GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 76 - 100 of 128 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
Orc1 removal from chromatin
  • DDB_G0272951
  • M4
  • cul2
  • culB
  • dapA
  • dpr1
  • fp21A
  • fp21B
  • fpa1
  • fpa1A
  • fpa1B
  • fpa2
  • fpaA
  • fpaB-1
  • fpaB-2
  • orc1
  • orcA
  • prdD
  • prdE
  • prtC
  • prtD
  • psmA1
  • psmA2
  • psmA3
  • psmA4
  • psmA5
  • psmA6
  • psmA7
  • psmB2
  • psmB3
  • psmB4-1
  • psmB4-2
  • psmB5
  • psmB6
  • psmB7
  • psmC1
  • psmC2
  • psmC3
  • psmC4
  • psmC6
  • psmD1
  • psmD10
  • psmD11
  • psmD12
  • psmD13
  • psmD14
  • psmD2
  • psmD3
  • psmD4
  • psmD6
  • psmD7
  • psmD8-1
  • psmD8-2
  • psmD9
  • psmE3
  • psmE4
  • psmF1
  • rbx1
  • skp1A
  • skp1B
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  • tbp2
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  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • veg116
Dictyostelium discoideum
ABC-family proteins mediated transport
  • DDB_G0272951
  • M4
  • abcA2
  • abcA3
  • abcA4
  • abcA5
  • abcA6
  • abcB2
  • abcB3
  • abcB6
  • abcB7
  • abcC1
  • abcC10
  • abcC12
  • abcC13
  • abcC14
  • abcC15
  • abcC2
  • abcC3
  • abcC5
  • abcC6
  • abcC7
  • abcC8
  • abcC9
  • abcF4
  • dapA
  • dpr1
  • eif2G
  • eif2a
  • eif2b
  • eif2s1
  • eif2s2
  • eif2s3
  • prdD
  • prdE
  • prtC
  • prtD
  • psmA1
  • psmA2
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  • psmA4
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  • psmA7
  • psmB2
  • psmB3
  • psmB4-1
  • psmB4-2
  • psmB5
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  • psmC3
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  • psmD11
  • psmD12
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  • psmD2
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  • psmD4
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  • psmD7
  • psmD8-1
  • psmD8-2
  • psmD9
  • psmE3
  • psmE4
  • psmF1
  • sks1
  • tagA
  • tagB
  • tagC
  • tagD
  • tbp2
  • tbpB
  • ubqB
  • ubqC
  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • veg116
Dictyostelium discoideum
Glycosphingolipid catabolism
  • DDB_G0272682
  • DDB_G0285897
  • DDB_G0288017
  • DDB_G0291524
  • DDB_G0292446
  • dcd
  • dcd2A
  • glb1
  • hexa1
  • hexa2
  • hexb1
  • hexb2
  • melA
  • nagA
  • nagE
  • rsc25
  • sapA
  • sgmA
  • sgmB
Dictyostelium discoideum
Sphingolipid catabolism
  • DDB_G0271516
  • DDB_G0275547
  • DDB_G0284367
  • comG
  • dcd3A
  • sglA
  • sppA
Dictyostelium discoideum
Role of phospholipids in phagocytosis
  • DDB_G0271516
  • DDB_G0275547
  • DDB_G0284155
  • DDB_G0284367
  • DDB_G0288795
  • akt
  • dagA
  • pkbA
  • pld1
  • pld3
  • pldA
  • pldB
  • pldC
  • pldY
  • pldZ
Dictyostelium discoideum
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade
  • DDB_G0271242
  • DDB_G0288095
  • DDB_G0288097
Dictyostelium discoideum
Regulation of TLR by endogenous ligand
  • DDB_G0271242
  • DDB_G0288095
  • DDB_G0288097
  • nhp6
Dictyostelium discoideum
Antimicrobial peptides
  • DDB_G0271242
  • DDB_G0278563
Dictyostelium discoideum
G alpha (i) signalling events
  • DDB_G0270858
  • DDB_G0273033
  • DDB_G0278897
