GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 401 - 425 of 499 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
Synthesis of PC
  • C06H2.2
  • CELE_T28D6.7
  • CELE_Y18H1A.11
  • F08C6.2
  • abhd-3.1
  • abhd-3.2
  • ace-1
  • cept-1
  • cept-2
  • cest-1
  • cest-1.1
  • cest-1.2
  • cest-12
  • cest-13
  • cest-16
  • cest-17
  • cest-19
  • cest-2.1
  • cest-2.2
  • cest-2.3
  • cest-24
  • cest-26
  • cha-1
  • chtl-1
  • cka-1
  • cka-2
  • ckb-1
  • ckb-2
  • ckb-3
  • ckb-4
  • ges-1
  • kin-10
  • kin-3
  • kin-5
  • lpin-1
Caenorhabditis elegans
Prostanoid ligand receptors
  • C06G4.5
  • npr-16
  • npr-18
  • npr-23
  • npr-24
  • npr-26
  • npr-28
Caenorhabditis elegans
G-protein activation
  • C06G4.5
  • eat-11
  • egl-30
  • gbp-2
  • gpb-1
  • gpb-2
  • gpc-1
  • gpc-2
  • npr-16
  • npr-18
  • npr-23
  • npr-24
  • npr-26
  • npr-28
Caenorhabditis elegans
BBSome-mediated cargo-targeting to cilium
  • C06G4.5
  • CELE_F54C9.11
  • arl-6
  • bbs-1
  • bbs-2
  • bbs-4
  • bbs-5
  • bbs-7
  • bbs-8
  • bbs-9
  • npr-16
  • npr-18
  • npr-23
  • npr-24
  • npr-26
  • npr-28
  • osm-12
Caenorhabditis elegans
G alpha (i) signalling events
  • C06G4.5
  • C28G1.2
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F35H10.10
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_F55D10.4
  • CELE_F57C9.6
  • CELE_ZK813.5
  • ador-1
  • ags-3
  • dop-2
  • dop-2L
  • dop-3
  • eat-11
  • eat-16
  • egl-10
  • gar-3
  • gbb-1
  • gbb-2
  • gbp-2
  • gnrr-4
  • gpa-16
  • gpa-4
  • gpa-6
  • gpb-1
  • gpb-2
  • gpc-1
  • gpc-2
  • gtr-1
  • mgl-1
  • mgl-3
  • npr-16
  • npr-18
  • npr-23
  • npr-24
  • npr-25
  • npr-26
  • npr-28
  • octr-1
  • rgs-1
  • rgs-10
  • rgs-11
  • rgs-2
  • rgs-3
  • rgs-4
  • rgs-6
  • rgs-7
  • rgs-8.1
  • rgs-8.2
  • rgs-9
  • ser-2
  • ser-4
  • spn-1
  • src-1
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-3
  • srp-6
  • srp-7
  • srp-8
  • tyra-2
Caenorhabditis elegans
G alpha (q) signalling events
  • C06G4.5
  • C24B5.1
  • C28G1.2
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F44G3.7
  • aap-1
  • age-1
  • apl-1
  • dcar-1
  • dop-6
  • eat-11
  • egl-30
  • egl-8
  • gar-3
  • gbp-2
  • gnrr-1
  • gnrr-4
  • gpb-1
  • gpb-2
  • gpc-1
  • gpc-2
  • grk-2
  • mgl-2
  • nex-3
  • nex-4
  • nmur-1
  • nmur-2
  • nmur-3
  • nmur-4
  • npr-14
  • npr-16
  • npr-18
  • npr-20
  • npr-23
  • npr-24
  • npr-25
  • npr-26
  • npr-28
