GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 151 - 175 of 499 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
RHOD GTPase cycle
  • C14A4.8
  • C49H3.6
  • CELE_F42G2.5
  • CELE_F54H5.3
  • CELE_F58E6.5
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_T09B4.2
  • CELE_Y38F2AR.10
  • CELE_ZC196.2
  • aap-1
  • abts-1
  • add-1
  • add-2
  • atn-1
  • cap-2
  • cav-1
  • cav-2
  • cyk-1
  • cyk-4
  • efhd-1
  • esyt-2
  • gap
  • gei-18
  • golg-2
  • hpo-28
  • ifa-1
  • ifa-2
  • ifa-3
  • ifa-4
  • ifb-1
  • ifb-2
  • ifc-1
  • ifc-2
  • ifd-1
  • ifd-2
  • ifp-1
  • ile-1
  • inft-2
  • lam-1
  • let-99
  • lmn-1
  • mua-6
  • nra-1
  • osm-10
  • pac-1
  • pak-2
  • plx-1
  • plx-2
  • rab-7
  • rga-1
  • rga-5
  • rga-8
  • rho-1
  • rhoa
  • snb-1
  • tag-325
  • toe-2
  • vang-1
  • vem-1
  • vpr-1
  • vrk-1
Caenorhabditis elegans
RHOB GTPase cycle
  • C07B5.4
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y105E8A.25
  • aap-1
  • aex-4
  • ani-2
  • bar-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdh-10
  • cgef-1
  • cyk-1
  • cyk-4
  • daam-1
  • ect-2
  • ephx-1
  • gck-4
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gei-1
  • hmp-2
  • hum-7
  • inft-2
  • let-502
  • let-99
  • osg-1
  • pes-7
  • pkn-1
  • pvl-1
  • rga-1
  • rga-5
  • rhgf-1
  • rhi-1
  • rho-1
  • rhoa
  • ric-4
  • snb-1
  • spy-1
  • sto-2
  • tag-81
  • toe-2
  • unc-73
  • vang-1
  • vav-1
  • wrm-1
  • zoo-1
Caenorhabditis elegans
RHOA GTPase cycle
  • C07B5.4
  • CELE_F23H11.4
  • CELE_H40L08.1
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y105E8A.25
  • PLD
  • aap-1
  • aex-4
  • ani-2
  • bar-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdh-10
  • ced-5
  • cgef-1
  • cri-3
  • cyk-1
  • cyk-4
  • daam-1
  • ect-2
  • ephx-1
  • fozi-1
  • frm-3
  • gck-4
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gei-1
  • hmp-2
  • hum-7
  • inft-2
  • let-502
  • let-99
  • maa-1
  • osg-1
  • pes-7
  • pix-1
  • pkn-1
  • pld-1
  • pmp-2
  • pvl-1
  • rga-1
  • rga-2
  • rga-4
  • rga-5
  • rga-6
  • rga-8
  • rga-9
  • rhgf-1
  • rhgf-2
  • rhi-1
  • rho-1
  • rhoa
  • ric-4
  • sly-1
  • snb-1
  • spv-1
  • spy-1
  • srgp-1
  • sto-2
  • tag-325
  • tag-81
  • tiam-1
  • toe-2
  • uig-1
  • unc-73
  • vang-1
  • vav-1
  • wrm-1
  • zoo-1
Caenorhabditis elegans
RHO GTPases activate PKNs
  • CELE_F55C10.5
  • CELE_W04B5.5
  • cdc-25.1
  • cdc-25.2
  • cdc-25.3
  • cdc-25.4
  • ced-10
  • ftt-1
  • ftt-2
  • gsp-1
  • mel-11
  • par-5
  • pkn-1
  • rac-1
  • rho-1
  • rhoa
Caenorhabditis elegans
RHO GTPases Activate WASPs and WAVEs
  • CELE_Y55F3AM.5
  • CELE_Y57G11C.1147
  • abi-1
  • abl-1
  • act-1
  • act-2
  • act-3
  • act-4
  • arp-2
  • arx-1
  • arx-2
  • arx-3
  • arx-4
  • arx-5
  • arx-6
  • arx-7
  • cdc-42
  • ced-10
  • ddl-2
  • gex-2
  • gex-3
  • kin-32
  • mpk-1
  • nck-1
  • rac-1
  • sem-5
  • sur-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
RHO GTPases Activate Formins
  • act-1
  • act-2
  • act-3
  • act-4
  • cdc-42
  • ced-10
  • cyk-1
  • daam-1
  • dsh-1
  • dsh-2
  • fozi-1
  • inft-2
  • mig-5
  • rac-1
  • rho-1
  • rhoa
  • src-1
  • srgp-1
Caenorhabditis elegans
RET signaling
  • CELE_F09G2.1
  • CELE_Y69A2AR.31
Caenorhabditis elegans
RAF/MAP kinase cascade
  • C50C3.2/C50C3.3
  • CELE_F11E6.8
  • CELE_F14B4.1
  • CELE_F59F5.3
  • CELE_R05G6.10
  • CELE_T22A3.6
  • aap-1
  • age-1
  • ddr-2
