GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 101 - 125 of 128 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
Macroautophagy
  • DDB_G0269162
  • DDB_G0269272
  • DDB_G0269448
  • DDB_G0271610
  • DDB_G0274833
  • DDB_G0278311
  • DDB_G0281845
  • DDB_G0283567
  • DDB_G0283753
  • DDB_G0284481
  • DDB_G0288175
  • DDB_G0288287
  • DDB_G0288731
  • DDB_G0289807
  • DDB_G0290005
  • DDB_G0290491
  • DDB_G0291948
  • DDB_G0292160
  • DDB_G0293258
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  • apg12
  • apg3
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  • apg4-2
  • apg5
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  • apg7
  • apg8
  • apg9
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  • atg12
  • atg18
  • atg3
  • atg4-1
  • atg4-2
  • atg5
  • atg6B
  • atg7
  • atg8
  • atg9
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  • chmp3
  • chmp4
  • chmp6
  • chmp7
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  • pik5
  • pikE
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  • prkab
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  • snf7
  • snfA
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  • tor
  • vps15
  • vps20
  • vps24
  • vps2B
  • vps32
  • wdr45l
  • wipi2
Dictyostelium discoideum
Progressive trimming of alpha-1,2-linked mannose residues from Man9/8/7GlcNAc2 to produce Man5GlcNAc2
  • DDB_G0268754
  • DDB_G0284391
  • DDB_G0284393
  • DDB_G0284395
  • DDB_G0292918
Dictyostelium discoideum
Synthesis of bile acids and bile salts via 7alpha-hydroxycholesterol
  • DDB_G0268562
  • abcB2
  • abcB3
  • abcB6
  • abcB7
  • acox1
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  • alrB
  • alrC
  • mfe2
  • mfeB
  • tagA
  • tagB
  • tagC
  • tagD
Dictyostelium discoideum
N-glycan trimming in the ER and Calnexin/Calreticulin cycle
  • DDB_G0268520
  • ubqB
  • ubqC
  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • veg116
Dictyostelium discoideum
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation
  • DDB_G0268504
  • DDB_G0269704
  • DDB_G0270000
  • DDB_G0271372
  • DDB_G0271726
  • DDB_G0271956
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  • DDB_G0272218
  • DDB_G0272951
  • DDB_G0273381
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  • DDB_G0273573
  • DDB_G0274897
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  • DDB_G0277011
  • DDB_G0277047
  • DDB_G0277053
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  • DDB_G0278049
  • DDB_G0278075
  • DDB_G0278671
  • DDB_G0278981
  • DDB_G0279003
  • DDB_G0279093
  • DDB_G0279435
  • DDB_G0279463
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  • DDB_G0280091
  • DDB_G0280347
  • DDB_G0280581
  • DDB_G0280895
  • DDB_G0281369
  • DDB_G0281657
  • DDB_G0281679
  • DDB_G0281833
  • DDB_G0282391
  • DDB_G0282479
  • DDB_G0283667
  • DDB_G0283893
  • DDB_G0283983
  • DDB_G0284145
  • DDB_G0284325
  • DDB_G0285063
  • DDB_G0285261
  • DDB_G0285581
  • DDB_G0285797
  • DDB_G0286289
  • DDB_G0286387
  • DDB_G0286991
  • DDB_G0287221
  • DDB_G0288345
  • DDB_G0288683
  • DDB_G0289043
  • DDB_G0289099
  • DDB_G0290547
  • DDB_G0290641
