GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 26 - 50 of 128 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Regulation of TLR by endogenous ligand
  • DDB_G0271242
  • DDB_G0288095
  • DDB_G0288097
  • nhp6
Dictyostelium discoideum
Regulation of PTEN stability and activity
  • DDB_G0267906
  • DDB_G0272951
  • DDB_G0275865
  • DDB_G0281657
  • DDB_G0283983
  • DDB_G0285063
  • DDB_G0285967
  • DDB_G0286481
  • DDB_G0288795
  • DDB_G0292920
  • M4
  • akt
  • casK
  • cnrN
  • csnk2b
  • dagA
  • dapA
  • dpr1
  • pkbA
  • prdD
  • prdE
  • prtC
  • prtD
  • psmA1
  • psmA2
  • psmA3
  • psmA4
  • psmA5
  • psmA6
  • psmA7
  • psmB2
  • psmB3
  • psmB4-1
  • psmB4-2
  • psmB5
  • psmB6
  • psmB7
  • psmC1
  • psmC2
  • psmC3
  • psmC4
  • psmC6
  • psmD1
  • psmD10
  • psmD11
  • psmD12
  • psmD13
  • psmD14
  • psmD2
  • psmD3
  • psmD4
  • psmD6
  • psmD7
  • psmD8-1
  • psmD8-2
  • psmD9
  • psmE3
  • psmE4
  • psmF1
  • pteN
  • ptenA
  • sks1
  • tbp2
  • tbpB
  • ubpA
  • ubqB
  • ubqC
  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • usp5
  • veg116
Dictyostelium discoideum
Regulation of HSF1-mediated heat shock response
  • DDB_G0278179
  • DDB_G0281165
  • DDB_G0281747
  • DDB_G0285709
  • DDB_G0293674
  • DDB_G0293678
  • bip2
  • erk1
  • erkA
  • fttB
  • gsk3
  • gskA
  • hsc70
  • hsp70
  • hspB
  • hspE-1
  • hspE-2
  • hspH
  • mhsp70
Dictyostelium discoideum
Recycling of bile acids and salts
  • abcB2
  • abcB3
  • abcB6
  • abcB7
  • abcC10
  • abcC12
  • abcC3
  • abcC5
  • abcC8
  • tagA
  • tagB
  • tagC
  • tagD
Dictyostelium discoideum
Receptor Mediated Mitophagy
  • DDB_G0277699
  • DDB_G0286481
  • DDB_G0290491
  • apg1
  • apg12
  • apg5
  • apg8
  • atg1
  • atg12
  • atg5
  • atg8
  • casK
  • csnk2b
Dictyostelium discoideum
Reactions specific to the complex N-glycan synthesis pathway
  • DDB_G0276661
  • alfA
  • fut1
  • fut10
  • fut11
  • fut2
  • fut3
  • fut4
  • fut5
  • fut6
  • fut7
  • fut9
Dictyostelium discoideum
ROS and RNS production in phagocytes
  • DDB_G0274141
  • atp6v1d
  • atp6v1g
  • dvacB
  • nramp
  • nramp1
  • redB
  • slc11a1
  • vatA
  • vatB
  • vatC
  • vatD-1
  • vatD-2
  • vatE
  • vatF
  • vatH
  • vatM
  • vatP
  • vatg
Dictyostelium discoideum
RAF/MAP kinase cascade
  • erk1
  • erkA
Dictyostelium discoideum
RAF activation
  • DDB_G0267566
  • DDB_G0267686
  • DDB_G0268876
  • DDB_G0272092
  • DDB_G0282963
  • DDB_G0290471
  • DDB_G0291516
  • DDB_G0291664
  • RacGEF
  • kxcB
  • mrkC
  • phg2
  • spkA-1
  • spkA-2
Dictyostelium discoideum
Progressive trimming of alpha-1,2-linked mannose residues from Man9/8/7GlcNAc2 to produce Man5GlcNAc2
  • DDB_G0268754
  • DDB_G0284391
  • DDB_G0284393
  • DDB_G0284395
  • DDB_G0292918
Dictyostelium discoideum
Prednisone ADME
  • DDB_G0268184
  • DDB_G0268562
  • abcB2
  • abcB3
  • abcB6
  • abcB7
  • alrA
  • alrB
  • alrC
  • tagA
  • tagB
  • tagC
  • tagD
  • ugt2
  • ugt3
Dictyostelium discoideum
Post-translational modification: synthesis of GPI-anchored proteins
  • DDB_G0279675
  • DDB_G0288963
  • pldG
  • xpnpep1
