GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 226 - 250 of 252 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
WNT ligand biogenesis and trafficking
  • Zwnt[a]
  • cgi100
  • cgi1000
  • int-1
  • tmed5
  • wnt-1
  • wnt-10a
  • wnt-2
  • wnt-4
  • wnt-5
  • wnt-8
  • wnt-8b
  • wnt1
  • wnt10a
  • wnt10b
  • wnt2
  • wnt2bb
  • wnt3
  • wnt3 l
  • wnt3a
  • wnt3l
  • wnt4
  • wnt4a
  • wnt5
  • wnt5a
  • wnt5b
  • wnt7a
  • wnt7aa
  • wnt8
  • wnt8a
  • wnt8b
  • wnt9a
  • wnt9b
  • wnt[a]
  • zgc:153617
  • zgc:63936
Danio rerio (zebrafish)
RND1 GTPase cycle
  • Aldh-III
  • CAV1
  • LOC100004299
  • aldh3a2
  • aldh3a2a
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • arms
  • cav1
  • cpda
  • dspa
  • epha2
  • epha2a
  • fam83b
  • fb36h09
  • fi33b05
  • flot2a
  • frs3
  • heg
  • id:ibd5152
  • im:6911394
  • kidins220
  • kidins220b
  • pik3r1
  • pik3r2
  • plxna1
  • plxna1b
  • rbm39a
  • rbm39b
  • rnd1a
  • rnd1b
  • rnd1l
  • rnpc2
  • rnpc2l
  • rras2
  • rtk6
  • scg10
  • scgn10
  • si:dkey-181m9.10
  • stb2
  • stbm
  • stip1
  • stmn2
  • stmn2b
  • tfr1a
  • tmem59
  • tri
  • vangl1
  • vangl2
  • wu:fa97g07
  • wu:fb09c08
  • wu:fb36h09
  • wu:fb65b05
  • wu:fc06b11
  • wu:fc07c04
  • wu:fc47b08
  • wu:fi33b05
  • wu:fk50c04
  • zgc:110132
  • zgc:110215
  • zgc:112139
  • zgc:113117
  • zgc:153089
  • zgc:194621
  • zgc:55780
  • zgc:92064
  • zgc:92133
Danio rerio (zebrafish)
Neurophilin interactions with VEGF and VEGFR
  • flk1b
  • kdr
  • kdrb
  • np-1
  • nrp1
  • nrp1a
Danio rerio (zebrafish)
RND2 GTPase cycle
  • Aldh-III
  • CAV1
  • LOC100004299
  • Rho
  • aldh3a2
  • aldh3a2a
  • arhgap1
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • arhn
  • arms
  • cav1
  • ckap4
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • epha2
  • epha2a
  • fam83b
  • fk03b12
  • fk61c06
  • frs3
  • heg
  • id:ibd5152
  • kctd13
  • kidins220
  • kidins220b
  • llk
  • lrrc1
  • nudc
  • pik3r1
  • pik3r2
  • plxnd1
  • rbm39a
  • rbm39b
  • rnd2
  • rnpc2
  • rnpc2l
  • rtk6
  • scrb1
  • scrib
  • si:dz163l24.1
  • stb2
  • stbm
  • tfr1a
  • tnfaip1
  • tri
  • vangl1
  • vangl2
  • wu:cegs2891
  • wu:fa97g07
  • wu:fb09c08
  • wu:fb65b05
  • wu:fc06b11
  • wu:fc07c04
  • wu:fi06b02
  • wu:fk03b12
  • wu:fk61c06
  • zgc:101523
  • zgc:110361
  • zgc:112139
  • zgc:113117
  • zgc:153204
  • zgc:55302
  • zgc:55780
  • zgc:56099
  • zgc:77379
  • zgc:85670
  • zgc:92064
Danio rerio (zebrafish)
FGFR1b ligand binding and activation
  • GIPC
  • TIP-2
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf2
  • fgf22
  • fgf3
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • gipc1
  • rgs19ip1
  • si:ch73-18k18.1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • tgfbr3
  • wu:fd11d03
  • zgc:109774
Danio rerio (zebrafish)
RAF/MAP kinase cascade
  • EGFR12
  • EGFR15
  • ERK1
  • NRG2b
  • ang1
  • angpt1
  • btc
