GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 76 - 100 of 252 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
HS-GAG biosynthesis
  • 2-OST
  • 2OST
  • 3-OST-6
  • 3OST6
  • Gpc2
  • Gpc5a
  • Gpc6a
  • HS2st
  • HS2st1
  • HS3st2
  • HS3st3X
  • HS3st3Z
  • HS3st6
  • SDC4
  • cb440
  • chunp6920
  • ext1b
  • ext2
  • fc14g07
  • fc47a08
  • fe05f10
  • fj47c03
  • gal3st4
  • gpc1
  • gpc2
  • gpc3
  • gpc4
  • gpc4/6
  • gpc5
  • gpc5a
  • gpc6
  • gpc6a
  • gpc6l
  • hs2st1
  • hs2st1a
  • hs3st2
  • hs3st3b1a
  • hs3st3b1b
  • hs3st3l
  • hs6st
  • hs6st1
  • hs6st1a
  • hs6st2
  • hs6st3b
  • im:6970974
  • im:7147474
  • kny
  • knypek
  • ndst1
  • ndst1b
  • ndst2b
  • sdc2
  • sdc4
  • sdc4l
  • si:ch1073-86a3.1
  • wu:fc14g07
  • wu:fc47a08
  • wu:fc47g09
  • wu:fe05f10
  • wu:fj47c03
  • zgc:103676
  • zgc:152967
  • zgc:158230
  • zgc:194854
Danio rerio (zebrafish)
FGFR4 ligand binding and activation
  • dob
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf23
  • fgf4
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr4
  • id:ibd5158
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
Crosslinking of collagen fibrils
  • bmp1a
  • lox
  • loxa
  • loxl1
  • loxl2b
  • loxl3b
  • mfn
  • si:ch211-238c15.1
  • tld
  • tll1
  • tolloid
  • zgc:77447
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol
  • fa11a08
  • fb73f10
  • fc83f12
  • fd16b10
  • fj46f04
  • fk90e11
  • inppl1a
  • itpk1b
  • plcd1a
  • plcd3a
  • plcg1
  • pten
  • ptenb
  • ship2a
  • si:bz1g13.4
  • wu:fa11a08
  • wu:fb73f10
  • wu:fc83f12
  • wu:fd16b10
  • wu:fj46f04
  • wu:fj57a05
  • wu:fk90e11
  • zgc:165641
Danio rerio (zebrafish)
Chondroitin sulfate biosynthesis
  • DC
  • bcan
  • bgn
  • bgna
  • chst11
  • chst12b.2
  • chst15
  • chst3b
  • chsy1
  • chys1
  • cspg2b
  • dcan
  • dcn
  • decorin
  • fb99b07
  • fi32a12
  • ncanb
  • si:dkey-26i13.3
  • vcanb
  • wu:fb99b07
  • wu:fc27h05
  • wu:fc27h06
  • wu:fi32a12
  • zgc:64191
  • zgc:91989
Danio rerio (zebrafish)
Electric Transmission Across Gap Junctions
  • PANX
  • connexin35
  • cx35
  • cx35b
  • cx52.7
  • gja10a
  • gja9
  • gjd2b
  • panx1
  • panx1a
  • panx2
  • si:ch211-192n14.2
  • zgc:194445
  • zgc:194451
  • zgc:55631
Danio rerio (zebrafish)
Peptide ligand-binding receptors
  • ACTH
  • DOR2
  • EDN3
  • EDN3a
  • Ednra2
  • MSH
  • NPYRYC
  • Npy1r
  • PPSS1
  • PPSS3
  • SI:bZ36D5.1
  • SI:bZ36D5.4
  • SS1
  • SS2
  • agt
  • agtr1b
  • agtr2
  • agtrl1
  • agtrl1a
  • agtrl1b
  • apln
  • aplnr2
  • aplnr3
  • aplnra
  • aplnrb
  • cort
  • ece1
  • edn1
  • edn3
  • edn3b
  • ednr-a
  • ednra
  • ednraa
  • ednrb1
  • ednrb1a
  • ednrba
  • et-1
  • fb12g05
  • fb14d01
  • fd11b07
  • fd57e04
  • gal
  • galn
  • galr2a
  • gper1
  • grn
  • im:7160079
  • kiss1
  • kiss1rb
  • mc1r
  • mc2r
  • mc3r
  • mc4r
  • mc5br
  • mc5ra
  • mc5rb
  • npy