  • DDB_G0291131
  • DDB_G0291612
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  • DDB_G0291984
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  • DDB_G0292362
  • DDB_G0292586
  • DDB_G0293756
  • DDB_G0295713
  • M4
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  • anapc7
  • anapc8
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  • veg116
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Dictyostelium discoideum
Cargo concentration in the ER
  • DDB_G0268452
  • DDB_G0269942
  • DDB_G0271968
  • ctsZ
  • gmsA
  • sarA
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  • sec24
  • sec24l
  • syn5
Dictyostelium discoideum
Atorvastatin ADME
  • DDB_G0268184
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  • abcC12
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  • abcC5
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  • tagB
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  • ugt2
  • ugt3
Dictyostelium discoideum
Prednisone ADME
  • DDB_G0268184
  • DDB_G0268562
  • abcB2
  • abcB3
  • abcB6
  • abcB7
  • alrA
  • alrB
  • alrC
  • tagA
  • tagB
  • tagC
  • tagD
  • ugt2
  • ugt3
Dictyostelium discoideum
Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis
  • DDB_G0268156
  • DDB_G0274261
  • DDB_G0279059
  • DDB_G0279493
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  • DDB_G0292610
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  • abcC9
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  • csn8
  • epnA
  • eps15
  • lmpC
  • mrrA
  • nedd8
  • sonA
  • sybA
  • sybB
  • ubqln
Dictyostelium discoideum
COPII-mediated vesicle transport
  • DDB_G0268044
  • DDB_G0268452
  • DDB_G0269584
  • DDB_G0269942
  • DDB_G0270566
  • DDB_G0271968
  • DDB_G0274803
  • DDB_G0275331
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  • DDB_G0283055
  • DDB_G0286167
  • DDB_G0291694
  • DDB_G0293712
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  • cak1-2
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  • syn7A
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  • tmem1-2
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  • trappc1-2
  • trappc2
  • trappc2l
  • trappc3
  • trappc4
  • trappc5
  • wimA
Dictyostelium discoideum
Peroxisomal protein import
  • DDB_G0268018
  • DDB_G0274339
  • DDB_G0275415
  • DDB_G0277335
  • DDB_G0277477
  • DDB_G0279049
  • DDB_G0280851
  • DDB_G0282495
  • DDB_G0287851
  • DDB_G0290089
  • DDB_G0290277
  • DDB_G0290547
  • acox1
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  • cat
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  • ddo-1
  • ddo-2
  • ech1
  • hacl1
  • haox
  • hmgL
  • idhM
  • mfe2
  • mfeB
  • pex10
  • pex12
  • pex13
  • pex14
  • pex5
  • pex7
  • redB
  • ubcB
  • ubqB
  • ubqC
  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • veg116
Dictyostelium discoideum
Regulation of PTEN stability and activity
  • DDB_G0267906
  • DDB_G0272951
  • DDB_G0275865
  • DDB_G0281657
  • DDB_G0283983
  • DDB_G0285063
  • DDB_G0285967
  • DDB_G0286481
  • DDB_G0288795
  • DDB_G0292920
  • M4
  • akt
  • casK
  • cnrN
  • csnk2b
  • dagA
  • dapA
  • dpr1
  • pkbA