  • npr-32
  • pcdr-1
  • rgs-1
  • rgs-10
  • rgs-11
  • rgs-2
  • rgs-3
  • rgs-4
  • rgs-6
  • rgs-7
  • rgs-8.1
  • rgs-8.2
  • rgs-9
  • ser-5
  • sro-1
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-3
  • srp-6
  • srp-7
  • srp-8
  • tag-89
  • tkr-1
  • trhr-1
  • unc-73
Caenorhabditis elegans
KSRP (KHSRP) binds and destabilizes mRNA
  • C06G4.1
  • akt-1
  • akt-2
  • ftt-1
  • ftt-2
  • fubl-1
  • fubl-2
  • fubl-3
  • fubl-4
  • fubp-3.1
  • fubp-3.2
  • fubp-3.3
  • fubp-3.4
  • par-5
Caenorhabditis elegans
RNA polymerase II transcribes snRNA genes
  • C06G3.8
  • CELE_F53H1.4
  • CELE_T26A8.4
  • CELE_Y71H2B.2
  • E01A2.2
  • TFIIE-alpha
  • TFIIE-beta
  • ama-1
  • cbp-20
  • cbp-80
  • ccnk-1
  • cdk-7
  • cdk-9
  • cids-1
  • cids-2
  • cit-1.1
  • cit-1.2
  • dic-1
  • ell-1
  • gei-11
  • gtf-2A2
  • gtf-2E1
  • gtf-2E2
  • gtf-2F1
  • gtf-2F2
  • gtf-2e1
  • gtf-2e2
  • gtf-2f1
  • gtf-2f2
  • inst-1
  • ints-1
  • ints-11
  • ints-13
  • ints-2
  • ints-3
  • ints-4
  • ints-5
  • ints-6
  • ints-7
  • ints-8
  • ints-9
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • pcf-11
  • pqn-51
  • rpap-2
  • rpb-1
  • rpb-10
  • rpb-11
  • rpb-12
  • rpb-2
  • rpb-3
  • rpb-4
  • rpb-5
  • rpb-6
  • rpb-7
  • rpb-8
  • rpb-9
  • snpc-1.1
  • snpc-3.2
  • snpc-4
  • ssup-72
  • taf-10
  • taf-11.3
  • taf-13
  • taf-5
  • taf-6.1
  • taf-8
  • taf-9
  • tbp
  • tbp-1
  • ttb-1
Caenorhabditis elegans
Aflatoxin activation and detoxification
  • C06A6.4
  • C53D5.5
  • CELE_H14N18.4
  • CELE_T03D8.6
  • CELE_T19H12.6
  • CELE_Y7A9A.1
  • CELE_Y97E10AR.2
  • cyp-23A1
  • cyp-23a1
  • cyp-33A1
  • cyp-33B1
  • cyp-33C1
  • cyp-33C11
  • cyp-33C12
  • cyp-33C2
  • cyp-33C3
  • cyp-33C4
  • cyp-33C5
  • cyp-33C6
  • cyp-33C7
  • cyp-33C8
  • cyp-33C9
  • cyp-33D1
  • cyp-33D3
  • cyp-33E1
  • cyp-33E2
  • cyp-33E3
  • cyp-33a1
  • cyp-33b1
  • cyp-33c1
  • cyp-33c11
  • cyp-33c12
  • cyp-33c2
  • cyp-33c3
  • cyp-33c4
  • cyp-33c5
  • cyp-33c6
  • cyp-33c7
  • cyp-33c8
  • cyp-33c9
  • cyp-33d1
  • cyp-33d3
  • cyp-33e1
  • cyp-33e2
  • cyp-33e3
  • cyp-34A1
  • cyp-34A10
  • cyp-34A2
  • cyp-34A5
  • cyp-34A6
  • cyp-34A7
  • cyp-34A8
  • cyp-34A9
  • cyp-34a1
  • cyp-34a10
  • cyp-34a2
  • cyp-34a4
  • cyp-34a5
  • cyp-34a6
  • cyp-34a7
  • cyp-34a8
  • cyp-34a9
  • cyp-35A1
  • cyp-35A2
  • cyp-35A3
  • cyp-35A4
  • cyp-35A5
  • cyp-35B1
  • cyp-35B2
  • cyp-35B3
  • cyp-35C1
