GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 526 - 550 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Uptake of dietary cobalamins into enterocytes
  • Amn
  • Cblif
  • Cubn
  • Gif
  • Ifcr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Signaling by MST1
  • Hpn
  • Mst1
  • Mst1r
  • Spint1
  • Spint2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Conversion from APC/C:Cdc20 to APC/C:Cdh1 in late anaphase
  • Anapc1
  • Anapc15
  • Anapc16
  • Anapc2
  • Anapc4
  • Anapc5
  • Anapc7
  • Cdc14a
  • Cdc16
  • Cdc20
  • Cdc23
  • Cdc26
  • Cdc27
  • Fzr1
  • LOC100366017
  • Ube2c
  • Ube2d1
  • Ube2e1
  • Ube2s
Rattus norvegicus (Norway rat)
ABO blood group biosynthesis
  • Abo2
  • Fta
  • Ftb
  • Fut1
  • Fut2
  • Sec1
Rattus norvegicus (Norway rat)
RUNX3 regulates NOTCH signaling
  • Cbp
  • Crebbp
  • Ep300
  • Kat2a
  • Kat2b
  • Maml1
  • Maml2
  • Maml3
  • Rbpj
  • Runx3
  • Snw1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Translation initiation complex formation
  • AABR07029195.1
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S12
  • EIF3S5
  • EIF3S6IP
  • Eif1a
  • Eif2a
  • Eif2g
  • Eif2s1
  • Eif2s2
  • Eif2s3
  • Eif2s3x
  • Eif3a
  • Eif3b
  • Eif3c
  • Eif3d
  • Eif3e
  • Eif3f
  • Eif3g
  • Eif3h
  • Eif3i
  • Eif3j
  • Eif3k
  • Eif3l
  • Eif3m
  • Eif3s1
  • Eif3s10
  • Eif3s2
  • Eif3s3
  • Eif3s4
  • Eif3s6
  • Eif3s7
  • Eif3s8
  • Eif3s9
  • Eif4a1
  • Eif4a2
  • Eif4e
  • Eif4g1
  • Eif4h
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • Int6
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • Lamr1
  • Pabp1
  • Pabpc1
  • Rig
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
  • Rps13
  • Rps14
  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
  • Rps17
  • Rps18
  • Rps19
  • Rps2
  • Rps20
  • Rps21
  • Rps23
  • Rps24
  • Rps25
  • Rps26
  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
  • Rps26l6
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
  • Rps29
  • Rps3
  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Uba80
  • Ubcep1
  • Wbscr1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Multifunctional anion exchangers
  • Dra
  • Dtdst
  • Pds
  • Sat1
  • Slc26a1
  • Slc26a11
  • Slc26a2
  • Slc26a3
  • Slc26a4
  • Slc26a6
  • Slc26a7
  • Slc26a9
  • Slc5a12
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interleukin-1 processing
  • Casp1
  • Ctsg
  • Gsdmd
  • Igif
  • Il18
  • Il1a
  • Il1b
  • Il1bc
  • Il1bce
  • Nfkb2
  • Rela
Rattus norvegicus (Norway rat)
Metalloprotease DUBs
  • ABRAXAS1
  • Abra1
  • Abraxas2
  • Amsh
  • Babam1
  • Babam2
  • Bard1
  • Brca1
  • Brcc3
