GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 76 - 100 of 252 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▲ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Transport of bile salts and organic acids, metal ions and amine compounds
  • UT
  • ctl2
  • ctl4
  • fe01a06
  • mate1
  • mate7
  • si:dkey-175a17.4
  • slc14a2
  • slc44a2
  • slc44a4
  • slc47a1
  • slc47a4
  • wu:fe01a06
Danio rerio (zebrafish)
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides
  • EAAT3
  • EAAT5A
  • SLC1A2a
  • SLC1A7
  • ctns
  • samc
  • si:ch211-284b7.1
  • si:ch73-116b16.2
  • si:dkey-21n12.2
  • slc1a1
  • slc1a2a
  • slc1a3b
  • slc1a7
  • slc1a7a
  • slc1a7b
  • slc25a26
  • slc32a1
  • zgc:110194
  • zgc:158324
  • zgc:91959
Danio rerio (zebrafish)
Antagonism of Activin by Follistatin
  • actbb
  • actbetaB
  • fst
  • fst1
  • fsta
  • fstl3
  • inhbab
  • inhbal
  • inhbb
  • si:dkey-28h18.3
  • zgc:114170
  • zgc:158348
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by Activin
  • ActrIIB
  • actbb
  • actbetaB
  • actr2b
  • actrIIb
  • acvr2b
  • acvr2ba
  • inhbab
  • inhbal
  • inhbb
  • madh2
  • madh3
  • madh3a
  • smad2
  • smad3
  • smad3a
  • wu:fa99e03
  • wu:fj97d11
  • zgc:158348
Danio rerio (zebrafish)
Apoptotic cleavage of cellular proteins
  • IAP1
  • bcap31
  • birc2
  • birc3
  • casp10
  • casp3
  • casp3a
  • casp6
  • casp6a
  • casp7
  • casp8l2
  • fb09d10
  • fnta
  • fv43b11
  • im:6909421
  • mst4
  • prkcd
  • prkcda
  • satb1a
  • sb:cb955
  • si:bz30i22.4
  • si:ch211-195k18.2
  • si:rp71-30i22.4
  • stk24a
  • stk26
  • wu:fb09d10
  • wu:fb51d12
  • wu:fv43b11
  • wu:fz92f09
  • zgc:100890
  • zgc:110595
  • zgc:112960
  • zgc:158397
  • zgc:163071
  • zgc:175288
  • zgc:56389
  • zgc:56558
Danio rerio (zebrafish)
Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade
  • GRK1A
  • GUCA1D
  • METAP2
  • fk56b01
  • fk56e06
  • fnta
  • fntb
  • gcap1
  • gcap2
  • gcap3
  • gcap4
  • gcap5
  • gnat1
  • gng1
  • gngt1
  • grk1
  • grk1a
  • grk7-2
  • grk7b
  • guca1a
  • guca1aa
  • guca1ab.1
  • guca1b
  • guca1c
  • guca1d
  • guca1e
  • im:2601337
  • im:6909421
  • metap1
  • metap2
  • metap2b
  • nmt-1
  • nmt1
  • nmt1a
  • nmt2
  • rcv1a
  • rcvrna
  • rho
  • saga
  • si:rp71-1p14.1
  • wu:fb51d12
  • wu:fb98h06
  • wu:fb99h09
  • wu:fc15d01
  • wu:fc18a04
  • wu:fk53d06
  • wu:fk56b01
  • wu:fk56e06
  • wu:fz92f09
  • zfo2
  • zgc:110714
  • zgc:114180
  • zgc:158397
  • zgc:66109
  • zgc:66243
  • zgc:66250
  • zgc:73318
  • zgc:85885
  • zgc:86774
Danio rerio (zebrafish)
Crosslinking of collagen fibrils
  • bmp1a
  • lox
  • loxa
  • loxl1
  • loxl2b
  • loxl3b
  • mfn
  • si:ch211-238c15.1
  • tld
  • tll1
  • tolloid
  • zgc:77447
Danio rerio (zebrafish)
N-glycan trimming in the ER and Calnexin/Calreticulin cycle
  • amfra
  • cdc48
  • engase
  • hm:zeh0386
  • ik:tdsubc_1f2
  • ngly1
  • psmc1
  • psmc1a
  • psmc1b
  • rad23ab