  • prdD
  • prdE
  • prtC
  • prtD
  • psmA1
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  • psmA3
  • psmA4
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  • psmB4-1
  • psmB4-2
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  • psmB6
  • psmB7
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  • psmC3
  • psmC4
  • psmC6
  • psmD1
  • psmD10
  • psmD11
  • psmD12
  • psmD13
  • psmD14
  • psmD2
  • psmD3
  • psmD4
  • psmD6
  • psmD7
  • psmD8-1
  • psmD8-2
  • psmD9
  • psmE3
  • psmE4
  • psmF1
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  • ptenA
  • sks1
  • tbp2
  • tbpB
  • ubpA
  • ubqB
  • ubqC
  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • usp5
  • veg116
Dictyostelium discoideum
Clathrin-mediated endocytosis
  • DDB_G0267588
  • DDB_G0271676
  • DDB_G0271812
  • DDB_G0272638
  • DDB_G0274261
  • DDB_G0274695
  • DDB_G0279059
  • DDB_G0279493
  • DDB_G0280377
  • DDB_G0281155
  • DDB_G0281235
  • DDB_G0286115
  • DDB_G0286699
  • DDB_G0292190
  • DDB_G0292610
  • PIPkinA
  • abcC1
  • abcC13
  • abcC14
  • abcC15
  • abcC2
  • abcC6
  • abcC7
  • abcC9
  • ap1b1
  • ap2a1-1
  • ap2a1-2
  • ap2s1
  • apm1
  • apm2
  • apmA
  • chcA
  • clc
  • clcA
  • clmA
  • eps15
  • gacBB
  • lmpC
  • mgp1
  • mrrA
  • pik1
  • pik2
  • pik3
  • pikA
  • pikB
  • pikC
  • pikF
  • pikG
  • pikH
  • sybA
  • sybB
Dictyostelium discoideum
RAF activation
  • DDB_G0267566
  • DDB_G0267686
  • DDB_G0268876
  • DDB_G0272092
  • DDB_G0282963
  • DDB_G0290471
  • DDB_G0291516
  • DDB_G0291664
  • RacGEF
  • kxcB
  • mrkC
  • phg2
  • spkA-1
  • spkA-2
Dictyostelium discoideum
Negative regulation of MAPK pathway
  • DDB_G0267566
  • DDB_G0267686
  • DDB_G0268876
  • DDB_G0270200
  • DDB_G0271350
  • DDB_G0271860
  • DDB_G0272092
  • DDB_G0273199
  • DDB_G0282963
  • DDB_G0290471
  • DDB_G0291516
  • DDB_G0291664
  • DDB_G0292880
  • RacGEF
  • erk1
  • erkA
  • kxcB
  • mpl1
  • mpl2
  • mpl3
  • mrkC
  • phg2
  • ptp1
  • ptp2
  • ptp3
  • ptpA1-1
  • ptpA1-2
  • ptpB
  • ptpC
  • spkA-1
  • spkA-2
Dictyostelium discoideum
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • D2
  • DDB_G0276969
  • DDB_G0279717
  • DDB_G0285555
  • DDB_G0291344
  • cryS
Dictyostelium discoideum
Neurotransmitter clearance
  • D2
  • DDB_G0276969
  • DDB_G0279717
  • DDB_G0285555
  • DDB_G0291344
  • cryS
Dictyostelium discoideum
Physiological factors
  • D2
  • DDB_G0276969
  • DDB_G0279717
  • DDB_G0285555
  • DDB_G0291344
  • cryS
Dictyostelium discoideum
Synthesis of PC
  • D2
  • DDB_G0271730
  • DDB_G0276969
  • DDB_G0279717
  • DDB_G0282159
  • DDB_G0285555
  • DDB_G0288717
  • DDB_G0290229
  • DDB_G0291344
  • DG1056
  • abhd
  • captA
  • captB
  • captC
  • captD
  • cryS
  • ctl2
  • lipB
  • pemtA
  • slc44a2
Dictyostelium discoideum
Phase I - Functionalization of compounds
  • D2
  • DDB_G0270652
  • DDB_G0275953
  • DDB_G0276969
  • DDB_G0277999
  • DDB_G0279717
  • DDB_G0283819
  • DDB_G0285555
  • DDB_G0288165
  • DDB_G0291344
  • comG
  • cryS
  • cyb5B
  • cyb5C
  • cyb5r1
  • cyp508A1-1
  • cyp508A1-2
  • cyp508A2-1
  • cyp508A2-2
  • cyp508A3-1
  • cyp508A3-2
  • cyp508A4