  • cyp-35a1
  • cyp-35a2
  • cyp-35a3
  • cyp-35a4
  • cyp-35a5
  • cyp-35b1
  • cyp-35b2
  • cyp-35b3
  • cyp-35c1
  • cyp-35d1
  • cyp-36A1
  • cyp36a1
  • dach-1
  • daf-9
Caenorhabditis elegans
APAP ADME
  • C06A6.4
  • C53D5.5
  • CELE_H14N18.4
  • CELE_T03D8.6
  • CELE_T19H12.6
  • CELE_Y7A9A.1
  • CELE_Y97E10AR.2
  • abcx-1
  • cyp-23A1
  • cyp-23a1
  • cyp-33A1
  • cyp-33B1
  • cyp-33C1
  • cyp-33C11
  • cyp-33C12
  • cyp-33C2
  • cyp-33C3
  • cyp-33C4
  • cyp-33C5
  • cyp-33C6
  • cyp-33C7
  • cyp-33C8
  • cyp-33C9
  • cyp-33D1
  • cyp-33D3
  • cyp-33E1
  • cyp-33E2
  • cyp-33E3
  • cyp-33a1
  • cyp-33b1
  • cyp-33c1
  • cyp-33c11
  • cyp-33c12
  • cyp-33c2
  • cyp-33c3
  • cyp-33c4
  • cyp-33c5
  • cyp-33c6
  • cyp-33c7
  • cyp-33c8
  • cyp-33c9
  • cyp-33d1
  • cyp-33d3
  • cyp-33e1
  • cyp-33e2
  • cyp-33e3
  • cyp-34A1
  • cyp-34A10
  • cyp-34A2
  • cyp-34A5
  • cyp-34A6
  • cyp-34A7
  • cyp-34A8
  • cyp-34A9
  • cyp-34a1
  • cyp-34a10
  • cyp-34a2
  • cyp-34a4
  • cyp-34a5
  • cyp-34a6
  • cyp-34a7
  • cyp-34a8
  • cyp-34a9
  • cyp-35A1
  • cyp-35A2
  • cyp-35A3
  • cyp-35A4
  • cyp-35A5
  • cyp-35B1
  • cyp-35B2
  • cyp-35B3
  • cyp-35C1
  • cyp-35a1
  • cyp-35a2
  • cyp-35a3
  • cyp-35a4
  • cyp-35a5
  • cyp-35b1
  • cyp-35b2
  • cyp-35b3
  • cyp-35c1
  • cyp-35d1
  • cyp-36A1
  • cyp36a1
  • dach-1
  • daf-9
  • gst-1
  • mrp-1
  • mrp-2
  • mrp-3
  • mrp-4
  • mrp-5
  • mrp-6
  • mrp-7
  • mrp-8
  • pes-9
  • ugt-57
  • wht-5
Caenorhabditis elegans
Localization of the PINCH-ILK-PARVIN complex to focal adhesions
  • C05D9.3
  • pat-4
Caenorhabditis elegans
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell
  • C05D9.3
  • pat-2
Caenorhabditis elegans
Syndecan interactions
  • C05D9.3
  • cet-1
  • daf-7
  • dbl-1
  • ina-1
  • kin-11
  • let-756
  • pat-2
  • pat-3
  • pkc-2
  • sdn-1
  • unc-129
Caenorhabditis elegans
Molecules associated with elastic fibres
  • C05D9.3
  • cet-1
  • daf-7
  • dbl-1
  • fbl-1
  • fbln1
  • nid-1
  • pat-2
  • pat-3
  • unc-129
Caenorhabditis elegans
Signal transduction by L1
  • C05D9.3
  • ced-10
  • egl-15
  • kin-10
  • kin-3
  • kin-5
  • kin-7
  • let-23
  • mek-2
  • mpk-1
  • pak-1
  • pat-2
  • pat-3
  • rac-1
  • sur-1
  • vav-1
  • wrk-1
Caenorhabditis elegans
TGF-beta receptor signaling activates SMADs
  • C05D9.3
  • aka-1
  • cem-3
  • cet-1
  • daf-1
  • daf-4
  • daf-7
  • daf-8
  • dbl-1
  • fkb-2
  • fkb-8
  • kpc-1
  • nid-1
  • pat-2
