GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 252 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
Trafficking and processing of endosomal TLR
  • UNC93B1
  • lrrc33
  • nrros
  • unc93b1
Danio rerio (zebrafish)
Apoptotic cleavage of cell adhesion proteins
  • E-cad
  • casp3
  • casp3a
  • cdh1
  • ctnnb1
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • ocln
  • oclna
  • wu:fd23h10
  • wu:fi13c01
  • zgc:100890
  • zgc:113992
  • zgc:56359
Danio rerio (zebrafish)
G alpha (q) signalling events
  • 5-ht2cr
  • 5ht2b
  • EDN3
  • EDN3a
  • Ednra2
  • FP
  • GNB1x
  • GNG5
  • GnRH-II
  • IT-NP
  • LOC794123
  • LOC798233
  • LTB4R
  • Lpar3
  • NPFF
  • RGS4
  • VT-NP
  • [g]3
  • adra1bb
  • agt
  • agtr1b
  • avp
  • avpl
  • avpr1a
  • avpr1aa
  • avpr1ab
  • avpr1b
  • cGnRH-II
  • cb436
  • chrm5
  • chrm5a
  • cysltr1
  • edg2
  • edn1
  • edn3
  • edn3b
  • ednr-a
  • ednra
  • ednraa
  • ednrb1
  • ednrb1a
  • ednrba
  • et-1
  • fb14d01
  • fb39f01
  • fj30h05
  • fj33a01
  • fp
  • gna11b
  • gna15.1
  • gnb1b
  • gnb1l
  • gnb3a
  • gnb3l
  • gnb5a
  • gng1
  • gng12b
  • gng13b
  • gng3
  • gng5
  • gng7
  • gng8
  • gngt1
  • gngt2
  • gngt2a
  • gnrh2
  • gnrhr2
  • gnrhr4
  • gpr39
  • gprc6a
  • grm1
  • grm1b
  • grm5a
  • grm5b
  • hcrt
  • hcrtr
  • hcrtr2
  • htr2b
  • htr2cl1
  • id:ibd1139
  • ik:tdsubc_2c12
  • im:7160079
  • itnp
  • kiss1
  • kiss1rb
  • lpar1
  • lpar2a
  • lpar3
  • lpar5a
  • lpar5b
  • lpar6
  • lpar6a
  • lpar6l
  • ltb4r
  • nk1a
  • npffl
  • npffr2.1
  • npffr2a
  • nts
  • ntsr1
  • opn4
  • opn4a
  • opn4d
  • opn4m1
  • oxt
  • oxtl
  • oxtr
  • oxtra
  • p2ry1
  • p2ry10
  • p2ry5
  • pik3ca
  • pik3r1
  • pik3r2
  • pik3r3a
  • pqrf
  • prok1
  • prok2
  • prokr1a
  • prokr1b
  • prokr1l
  • ptafr
  • ptger1a
  • ptger1b
  • ptgfr
  • rgs13
  • rgs4
  • rgs5
  • rgs5a
  • rgs8
  • sb:cb436
  • si:ch211-125a15.3
  • si:ch211-150f22.3
  • si:ch211-152p11.4
  • si:ch211-157p22.8
  • si:ch211-1n9.11
  • si:ch211-202p1.5
  • si:ch211-217k17.1
  • si:ch211-272h9.1
  • si:ch211-272h9.2
  • si:ch211-278p9.5
  • si:ch211-44l19.2
  • si:ch211-89m7.1
  • si:ch211-93b22.1
  • si:dkey-202e17.4
  • si:dkey-211g8.7
  • si:dkey-211h10.1
  • si:dkey-228g21.4
  • si:dkey-24g18.2
  • si:dkey-44g17.6
  • si:dkeyp-84g1.5
  • si:dz22b13.1
  • si:dz46m7.1
  • tac1
  • tac2a
  • tac3a
  • tacr1a
  • tacr2
  • tacr3b
  • tacr3l
  • tbxa2r
  • trio
