GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 376 - 400 of 499 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
GABA synthesis, release, reuptake and degradation
  • aex-4
  • cpx-1
  • dnj-14
  • hsp-1
  • hsp70a
  • lan-2
  • rab-3
  • ric-4
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • snt-1
  • tag-81
  • unc-10
  • unc-18
  • unc-25
  • unc-47
  • unc-64
  • vamp-7
Caenorhabditis elegans
Acetylcholine Neurotransmitter Release Cycle
  • aex-4
  • cha-1
  • cho-1
  • cpx-1
  • lan-2
  • rab-3
  • ric-4
  • rimb-1
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • snt-1
  • syd-2
  • tag-168
  • tag-81
  • unc-10
  • unc-13
  • unc-17
  • unc-18
  • unc-64
  • vamp-7
Caenorhabditis elegans
Glutamate Neurotransmitter Release Cycle
  • aex-4
  • cpx-1
  • eat-4
  • glna-1
  • glna-2
  • glna-3
  • glt-1
  • glt-3
  • glt-4
  • glt-5
  • glt-6
  • glt-7
  • lan-2
  • praf-3
  • rab-3
  • ric-4
  • rimb-1
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • snt-1
  • syd-2
  • tag-168
  • tag-81
  • unc-10
  • unc-13
  • unc-18
  • unc-64
  • vamp-7
  • vglu-2
  • vglu-3
Caenorhabditis elegans
Platelet degranulation
  • C03F11.3
  • C05D9.3
  • C18E9.7
  • C27B7.7
  • C28G1.2
  • C32B5.13
  • C32B5.7
  • C54G4.4
  • CELE_F14B4.1
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F21C10.7
  • CELE_F26H9.2
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_F47B7.2
  • CELE_K02E7.10
  • CELE_K07E8.6
  • CELE_R07E3.1
  • CELE_R07G3.8
  • CELE_R09F10.1
  • CELE_T22A3.6
  • CELE_Y113G7B.15
  • CELE_Y51A2D.8
  • CELE_Y71H2AM.25
  • CELE_Y71H2AR.2
  • CELE_ZK973.11
  • R07B1.3
  • act-1
  • act-2
  • act-3
  • act-4
  • aex-6
  • aipl-1
  • aldo-1
  • aldo-2
  • apl-1
  • atn-1
  • cal-5
  • cdc-37
  • cdh-10
  • cet-1
  • cfh-1
  • chil-10
  • daf-7
  • dbl-1
  • deb-1
  • famp-1
  • fln-1
  • igdb-1
  • igdb-2
  • iglr-1
  • lan-2
  • ldp-1
  • lin-49
  • lmp-1
  • lmp-2
  • lron-6
  • manf-1
  • moma-1
  • mrp-6
  • ola-1
  • ooc-5
  • ost-1
  • pat-2
  • pat-3
  • pvf-1
  • rab27
  • rme-2
  • scav-2
  • scav-3
  • scav-4
  • scav-6
  • slfl-5
  • sod-1
  • sparc
  • spp-10
  • spp-8
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-3
  • srp-6
  • srp-7
  • srp-8
  • tag-196
  • tag-210
  • tag-225
  • tag-329
  • timp-1
  • tln-1
  • tor-1
  • tor-2
  • tsp-11
  • tsp-7
  • unc-112
  • unc-129
  • unc-18
  • uncp-18
  • vig-1
Caenorhabditis elegans
Highly calcium permeable nicotinic acetylcholine receptors
  • acr-12
  • acr-2
  • acr-3
  • acr-6
  • acr-8
  • lev-1
  • lev-7
  • lev-8
  • lgc-3
  • pbo-6
  • unc-29
  • unc-38
  • unc-63
Caenorhabditis elegans
Highly sodium permeable postsynaptic acetylcholine nicotinic receptors
  • acr-12
  • acr-2
  • acr-3
  • acr-6
  • acr-8
  • lev-1
  • lev-7
  • lev-8
  • lgc-3
  • pbo-6
  • unc-29
  • unc-38
  • unc-63
Caenorhabditis elegans
Neurotransmitter receptors and postsynaptic signal transmission
  • acc-1
  • acc-2
  • acc-3
  • acc-4
  • acr-20
  • acr-21
  • acr-22
  • acr-23
  • acr-24
  • acr-4
  • acr-5
  • avr-14
  • avr-15
  • deg-3
  • des-2
  • gbr-4
  • ggr-1
  • ggr-2
  • ggr-3
  • glc-1
  • glc-2
  • glc-3
  • glc-4
  • lgc-10
  • lgc-11
  • lgc-12
  • lgc-30