  • npy1r
  • npy4r
  • npy8ar
  • npy8br
  • npyrya
  • npyryb
  • npyryc
  • nts
  • ntsr1
  • oprd1b
  • or4
  • penk
  • penkb
  • pomc
  • pomca
  • ppg
  • prok1
  • prok2
  • prokr1a
  • prokr1b
  • prokr1l
  • pyy
  • pyya
  • sb:eu249
  • si:bz36d5.2
  • si:ch211-157p22.8
  • si:ch211-202p1.5
  • si:ch211-44l19.2
  • si:dkey-211h10.1
  • si:dkey-253i9.3
  • sst1
  • sst1.1
  • sst3
  • sst7
  • sstr1b
  • sstr5
  • wu:fb12g05
  • wu:fb14d01
  • wu:fb62f06
  • wu:fb75g12
  • wu:fd11b07
  • wu:fd57e04
  • wu:fj87b02
  • zMC5b
  • zgc:111892
  • zgc:113016
  • zgc:153708
  • zgc:154079
  • zgc:194217
  • zgc:194235
  • zgc:194624
  • zgc:194648
  • zgc:194694
  • zgc:194705
  • zgc:195074
  • zgc:195090
  • zgc:92779
  • zya
  • zyb
Danio rerio (zebrafish)
mTORC1-mediated signalling
  • RRAGB
  • S6K1
  • eif4ea
  • eif4ebp1
  • fc04h09
  • fc51h01
  • fkbp1b
  • frap1
  • gbl
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • mapksp1
  • mlst8
  • mtor
  • rheb
  • rps6
  • rps6kb1
  • rps6kb1b
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • si:dkey-176g4.2
  • si:dkeyp-115a10.1
  • slc38a9
  • tor
  • wu:fa92e06
  • wu:fb64g06
  • wu:fc04h09
  • wu:fc22h08
  • wu:fc51h01
  • wu:fc68h09
  • ywhab
  • ywhab2
  • ywhabb
  • zgc:111971
  • zgc:55713
  • zgc:56499
  • zgc:73144
  • zgc:73381
Danio rerio (zebrafish)
TP53 Regulates Metabolic Genes
  • COX4I1
  • D244
  • PGI
  • RRAGB
  • TXN
  • cb116
  • cb58
  • coi
  • coii
  • coiii
  • cox1
  • cox11
  • cox16
  • cox19
  • cox2
  • cox20
  • cox3
  • cox4i1
  • cox5a
  • cox5aa
  • cox5ba
  • cox6a1
  • cox6b1
  • cox7a2l
  • cox7a3
  • cox7b
  • cox7c
  • coxi
  • coxii
  • coxiii
  • cyc
  • ddit4
  • fa92g05
  • fam36a
  • fb15h09
  • fb93e02
  • fe38c12
  • fk47c09
  • frap1
  • gbl
  • glsl
  • gpi
  • gpib
  • hm:zeh0438
  • hm:zehl0637
  • hm:zehn0976
  • im:6898613
  • im:6904550
  • im:7154392
  • lamtor2
  • lamtor3
  • lamtor4
  • lamtor5
  • lst8
  • mapksp1
  • mg:bb02d03
  • mlst8
  • mt-co1
  • mt-co2
  • mt-co3
  • mtco1
  • mtco2
  • mtco3
  • mtor
  • ndufa4
  • ndufa4a
  • ndufa4l
  • ns:zf-e250
  • pgi-2
  • prdx1
  • prdx2
  • prdx5
  • prkaa1
  • prkab1a
  • prkag1
  • rheb
  • rptor
  • rraga
  • rragc
  • rragca
  • sb:cb130
  • sco2
  • sesn2
  • si:dkey-161j23.2
  • si:dkey-176g4.2
  • si:dkey-222f2.8
  • slc38a9
  • surf1
  • tigara
  • tor
  • txn
  • wu:fa91b01
  • wu:fa92g05
  • wu:fa94c10
  • wu:fa94d09
  • wu:fb02e12
  • wu:fb15h09
  • wu:fb33b01
  • wu:fb36f06
  • wu:fb48f06
  • wu:fb51h04
  • wu:fb93e02
  • wu:fc22h08
  • wu:fc68h09
  • wu:fd12h04
  • wu:fe38c12
  • wu:fi22e10
  • wu:fj32b09
  • wu:fj35d07
  • wu:fj49c05
  • wu:fj56d06
  • wu:fk47c09
  • wu:fk86h02
  • wu:fp89f04
  • wu:fq19b09
  • ywhab
  • ywhab2
  • ywhabb
  • ywhabl
  • ywhae
  • ywhae1
  • ywhag
  • ywhag2
  • ywhah
  • ywhaq
  • ywhaq1
  • ywhaq2
  • ywhaqa
  • ywhaqb