  • vsnp
  • wu:fb12d06
  • wu:fb14d01
  • wu:fb16a12
  • wu:fb39f01
  • wu:fb62d01
  • wu:fb62f06
  • wu:fb65b05
  • wu:fb75g12
  • wu:fb98e06
  • wu:fc06d08
  • wu:fj09d12
  • wu:fj30h05
  • wu:fj33a01
  • wu:fj56b02
  • wu:fj87b02
  • wu:fk53d05
  • wu:fk53d06
  • wu:fk56b03
  • wu:fq40d10
  • xx:tdsubc_2c12
  • zgc:100880
  • zgc:100942
  • zgc:101053
  • zgc:101761
  • zgc:103685
  • zgc:110316
  • zgc:111892
  • zgc:112062
  • zgc:153784
  • zgc:162893
  • zgc:163081
  • zgc:194094
  • zgc:194119
  • zgc:194481
  • zgc:194493
  • zgc:194865
  • zgc:194868
  • zgc:55774
  • zgc:64187
  • zgc:66034
  • zgc:73230
  • zgc:73318
  • zgc:92157
  • zgc:92641
  • zgc:92704
  • zgc:92709
  • zgc:92852
Danio rerio (zebrafish)
EPHB-mediated forward signaling
  • ARPC1A
  • actba
  • actbb
  • actr2
  • actr2a
  • actr2b
  • actr3
  • arp2a
  • arp2b
  • arpc1a
  • arpc1b
  • arpc2
  • arpc3
  • arpc4
  • arpc4l
  • arpc5b
  • bact
  • bactin1
  • bactin2
  • bactzf
  • cb440
  • cb871
  • cdc42
  • cdc42a
  • fa07b12
  • fj15h02
  • fj62g06
  • fk84a07
  • hrasb
  • hrasl
  • rasa1b
  • rhoac
  • rock2
  • rock2a
  • rok2
  • sdc2
  • wasla
  • wu:fa07b12
  • wu:fa22f07
  • wu:fb07d08
  • wu:fb63b05
  • wu:fj08e12
  • wu:fj15h02
  • wu:fj62g06
  • wu:fk84a07
  • wu:fk93e03
  • zgc:101093
  • zgc:103676
  • zgc:110734
  • zgc:158395
  • zgc:63918
  • zgc:64056
  • zgc:77769
  • zgc:77932
  • zgc:86828
Danio rerio (zebrafish)
Stimuli-sensing channels
  • accn1
  • accn2a
  • accn2b
  • accn2c
  • accn4a
  • ano10
  • asic1a
  • asic1b
  • asic1c
  • asic2
  • asic4a
  • clcn2c
  • clcn4
  • im:6903943
  • si:ch211-229n1.3
  • stoml3
  • stoml3a
  • stoml3b
  • tmem16k
  • tpc2
  • tpcn2
  • ttyh2l
  • ttyh3b
  • zgc:110200
Danio rerio (zebrafish)
ABC-family proteins mediated transport
  • CH211-265P12.8
  • LMP7
  • MRP
  • PA28-gamma
  • PSMA5
  • PSMB9A
  • PSMD10
  • Psma2
  • Psmb11b
  • Y
  • abcb9
  • abcc2
  • abcc4
  • abcc5
  • abcf1
  • beta1
  • beta1ia
  • beta2i
  • beta5
  • beta5ia
  • beta5tb
  • cb1019
  • cdc48
  • cftr
  • dZ52I16.4
  • derl2
  • eif2
  • eif2s1
  • eif2s1b
  • eif2s2
  • eif2s3
  • erlec1
  • erlin1
  • erlin2
  • etID309919.2
  • fa93g07
  • fb17c09
  • fb19d01
  • fb20g04
  • fb49a10
  • fc34f08
  • fj42d12
  • fj51h02
  • fk89d05
  • gankyrin
  • hm:zeh0386
  • ik:tdsubc_1f2
  • im:6909944
  • lmp2
  • lmp7
  • macropain
  • os9
  • prosome
  • psma1
  • psma2
  • psma2a