  • xpnpepl
  • xpnpepl1
Dictyostelium discoideum
Platelet homeostasis
  • p2xA
  • p2xB
  • p2xC
  • p2xD
  • p2xE
Dictyostelium discoideum
Platelet degranulation
  • CP1
  • DDB_G0267974
  • DDB_G0268156
  • DDB_G0268758
  • DDB_G0269600
  • DDB_G0272218
  • DDB_G0274385
  • DDB_G0275765
  • DDB_G0276317
  • DDB_G0280565
  • DDB_G0281889
  • DDB_G0282287
  • DDB_G0282859
  • DDB_G0282977
  • DDB_G0283859
  • DDB_G0284679
  • DDB_G0286055
  • DDB_G0287201
  • DDB_G0288133
  • DDB_G0291191
  • abcC1
  • abcC13
  • abcC14
  • abcC15
  • abcC2
  • abcC6
  • abcC7
  • abcC9
  • abpA
  • abpC
  • abpD
  • act26
  • actnA
  • actnB
  • aip1
  • ann7
  • calA
  • calB
  • camA
  • chid1
  • cprA
  • cyb5r1
  • cyri
  • fam49
  • fba
  • fip-1
  • fip-2
  • gtpbp1
  • lmpA
  • lmpB
  • lmpC
  • mlcD
  • nxnA
  • nxnB
  • rab32D
  • sadA
  • sapA
  • scfd2
  • sec1
  • sec1A
  • sodE
  • talB
  • triA
  • tubA
  • vti1
  • vti1A
  • vti1B
  • wdpA
Dictyostelium discoideum
Physiological factors
  • D2
  • DDB_G0276969
  • DDB_G0279717
  • DDB_G0285555
  • DDB_G0291344
  • cryS
Dictyostelium discoideum
Phase I - Functionalization of compounds
  • D2
  • DDB_G0270652
  • DDB_G0275953
  • DDB_G0276969
  • DDB_G0277999
  • DDB_G0279717
  • DDB_G0283819
  • DDB_G0285555
  • DDB_G0288165
  • DDB_G0291344
  • comG
  • cryS
  • cyb5B
  • cyb5C
  • cyb5r1
  • cyp508A1-1
  • cyp508A1-2
  • cyp508A2-1
  • cyp508A2-2
  • cyp508A3-1
  • cyp508A3-2
  • cyp508A4
  • cyp508B1
  • cyp508C1
  • cyp508D1
  • cyp515A1
  • cyp515B1
  • cyp516A1
  • cyp516B1
  • cyp517A1
  • cyp517A2
  • cyp517A4
  • cyp518A1
  • cyp518B1
  • cyp519B1
  • cyp519D1
  • cyp519E1
  • cyp521A1
  • cyp522A1
  • cyp554A1
  • cyp555A1
  • ostA
  • ostB
Dictyostelium discoideum
Peroxisomal protein import
  • DDB_G0268018
  • DDB_G0274339
  • DDB_G0275415
  • DDB_G0277335
  • DDB_G0277477
  • DDB_G0279049
  • DDB_G0280851
  • DDB_G0282495
  • DDB_G0287851
  • DDB_G0290089
  • DDB_G0290277
  • DDB_G0290547
  • acox1
  • agxt
  • cat
  • catA
  • ddo-1
  • ddo-2
  • ech1
  • hacl1
  • haox
  • hmgL
  • idhM
  • mfe2
  • mfeB
  • pex10
  • pex12
  • pex13
  • pex14
  • pex5
  • pex7
  • redB
  • ubcB
  • ubqB
  • ubqC
  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • veg116
Dictyostelium discoideum
Pentose phosphate pathway
  • PGD
  • g6pd-1
  • g6pd-2
  • gnd
  • pgl
  • pgls
  • pgmB
  • rbsk
  • rpe
  • rpiA
  • tal
  • zwf
Dictyostelium discoideum
Passive transport by Aquaporins
  • DDB_G0290691
  • aqpA
  • aqpB
  • wacA
Dictyostelium discoideum
PLC beta mediated events
  • Ga3
  • gbqA
  • gpa10
  • gpa11
  • gpa12
  • gpaA
  • gpaB
  • gpaC
  • gpaD
  • gpaE
  • gpaF
  • gpaG
  • gpaH
  • gpaJ
  • gpaK
  • gpaL
  • pipA
  • plc
Dictyostelium discoideum
PI3K/AKT Signaling
  • DDB_G0273293
  • DDB_G0288795
  • DG1117
  • akt
  • amiA
  • dagA
  • lst8
  • pdkA
  • pia
  • piaA
  • pkbA
  • rip3
  • ripA
  • tor
Dictyostelium discoideum
PDE3B signalling
  • Pde4
  • pde2
  • pde3
  • regA
Dictyostelium discoideum
Orc1 removal from chromatin
  • DDB_G0272951
  • M4
  • cul2
  • culB
  • dapA