  • egl-15
  • egl-17
  • kin-32
  • kin-36
  • kin-7
  • klo-1
  • klo-2
  • let-23
  • let-341
  • let-60
  • let-756
  • lin-34
  • mpk-1
  • ptp-3
  • pvf-1
  • pxf-1
  • ra-gef
  • rgef-1
  • rgl-1
  • rme-2
  • sem-5
  • sma-1
  • sos-1
  • spc-1
  • src-1
  • sur-1
  • svh-2
  • svh-4
  • unc-70
Caenorhabditis elegans
RAF activation
  • CELE_Y53F4B.1
  • Ras2
  • brap-2
  • ftt-1
  • ftt-2
  • gsp-1
  • ksr-1
  • let-60
  • let-92
  • lin-34
  • lin-45
  • paa-1
  • par-1
  • par-5
  • phb-1
  • pph-1
  • pptr-1
  • pptr-2
  • raf-1
  • ras-2
  • soc-2
  • sur-8
Caenorhabditis elegans
RAC3 GTPase cycle
  • C05D9.3
  • CELE_F22G12.5
  • CELE_F23H11.4
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y34B4A.4
  • CELE_Y57G11C.1147
  • aap-1
  • abi-1
  • abl-1
  • aex-4
  • cav-1
  • cav-2
  • cdc-42
  • cdh-4
  • ced-10
  • cgef-1
  • cyk-1
  • cyk-4
  • gap
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gex-2
  • gex-3
  • git-1
  • glt-1
  • glt-3
  • glt-4
  • glt-5
  • glt-6
  • glt-7
  • kin-18
  • let-99
  • magu-1
  • max-2
  • ocrl-1
  • pac-1
  • pak-1
  • pak-2
  • rab-7
  • rac-1
  • rga-1
  • rga-5
  • rga-6
  • rga-8
  • rhi-1
  • ric-4
  • snb-1
  • srgp-1
  • sulu
  • syd-1
  • tag-325
  • tag-81
  • tiam-1
  • toe-2
  • unc-112
  • unc-73
  • vab-1
  • vang-1
  • vav-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
RAC2 GTPase cycle
  • C05D9.3
  • CELE_F22G12.5
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y57G11C.1147
  • CELE_Y67A10A.7
  • CELE_Y71H2AM.12
  • PLD
  • aap-1
  • abi-1
  • age-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdc-42
  • cdh-4
  • ced-10
  • ced-5
  • cgef-1
  • cyk-1
  • cyk-4
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gex-2
  • gex-3
  • git-1
  • gop-3
  • kin-18
  • let-99
  • magu-1
  • max-2
  • mtx-1
  • pak-1
  • pak-2
  • pes-7
  • pld-1
  • rab-7
  • rac-1
  • rac-2
  • rga-1
  • rga-5
  • rga-8
  • rhi-1
  • snb-1
  • sulu
  • syd-1
  • tiam-1
  • toe-2
  • unc-73
  • vab-1
  • vang-1
  • vav-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
RAC1 GTPase cycle
  • C05D9.3
  • CELE_F22G12.5
  • CELE_F23H11.4
  • CELE_F46H5.4
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y105E8A.25
  • CELE_Y57G11C.1147
  • PLD
  • aap-1
  • abi-1
  • abl-1
  • aex-4
  • age-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdc-42
  • ced-10
  • ced-5
  • cgef-1
  • chin-1
  • citk-1
  • citk-2
  • cyk-1
  • cyk-4
  • ect-2
  • ephx-1
  • fozi-1
  • frm-3
  • gap
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gei-1
  • gex-2
  • gex-3
  • git-1
  • glt-1
  • glt-3
  • glt-4
  • glt-5
  • glt-6
  • glt-7
  • gpa-12
  • hum-7
  • kin-18
  • let-341
  • let-99
  • magu-1
  • max-2
  • mrck-1
  • pac-1
  • pak-1
  • pak-2
  • par-6
  • pes-7
  • pix-1
  • pkn-1
  • pld-1
  • rab-7
  • rac-1
  • rga-1
  • rga-2
  • rga-5
  • rga-8
  • rga-9
  • rhgf-1
  • rhi-1
  • ric-4
  • rlbp-1
  • snb-1
  • sos-1
  • spv-1
  • srgp-1
  • sulu
  • syd-1
  • tag-325
  • tag-77
  • tag-81
  • tiam-1
  • toe-2
  • uig-1
  • unc-112
  • unc-73
  • vab-1
  • vang-1
  • vav-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
RAB geranylgeranylation
  • CELE_M57.2
  • CELE_ZK669.5
  • aex-6
  • ggtb-1
  • glo-1
  • rab-1
  • rab-10
  • rab-11.1
  • rab-11.2
  • rab-14
  • rab-18
  • rab-19
  • rab-21
  • rab-3
  • rab-30
  • rab-33
  • rab-35
  • rab-37
  • rab-39
  • rab-5
  • rab-6.1