  • psma2b
  • psma3
  • psma4
  • psma5
  • psma6b
  • psma7
  • psma8
  • psmb1
  • psmb10
  • psmb11b
  • psmb12
  • psmb13a
  • psmb2
  • psmb3
  • psmb5
  • psmb6
  • psmb8
  • psmb8a
  • psmb9
  • psmb9a
  • psmc1
  • psmc1a
  • psmc1b
  • psmc2
  • psmc4
  • psmc5
  • psmc6
  • psmd1
  • psmd10
  • psmd11b
  • psmd12
  • psmd13
  • psmd14
  • psmd3
  • psmd4
  • psmd4a
  • psmd6
  • psmd7
  • psmd8
  • psme1
  • psme2
  • psme3
  • psme4b
  • rnf185
  • rps27a
  • sb:cb309
  • si:busm1-52i16.4
  • si:ch1073-183g13.2
  • si:dkey-21k4.3
  • si:dz202l16.5
  • si:dz52i16.4
  • si:rp71-45k5.4
  • si:zc14a17.13
  • tdsubc_1f2
  • uba52
  • unp309
  • unp310
  • vcp
  • wu:fa14g03
  • wu:fa66f04
  • wu:fa91f08
  • wu:fa93g07
  • wu:faa49c06
  • wu:fb05d04
  • wu:fb11d10
  • wu:fb17c09
  • wu:fb19c08
  • wu:fb19d01
  • wu:fb20g04
  • wu:fb23a11
  • wu:fb38a06
  • wu:fb49a10
  • wu:fb59c07
  • wu:fb79c06
  • wu:fb98h03
  • wu:fc26g03
  • wu:fc34f08
  • wu:fc39a05
  • wu:fc49f02
  • wu:fc85c10
  • wu:fe05d10
  • wu:fe38b10
  • wu:fi03c01
  • wu:fi15g10
  • wu:fj14c10
  • wu:fj22d05
  • wu:fj42d12
  • wu:fj51h02
  • wu:fj94a08
  • wu:fk28c01
  • wu:fk89d05
  • wu:fu10f07
  • wu:fu88b08
  • x
  • xx:tdsubc_1f2
  • y
  • zgc:109707
  • zgc:109823
  • zgc:110363
  • zgc:110436
  • zgc:110710
  • zgc:114044
  • zgc:123344
  • zgc:153838
  • zgc:162272
  • zgc:55284
  • zgc:55818
  • zgc:56176
  • zgc:56374
  • zgc:56377
  • zgc:56471
  • zgc:56516
  • zgc:63709
  • zgc:63995
  • zgc:65867
  • zgc:66072
  • zgc:66168
  • zgc:77084
  • zgc:77139
  • zgc:77369
  • zgc:77482
  • zgc:85667
  • zgc:86762
  • zgc:86820
  • zgc:86833
  • zgc:86851
  • zgc:86923
  • zgc:91842
  • zgc:92282
  • zgc:92464
  • zgc:92596
  • zgc:92716
  • zgc:92726
  • zgc:92791
Danio rerio (zebrafish)
EPH-Ephrin signaling
  • D160
  • EphA3
  • RTK2
  • al1
  • efna1
  • efna1b
  • efna2
  • efna3
  • efna3b
  • efna5
  • efna5b
  • efnb1
  • efnb2b
  • efnb3
  • efnb3b
  • ek1
  • ek2
  • epha2
  • epha2a
  • epha3
  • epha4
  • epha4a
  • epha4b
  • epha7
  • ephb4a
  • ephrin-A3
  • eplg6
  • eplg7
  • fc10d03
  • fc51g03
  • hm:zeh0344
  • id:ibd2782
  • id:ibd5049
  • id:ibd5152
  • lerk6
  • lerk7
  • rtk2
  • rtk5
  • rtk6
  • si:dkey-23k6.1
  • wu:fc10d03
  • wu:fc51g03
  • zeh0344
  • zek1
  • zek2
  • zgc:100772
  • zgc:111938
Danio rerio (zebrafish)
Synaptic adhesion-like molecules
  • AMPA
  • GRIN3A
  • SI:zC231H1.1
  • ZfGluR1a
