-4
  • tag-274
  • ttm-5
  • wht-5
Caenorhabditis elegans
RHOD GTPase cycle
  • C14A4.8
  • C49H3.6
  • CELE_F42G2.5
  • CELE_F54H5.3
  • CELE_F58E6.5
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_T09B4.2
  • CELE_Y38F2AR.10
  • CELE_ZC196.2
  • aap-1
  • abts-1
  • add-1
  • add-2
  • atn-1
  • cap-2
  • cav-1
  • cav-2
  • cyk-1
  • cyk-4
  • efhd-1
  • esyt-2
  • gap
  • gei-18
  • golg-2
  • hpo-28
  • ifa-1
  • ifa-2
  • ifa-3
  • ifa-4
  • ifb-1
  • ifb-2
  • ifc-1
  • ifc-2
  • ifd-1
  • ifd-2
  • ifp-1
  • ile-1
  • inft-2
  • lam-1
  • let-99
  • lmn-1
  • mua-6
  • nra-1
  • osm-10
  • pac-1
  • pak-2
  • plx-1
  • plx-2
  • rab-7
  • rga-1
  • rga-5
  • rga-8
  • rho-1
  • rhoa
  • snb-1
  • tag-325
  • toe-2
  • vang-1
  • vem-1
  • vpr-1
  • vrk-1
Caenorhabditis elegans
Insertion of tail-anchored proteins into the endoplasmic reticulum membrane
  • alh-4
  • alh-5
  • apl-1
  • cytb-5.1
  • emo-1
  • oar-1
  • sec-61.B
  • sec-61.G
  • sec-61.b
  • serp-1.1
  • sgt-1
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • syn-3
  • syx-5
  • ubc-26
  • unc-64
  • vamp-7
  • vpr-1
Caenorhabditis elegans
RET signaling
  • CELE_F09G2.1
  • CELE_Y69A2AR.31
Caenorhabditis elegans
RAB geranylgeranylation
  • CELE_M57.2
  • CELE_ZK669.5
  • aex-6
  • ggtb-1
  • glo-1
  • rab-1
  • rab-10
  • rab-11.1
  • rab-11.2
  • rab-14
  • rab-18
  • rab-19
  • rab-21
  • rab-3
  • rab-30
  • rab-33
  • rab-35
  • rab-37
  • rab-39
  • rab-5
  • rab-6.1
  • rab-6.2
  • rab-7
  • rab-8
  • rab27
  • rab8
  • rabr-1
  • rabr-3
  • rabr-4
  • rep-1
  • rsef-1
  • tag-312
  • unc-108
Caenorhabditis elegans
Activation of AMPA receptors
  • glr-1
  • glr-2
  • glr-3
  • glr-4
  • glr-5
  • glr-6
  • glr-7
Caenorhabditis elegans
Unblocking of NMDA receptors, glutamate binding and activation
  • atn-1
  • cal-5
  • dlg-1
  • glr-1
  • glr-2
  • glr-3
  • glr-4
  • glr-5
  • glr-6
  • glr-7
  • let-413
  • nmr-1
  • nmr-2
  • unc-43
Caenorhabditis elegans
Synaptic adhesion-like molecules
  • CELE_Y54F10BM.3
  • dlg-1
  • glr-1
  • glr-2
  • glr-3
  • glr-4
  • glr-5
  • glr-6
  • glr-7
  • nmr-1
  • nmr-2
  • ptp-3
  • ret-1
  • unc-89
Caenorhabditis elegans
Cargo concentration in the ER
  • C28G1.2
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F44G3.7
  • cle-1
  • cni-1
  • cnih-2
  • cpz-1
  • glr-1
  • glr-2
  • glr-3
  • glr-4
  • glr-5
  • glr-6
  • glr-7
  • gosr-2.1
  • ile-1
  • ile-2
  • memb-1
  • sar-1
  • sec-22
  • sec-23
  • sec-24.1
  • sec-24.2
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-3
  • srp-6
  • srp-7
  • srp-8
  • syn-3
  • syx-5
Caenorhabditis elegans
COPII-mediated vesicle transport
  • C28G1.2
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_T10F2.5