  • rps27a
  • saks1
  • tdsubc_1f2
  • uba52
  • ubxn1
  • vcp
  • wu:fa91f08
  • wu:fb05d04
  • wu:fj14c10
  • xx:tdsubc_1f2
  • zgc:123344
  • zgc:56516
  • zgc:66168
  • zgc:86923
Danio rerio (zebrafish)
Interaction With Cumulus Cells And The Zona Pellucida
  • CHIA
  • ZP3
  • ZPC
  • b4galt1l
  • chia.1
  • chia.2
  • chia.3
  • chia.4
  • chia.5
  • chia.6
  • chioIIa
  • chioIa
  • chioIb
  • chit1
  • fa55e05
  • fe16c11
  • fi20d05
  • fj87h02
  • im:6902904
  • si:dkey-202n12.1
  • si:dkey-51e6none
  • spam1
  • wu:fa55e05
  • wu:fa55g10
  • wu:fb57c11
  • wu:fb61c11
  • wu:fb66f12
  • wu:fd61a02
  • wu:fe16c11
  • wu:fi13f01
  • wu:fi20d05
  • wu:fj87h02
  • zfZPC
  • zgc:114017
  • zgc:153827
  • zgc:154116
  • zgc:158668
  • zgc:162961
  • zgc:173556
  • zgc:55406
  • zgc:55941
  • zgc:56053
  • zgc:63792
  • zgc:77889
  • zgc:77912
  • zp2
  • zp2.2
  • zp2a
  • zp2l1
  • zp2l2
  • zp2v2
  • zp3
  • zp3.2
  • zp3.3
  • zp3a.2
  • zp3al
  • zp3b
  • zp3d.1
  • zp3e
  • zpb2b
  • zpb2c
  • zpc1-2
  • zpc2
  • zpc3
  • zpc4a-1
  • zpc6
Danio rerio (zebrafish)
Miscellaneous transport and binding events
  • ankh
  • ankhb
  • ctns
  • lrrc8a
  • lrrc8aa
  • lrrc8ab
  • lrrc8d
  • lrrc8db
  • magt1
  • nipa1
  • nipal3
  • npal3
  • si:zfos-323e3.4
  • wu:fb18g12
  • wu:fc12a05
  • wu:fi21b10
  • zgc:101743
  • zgc:110194
  • zgc:153223
  • zgc:92224
Danio rerio (zebrafish)
Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein
  • alg1
  • alg12
  • alg3
  • alg8
  • dpagt1
  • fb18d03
  • mpdu1b
  • si:ch211-117m20.1
  • si:dkey-164m14.3
  • si:rp71-1p14.2
  • wu:fb18d03
  • wu:fi19e09
  • wu:fi19f07
  • wu:fi34b12
  • zgc:112396
  • zgc:112507
  • zgc:66221
  • zgc:86765
Danio rerio (zebrafish)
G alpha (12/13) signalling events
  • adra1bb
  • arhgef11
  • arhgef18
  • arhgef18a
  • arhgef37
  • arhgef39
  • fgd4
  • fgd4a
  • fj59e07
  • gna12
  • gna12a
  • gna12l
  • gna13
  • gna13a
  • rasgrf2
  • rhoac
  • rock2
  • rock2a
  • rok2
  • si:ch211-194i18.1
  • si:dkey-57m7.1
  • sos1
  • tbxa2r
  • trio
  • wu:fc21e04
  • wu:fe25e05
  • wu:fj05f11
  • wu:fj59e07
  • zgc:103517
  • zgc:103685
  • zgc:112436
  • zgc:158274
  • zgc:85686
Danio rerio (zebrafish)
Activated PKN1 stimulates transcription of AR (androgen receptor) regulated genes KLK2 and KLK3
  • LOC100150038
  • LOC100329358
  • LOC100331412
  • LOC100332229
  • LOC103908680
  • LOC108181627
  • LOC562770
  • LOC570661
  • LOC794549
  • NR3C4
  • ar
  • grip1
  • h2af1al
  • h2afvb
  • h2afvl
  • h2afx1
  • h2afza
  • h2av
  • h2ax1
  • h2az2a
  • h2az2b
  • h3-5
  • h3f3a
  • h3f3b.1
  • h3f3c
  • h3f3d
  • hist2h2l
  • im:6896397
  • jmjd2c
  • kdm4c
  • ncoa2
  • pkn1b
  • si:ch211-113a14.17
  • si:ch211-113a14.29
  • si:ch211-113a14.6
  • si:ch73-36p18.4
  • si:dkey-108k21.12
  • si:dkey-108k21.18
  • si:dkey-108k21.28
  • si:dkey-23a13.7
  • src2
  • tif2
  • wu:fd55d07
  • zgc:112234
  • zgc:113984
  • zgc:173585