  • Brcc36
  • Bre
  • Ccdc98
  • ENSRNOG00000062927
  • Ep300
  • Fam175a
  • Fam175b
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac25
  • H2ac4
  • H2aj
  • Hist2h2aa3
  • Hist3h2a
  • Kat2b
  • LOC100360645
  • LOC120097726
  • Merit40
  • Mysm1
  • Nba1
  • Nlrp3
  • Psmd14
  • Rap80
  • Rps27a
  • Stam
  • Stambp
  • Stambpl1
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Uimc1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of 5-eicosatetraenoic acids
  • Alox5
  • Alox5ap
  • Flap
  • Ltc4s
  • Pon
  • Pon1
  • Pon2
  • Pon3
Rattus norvegicus (Norway rat)
ISG15 antiviral mechanism
  • Arih1
  • Becn1
  • Ddx48
  • Eif2ak2
  • Eif4a1
  • Eif4a2
  • Eif4a3
  • Eif4e
  • Eif4g1
  • Eif4g2
  • Eif4g3
  • Erk1
  • Flnb
  • Ifit1bl
  • Irf3
  • Isg15
  • Jak1
  • LOC100366017
  • Mapk3
  • Mx2
  • Nedd4
  • Nedd4a
  • Plcg1
  • Pp2c2
  • Ppm1b
  • Pppm1b
  • Prkm3
  • Prkr
  • Rig1
  • Rpf1
  • Stat1
  • Stat4
  • Trim25
  • Uba7
  • Ube2e1
  • Ube2l6
  • Usp18
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of PA
  • Acp6
  • Agpat1
  • Agpat2
  • Agpat3
  • Agpat4
  • Agpat5
  • Agpat6
  • Agpat9
  • Alpi
  • Aytl2
  • Cpla2
  • Ddhd1
  • Ddhd2
  • Gnpat
  • Gpam
  • Gpat1
  • Gpat2
  • Gpat3
  • Gpat4
  • Gpd1
  • Gpd1l
  • Gpd1l1
  • Gpd2
  • Lclat1
  • Liph
  • Lipi
  • Lpcat1
  • Lpcat4
  • Miga1
  • Miga2
  • Pla2g10
  • Pla2g12a
  • Pla2g1b
  • Pla2g2a
  • Pla2g2d
  • Pla2g2f
  • Pla2g4
  • Pla2g4a
  • Pla2g4b
  • Pla2g4d
  • Pla2g5
  • Pla2r1
  • Pld1
  • Pld2
  • Pld6
  • ddhd2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Tandem of pore domain in a weak inwardly rectifying K+ channels (TWIK)
  • Kcnk1
  • Kcnk6
  • Kcnk7
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of PLK1 Activity at G2/M Transition
  • AABR07000222.1
  • Actr1a
  • Aik
  • Airk1
  • Ajuba
  • Akap9
  • Alms1
  • Ark1
  • Aura
  • Aurka
  • Ayk1
  • Azi1
  • Bora
  • Btak
  • Btrc
  • Ccdc5
  • Ccnb1
  • Ccnb2
  • Ccnb2-ps2
  • Ccp110
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdk5rap2
  • Cdkn1
  • Cenpj
  • Cep131
  • Cep135
  • Cep152
  • Cep164
  • Cep192
  • Cep250
  • Cep290
  • Cep41
  • Cep43
  • Cep57
  • Cep63
  • Cep70
  • Cep72
  • Cep76
  • Cep78
  • Cetn2
  • Ck1e-2
  • Ckap5
  • Clasp1
  • Csnk1d
  • Csnk1e
  • Ctrn1
  • Cul1
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dhc1
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci2
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dnec1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i2
  • Dynll1
  • Fbxw11
  • Fgfr1op
  • Haus1
  • Haus4
  • Haus5
  • Haus6
  • Haus7
  • Haus8
  • Hckid
