GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 101 - 125 of 250 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
LDL clearance
  • AMP1
  • APL1
  • APL2
  • APL3
  • APM4
  • APS2
  • CHC1
  • CLC1
  • NCR1
  • NPC2
  • OSW3
  • PRB1
  • RRT12
  • YAP17
  • YAP80
  • YSP3
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Lactose synthesis
  • VPS73
  • YBR241C
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Linoleic acid (LA) metabolism
  • APA1
  • ELO1
  • ELO2
  • ELO3
  • FEN1
  • GNS1
  • PAL1
  • PAT2
  • PXA1
  • SRE1
  • SSH2
  • SUR4
  • VBM1
  • VBM2
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Lysine catabolism
  • ARO8
  • ARO9
  • LYS13
  • LYS9
  • YGL159W
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • AMS1
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
MAP2K and MAPK activation
  • DAC2
  • FUS3
  • HOG4
  • KSS1
  • MKK1
  • MKK2
  • MPK1
  • PBS2
  • SFS4
  • SLT2
  • SMK1
  • SSK4
  • SSP32
  • SSP33
  • STE7
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
MAPK1 (ERK2) activation
  • DAC2
  • FUS3
  • HOG4
  • KSS1
  • MKK1
  • MKK2
  • MPK1
  • PBS2
  • SFS4
  • SLT2
  • SMK1
  • SSK4
  • SSP32
  • SSP33
  • STE7
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
MAPK6/MAPK4 signaling
  • BLM10
  • BLM3
  • CDC14
  • CDC42
  • CIM3
  • CIM5
  • CLA4
  • CRL13
  • CRL3
  • CRM1
  • DAC2
  • DOA3
  • DOA5
  • FUS3
  • HRD2
  • KAP124
  • KSS1
  • MPK1
  • MPR1
  • NAS1
  • NAS2
  • NAS4
  • NAS5
  • NAS7
  • NIN1
  • OAF3
  • PCS1
  • PRC1
  • PRC2
  • PRE1
  • PRE10
  • PRE2
  • PRE3
  • PRE4
  • PRE5
  • PRE6
  • PRE8
  • PRE9
  • PRG1
  • PRS1
  • PRS2
  • PRS4
  • PRS5
  • PUP1
  • PUP2
  • PUP3
  • RPD1
  • RPN1
  • RPN11
  • RPN12
  • RPN2
  • RPN3
  • RPN5
  • RPN6
  • RPN7
  • RPN8
  • RPN9
  • RPT1
  • RPT2
  • RPT3
  • RPT4
  • RPT5
  • RPT6
  • SCD2
  • SCL1
  • SEN3
  • SKM1
  • SLT2
  • SMK1
  • SRO2
  • STE20
  • SUG1
  • SUG2
  • SUN2
  • TBPY
  • TBY1
  • UBI4
  • XPO1
  • YHS4
  • YNT1
  • YTA1
  • YTA2
  • YTA3
  • YTA5
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
MASTL Facilitates Mitotic Progression
  • IGO1
  • IGO2
  • RIM15
  • TAK1
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
MTOR signalling
  • GTR1
  • GTR2
  • RHB1
  • RSG1
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Macroautophagy
  • APG1
  • APG12
  • APG13
  • APG3
  • APG5
  • APG6
  • APG7
  • APG8
  • APG9
  • ASI10
  • ATG1
  • ATG11
  • ATG12
  • ATG13
  • ATG18
  • ATG21
  • ATG3
  • ATG5
  • ATG6
  • ATG7
  • ATG8
  • ATG9
  • AUT1
  • AUT10
  • AUT3