  • pat-3
  • sli-1
  • sma-4
  • unc-129
Caenorhabditis elegans
Laminin interactions
  • C05D9.3
  • CELE_Y64G10A.7
  • ina-1
  • pat-3
  • rig-5
  • ttn-1
Caenorhabditis elegans
RHOG GTPase cycle
  • C05D9.3
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y22D7AL.10
  • CELE_Y53F4B.1
  • CELE_Y71H2AM.12
  • F07F6.4
  • PLD
  • aap-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdc-42
  • cdh-4
  • ced-10
  • ced-12
  • ced-5
  • cgef-1
  • cyk-1
  • ephx-1
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gex-2
  • itsn-1
  • let-99
  • magu-1
  • max-2
  • nuo-2
  • pak-1
  • pak-2
  • pes-7
  • pld-1
  • rab-7
  • rac-1
  • rac-2
  • rga-1
  • rga-5
  • rhi-1
  • snb-1
  • toe-2
  • uig-1
  • unc-73
  • vab-1
  • vang-1
  • vav-1
Caenorhabditis elegans
Basigin interactions
  • C05D9.3
  • CELE_K03B8.6
  • CELE_T22F3.12
  • cav-1
  • cav-2
  • cyn-4
  • cyp-4
  • ina-1
  • mct-1
  • mct-2
  • mct-3
  • mct-4
  • mct-5
  • mct-6
  • mog-6
  • nkb-1
  • nkb-2
  • nkb-3
  • rig-6
  • slcf-1
  • wrk-1
  • zmp-1
  • zmp-2
  • zmp-3
  • zmp-5
  • zmp-6
Caenorhabditis elegans
RAC2 GTPase cycle
  • C05D9.3
  • CELE_F22G12.5
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y57G11C.1147
  • CELE_Y67A10A.7
  • CELE_Y71H2AM.12
  • PLD
  • aap-1
  • abi-1
  • age-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdc-42
  • cdh-4
  • ced-10
  • ced-5
  • cgef-1
  • cyk-1
  • cyk-4
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gex-2
  • gex-3
  • git-1
  • gop-3
  • kin-18
  • let-99
  • magu-1
  • max-2
  • mtx-1
  • pak-1
  • pak-2
  • pes-7
  • pld-1
  • rab-7
  • rac-1
  • rac-2
  • rga-1
  • rga-5
  • rga-8
  • rhi-1
  • snb-1
  • sulu
  • syd-1
  • tiam-1
  • toe-2
  • unc-73
  • vab-1
  • vang-1
  • vav-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
RAC3 GTPase cycle
  • C05D9.3
  • CELE_F22G12.5
  • CELE_F23H11.4
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y34B4A.4
  • CELE_Y57G11C.1147
  • aap-1
  • abi-1
  • abl-1
  • aex-4
  • cav-1
  • cav-2
  • cdc-42
  • cdh-4
  • ced-10
  • cgef-1
  • cyk-1
  • cyk-4
  • gap
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gex-2
  • gex-3
  • git-1
  • glt-1
  • glt-3
  • glt-4
  • glt-5
  • glt-6
  • glt-7
  • kin-18
  • let-99
  • magu-1
  • max-2
  • ocrl-1
  • pac-1
  • pak-1
  • pak-2
  • rab-7
  • rac-1
  • rga-1
  • rga-5
  • rga-6
  • rga-8
  • rhi-1
  • ric-4
  • snb-1
  • srgp-1
  • sulu
  • syd-1
  • tag-325