  • Hice1
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • Iak1
  • Jub
  • LOC100360645
  • LOC309692
  • Lis-1
  • Lis1
  • Map1c
  • Mapre1
  • Mbs
  • Mypt1
  • Nde1
  • Nedd1
  • Nek2l1
  • Ninl
  • Nude
  • Nude1
  • Ny-sar-48
  • Odf2
  • Odf84
  • Ofd1
  • Optn
  • Pafah1b1
  • Pafaha
  • Pcm1
  • Pcnt
  • Pin
  • Plk
  • Plk1
  • Plk4
  • Ppp1cb
  • Ppp1r12a
  • Ppp1r12b
  • Ppp2r1a
  • Prkaca
  • Prkar2b
  • Rab8
  • Rab8a
  • Rps27a
  • Sak
  • Sdccag8
  • Sfi1
  • Skp1
  • Skp1a
  • Ssna1
  • Stk15
  • Stk6
  • Tsga14
  • Tuba1
  • Tuba1a
  • Tuba4
  • Tuba4a
  • Tubb2c
  • Tubb4b
  • Tubb5
  • Tubg
  • Tubg1
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ywhae
  • Ywhag
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of PIPs at the plasma membrane
  • Arf1
  • Bmx
  • Fapp2
  • Inpp4a
  • Inpp4b
  • Inpp5d
  • Inpp5j
  • Inpp5k
  • Inppl1
  • Mtm1
  • Mtmr1
  • Mtmr14
  • Mtmr3
  • Mtmr6
  • Ocrl
  • Pepp1
  • Pi4k2a
  • Pi4k2b
  • Pi4kii
  • Pib5pa
  • Pik3c2a
  • Pik3c2b
  • Pik3c2g
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3cd
  • Pik3cg
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Pik3r5
  • Pik3r6
  • Pip4k2a
  • Pip4k2b
  • Pip4k2c
  • Pip4ka
  • Pip5k1a
  • Pip5k1b
  • Pip5k1c
  • Pip5k2a
  • Pip5k2b
  • Pip5k2c
  • Pipp
  • Plekha1
  • Plekha2
  • Plekha3
  • Plekha4
  • Plekha5
  • Plekha6
  • Plekha8
  • Pten
  • Ptpn13
  • Rab14
  • Rab4
  • Rab4a
  • Rab5a
  • Rufy1
  • Ship
  • Ship1
  • Ship2
  • Synj1
  • Synj2
Rattus norvegicus (Norway rat)
DAP12 interactions
  • 1700031A10Rik
  • 2781a1
  • 2788a1a2
  • 2795a1
  • 2800a1a2
  • 2812a1a2
  • 2824a1
  • 2829a1a2
  • 2846a1a2
  • 2860a1
  • 2865a2
  • 2869a1a2
  • 2879a1
  • 2886a1-a1a2
  • 2901a1a2
  • 2906a1
  • 2920a1a2
  • 2927a1
  • 2941a1a2
  • 2945a1a2
  • 2950a1
  • 2953a1a2
  • 2959a1
  • 2976a1
  • 2981a1a2
  • 2984a1a2
  • 2994a1
  • 3082ex4-5
  • 3252a3
  • 3258a2
  • 3281a3
  • 3298a3
  • AABR07044308.2
  • AABR07044362.1
  • AABR07072807.1
  • AC120486.1
  • B2m
  • Cd300e
  • Cd300lb
  • Cd94
  • Clec5a
  • Dap12
  • ENSRNOG00000064836
  • ENSRNOG00000069480
  • H2-M10.6
  • H2-M10.6l
  • Kir3dl1
  • Klrc1
  • Klrd1
  • LOC102546590
  • LOC120093125
  • Nerg-ps11
  • Nerg-ps12
  • Nerg-ps13
  • Nerg-ps14
  • Nerg-ps15
  • Pbp-ps
  • Ppid-ps
  • Ppp1cb-ps
  • RT1-A1
  • RT1-A2
  • RT1-CE1
  • RT1-CE11
  • RT1-CE14
  • RT1-CE16
  • RT1-CE2
  • RT1-M1-1
  • RT1-M1-2
  • RT1-M1-3
  • RT1-M1-4
  • RT1-M1-5
  • RT1-M10-1
  • RT1-M10-2
  • RT1-M10-3
  • RT1-M10-4
  • RT1-M2
  • RT1-M3-1
  • RT1-M5
  • RT1-M7
  • RT1-M8
  • RT1-N3
  • RT1-O1l1
  • RT1-P2
  • RT1-S3
  • Rcrg1-ps25