  • dlg1l
  • dlg4
  • flot1
  • flot1a
  • flot2a
  • glur1a
  • glur3b
  • glur4a
  • gria1.1
  • gria1a
  • gria3
  • gria3.2
  • gria3b
  • gria4
  • gria4a
  • iGluR4
  • lrfn1
  • lrfn2b
  • reggie2
  • si:bz1o18.1
  • si:cabz01090165.1
  • si:dz44o19.1
  • si:zc140k5.3
  • wu:fj45g11
  • zfGRIA1[a]
  • zfGRIA3[b]
  • zmp:0000001073
Danio rerio (zebrafish)
The NLRP3 inflammasome
  • TXN
  • asc
  • asc1
  • fb15h09
  • hsp90ab1
  • hsp90b
  • hspc3
  • nlrp1
  • p2rx7
  • p2xr7
  • panx1
  • panx1a
  • pstpip1b
  • pycard
  • sb:cb368
  • sgut1
  • sugt1
  • txn
  • txnip
  • txnipa
  • wu:fb15h09
  • wu:fd45a02
  • zgc:123255
  • zgc:194990
  • zgc:55631
  • zgc:92903
Danio rerio (zebrafish)
Clearance of dopamine
  • dat
  • slc6a3
Danio rerio (zebrafish)
Multifunctional anion exchangers
  • SLC26A6
  • si:dkey-31f5.2
  • slc26a11
  • slc26a2
  • slc26a3
  • slc26a3.1
  • slc26a6l
  • slc5a12
  • smctn
  • wu:fd14d06
  • zgc:64158
Danio rerio (zebrafish)
Nicotinamide salvaging
  • aibp
  • apoa1bp
  • cyp8b1.1
  • naprt
  • naprt1
  • naxd
  • naxe
  • nudt12
  • parp16
  • parp6b
  • parp8
  • ptgis
  • ptgisl
  • ptgs2b
  • rnls
  • si:ch73-198j8.4
  • si:dkey-3h3.2
  • si:dkey-97o5.6
  • slc5a8
  • slc5a8l
  • smcte
  • zgc:64002
  • zgc:77744
  • zgc:92286
  • zgc:92406
Danio rerio (zebrafish)
Calcitonin-like ligand receptors
  • adm2
  • adm2a
  • calc
  • calca
  • calcrl
  • calcrla
  • cgrp
  • imdn
  • ramp1
  • ramp2
  • si:dkey-22l11.3
  • zgc:174936
  • zgc:92886
Danio rerio (zebrafish)
Activation of the phototransduction cascade
  • GNB1x
  • fb39f01
  • fk56e06
  • gnat1
  • gnb1b
  • gnb1l
  • gng1
  • gngt1
  • rho
  • wu:fb39f01
  • wu:fb98e06
  • wu:fj09d12
  • wu:fk53d06
  • wu:fk56e06
  • zfo2
  • zgc:55774
  • zgc:73318
Danio rerio (zebrafish)
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell
  • SCN2B
  • cb810
  • cd226
  • cd40
  • cd40lg
  • cxadr
  • dl3
  • itga4
  • itgb1
  • itgb1b
  • itgb1b.1
  • itgb1b.2
  • mag
  • nectin1b
  • pvrl1b
  • sb:cb1043
  • sc:d147
  • scn2b
  • si:ch211-231h20.3
  • si:ch211-264f5.2
  • si:ch73-208g10.1
  • siglec-4
  • tnfsf10
  • tnfsf10l2
  • tnfsf10l4
  • zgc:113297
  • zgc:158817
  • zgc:85632
  • zgc:92320
Danio rerio (zebrafish)
Cation-coupled Chloride cotransporters
  • nkcc1
  • slc12a2
Danio rerio (zebrafish)
Adrenaline,noradrenaline inhibits insulin secretion
  • GNB1x
  • GNG5
  • [g]3
  • adcy5
  • adra2a