  • DDB_G0282583
  • DDB_G0286173
  • DDB_G0286817
  • GluPR
  • gpa9
  • gpaI
  • gpbA
  • grlE
  • grlP
  • grlQ
Dictyostelium discoideum
G alpha (q) signalling events
  • DDB_G0270858
  • DDB_G0273033
  • DDB_G0278897
  • DDB_G0282583
  • DDB_G0286173
  • DDB_G0286817
  • Ga3
  • gbqA
  • gpa10
  • gpa11
  • gpa12
  • gpaA
  • gpaB
  • gpaC
  • gpaD
  • gpaE
  • gpaF
  • gpaG
  • gpaH
  • gpaJ
  • gpaK
  • gpaL
  • pipA
  • plc
Dictyostelium discoideum
Hyaluronan biosynthesis and export
  • DDB_G0270636
  • DDB_G0287365
Dictyostelium discoideum
LDL clearance
  • DDB_G0270454
  • DDB_G0276657
  • DDB_G0278295
  • DDB_G0281675
  • DDB_G0282107
  • DDB_G0282109
  • DDB_G0282177
  • DDB_G0282179
  • DDB_G0283413
  • DDB_G0283819
  • DDB_G0285639
  • DDB_G0287185
  • DDB_G0291344
  • ap1b1
  • ap2a1-1
  • ap2a1-2
  • ap2s1
  • apm1
  • apm2
  • apmA
  • chcA
  • clc
  • clcA
  • ctnC
Dictyostelium discoideum
Linoleic acid (LA) metabolism
  • DDB_G0270312
  • DDB_G0271066
  • DDB_G0272012
  • DDB_G0274669
  • DDB_G0277569
  • DDB_G0288001
  • abcD3
  • eloA
  • fcsA
  • fcsB
  • sre1
Dictyostelium discoideum
alpha-linolenic acid (ALA) metabolism
  • DDB_G0270312
  • DDB_G0271066
  • DDB_G0272012
  • DDB_G0274339
  • DDB_G0274669
  • DDB_G0277569
  • DDB_G0288001
  • abcD3
  • acox1
  • eloA
  • fcsA
  • fcsB
  • mfe2
  • mfeB
  • sre1
Dictyostelium discoideum
Lewis blood group biosynthesis
  • DDB_G0270208
  • fut1
  • fut10
  • fut11
  • fut2
  • fut3
  • fut4
  • fut5
  • fut6
  • fut7
  • fut9
Dictyostelium discoideum
Synthesis of very long-chain fatty acyl-CoAs
  • DDB_G0270106
  • DDB_G0270312
  • DDB_G0271066
  • DDB_G0272012
  • DDB_G0274669
  • DDB_G0275049
  • DDB_G0277569
  • DDB_G0278113
  • DDB_G0278683
  • DDB_G0288001
  • DDB_G0289539
  • eloA
  • fcsA
  • fcsB
  • gpsn2
  • sre1
Dictyostelium discoideum
KEAP1-NFE2L2 pathway
  • DDB_G0270098
  • DDB_G0271372
  • DDB_G0272951
  • DDB_G0279427
  • DDB_G0290491
  • M4
  • apg8
  • atg8
  • cdcD
  • cul3
  • culC
  • dapA
  • dpr1
  • npl4
  • nploc4
  • prdD
  • prdE
  • prtC
  • prtD
  • psmA1
  • psmA2
  • psmA3
  • psmA4
  • psmA5
  • psmA6
  • psmA7
  • psmB2
  • psmB3
  • psmB4-1
  • psmB4-2
  • psmB5
  • psmB6
  • psmB7
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  • psmC2
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  • psmC4
  • psmC6
  • psmD1
  • psmD10
  • psmD11
  • psmD12
  • psmD13
  • psmD14
  • psmD2
  • psmD3
  • psmD4
  • psmD6
  • psmD7
  • psmD8-1
  • psmD8-2
  • psmD9
  • psmE3
  • psmE4
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  • rbx1
  • sks1
  • tbp2
  • tbpB
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  • ubqC
  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • ubxd7
  • ufd1
  • veg116
Dictyostelium discoideum
Interleukin-4 and Interleukin-13 signaling
  • DDB_G0270046
  • DDB_G0279767
  • DDB_G0290073
  • dstA
  • dstB
  • dstC
  • dstD
  • grp94
  • stat5
  • statA
  • statB
  • statC
Dictyostelium discoideum
Cholesterol biosynthesis
  • DDB_G0269788
  • DDB_G0271544
  • DDB_G0281069
  • DDB_G0281487
  • Dipi
  • arv1
  • cas1
  • cyp51
  • erg24
  • fdfT
  • fps
  • ggps1
  • hgsB
  • hmgA
  • idi
  • ipi