  • lgc-31
  • lgc-32
  • lgc-34
  • lgc-39
  • lgc-4
  • lgc-40
  • lgc-41
  • lgc-42
  • lgc-44
  • lgc-45
  • lgc-46
  • lgc-47
  • lgc-48
  • lgc-49
  • lgc-5
  • lgc-50
  • lgc-51
  • lgc-52
  • lgc-53
  • lgc-54
  • lgc-55
  • lgc-56
  • lgc-58
  • lgc-6
  • lgc-7
  • lgc-8
  • lgc-9
  • mod-1
Caenorhabditis elegans
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors
  • acr-12
  • acr-2
  • acr-20
  • acr-21
  • acr-22
  • acr-23
  • acr-24
  • acr-25
  • acr-3
  • acr-4
  • acr-5
  • acr-6
  • acr-8
  • deg-3
  • des-2
  • lev-1
  • lev-7
  • lev-8
  • lgc-10
  • lgc-11
  • lgc-12
  • lgc-3
  • lgc-30
  • lgc-31
  • lgc-4
  • lgc-5
  • lgc-6
  • lgc-7
  • lgc-8
  • lgc-9
  • pbo-6
  • unc-29
  • unc-38
  • unc-63
Caenorhabditis elegans
Transport of vitamins, nucleosides, and related molecules
  • CELE_T26C5.3
Caenorhabditis elegans
GRB2:SOS provides linkage to MAPK signaling for Integrins
  • C05D9.3
  • C18E9.7
  • kin-32
  • let-341
  • mig-10
  • pat-2
  • pat-3
  • rap-1
  • sem-5
  • sos-1
  • src-1
  • tln-1
Caenorhabditis elegans
Integrin signaling
  • C05D9.3
  • C18E9.7
  • C34F11.5
  • CELE_W04B5.5
  • akt-1
  • akt-2
  • csk-1
  • epac-1
  • kin-32
  • mig-10
  • pat-2
  • pat-3
  • rap-1
  • rgef-1
  • src-1
  • tln-1
Caenorhabditis elegans
WNT ligand biogenesis and trafficking
  • cwn-1
  • cwn-2
  • egl-20
  • let-553
  • lin-44
  • mig-14
  • mom-2
  • mom-3
  • pvl-2
  • snx-3
  • tmed-1
  • vps-26
  • vps-29
  • vps-35
  • wnt-1
  • wnt-2
Caenorhabditis elegans
PCP/CE pathway
  • CELE_Y71H2AM.12
  • ced-10
  • cwn-1
  • cwn-2
  • daam-1
  • dsh-1
  • dsh-2
  • lin-44
  • mig-5
  • mom-2
  • mom-5
  • rac-1
  • rac-2
  • rho-1
  • rhoa
  • wnt-1
  • wnt-2
Caenorhabditis elegans
Ca2+ pathway
  • cal-5
  • cfz-2
  • cna-1
  • cnb-1
  • cwn-2
  • eat-11
  • gbp-2
  • goa-1
  • gpb-1
  • gpb-2
  • gpc-1
  • gpc-2
  • hmp-2
  • let-60
  • lin-17
  • lin-34
  • lin-44
  • lit-1
  • mom-2
  • mom-5
  • nlk
  • pop-1
  • tax-6
  • unc-43
  • wnt-2
Caenorhabditis elegans
Acyl chain remodelling of PE
  • C03H5.4
  • C07E3.9
  • C31H1.5
  • C45B2.6
  • CELE_Y69A2AL.2
  • LPT-1
  • clec-148
  • clec-161
  • clec-178
  • clec-48
  • clec-49
  • clec-50
  • clec-51
  • clec-52
  • clec-53
  • clec-89
  • ipla-6
  • lid-1
  • mboa-3
  • mboa-4
  • mboa-6
Caenorhabditis elegans
Fatty acyl-CoA biosynthesis
  • acly-1
  • acs-20
  • acs-22
  • fasn-1
  • fat-5
  • fat-6
  • fat-7
  • morc-1
  • pod-2
  • ppt-1
Caenorhabditis elegans
Serotonin Neurotransmitter Release Cycle
  • aex-4
  • cat-1
  • cpx-1
  • lan-2
  • rab-3
  • ric-4
  • rimb-1
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • snn-1
  • snt-1
  • syd-2
  • tag-168
  • tag-81
  • unc-10
  • unc-13
  • unc-18
  • unc-64
  • vamp-7
Caenorhabditis elegans
Dopamine Neurotransmitter Release Cycle
  • aex-4
  • cat-1
  • cpx-1
  • lan-2
  • lin-10
  • lin-2
  • lin-7
  • rab-3
  • ric-4
  • rimb-1
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • snn-1
  • snt-1
  • syd-2
  • tag-168
  • tag-81
  • unc-10
  • unc-13
  • unc-18
  • unc-64
  • vamp-7
Caenorhabditis elegans
pre-mRNA splicing
  • C16C10.4
  • C47E8.4
  • CELE_K01G5.8
  • CELE_T23G11.4
  • CELE_Y18H1A.2