  • Rcrg1-ps26
  • Rcrg1-ps27
  • Rcrg1-ps28
  • Rcrg1-ps29
  • Rcrg1-ps30
  • Rcrg1-ps31
  • Rcrg1-ps32
  • Rcrg1-ps33
  • Rcrg1-ps34
  • Rcrg1-ps35
  • Rcrg1-ps36
  • Rcrg1-ps37
  • Rcrg1-ps38
  • Rcrg1-ps39
  • Rcrg1-ps40
  • Rpl39-ps
  • Siglec10
  • Siglec15
  • Sirpal1
  • Sirpd
  • Trem1
  • Trem2
  • Trim15
  • Trim31
  • Trim39-ps
  • Tyrobp
Rattus norvegicus (Norway rat)
ERKs are inactivated
  • Bmk1
  • Dusp3
  • Dusp4
  • Dusp6
  • Dusp7
  • Erk1
  • Erk2
  • Erk5
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Mapk7
  • Mkp2
  • Mkp3
  • Mkpx
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5d
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Vrk3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Signal attenuation
  • Ash
  • Erk1
  • Erk2
  • Grb10
  • Grb2
  • Ins-1
  • Ins1
  • Insr
  • Irs-1
  • Irs1
  • Irs2
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Shc1
  • Sos1
Rattus norvegicus (Norway rat)
cGMP effects
  • AABR07006724.1
  • Insp3r
  • Irag1
  • Itpr1
  • Mrvi1
  • Pde10a
  • Pde11a
  • Pde1a
  • Pde1b
  • Pde1b1
  • Pde2a
  • Pde5
  • Pde5a
  • Pde9a
  • Prkg1
  • Prkg2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Tight junction interactions
  • F11r
  • Jam1
  • Par-6a
  • Par3
  • Par6a
  • Pard3
  • Pard6a
  • Pard6b
  • Pard6g
  • Pkcl
  • Prkci
Rattus norvegicus (Norway rat)
CS/DS degradation
  • Arsb
  • Bcan
  • Behab
  • Bgn
  • Caleb
  • Cspg2
  • Cspg3
  • Cspg4
  • Cspg5
  • Dcn
  • Hexa
  • Hexb
  • Hyal1
  • Hyal3
  • Ids
  • Idua
  • LOC100363795
  • Ncan
  • Ng2
  • Ngc
  • Vcan
Rattus norvegicus (Norway rat)
Signaling by Type 1 Insulin-like Growth Factor 1 Receptor (IGF1R)
  • Cilp
  • Igf-1
  • Igf-2
  • Igf1
  • Igf1r
  • Igf2
Rattus norvegicus (Norway rat)
SHC-mediated cascade:FGFR3
  • Ash
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf23
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf7a
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr3
  • Grb2
  • Hras
  • Hras1
  • Kras
  • Kras2
  • Nras
  • Shc1
  • Sos1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Tandem pore domain halothane-inhibited K+ channel (THIK)
  • Kcnk13
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glucuronidation
  • Abhd10
  • RGD1559459
  • Udpgtr2
  • Ugt1
  • Ugt1a1
  • Ugt1a2
  • Ugt1a3
  • Ugt1a5
  • Ugt1a6
  • Ugt1a7
  • Ugt1a7c
  • Ugt1a8
  • Ugt2a-1
  • Ugt2a1
  • Ugt2b
  • Ugt2b1
  • Ugt2b12
  • Ugt2b15
  • Ugt2b17
  • Ugt2b2
  • Ugt2b3
  • Ugt2b34l1
  • Ugt2b36
  • Ugt2b37
  • Ugt2b4
  • Ugt2b5
  • Ugt2b6
  • Ugt2b7
  • Ugt2b8
  • Ugt3a1
  • Ugt3a2
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024