  • mvd
  • mvk
  • sqle
Dictyostelium discoideum
Synthesis of bile acids and bile salts
  • DDB_G0269788
  • DDB_G0270946
  • DDB_G0279611
  • osbD
  • osbF
  • osbH
  • osbK
Dictyostelium discoideum
Neddylation
  • DDB_G0269686
  • DDB_G0270220
  • DDB_G0271372
  • DDB_G0272016
  • DDB_G0272218
  • DDB_G0272666
  • DDB_G0272951
  • DDB_G0277011
  • DDB_G0277249
  • DDB_G0278671
  • DDB_G0279093
  • DDB_G0280581
  • DDB_G0280895
  • DDB_G0284157
  • DDB_G0284369
  • DDB_G0285813
  • DDB_G0286387
  • DDB_G0286565
  • DDB_G0288453
  • DDB_G0288597
  • DDB_G0289099
  • DDB_G0290025
  • DDB_G0291902
  • DDB_G0292144
  • DDB_G0292302
  • M4
  • appbp1
  • cand1
  • cdcD
  • cnrM
  • commd1
  • commd10
  • commd2
  • commd3
  • commd4
  • commd5
  • commd6
  • commd7
  • commd8
  • csn1
  • csn2
  • csn3
  • csn4
  • csn5
  • csn6
  • csn7
  • csn8
  • cul1
  • cul2
  • cul3
  • cul4
  • cul5
  • culA
  • culB
  • culC
  • culD
  • culE
  • dapA
  • ddb1
  • dpr1
  • ercc8
  • fp21A
  • fp21B
  • fpa1
  • fpa1A
  • fpa1B
  • fpa2
  • fpaA
  • fpaB-1
  • fpaB-2
  • hbx1
  • mtpn
  • nae1
  • nedd8
  • npl4
  • nploc4
  • prdD
  • prdE
  • prtC
  • prtD
  • psmA1
  • psmA2
  • psmA3
  • psmA4
  • psmA5
  • psmA6
  • psmA7
  • psmB2
  • psmB3
  • psmB4-1
  • psmB4-2
  • psmB5
  • psmB6
  • psmB7
  • psmC1
  • psmC2
  • psmC3
  • psmC4
  • psmC6
  • psmD1
  • psmD10
  • psmD11
  • psmD12
  • psmD13
  • psmD14
  • psmD2
  • psmD3
  • psmD4
  • psmD6
  • psmD7
  • psmD8-1
  • psmD8-2
  • psmD9
  • psmE3
  • psmE4
  • psmF1
  • rbbD
  • rbbE
  • rbx1
  • repE
  • skp1A
  • skp1B
  • sks1
  • tbp2
  • tbpB
  • tceb1
  • triA
  • uba3
  • ube1c
  • ube2m
  • ubqB
  • ubqC
  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • ubxd7
  • uch1
  • uchl
  • ufd1
  • veg116
  • warA
  • wdr23
  • wdr5
  • wdr68
  • wdsof1
  • wri
Dictyostelium discoideum
Amino acids regulate mTORC1
  • DDB_G0269680
  • DDB_G0271288
  • DDB_G0272696
  • DDB_G0274141
  • DDB_G0274833
  • DDB_G0277257
  • DDB_G0278475
  • DDB_G0279099
  • DDB_G0279427
  • DDB_G0280947
  • DDB_G0281111
  • DDB_G0283567
  • DDB_G0284957
  • DDB_G0289243
  • DDB_G0291948
  • DDB_G0292056
  • DDB_G0292160
  • atp6v1d
  • atp6v1g
  • dvacB
  • lst8
  • mapbpip
  • mios
  • ragA
  • ragC
  • raptor
  • rheb
  • sec13
  • tor
  • vatA
  • vatB
  • vatC
  • vatD-1
  • vatD-2
  • vatE
  • vatF
  • vatH
  • vatM
  • vatP
  • vatg
  • wdr24
Dictyostelium discoideum
GDP-fucose biosynthesis
  • DDB_G0269678
  • fpgt
  • fuct1
  • ger
  • gmd
  • slc35c1
Dictyostelium discoideum
Synthesis of PA
  • DDB_G0269584
  • DDB_G0269848
  • DDB_G0270566
  • DDB_G0274969
  • DDB_G0276935
  • DDB_G0281695
  • DDB_G0283951
  • DDB_G0284155
  • DDB_G0284753
  • DDB_G0284755
  • DDB_G0288523
  • DDB_G0291332
  • DDB_G0291694
  • cf60
  • pld1
  • pldA
  • pldB
  • pldC
Dictyostelium discoideum
Fatty acyl-CoA biosynthesis
  • DDB_G0269356
  • DDB_G0273105
  • DDB_G0281965
  • DDB_G0288801
  • accA
  • acly
  • pks1
  • pks16
  • pks17
  • ppt1
  • ppt2
  • stlA
Dictyostelium discoideum

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


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Last updated: August 19, 2024