  • AUT7
  • AUT9
  • CAT1
  • CAT3
  • CCR1
  • CHM2
  • CHM6
  • CRP1
  • CVT10
  • CVT18
  • CVT2
  • CVT21
  • CVT5
  • CVT7
  • CVT9
  • DID1
  • DID3
  • DID4
  • END12
  • FRK1
  • GAL83
  • GLC2
  • GRD7
  • GRD8
  • HSV1
  • HSV2
  • KIN1
  • KIN2
  • KIN3
  • KIN31
  • KIN4
  • MAI1
  • MDG1
  • NMR1
  • PAS14
  • PEP15
  • REN1
  • SCI1
  • SIP1
  • SIP2
  • SNF1
  • SNF4
  • SNF7
  • SPM1
  • SPM2
  • SVP1
  • VAC4
  • VPL17
  • VPL19
  • VPL2
  • VPL7
  • VPS15
  • VPS2
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS30
  • VPS32
  • VPS34
  • VPS38
  • VPT14
  • VPT20
  • VPT29
  • VPT30
  • YJL049W
  • YMR1
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol
  • BMS1
  • CRY2
  • CSL4
  • DBP8
  • DHR1
  • DIP2
  • DOB1
  • EBP2
  • ECM16
  • ECM20
  • EMG1
  • ERB1
  • FCF1
  • FMI1
  • GRC3
  • IMP3
  • IMP4
  • IPI1
  • IPI2
  • IPI3
  • KRE31
  • KRR1
  • LAS1
  • LOT3
  • LRP1
  • MPP10
  • MTR3
  • MTR4
  • NAN1
  • NEP1
  • NOC4
  • NOP1
  • NOP14
  • NOP5
  • NOP56
  • NOP58
  • NOP7
  • NUG1
  • PWP2
  • RCL1
  • RIX1
  • ROK1
  • RPS101
  • RPS102
  • RPS10A
  • RPS10B
  • RPS13A
  • RPS13B
  • RPS14B
  • RPS2
  • RPS30
  • RPS4
  • RPS6A
  • RPS6B
  • RPS7A
  • RPS9A
  • RPS9B
  • RRP13
  • RRP3
  • RRP36
  • RRP4
  • RRP40
  • RRP41
  • RRP42
  • RRP43
  • RRP45
  • RRP46
  • RRP47
  • RRP5
  • RRP6
  • RRP7
  • RRP9
  • RTC1
  • SAS10
  • SIK1
  • SKI4
  • SKI6
  • SMT4
  • SNU13
  • SOF1
  • SUP38
  • SUP44
  • SUP46
  • ULP1
  • ULP2
  • UNC733
  • UTP1
  • UTP10
  • UTP11
  • UTP12
  • UTP13
  • UTP14
  • UTP15
  • UTP17
  • UTP18
  • UTP19
  • UTP2
  • UTP20
  • UTP21
  • UTP22
  • UTP25
  • UTP3
  • UTP4
  • UTP5
  • UTP6
  • UTP7
  • YC1D
  • YPH1
  • YS11A
  • YTM1
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Metal ion SLC transporters
  • COT1
  • CTR2
  • ZRC1
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Miscellaneous transport and binding events
  • ERS1
  • LPE10
  • MFM1
  • OST3
  • OST6
  • RTC2
  • YPQ1
  • YPQ2
  • YPQ3
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Mitochondrial protein degradation
  • AAC1
  • AAC2
  • AAC3
  • ABF2
  • ACO1
  • AFG3
  • ALD3
  • ALD4
  • ALD5
  • ALD6
  • ALD7
  • ALDH1
  • ALDH2
  • ALDH5
  • ATP1
  • ATP2
  • ATP20
  • ATP3
  • ATP3a
  • ATP3b
  • ATP5
  • ATP6
  • ATP7
  • CAR1
  • CEM1
  • CIT1
  • COX1
  • COX4
  • COX6
  • DLD
  • DLD1
  • ENS1
  • ERG13
  • FUM1
  • GLU1
  • GLU3
  • HEM15
  • HIM1
  • HMGS
  • HMO1
  • HMO2
  • HSM2
  • HSP60
  • ISM1
  • IXR1
  • KGD1
  • LON
  • LYS6
  • MAS2
  • MDH2
  • MIF2