  • adra2c
  • fb39f01
  • fi21e06
  • gnai1
  • gnai2
  • gnai2b
  • gnb1b
  • gnb1l
  • gnb3a
  • gnb3l
  • gnb5a
  • gng1
  • gng12b
  • gng13b
  • gng3
  • gng5
  • gng7
  • gng8
  • gngt1
  • gngt2
  • gngt2a
  • id:ibd1139
  • ik:tdsubc_2c12
  • si:dkey-178j17.2
  • si:dkey-44g17.6
  • si:dkeyp-60a7.2
  • wu:fb39f01
  • wu:fb98e06
  • wu:fi21e06
  • wu:fj09d12
  • wu:fj56b02
  • wu:fk53d05
  • wu:fk53d06
  • xx:tdsubc_2c12
  • zgc:100880
  • zgc:110316
  • zgc:55774
  • zgc:56690
  • zgc:63957
  • zgc:73318
  • zgc:92641
  • zgc:92704
  • zgc:92709
  • zgc:92852
Danio rerio (zebrafish)
Enzymatic degradation of dopamine by COMT
  • comta
  • mrc
  • tomt
Danio rerio (zebrafish)
Rhesus glycoproteins mediate ammonium transport.
  • rhag
  • rhbg
  • rhcg2a
  • rhcgl1
  • wu:fj61d12
  • zgc:171954
Danio rerio (zebrafish)
p75NTR recruits signalling complexes
  • RICK
  • hal
  • hm:zeh0386
  • ik:tdsubc_1f2
  • myd88
  • ngf
  • ngfb
  • ngfrb
  • ngfrl
  • p62
  • prkci
  • ripk2
  • rps27a
  • sb:cb621
  • sqstm1
  • tdsubc_1f2
  • traf6
  • uba52
  • wu:fa91f08
  • xx:tdsubc_1f2
  • zgc:123344
  • zgc:66168
  • zgc:85784
Danio rerio (zebrafish)
Transcriptional and post-translational regulation of MITF-M expression and activity
  • hint1
  • kit
  • kita
  • kitla
  • kitlga
  • mapk1
  • mitfb
  • sparse
  • zERK2
Danio rerio (zebrafish)
RHO GTPases Activate ROCKs
  • rhoac
  • rock2
  • rock2a
  • rok2
Danio rerio (zebrafish)
Class B/2 (Secretin family receptors)
  • PTH
  • crf
  • crh
  • crhb
  • crhbp
  • pth1
  • pth1a
  • pth1r
  • pth1ra
  • pth2
  • pth2r
  • pth2ra
  • pthlh
  • pthlha
  • pthr1
  • pthr2
  • pthrp
  • si:ch211-286m4.5
  • tip39
  • zPTH1R
  • zgc:101864
  • zgc:123155
  • zgc:91905
Danio rerio (zebrafish)
Axonal growth inhibition (RHOA activation)
  • arhgdia
  • fb64c01
  • im:7136397
  • lingo1
  • lingo1b
  • lingo4b
  • mag
  • ngfrb
  • ngfrl
  • rhoac
  • rtn1
  • rtn1a
  • rtn4b
  • rtn5
  • rtn6
  • siglec-4
  • wu:fa96g11
  • wu:fb64c01
  • wu:fc07e07
  • wu:fq24d12
  • zgc:113566
  • zgc:198379
  • zgc:55554
  • zgc:73298
  • zgc:77681
  • zgc:86778
Danio rerio (zebrafish)
Highly calcium permeable nicotinic acetylcholine receptors
  • LOC555747
  • LOC556619
  • chrna1
  • chrna2
  • chrna2a
  • chrna4
  • chrna4b
  • chrna6
  • chrnb3a
  • nic1
  • si:dkey-234d14.1
  • zgc:136717
Danio rerio (zebrafish)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024