  • c-met
  • cmet
  • dob
  • egfr
  • egfra
  • epgn
  • erbb2
  • erbb3
  • erbb3b
  • erbb4
  • erbb4a
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf7
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fgfr2
  • fgfr3
  • fgfr4
  • fi06b09
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hbegfa
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • kl
  • mapk1
  • mapk3
  • met
  • nras
  • nrg2b
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • pdgfra
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3r1
  • pik3r2
  • ranbp9
  • rasgrf2
  • rasgrp3
  • rgl1
  • si:ch211-227n20.1
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • sparse
  • tek
  • tie-2
  • tie2
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb65b05
  • wu:fc32c12
  • wu:fc76g06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fi06b09
  • wu:fj59e07
  • wu:fv70f10
  • zERK1
  • zERK2
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:153249
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:63601
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
NFG and proNGF binds to p75NTR
  • ngf
  • ngfb
  • ngfrb
  • ngfrl
Danio rerio (zebrafish)
G beta:gamma signalling through PI3Kgamma
  • akt2
  • akt3b
  • cb945
  • pdpk1b
  • rhoac
  • zgc:77318
Danio rerio (zebrafish)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR3
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr3
  • fj46f04
  • id:ibd5158
  • plcg1
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fj46f04
  • wu:fj57a05
Danio rerio (zebrafish)
Myogenesis
  • Ctnna2
  • MEF2B
  • R-cadherin
  • boc
  • cb507
  • cb553
  • cb641
  • cdh2
  • cdh4
  • cdon
  • ctnna1
  • ctnnb1
  • etID309781.16
  • fa16d03
  • fk53b11
  • mapk11
  • mapk12b
  • mapk14
  • mapk14b
  • mef2D
  • mef2b
  • mef2d
  • mrf4
  • myf-5
  • myf5
  • myf6
  • myod
  • myod1
  • myog
  • pac
  • rcad
  • si:ch211-125m10.1
  • si:dkey-14d8.5
  • tcf12
  • tcf3a
  • tcf3b
  • wu:fa10c03
  • wu:fa16d03
  • wu:fb94b11
  • wu:fc50h03
  • wu:fk53b11
  • zgc:100763
  • zgc:109833
  • zgc:110509
  • zgc:136316
  • zgc:158240
  • zgc:86905
Danio rerio (zebrafish)
VEGF binds to VEGFR leading to receptor dimerization
  • figf
  • flk1b
  • flt-4
  • flt4
  • kdr
  • kdrb
  • vegf
  • vegf-d
  • vegfa
  • vegfaa
  • vegfc
  • vegfd
  • vegfr3
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by PDGF
  • furin
  • furina
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • pdgfra
  • ptpn12
  • si:dkey-281a24.5
  • wu:fc32c12
  • zgc:153249
  • zgc:65856
  • zgc:77437
Danio rerio (zebrafish)
MHC class II antigen presentation
  • Ap1m1
  • CTSB
  • GILT
  • Iclp-1
  • MHCII
  • Ppgb
  • ap1g2
  • ap1m2
  • ap1s1
  • ap1s2
  • arf1
  • b2m
  • canx
  • catD
  • cb173
  • cb271
  • cb420
  • cb460
  • cb912
  • cd74a
  • clta
  • ctsa
  • ctsb
  • ctsba
  • ctsc
  • ctsd
  • ctsf
  • ctsh
  • ctsk
  • ctsl
  • ctsl.1
  • ctss2.1
  • ctssb.1