  • MIF4
  • MNP1
  • MRP4
  • MRP4A
  • MRPL12
  • MRPL32
  • NHP10
  • NHP6A
  • NHPA
  • OGD1
  • OLI2
  • OLI4
  • ORD1
  • OSCP
  • OXI3
  • PDB1
  • PET9
  • PHO1
  • PIM1
  • PKA2
  • PRO2
  • QCR8
  • RCA1
  • RIM1
  • SSC1
  • TPK2
  • YKR1
  • YTA10
  • YTA12
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Multifunctional anion exchangers
  • SEL2
  • SFP2
  • SUL1
  • SUL2
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
NIK-->noncanonical NF-kB signaling
  • BCK1
  • LAS3
  • SLK1
  • SSP31
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Negative feedback regulation of MAPK pathway
  • DAC2
  • FUS3
  • HOG4
  • KSS1
  • MKK1
  • MKK2
  • MPK1
  • PBS2
  • SFS4
  • SLT2
  • SMK1
  • SSK4
  • SSP32
  • SSP33
  • STE7
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Negative regulation of MAPK pathway
  • DAC2
  • FUS3
  • KSS1
  • MPK1
  • PTP1
  • PTP2
  • PTP3
  • SLT2
  • SMK1
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Negative regulation of the PI3K/AKT network
  • TEP1
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Neutrophil degranulation
  • ABF2
  • ACT2
  • ACT3
  • ACT5
  • AIM14
  • AIM7
  • AMD
  • AMD1
  • APG7
  • APL3
  • APM1
  • APT1
  • ARC15
  • ARP1
  • ARP2
  • ARX1
  • ATG7
  • BEM3
  • BET5
  • BIN3
  • BUD1
  • BUD16
  • BUR1
  • CAP1
  • CAR1
  • CBR
  • CBR1
  • CBR5
  • CCT2
  • CCT8
  • CDC19
  • CDC48
  • CDC50
  • CDD1
  • CIM5
  • CKB2
  • CLS7
  • CSC1
  • CTA1
  • CTK1
  • CTS2
  • CUE5
  • CUP5
  • CVT2
  • CYK1
  • DAC2
  • DAP1
  • DCK1
  • DED1
  • DHC1
  • DNF1
  • DNF3
  • DOA5
  • DRS2
  • DSN1
  • DYN1
  • DYN2
  • EFT1
  • EFT2
  • EMI2
  • EPS1
  • ERF4
  • ERV29
  • FAT1
  • FOX3
  • FRE8
  • FUS3
  • GA-5
  • GAL5
  • GDB1
  • GDI1
  • GEF2
  • GID5
  • GLG1
  • GLG2
  • GLK1
  • GPH1
  • HBS1
  • HDF1
  • HDF2
  • HEM2
  • HEX1
  • HFD1
  • HIM1
  • HKA
  • HKB
  • HMO1
  • HMO2
  • HOG1
  • HOR3
  • HPO2
  • HRD2
  • HSC82
  • HSM2
  • HSP82
  • HSP90
  • HSS7
  • HXK1
  • HXK2
  • HYM1
  • IDP1
  • IDS2
  • IMD2
  • IMD3
  • IMD4
  • IQG1
  • IST1
  • IST2
  • IXR1
  • JEM1
  • KAP95
  • KAR8
  • KSS1
  • LAP2
  • LSB2
  • MDS3
  • MPK1
  • MPR1
  • NAS1
  • NAS4
  • NAS5
  • NAS7
  • NDK1
  • NES24
  • NGK1
  • NHP10
  • NHP6A
  • NHPA
  • NIT3
  • NPC2
  • NPP1
  • NPP2
  • NPT1
  • OMS1
  • ORD1
  • ORM1
  • ORM2
  • OST3
  • OST6
  • PFK1
  • PFK2
  • PGI1
  • PGM1
  • PGM2
  • PGM3
  • PHM7
  • PIN3
  • PKC1
  • PLD1
  • PMD1
  • PNP1
  • POT1
  • POX3
  • PRE8
  • PRM15
  • PRS4
  • PRX1
  • PTP1
  • PTP2
  • PTP3
  • PTR2
  • PUP1