  • dpr1
  • fp21A
  • fp21B
  • fpa1
  • fpa1A
  • fpa1B
  • fpa2
  • fpaA
  • fpaB-1
  • fpaB-2
  • orc1
  • orcA
  • prdD
  • prdE
  • prtC
  • prtD
  • psmA1
  • psmA2
  • psmA3
  • psmA4
  • psmA5
  • psmA6
  • psmA7
  • psmB2
  • psmB3
  • psmB4-1
  • psmB4-2
  • psmB5
  • psmB6
  • psmB7
  • psmC1
  • psmC2
  • psmC3
  • psmC4
  • psmC6
  • psmD1
  • psmD10
  • psmD11
  • psmD12
  • psmD13
  • psmD14
  • psmD2
  • psmD3
  • psmD4
  • psmD6
  • psmD7
  • psmD8-1
  • psmD8-2
  • psmD9
  • psmE3
  • psmE4
  • psmF1
  • rbx1
  • skp1A
  • skp1B
  • sks1
  • tbp2
  • tbpB
  • ubqB
  • ubqC
  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • veg116
Dictyostelium discoideum
Nitric oxide stimulates guanylate cyclase
  • redB
Dictyostelium discoideum
Neutrophil degranulation
  • ADA2
  • Arc15
  • Arp1
  • CP2
  • CP3
  • CP4
  • CP5
  • CP6
  • CP7
  • CatD
  • DDB_G0267590
  • DDB_G0267742
  • DDB_G0267752
  • DDB_G0267952
  • DDB_G0267974
  • DDB_G0268034
  • DDB_G0269380
  • DDB_G0269774
  • DDB_G0270134
  • DDB_G0270454
  • DDB_G0271242
  • DDB_G0272220
  • DDB_G0272434
  • DDB_G0272742
  • DDB_G0273095
  • DDB_G0273153
  • DDB_G0273419
  • DDB_G0273473
  • DDB_G0274339
  • DDB_G0274461
  • DDB_G0274833
  • DDB_G0275535
  • DDB_G0275917
  • DDB_G0276227
  • DDB_G0276567
  • DDB_G0276661
  • DDB_G0276961
  • DDB_G0277093
  • DDB_G0277773
  • DDB_G0277967
  • DDB_G0278295
  • DDB_G0278401
  • DDB_G0278487
  • DDB_G0278563
  • DDB_G0278773
  • DDB_G0279493
  • DDB_G0279583
  • DDB_G0279675
  • DDB_G0280557
  • DDB_G0280565
  • DDB_G0280643
  • DDB_G0280855
  • DDB_G0281053
  • DDB_G0281055
  • DDB_G0281325
  • DDB_G0281401
  • DDB_G0281675
  • DDB_G0282107
  • DDB_G0282109
  • DDB_G0282177
  • DDB_G0282179
  • DDB_G0282517
  • DDB_G0282683
  • DDB_G0282859
  • DDB_G0282971
  • DDB_G0282991
  • DDB_G0283893
  • DDB_G0284155
  • DDB_G0284307
  • DDB_G0284753
  • DDB_G0284755
  • DDB_G0284997
  • DDB_G0285063
  • DDB_G0285639
  • DDB_G0285709
  • DDB_G0285897
  • DDB_G0286315
  • DDB_G0286691
  • DDB_G0286891
  • DDB_G0287185
  • DDB_G0287559
  • DDB_G0287731
  • DDB_G0288717
  • DDB_G0288795
  • DDB_G0288847
  • DDB_G0289029
  • DDB_G0289063
  • DDB_G0289195
  • DDB_G0289231
  • DDB_G0289735
  • DDB_G0289749
  • DDB_G0290593
  • DDB_G0290995
  • DDB_G0291131
  • DDB_G0291332
  • DDB_G0291524
  • DDB_G0291984
  • DDB_G0292160
  • DDB_G0293674
  • DDB_G0293678
  • DDB_G0294569
  • DDB_G0294571
  • DDB_G0294577
  • DDB_G0295811
  • DDB_G0295845
  • DG1029
  • Rab1C
  • abcA2
  • abcA3
  • abcA4
  • abcA5
  • abcA6
  • abp1-1
  • abp1-2
  • abpA
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  • abpE-1
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  • acly
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  • alad
  • alfA
  • amdA
  • ann7
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  • ap2a1-2
  • apg7
  • apm1
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  • arlE
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  • arp11
  • arp2
  • arpA
  • arpB
  • arpH
  • atg7
  • atp6v1d
  • calA
  • calB
  • camA
  • cand1