  • ctssb1
  • dnm2
  • dnm2b
  • dnm2l
  • fc07e03
  • fc38f10
  • fc44c02
  • fc47h06
  • fj40d12
  • hla-dpa1
  • hm:zewp0159
  • iclp1
  • id:ibd1201
  • ifi30
  • ik:tdsubc_1h2
  • im:6797184
  • im:6910535
  • lgmn
  • mhc2b
  • mhc2d8.45b1
  • mhc2daa
  • mhc2dgb
  • ns:zf-a41
  • sar1a
  • sar1ab
  • sb:cb146
  • sb:cb173
  • sb:cb271
  • sb:cb420
  • sec13
  • sec13l1
  • sec23a
  • sec31a
  • sec31l1
  • sec31p
  • si:busm1-160c18.10
  • si:busm1-194e12.12
  • si:busm1-194e12.8
  • si:busm1-228j01.6
  • si:busm1-266f07.2
  • si:busm1-48c11.4
  • si:dkey-239j18.2
  • si:dkey-269i1.3
  • si:dz160c18.10
  • si:dz194e12.12
  • si:dz194e12.8
  • si:dz228j01.6
  • si:dz266f07.2
  • si:dz48c11.4
  • si:zc14a17.4
  • wu:fa08f09
  • wu:fa13g05
  • wu:fa93a04
  • wu:fa95f03
  • wu:fa98g05
  • wu:fb08b05
  • wu:fb11f09
  • wu:fb12a01
  • wu:fb13d06
  • wu:fb33e02
  • wu:fb33g02
  • wu:fb34e12
  • wu:fb34g12
  • wu:fb36c08
  • wu:fb61d08
  • wu:fb78h01
  • wu:fb93e11
  • wu:fb94g06
  • wu:fc07e03
  • wu:fc38f10
  • wu:fc44c02
  • wu:fc47h06
  • wu:fd13d02
  • wu:fd19a08
  • wu:fe06b12
  • wu:fi17f10
  • wu:fj17b09
  • wu:fj40d12
  • wu:fj48d06
  • wu:fj58d01
  • wu:fj91g05
  • wu:fj92g08
  • wu:fk94e07
  • zf-a41
  • zgc:101701
  • zgc:103537
  • zgc:110367
  • zgc:110650
  • zgc:112226
  • zgc:112369
  • zgc:113853
  • zgc:123061
  • zgc:123302
  • zgc:153093
  • zgc:55862
  • zgc:56704
  • zgc:63524
  • zgc:63980
  • zgc:65802
  • zgc:65809
  • zgc:73358
  • zgc:76953
  • zgc:77181
  • zgc:77233
  • zgc:77925
  • zgc:85689
  • zgc:85774
  • zgc:92089
  • zmp:0000001138
Danio rerio (zebrafish)
RHO GTPases activate PKNs
  • CPI-17
  • Pp1alpha-96A
  • im:7147597
  • mbs
  • mypt1
  • pdpk1b
  • pkn1b
  • pkn2
  • pkn3
  • ppp1cbl
  • ppp1r12a
  • ppp1r14a
  • ppp1r14aa
  • prk2
  • prkcl2
  • rac1
  • rac1a
  • rhoac
  • wu:fa14b10
  • wu:fd16e02
  • zgc:110700
  • zgc:55823
  • zgc:55917
  • zgc:64169
  • zgc:77318
  • zgc:86934
Danio rerio (zebrafish)
G alpha (12/13) signalling events
  • adra1bb
  • arhgef11
  • arhgef18
  • arhgef18a
  • arhgef37
  • arhgef39
  • fgd4
  • fgd4a
  • fj59e07
  • gna12
  • gna12a
  • gna12l
  • gna13
  • gna13a
  • rasgrf2
  • rhoac
  • rock2
  • rock2a
  • rok2
  • si:ch211-194i18.1
  • si:dkey-57m7.1
  • sos1
  • tbxa2r
  • trio
  • wu:fc21e04
  • wu:fe25e05
  • wu:fj05f11
  • wu:fj59e07
  • zgc:103517
  • zgc:103685
  • zgc:112436
  • zgc:158274
  • zgc:85686
Danio rerio (zebrafish)
Downstream signal transduction
  • Stat5
  • crk
  • crkl
  • fb18e12
  • fb34h10
  • fc05a01
  • fd20h08
  • fi19g05
  • fj46f04
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • im:7147817
  • nck1b
  • nck2b
  • nras
  • pdgfab
  • pdgfbb
  • pdgfra
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3r1
  • pik3r2
  • plcg1
  • sb:eu508
  • sb:eu615
  • si:ch211-147g19.3
  • sos1
  • src
  • stat1
  • stat1a
  • stat5
  • stat5.1
  • stat5.2