  • PUP2
  • PUR5
  • PYK1
  • PYK2
  • RHO1
  • RHO2
  • RHO3
  • RHO4
  • RNY1
  • RPD1
  • RPN1
  • RPN11
  • RPN2
  • RPN3
  • RPN5
  • RPN6
  • RPN7
  • RPN8
  • RPN9
  • RPT1
  • RPT5
  • RSN1
  • RSR1
  • SAC7
  • SCP1
  • SCS2
  • SEC19
  • SEC26
  • SEC4
  • SEC9
  • SEL1
  • SEN3
  • SGV1
  • SHR5
  • SLC1
  • SLT2
  • SMK1
  • SPO14
  • SPO20
  • SPO75
  • SPP81
  • SRO6
  • SRP14
  • SRV2
  • SSA1
  • SSA2
  • SSA3
  • SSA4
  • SSB1
  • SSB2
  • SSK3
  • SSR2
  • STT1
  • STV1
  • SUN2
  • SWA3
  • SWA4
  • TCP2
  • TEF1
  • TEF2
  • TOM1
  • TPX1
  • TSA
  • TSA1
  • TSA2
  • UBX2
  • VAM4
  • VID28
  • VMA3
  • VMA8
  • VPH1
  • VPS12
  • VPS21
  • VPS73
  • VPT12
  • WBP1
  • YAP54
  • YBR241C
  • YBR284W
  • YFR018C
  • YG101
  • YG103
  • YJL070C
  • YKU70
  • YKU80
  • YNK
  • YNK1
  • YPT10
  • YPT21
  • YPT51
  • YPT52
  • YPT53
  • YPT6
  • YPT7
  • YTA1
  • YTA3
  • ZRG14
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC)
  • CBC1
  • CBC2
  • CBP20
  • CBP80
  • CDC55
  • CRY2
  • CYH2
  • EBS1
  • ESL1
  • ESL2
  • EST1
  • FAL1
  • GCR3
  • GRC5
  • GST1
  • IFS1
  • IFS2
  • KRB1
  • L10E
  • L12EIB
  • L12EIIA
  • MAK18
  • MAK8
  • MOF4
  • MUD13
  • NAB1
  • NAB1A
  • NAM7
  • NMD2
  • PES4
  • PLC2
  • PNM2
  • PPH21
  • QSR1
  • RP28A
  • RP28B
  • RP29
  • RP39A
  • RP39B
  • RP51A
  • RP51B
  • RP55A
  • RP61R
  • RPA0
  • RPA1
  • RPA2
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10B
  • RPL10E
  • RPL11A
  • RPL11B
  • RPL12A
  • RPL12B
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL13B
  • RPL14B
  • RPL15A
  • RPL15B
  • RPL16A
  • RPL16B
  • RPL17
  • RPL17A
  • RPL17AA
  • RPL17AB
  • RPL17B
  • RPL18A
  • RPL18A1
  • RPL18A2
  • RPL18B
  • RPL19A
  • RPL19B
  • RPL1A
  • RPL1B
  • RPL2
  • RPL20A
  • RPL20B
  • RPL21A
  • RPL23A
  • RPL23B
  • RPL24A
  • RPL25
  • RPL26
  • RPL26A
  • RPL26B
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL2A
  • RPL2B
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL30A
  • RPL31A
  • RPL31B
  • RPL32
  • RPL33A
  • RPL33B
  • RPL34
  • RPL34A
  • RPL34B
  • RPL35A
  • RPL35B
  • RPL36A
  • RPL36B
  • RPL37A
  • RPL37B
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39A
  • RPL39B
  • RPL41A
  • RPL41B
  • RPL42A
  • RPL42B
  • RPL44
  • RPL46
  • RPL4A
  • RPL4B
  • RPL5
  • RPL5A
  • RPL5B
  • RPL6A
  • RPL6B
  • RPL7A
  • RPL8A
  • RPL8B
  • RPL9B
  • RPLA0
  • RPLA1
  • RPLA2
  • RPP0
  • RPP1A
  • RPP2A
  • RPS0A
  • RPS101
  • RPS102
  • RPS10A
  • RPS10B
  • RPS11A
  • RPS11B
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS13A