  • cap
  • cat
  • catA
  • cct2
  • cct8
  • cda
  • cdc7
  • cdcD
  • cdk9-1
  • cdk9-2
  • cf60
  • cfaD
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  • copb
  • cpiA
  • cpiB
  • cpiC
  • cpl
  • cplA
  • cpnA
  • cpnB-1
  • cpnB-2
  • cpnC
  • cpnD
  • cpnE
  • cpnF
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  • cprC
  • cprD
  • cprE
  • cprF
  • cprG
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  • cspA
  • ctl2
  • ctnC
  • ctsB
  • ctsD
  • ctsZ
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  • dagA
  • ddi
  • ddiA
  • ddost
  • ddx3
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  • dhcA
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  • dlcB
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  • dnajc3
  • docA
  • docB
  • docC
  • docD
  • dst2
  • dstB
  • dync1li1
  • eef1a1
  • eef1a2
  • efaAI
  • efaAII
  • efaa1
  • efaa2
  • efbA
  • erk1
  • erkA
  • fba
  • fip-1
  • fip-2
  • g6pi
  • gaa
  • gacJJ
  • gapA
  • gghB
  • gip17
  • glb1
  • glpD
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  • gmfA
  • gmsA
  • gnrA
  • gnrB
  • gnrC
  • gpi
  • gpmA
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  • gsta2-1
  • gsta2-2
  • gsta3
  • gsta4
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  • gtr3
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  • hemB
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  • hsc90
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  • hspB
  • hspD
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  • hspE-2
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  • lkhA
  • lmpA
  • lmpB
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  • lvsC
  • manA
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  • melA
  • mlcD
  • mvpA
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  • napA
  • naprt
  • ncstn
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  • ndkB
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  • ndkC-2
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  • nramp1
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  • p2xA
  • p2xB
  • p2xC
  • p2xD
  • p2xE
  • pgam
  • pgi
  • pgmA
  • pgmB
  • pir121
  • pirA
  • pkbA
  • pld1
  • pldA
  • pldB
  • pldC
  • poxA
  • prdx4
  • prlA
  • psaA
  • psaB
  • psenA
  • psenB
  • psmA2
  • psmA5
  • psmB7
  • psmC2
  • psmC3
  • psmD1
  • psmD11
  • psmD12
  • psmD13
  • psmD14
  • psmD2
  • psmD3
  • psmD6
  • psmD7
  • ptp1
  • ptp2
  • ptp3
  • ptpA1-1
  • ptpA1-2
  • ptpB
  • ptpC
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  • pykA
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  • rab18
  • rab24
  • rab32D
  • rab4
  • rab5A
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  • rab7
  • rab7A
  • rab7B
  • rab8A
  • rab8B
  • rabD
  • rabK1
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  • rabM
  • rabN1
  • rabN2
  • rabR
  • rabT1
  • rabT2
  • rabV
  • rabX
  • rabZ
  • rac1A
  • rac1B
  • rac1C
  • racB
  • racC
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Last updated: August 19, 2024