  • stat5a
  • stat5b
  • stat6
  • stat7
  • wu:fa55g05
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb34h10
  • wu:fb65b05
  • wu:fc05a01
  • wu:fc32c12
  • wu:fc54a04
  • wu:fd20h08
  • wu:fi19g05
  • wu:fj46f04
  • wu:fj57a05
  • wu:fj59e07
  • wu:fj60e01
  • wu:fj66g07
  • zgc:100936
  • zgc:103549
  • zgc:110734
  • zgc:153249
  • zgc:158274
  • zgc:63469
  • zgc:73077
  • zgc:92024
Danio rerio (zebrafish)
RHOQ GTPase cycle
  • CAV1
  • IQGAP1
  • IQGAP3
  • LOC100004299
  • arhgap1
  • arhgap35a
  • arhgap5
  • arl13b
  • arl2l1
  • cav1
  • cb422
  • cb80
  • cdc42
  • cdc42a
  • cdc42ep2
  • cdc42ep3
  • cdc42ep4
  • cdc42ep4a
  • cftr
  • cip4
  • cx43
  • dlg3
  • fb55a05
  • fe38f01
  • fj62g06
  • fk03b12
  • fk61c06
  • gja1
  • gopc
  • hmp
  • im:7152854
  • im:7156663
  • iqgap1
  • iqgap3
  • jup
  • jupa
  • kinase
  • llk
  • mpp7
  • pak2
  • pak2a
  • rab-7
  • rab7
  • rab7a
  • rhoq
  • scrb1
  • scrib
  • shf
  • si:dz198m22.1
  • slc1a5
  • sof
  • srgap2
  • stb2
  • stoml3
  • stoml3a
  • stoml3b
  • tfr1a
  • trip10
  • vamp3
  • vangl1
  • wasla
  • wu:cegs2891
  • wu:fb07d08
  • wu:fb55a05
  • wu:fb71h01
  • wu:fc07c04
  • wu:fe38f01
  • wu:fi15a09
  • wu:fj62g06
  • wu:fk03b12
  • wu:fk61c06
  • zgc:103557
  • zgc:110200
  • zgc:110361
  • zgc:158395
  • zgc:55997
  • zgc:56254
  • zgc:63918
  • zgc:64058
  • zgc:65853
  • zgc:86726
  • zgc:91798
  • zgc:91889
  • zgc:92806
Danio rerio (zebrafish)
Neurotransmitter clearance
  • cbe
  • ces2
  • ces2a
  • im:6908784
  • oct1
  • si:dkey-38l12.2
  • slc22a2
  • wu:fc01b11
  • zgc:153863
  • zgc:64076
Danio rerio (zebrafish)
Interaction With Cumulus Cells And The Zona Pellucida
  • CHIA
  • ZP3
  • ZPC
  • b4galt1l
  • chia.1
  • chia.2
  • chia.3
  • chia.4
  • chia.5
  • chia.6
  • chioIIa
  • chioIa
  • chioIb
  • chit1
  • fa55e05
  • fe16c11
  • fi20d05
  • fj87h02
  • im:6902904
  • si:dkey-202n12.1
  • si:dkey-51e6none
  • spam1
  • wu:fa55e05
  • wu:fa55g10
  • wu:fb57c11
  • wu:fb61c11
  • wu:fb66f12
  • wu:fd61a02
  • wu:fe16c11
  • wu:fi13f01
  • wu:fi20d05
  • wu:fj87h02
  • zfZPC
  • zgc:114017
  • zgc:153827
  • zgc:154116
  • zgc:158668
  • zgc:162961
  • zgc:173556
  • zgc:55406
  • zgc:55941
  • zgc:56053
  • zgc:63792
  • zgc:77889
  • zgc:77912
  • zp2
  • zp2.2
  • zp2a
  • zp2l1
  • zp2l2
  • zp2v2
  • zp3
  • zp3.2
  • zp3.3
  • zp3a.2
  • zp3al
  • zp3b
  • zp3d.1
  • zp3e
  • zpb2b
  • zpb2c
  • zpc1-2
  • zpc2
  • zpc3
  • zpc4a-1
  • zpc6
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis of Dolichyl-phosphate
  • dhdds
  • dolk
  • dolpp1
  • mvd
  • mvda
  • ngbr
  • nus1
  • srd5a3
  • wu:fd56c06
  • zgc:101585
  • zgc:77088
Danio rerio (zebrafish)
Effects of PIP2 hydrolysis
  • bZ1P14.9
  • fb09d10
  • fv43b11
  • prkcd
  • prkcda
  • prkceb
  • prkcha
  • si:rp71-1p14.9
  • trpc6
  • trpc6a
  • trpc7b
  • wu:fb09d10
  • wu:fv43b11
  • zgc:172124