  • tag-81
  • tiam-1
  • toe-2
  • unc-112
  • unc-73
  • vab-1
  • vang-1
  • vav-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
RAC1 GTPase cycle
  • C05D9.3
  • CELE_F22G12.5
  • CELE_F23H11.4
  • CELE_F46H5.4
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y105E8A.25
  • CELE_Y57G11C.1147
  • PLD
  • aap-1
  • abi-1
  • abl-1
  • aex-4
  • age-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdc-42
  • ced-10
  • ced-5
  • cgef-1
  • chin-1
  • citk-1
  • citk-2
  • cyk-1
  • cyk-4
  • ect-2
  • ephx-1
  • fozi-1
  • frm-3
  • gap
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gei-1
  • gex-2
  • gex-3
  • git-1
  • glt-1
  • glt-3
  • glt-4
  • glt-5
  • glt-6
  • glt-7
  • gpa-12
  • hum-7
  • kin-18
  • let-341
  • let-99
  • magu-1
  • max-2
  • mrck-1
  • pac-1
  • pak-1
  • pak-2
  • par-6
  • pes-7
  • pix-1
  • pkn-1
  • pld-1
  • rab-7
  • rac-1
  • rga-1
  • rga-2
  • rga-5
  • rga-8
  • rga-9
  • rhgf-1
  • rhi-1
  • ric-4
  • rlbp-1
  • snb-1
  • sos-1
  • spv-1
  • srgp-1
  • sulu
  • syd-1
  • tag-325
  • tag-77
  • tag-81
  • tiam-1
  • toe-2
  • uig-1
  • unc-112
  • unc-73
  • vab-1
  • vang-1
  • vav-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
MET interacts with TNS proteins
  • C05D9.3
  • CELE_F11E6.8
  • CELE_T22A3.6
  • svh-2
  • svh-6
  • tag-163
  • tns-1
Caenorhabditis elegans
MET activates PTK2 signaling
  • C05D9.3
  • CELE_F11E6.8
  • CELE_T22A3.6
  • CELE_Y64G10A.7
  • ina-1
  • kin-32
  • pat-2
  • src-1
  • svh-2
Caenorhabditis elegans
VEGFA-VEGFR2 Pathway
  • C05D9.3
  • C49C3.10
  • CELE_F08H9.3
  • CELE_F08H9.4
  • CELE_F11E6.8
  • CELE_F12F6.1
  • CELE_F13B12.6
  • CELE_F21F3.2
  • CELE_F59F5.3
  • CELE_Y106G6D.4
  • CELE_Y106G6E.1
  • CELE_Y51B9A.9
  • CELE_ZK1128.7
  • aap-1
  • age-1
  • cdc-42
  • ced-10
  • ddr-2
  • gap-3
  • gska-3
  • gskl-2
  • hsp-12.1
  • hsp-12.2
  • hsp-12.3
  • hsp-12.6
  • hsp-16
  • hsp-16.1
  • hsp-16.11
  • hsp-16.2
  • hsp-16.41
  • hsp-16.48
  • hsp-16.49
  • hsp-17
  • hsp-43
  • hsp12-2
  • hsp16-1a
  • hsp16-1b
  • hsp16-2
  • hsp16-41
  • hsp16-48
  • hsp16-48a
  • hsp16-48b
  • hsp16-49
  • kin-1
  • kin-32
  • kin-36
  • let-502
  • mak-1
  • mak-2
  • max-2
  • nck-1
  • pak-1
  • pat-2
  • pat-3
  • pmk-1
  • pmk-2
  • pmk-3
  • rac-1
  • rho-1
  • rhoa
  • sip-1
  • src-1
  • svh-2
  • svh-4
  • vav-1
Caenorhabditis elegans

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024