  • RPS13B
  • RPS13C
  • RPS14A
  • RPS14B
  • RPS15
  • RPS16A
  • RPS16AA
  • RPS16B
  • RPS17A
  • RPS17B
  • RPS18A
  • RPS18B
  • RPS19A
  • RPS1B
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS21B
  • RPS22A
  • RPS23A
  • RPS23B
  • RPS24
  • RPS24A
  • RPS24B
  • RPS24EA
  • RPS24EB
  • RPS25A
  • RPS25B
  • RPS26
  • RPS26A
  • RPS26B
  • RPS27A
  • RPS27B
  • RPS28A
  • RPS28B
  • RPS29A
  • RPS3
  • RPS30
  • RPS31
  • RPS31A
  • RPS33B
  • RPS36A
  • RPS37
  • RPS4
  • RPS4A
  • RPS4B
  • RPS5
  • RPS6A
  • RPS6B
  • RPS7A
  • RPS7B
  • RPS8A
  • RPS8B
  • RPS9A
  • RPS9B
  • SAE1
  • SAL3
  • SAL4
  • SCD2
  • SCL41A
  • SCL41B
  • SOS1
  • SOS2
  • SPB2
  • SSM1
  • SSM1A
  • SSM1B
  • SSM2
  • STO1
  • SUA1
  • SUA6
  • SUF12
  • SUF14
  • SUP1
  • SUP2
  • SUP35
  • SUP38
  • SUP44
  • SUP45
  • SUP46
  • SUT1
  • TCM1
  • TIF4631
  • TPD3
  • UBI3
  • UBI4
  • UPF1
  • UPF2
  • UPF3
  • URP1
  • URP2
  • YL10A
  • YL10B
  • YL14A
  • YL14B
  • YL16A
  • YL16B
  • YL43
  • YL8A
  • YS11A
  • YS29A
  • YST1
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC)
  • CBC1
  • CBC2
  • CBP20
  • CBP80
  • CRY2
  • CYH2
  • GCR3
  • GRC5
  • GST1
  • IFS2
  • KRB1
  • L10E
  • L12EIB
  • L12EIIA
  • MAK18
  • MAK8
  • MOF4
  • MUD13
  • NAB1
  • NAB1A
  • NAM7
  • PES4
  • PLC2
  • PNM2
  • QSR1
  • RP28A
  • RP28B
  • RP29
  • RP39A
  • RP39B
  • RP51A
  • RP51B
  • RP55A
  • RP61R
  • RPA0
  • RPA1
  • RPA2
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10B
  • RPL10E
  • RPL11A
  • RPL11B
  • RPL12A
  • RPL12B
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL13B
  • RPL14B
  • RPL15A
  • RPL15B
  • RPL16A
  • RPL16B
  • RPL17
  • RPL17A
  • RPL17AA
  • RPL17AB
  • RPL17B
  • RPL18A
  • RPL18A1
  • RPL18A2
  • RPL18B
  • RPL19A
  • RPL19B
  • RPL1A
  • RPL1B
  • RPL2
  • RPL20A
  • RPL20B
  • RPL21A
  • RPL23A
  • RPL23B
  • RPL24A
  • RPL25
  • RPL26
  • RPL26A
  • RPL26B
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL2A
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  • SUT1
  • TCM1
  • TIF4631
  • UBI3
  • UBI4
  • UPF1
  • URP1
  • URP2
  • YL10A
  • YL10B
  • YL14A
  • YL14B
  • YL16A
  • YL16B
  • YL43
  • YL8A
  • YS11A
  • YS29A
  • YST1
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Nuclear Receptor transcription pathway
  • SNT1
  • SPS1
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)
Oleoyl-phe metabolism
  • CPS
  • CPS1
Saccharomyces cerevisiae (brewer's yeast)

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Last updated: August 19, 2024