  • cyp508B1
  • cyp508C1
  • cyp508D1
  • cyp515A1
  • cyp515B1
  • cyp516A1
  • cyp516B1
  • cyp517A1
  • cyp517A2
  • cyp517A4
  • cyp518A1
  • cyp518B1
  • cyp519B1
  • cyp519D1
  • cyp519E1
  • cyp521A1
  • cyp522A1
  • cyp554A1
  • cyp555A1
  • ostA
  • ostB
Dictyostelium discoideum
Aspirin ADME
  • D2
  • DDB_G0268184
  • DDB_G0276969
  • DDB_G0279717
  • DDB_G0285555
  • DDB_G0291344
  • abcC10
  • abcC12
  • abcC3
  • abcC5
  • abcC8
  • cryS
  • cyp508A1-1
  • cyp508A1-2
  • cyp508A2-1
  • cyp508A2-2
  • cyp508A3-1
  • cyp508A3-2
  • cyp508A4
  • cyp508B1
  • cyp508C1
  • cyp508D1
  • cyp515A1
  • cyp515B1
  • cyp516A1
  • cyp516B1
  • cyp517A1
  • cyp517A2
  • cyp517A4
  • cyp518A1
  • cyp518B1
  • cyp519B1
  • cyp519D1
  • cyp519E1
  • cyp521A1
  • cyp522A1
  • cyp554A1
  • cyp555A1
  • ostA
  • ostB
  • ugt2
  • ugt3
Dictyostelium discoideum
Degradation of the extracellular matrix
  • CP2
  • CP3
  • CP4
  • CP5
  • CP6
  • CP7
  • DDB_G0272742
  • DDB_G0278401
  • DDB_G0282991
  • cfaD
  • cprB
  • cprC
  • cprD
  • cprE
  • cprF
  • cprG
Dictyostelium discoideum
Platelet degranulation
  • CP1
  • DDB_G0267974
  • DDB_G0268156
  • DDB_G0268758
  • DDB_G0269600
  • DDB_G0272218
  • DDB_G0274385
  • DDB_G0275765
  • DDB_G0276317
  • DDB_G0280565
  • DDB_G0281889
  • DDB_G0282287
  • DDB_G0282859
  • DDB_G0282977
  • DDB_G0283859
  • DDB_G0284679
  • DDB_G0286055
  • DDB_G0287201
  • DDB_G0288133
  • DDB_G0291191
  • abcC1
  • abcC13
  • abcC14
  • abcC15
  • abcC2
  • abcC6
  • abcC7
  • abcC9
  • abpA
  • abpC
  • abpD
  • act26
  • actnA
  • actnB
  • aip1
  • ann7
  • calA
  • calB
  • camA
  • chid1
  • cprA
  • cyb5r1
  • cyri
  • fam49
  • fba
  • fip-1
  • fip-2
  • gtpbp1
  • lmpA
  • lmpB
  • lmpC
  • mlcD
  • nxnA
  • nxnB
  • rab32D
  • sadA
  • sapA
  • scfd2
  • sec1
  • sec1A
  • sodE
  • talB
  • triA
  • tubA
  • vti1
  • vti1A
  • vti1B
  • wdpA
Dictyostelium discoideum
MHC class II antigen presentation
  • CP1
  • CP2
  • CP3
  • CP4
  • CP5
  • CP6
  • CP7
  • CatD
  • DDB_G0272742
  • DDB_G0274385
  • DDB_G0278401
  • DDB_G0282991
  • DDB_G0286055
  • DDB_G0291191
  • cfaD
  • cprA
  • cprB
  • cprC
  • cprD
  • cprE
  • cprF
  • cprG
  • ctsB
  • ctsD
  • gmsA
Dictyostelium discoideum
FBXL7 down-regulates AURKA during mitotic entry and in early mitosis
  • AurB
  • Aurora
  • DDB_G0272951
  • M4
  • aurK
  • cul2
  • culB
  • dapA
  • dpr1
  • fp21A
  • fp21B
  • fpa1
  • fpa1A
  • fpa1B
  • fpa2
  • fpaA
  • fpaB-1
  • fpaB-2
  • prdD
  • prdE
  • prtC
  • prtD
  • psmA1
  • psmA2
  • psmA3
  • psmA4
  • psmA5
  • psmA6
  • psmA7
  • psmB2
  • psmB3
  • psmB4-1
  • psmB4-2
  • psmB5
  • psmB6
  • psmB7
  • psmC1
  • psmC2
  • psmC3
  • psmC4
  • psmC6
  • psmD1
  • psmD10
  • psmD11
  • psmD12
  • psmD13
  • psmD14
  • psmD2
  • psmD3
  • psmD4
  • psmD6
  • psmD7
  • psmD8-1
  • psmD8-2
  • psmD9
  • psmE3
  • psmE4
  • psmF1
  • rbx1
  • skp1A
  • skp1B
  • sks1
  • tbp2
  • tbpB
  • ubqB
  • ubqC
  • ubqF
  • ubqG
  • ubqH
  • ubqI
  • ubqJ
  • ubqO
  • veg116
Dictyostelium discoideum

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Last updated: August 19, 2024