  • zgc:173587
  • zgc:194998
  • zgc:56685
Danio rerio (zebrafish)
Tie2 Signaling
  • ang1
  • ang2-1
  • angpt1
  • angpt2a
  • fb18e12
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • nras
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3r1
  • pik3r2
  • sos1
  • tek
  • tie-2
  • tie2
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fb65b05
  • wu:fc76g06
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
FRS-mediated FGFR2 signaling
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf7
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr2
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
SHC-mediated cascade:FGFR2
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf7
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr2
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
FRS-mediated FGFR1 signaling
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • kl
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
FRS-mediated FGFR4 signaling
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr4
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
FRS-mediated FGFR3 signaling
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr3
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
SHC-mediated cascade:FGFR1
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • kl
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
SHC-mediated cascade:FGFR3
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr3
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
Lewis blood group biosynthesis
  • LOC565422
  • LOC796410
  • LOC798349
  • b3galt10.1
  • b3galt11
  • b3galt2
  • fe05b03
  • fut10
  • fut11
  • fut7
  • fut9a
  • im:7151092
  • siat4c
  • st3gal4
  • wu:fe05b03
  • zgc:152705
  • zgc:158162
  • zgc:194168
  • zgc:194170
  • zgc:194313
  • zgc:194330
  • zgc:76904
Danio rerio (zebrafish)
Termination of O-glycan biosynthesis
  • heg
  • im:7151092
  • siat4
  • siat4c
  • siat7D
  • siat7c
  • st3gal1l
  • st3gal2l
  • st3gal4
  • st3gal8
  • st6GalNAc III
  • st6GalNAc-III
  • st6galnac3
  • st6galnac4
  • wu:fb67c12
  • zgc:111788
  • zgc:153237
  • zgc:158162
  • zgc:73301
Danio rerio (zebrafish)
EPHB-mediated forward signaling
  • ARPC1A
  • actba
  • actbb
  • actr2
  • actr2a
  • actr2b
  • actr3
  • arp2a
  • arp2b
  • arpc1a
  • arpc1b
  • arpc2
  • arpc3
  • arpc4
  • arpc4l
  • arpc5b
  • bact
  • bactin1
  • bactin2
  • bactzf
  • cb440
  • cb871
  • cdc42
  • cdc42a
  • fa07b12
  • fj15h02
  • fj62g06
  • fk84a07
  • hrasb
  • hrasl
  • rasa1b
  • rhoac
  • rock2
  • rock2a
  • rok2
  • sdc2
  • wasla
  • wu:fa07b12
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Danio rerio (zebrafish)
MHC class II antigen presentation
  • Ap1m1
  • CTSB
  • GILT
  • Iclp-1
  • MHCII
  • Ppgb
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  • ap1m2
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Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024