  • zgc:56558
Danio rerio (zebrafish)
ARMS-mediated activation
  • arms
  • crk
  • fb34h10
  • fc05a01
  • fi19g05
  • kidins220
  • kidins220b
  • ngf
  • ngfb
  • rap1a
  • rap1aa
  • wu:fb34h10
  • wu:fc05a01
  • wu:fc54a04
  • wu:fc66g06
  • wu:fi19g05
  • zgc:100936
  • zgc:86676
Danio rerio (zebrafish)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR4
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
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  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr4
  • fj46f04
  • id:ibd5158
  • plcg1
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fj46f04
  • wu:fj57a05
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
The canonical retinoid cycle in rods (twilight vision)
  • CRALBPb
  • RDHA
  • RDHB
  • cyp4v2
  • cyp4v2a
  • dhrs9
  • im:6901729
  • im:7136890
  • lrat
  • lrata
  • rbp1
  • rbp1.1
  • rbp1b
  • rdh1
  • rdh10a
  • rdh12
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  • rdh5
  • rho
  • rlbp1
  • rlbp1b
  • rpe65a
  • rpepa
  • sb:eu611
  • si:dkey-102c8.5
  • wu:fb64b07
  • wu:fd50b03
  • wu:fj43a10
  • zfo2
  • zgc:100825
  • zgc:154161
  • zgc:73286
  • zgc:77766
  • zgc:92430
Danio rerio (zebrafish)
Platelet degranulation
  • ANX V
  • CYB5R1
  • IGF-1
  • IGF-1L
  • IGF-1a
  • IGF-I
  • LOC792613
  • MRP
  • PAI
  • PAI-1
  • PAI1
  • PLANH1
  • TAGLN
  • Tbeta11
  • VWF
  • abcc4
  • actbb
  • actn2
  • actn2b
  • ahsg
  • ahsg1
  • ai39657
  • aldoa
  • aldoaa
  • antivin
  • anx
  • anx5
  • anxa5
  • anxa5b
  • apoa
  • apoa1
  • apoa1a
  • apool
  • app
  • appa
  • atv
  • atv2
  • bactin2
  • cb1019
  • cb223
  • cb420
  • cb720
  • cb73
  • cb79
  • cb989
  • cd163
  • cd36
  • cd63
  • cdc37l1
  • cfd
  • cfdl
  • chid1
  • clu
  • ctsf
  • cuzn
  • cxcl-c13d
  • cxcl8b.1
  • cxcl8b.3
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  • dia1
  • etID32613.12
  • f13a1
  • f13a1b
  • f5
  • fa92e03
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  • fam49bb
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  • figf
  • fj34a12
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  • fo83d04
  • gas6
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  • il8l1
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  • itgb3b
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  • itih3a.1
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  • lhfpl2a
  • mage
  • manf
  • ndnl2
  • ola1
  • pdgfab
  • pdgfbb
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  • pros1
  • sb:cb420
  • sb:cb79
  • sccpdha
  • sccpdha.1
  • scg3
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  • sepp1a
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  • si:bz20i5.3
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  • vegfa
  • vegfaa
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  • zgc:92525
Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024