  • CELE_Y57G11A.5
  • CELE_Y66D12A.8
  • CELE_ZK616.1
  • E01A2.2
  • F37A4.2
  • K07C5.6
  • R05D3.8
  • R07E5.1
  • RBM8
  • T27F2.1
  • Y14
  • acin-1
  • aly-3
  • ama-1
  • bcas-2
  • bud-31
  • cacn-1
  • casc-3
  • cbp-20
  • cbp-80
  • ccdc-12
  • ccdc-55
  • cdc-5L
  • cdc-5l
  • cey-1
  • cey-2
  • cey-3
  • cey-4
  • ctnb-1
  • cwc-15
  • cyn-10
  • cyn-12
  • cyn-15
  • cyn-4
  • cyp-10
  • cyp-4
  • ddx-15
  • ddx-17
  • ddx-35
  • ddx-46
  • eftu-2
  • eif-4A3
  • emb-4
  • fust-1
  • gad-1
  • gtf-2F1
  • gtf-2F2
  • gtf-2f1
  • gtf-2f2
  • hel-1
  • hrp-1
  • hrp-2
  • hrpf-1
  • hrpf-2
  • hrpk-1
  • hrpl-1
  • hrpr-1
  • hrpu-1
  • hsp-1
  • hsp70a
  • isy-1
  • let-504
  • let-858
  • mag-1
  • mog-1
  • mog-2
  • mog-3
  • mog-5
  • mog-6
  • mtr-4
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • pes-4
  • phf-5
  • plrg-1
  • pnn-1
  • pqbp-1.1
  • prcc-1
  • prp-17
  • prp-18
  • prp-19
  • prp-8
  • ptb-1
  • rbm-17
  • rbm-22
  • rbm-5
  • rbp-1
  • rnp-2
  • rnp-4
  • rnp-5
  • rnp-6
  • rpb-1
  • rpb-10
  • rpb-11
  • rpb-12
  • rpb-2
  • rpb-3
  • rpb-4
  • rpb-5
  • rpb-6
  • rpb-7
  • rpb-8
  • rpb-9
  • rsp-2
  • rsp-3
  • rsp-4
  • rsp-6
  • rsp-7
  • rsp-8
  • rsr-1
  • sacy-1
  • sap-1
  • sap-140
  • scaf-6
  • sde-2
  • sel-13
  • sig-7
  • smg-4
  • snr-1
  • snr-2
  • snr-3
  • snr-4
  • snr-5
  • snr-6
  • snr-7
  • snrp-200
  • snrp-40.1
  • snrp-40.2
  • sqd-1
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-4
  • syf-1
  • syf-2
  • syf-3
  • tag-65
  • tofu-2
  • yju-2
Caenorhabditis elegans
PKR-mediated signaling
  • CELE_F52C6.3
  • CELE_R11H6.5
  • CELE_T12G3.2
  • ari-1.1
  • cdk-1
  • dnj-7
  • dus-2
  • glo-4
  • herc-1
  • jkk-1
  • let-92
  • mek-1
  • mek-5
  • ncc-1
  • nck-1
  • paa-1
  • pek-1
  • pptr-1
  • rde-4
  • rha-1
  • sek-1
  • sek-3
  • sek-4
  • sek-5
  • sphk-1
  • sta-1
  • sta-2
  • stat-b
  • strd-1
  • tag-274
  • ubc-18
  • ubia
  • ubq-1
  • zfr-1
Caenorhabditis elegans
Lewis blood group biosynthesis
  • B0024.15
  • B0205.4
  • BE10.3
  • C05E4.15
  • C27D9.1
  • CEFT-4
  • CELE_F10E7.1
  • CELE_F53A2.11
  • CELE_F53C3.11
  • CELE_T05A7.11
  • CELE_T05A7.13
  • CELE_Y47D3A.1
  • fut-3
  • pha-1
  • pha1
Caenorhabditis elegans
Reactions specific to the complex N-glycan synthesis pathway
  • BE10.3
  • C05E4.15
  • C27D9.1
  • CEFT-4
  • CELE_F10E7.1
  • CELE_F53A2.11
  • CELE_F53C3.11
  • CELE_T05A7.11
  • CELE_T05A7.13
  • CELE_Y47D3A.1
  • W03G11.3
  • aman-2
  • aman-3
  • fut-3
  • fut-8
  • gly-20
  • pha-1
  • pha1
Caenorhabditis elegans
Glycolysis
  • C50D2.7
  • CELE_Y43F4B.5
  • T03F6.3
  • aldo-1
  • aldo-2
  • enol-1
  • gpd-1
  • gpd-2
  • gpd-3
  • gpd-4
  • gpi-1
  • hxk-1
  • hxk-2
  • hxk-3
  • pfk-1.1
  • pfk-1.2
  • pgk-1
  • pyk-1
  • pyk-2
  • tpi-1
Caenorhabditis elegans
Nicotinamide salvaging
  • R107.2
  • Y18D10A.3
  • anmt-1
  • ndx-9
  • nprt-1
  • oct-1
  • slc-5A12
Caenorhabditis elegans
WNT5A-dependent internalization of FZD2, FZD5 and ROR2
  • ap50
  • apa-2
  • apb-1
  • aps-2
  • cam-1
  • cfz-2
  • chc-1
  • clic-1
  • cwn-2
  • dpy-23
  • kin-8
  • mom-5
  • wnt-2
Caenorhabditis elegans

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024