  • CELE_Y42H9AR.1
  • CELE_Y59A8B.25
  • CELE_Y59A8B.8
  • CeSec13R
  • cle-1
  • cni-1
  • cnih-2
  • cpz-1
  • glr-1
  • glr-2
  • glr-3
  • glr-4
  • glr-5
  • glr-6
  • glr-7
  • golg-2
  • gosr-2.1
  • ile-1
  • ile-2
  • memb-1
  • nbet-1
  • npp-20
  • nsf-1
  • rab-1
  • sar-1
  • sec-12
  • sec-13
  • sec-16
  • sec-16A.1
  • sec-16A.2
  • sec-16a.2
  • sec-22
  • sec-23
  • sec-24.1
  • sec-24.2
  • sec-31
  • sedl-1
  • sly-1
  • snap-1
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-3
  • srp-6
  • srp-7
  • srp-8
  • syn-3
  • syx-5
  • tbc-20
  • tfg-1
  • trpp-1
  • trpp-10
  • trpp-3
  • trpp-4
  • trpp-5
  • trpp-6
  • trpp-9
  • uso-1
  • ykt-6
Caenorhabditis elegans
Energy dependent regulation of mTOR by LKB1-AMPK
  • CeTor
  • F13H10.3
  • aak-1
  • aak-2
  • aakb-1
  • aakb-2
  • aakg-1
  • aakg-2
  • aakg-3
  • aakg-4
  • aakg-5
  • daf-15
  • let-363
  • lmtr-2
  • lmtr-3
  • lmtr-5
  • mlst-8
  • ppm-1.A
  • raga-1
  • ragc-1
  • rheb-1
Caenorhabditis elegans
Macroautophagy
  • C01A2.4
  • CELE_R12C12.5
  • CELE_Y34B4A.2
  • CELE_ZC247.1
  • CeTor
  • F13H10.3
  • aak-1
  • aak-2
  • aakb-1
  • aakb-2
  • aakg-1
  • aakg-2
  • aakg-3
  • aakg-4
  • aakg-5
  • atg-11
  • atg-12
  • atg-13
  • atg-16.1
  • atg-16.2
  • atg-18
  • atg-3
  • atg-4.1
  • atg-4.2
  • atg-5
  • atg-6
  • atg-7
  • atg-8.1
  • atg-9
  • atgr-18
  • atgr-5
  • bec-1
  • chmp-7
  • daf-15
  • dlc-1
  • dlc-2
  • dlc-3
  • dlc-4
  • dlc-5
  • dlc-6
  • epg-1
  • epg-6
  • epg-7
  • epg-8
  • epg-9
  • let-363
  • let-512
  • lgg-1
  • lgg-2
  • lgg-3
  • lmtr-2
  • lmtr-3
  • lmtr-5
  • mlst-8
  • raga-1
  • ragc-1
  • rheb-1
  • tag-283
  • unc-51
  • vps-15
  • vps-2
  • vps-20
  • vps-24
  • vps-32.1
  • vps-34
Caenorhabditis elegans
Deactivation of the beta-catenin transactivating complex
  • apr-1
  • chd-7
  • cog-2
  • ctbp-1
  • egl-13
  • esg
  • ftt-1
  • ftt-2
  • hda-3
  • hmp-2
  • par-5
  • pop-1
  • sem-2
  • sox-2
  • sox-3
  • sox-4
  • unc-37
  • xpo-1
Caenorhabditis elegans
Neurotransmitter receptors and postsynaptic signal transmission
  • acc-1
  • acc-2
  • acc-3
  • acc-4
  • acr-20
  • acr-21
  • acr-22
  • acr-23
  • acr-24
  • acr-4
  • acr-5
  • avr-14
  • avr-15
  • deg-3
  • des-2
  • gbr-4
  • ggr-1
  • ggr-2
  • ggr-3
  • glc-1
  • glc-2
  • glc-3
  • glc-4
  • lgc-10
  • lgc-11
  • lgc-12
  • lgc-30
  • lgc-31
  • lgc-32
  • lgc-34
  • lgc-39
  • lgc-4
  • lgc-40
  • lgc-41
  • lgc-42
  • lgc-44
  • lgc-45
  • lgc-46
  • lgc-47
  • lgc-48
  • lgc-49
  • lgc-5
  • lgc-50
  • lgc-51
  • lgc-52
  • lgc-53
  • lgc-54
  • lgc-55
  • lgc-56
  • lgc-58
  • lgc-6
  • lgc-7
  • lgc-8
  • lgc-9
  • mod-1
Caenorhabditis elegans

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024