  • rab-6.2
  • rab-7
  • rab-8
  • rab27
  • rab8
  • rabr-1
  • rabr-3
  • rabr-4
  • rep-1
  • rsef-1
  • tag-312
  • unc-108
Caenorhabditis elegans
Proton/oligopeptide cotransporters
  • cpta
  • cptb
  • opt-1
  • opt-2
  • opt-3
  • pep-1
  • pep-2
  • pept-1
  • pept-2
  • pept-3
Caenorhabditis elegans
Proton-coupled monocarboxylate transport
  • mct-1
  • mct-2
  • mct-3
  • mct-4
  • mct-5
  • mct-6
  • rig-6
  • slcf-1
Caenorhabditis elegans
Protein methylation
  • C37A2.6
  • C42C1.13
  • CELE_F23C8.5
  • CELE_F29B9.1
  • M142.8
  • cdc-48.2
  • eft-3
  • eft-4
Caenorhabditis elegans
Prostanoid ligand receptors
  • C06G4.5
  • npr-16
  • npr-18
  • npr-23
  • npr-24
  • npr-26
  • npr-28
Caenorhabditis elegans
Progressive trimming of alpha-1,2-linked mannose residues from Man9/8/7GlcNAc2 to produce Man5GlcNAc2
  • C52E4.5
  • mans-1
Caenorhabditis elegans
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA
  • CELE_Y57G11A.5
  • CELE_ZK616.1
  • R05D3.8
  • ama-1
  • cbp-20
  • cbp-80
  • cey-1
  • cey-2
  • cey-3
  • cey-4
  • cfim-1
  • cfim-2
  • clpf-1
  • cpf-1
  • cpf-2
  • cpsf-1
  • cpsf-2
  • cpsf-3
  • cpsf-4
  • fipp-1
  • fust-1
  • gtf-2F1
  • gtf-2F2
  • gtf-2f1
  • gtf-2f2
  • hrp-1
  • hrp-2
  • hrpf-1
  • hrpf-2
  • hrpk-1
  • hrpl-1
  • hrpr-1
  • hrpu-1
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • pabp-2
  • pap-1
  • pcf-11
  • pes-4
  • pfs-2
  • ptb-1
  • rbm-5
  • rbp-1
  • rpb-1
  • rpb-10
  • rpb-11
  • rpb-12
  • rpb-2
  • rpb-3
  • rpb-4
  • rpb-5
  • rpb-6
  • rpb-7
  • rpb-8
  • rpb-9
  • rsp-2
  • rsp-3
  • rsp-4
  • rsp-6
  • rsp-7
  • rsp-8
  • sqd-1
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-4
  • suf-1
  • symk-1
  • tofu-2
Caenorhabditis elegans
Presynaptic depolarization and calcium channel opening
  • STG-1
  • ccb-1
  • ccb-2
  • stg-1
  • stg-2
  • unc-2
  • unc-36
  • unc-72
Caenorhabditis elegans
Prednisone ADME
  • C01G5.5
  • C07D8.6
  • C28G1.2
  • C56G3.2
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_F53F1.2
  • CELE_F53F1.3
  • CELE_K07C5.2
  • CELE_Y39G8B.1
  • CELE_Y39G8B.2
  • CELE_ZC443.1
  • exc-15
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-3
  • srp-6
  • srp-7
  • srp-8
  • ugt-57
Caenorhabditis elegans
Pre-NOTCH Processing in Golgi
  • CELE_F55H12.3
  • CELE_R08E3.1
  • lin-12
  • sel-9
Caenorhabditis elegans
Postmitotic nuclear pore complex (NPC) reformation
  • CeSec13R
  • npp-10
  • npp-15
  • npp-18
  • npp-2
  • npp-20
  • npp-23
  • npp-5
  • npp-6
  • nup133
  • ran-1
  • ran-2
  • ran-3
  • sec-13
  • smo-1
  • smt3
  • srap-1
  • sumo
  • ubc-9
Caenorhabditis elegans
Post-translational protein phosphorylation
  • B0524.2
  • C16E9.1
  • C18E9.7
  • C28G1.2
  • CELE_D1054.1
  • CELE_F07F6.7
  • CELE_F07F6.8
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_F47B7.2
  • CELE_M04D5.1
  • CELE_W01A8.8
  • CELE_Y64G10A.7
  • CELE_ZK1307.8
  • W03G11.3
  • Y71H2AM.10
  • anoh-2
  • apl-1
  • atgl-1
  • calu-1
  • cet-1
  • cpi-2
  • daf-7
  • dbl-1
  • dnj-7
  • egl-17
  • enpl-1
  • famk-1
  • lec-2
  • nid-1
  • nucb-1
  • ost-1
  • pdi-1
  • pdi-2
  • pdi-6
  • sdn-1
  • sparc
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-3
  • srp-6
  • srp-7
  • srp-8
  • sup-17
  • tag-225
  • tag-320
  • timp-1
  • unc-129
Caenorhabditis elegans
Platelet homeostasis
  • paf-1
  • paf-2
Caenorhabditis elegans

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024