  • ywhaz
  • zeh0438
  • zgc:103782
  • zgc:109989
  • zgc:110058
  • zgc:110300
  • zgc:110343
  • zgc:111971
  • zgc:112318
  • zgc:114165
  • zgc:158646
  • zgc:162286
  • zgc:55377
  • zgc:55499
  • zgc:56499
  • zgc:56564
  • zgc:63883
  • zgc:63896
  • zgc:66312
  • zgc:73065
  • zgc:73144
  • zgc:73316
  • zgc:77062
  • zgc:77351
  • zgc:92228
  • zgc:92631
  • zgc:92891
  • zgc:92903
Danio rerio (zebrafish)
Sema3A PAK dependent Axon repulsion
  • cb422
  • cb820
  • fynb
  • hsp90a.2
  • hsp90a2
  • hsp90aa1.2
  • hsp90ab1
  • hsp90b
  • hspc3
  • kinase
  • limk1
  • limk1a
  • np-1
  • nrp1
  • nrp1a
  • pak2
  • pak2a
  • plxna1
  • plxna1b
  • plxna2
  • plxna3
  • plxna4
  • rac1
  • rac1a
  • sema3ab
  • semaz1b
  • si:dz198m22.1
  • wu:fb71h01
  • wu:fd16e02
  • zgc:55823
  • zgc:55917
  • zgc:86934
  • zgc:91798
Danio rerio (zebrafish)
Metabolism of folate and pterines
  • aldh1l1
  • cb595
  • dhfr
  • fa92h12
  • fk48e08
  • fk51d09
  • folr
  • fpgs
  • im:7144504
  • mthfd1a
  • mthfd1l
  • mthfd2
  • mthfr
  • mthfs
  • pcft
  • shmt1
  • shmt2
  • si:dkey-25e12.5
  • si:dkey-25e12.6
  • si:dkeyp-100a1.4
  • slc19a1
  • slc25a32b
  • slc46a1
  • wu:fa92h12
  • wu:fb38b11
  • wu:fe12e11
  • wu:fk48e08
  • wu:fk49h03
  • wu:fk51d09
  • zgc:110786
  • zgc:63807
  • zgc:66171
  • zgc:77524
  • zgc:86637
  • zgc:91891
Danio rerio (zebrafish)
VxPx cargo-targeting to cilium
  • arf4a
  • pkd2
  • rab11a
  • rab11fip3
  • rab3ip
  • rab8
  • rab8a
  • rho
  • wu:fi15h09
  • zfo2
  • zgc:101030
  • zgc:103679
  • zgc:110270
  • zgc:162699
  • zgc:174360
Danio rerio (zebrafish)
Elevation of cytosolic Ca2+ levels
  • P2X.514
  • P2X3
  • bZ1P14.9
  • fb99b08
  • p2rx1
  • p2rx2
  • p2rx3
  • p2rx3a
  • p2rx5
  • p2rx7
  • p2rx8
  • p2x3
  • p2x5
  • p2xr1
  • p2xr2
  • p2xr514
  • p2xr7
  • si:rp71-1p14.9
  • trpc6
  • trpc6a
  • trpc7b
  • wu:fb99b08
  • zP2X3
  • zfP2X3
Danio rerio (zebrafish)
Termination of O-glycan biosynthesis
  • heg
  • im:7151092
  • siat4
  • siat4c
  • siat7D
  • siat7c
  • st3gal1l
  • st3gal2l
  • st3gal4
  • st3gal8
  • st6GalNAc III
  • st6GalNAc-III
  • st6galnac3
  • st6galnac4
  • wu:fb67c12
  • zgc:111788
  • zgc:153237
  • zgc:158162
  • zgc:73301
Danio rerio (zebrafish)
Adrenoceptors
  • adra1bb
  • adra2a
  • adra2b
  • adra2c
  • adrb1
  • adrb2b
  • zgc:103685
  • zgc:162188
  • zgc:194728
  • zgc:194731
Danio rerio (zebrafish)
Amine ligand-binding receptors
  • si:ch211-119b12.1
  • si:ch211-119b12.3
  • si:dkey-7c18.1
  • si:dkey-7c18.17
  • si:dkey-7c18.19
  • si:dkey-7c18.20
  • si:dkey-7c18.21
  • si:dkey-7c18.7
  • si:dkey-7c18.9
  • ta66
  • taar10a
  • taar12b
  • taar12e
  • taar12f
  • taar12g
  • taar13c
  • taar13e
  • taar14e
  • taar14f
  • taar15
  • taar66
  • taar69
  • taar72
  • zgc:194718
Danio rerio (zebrafish)
Adherens junctions interactions
  • E-cad
  • R-cadherin
  • cadm1b
  • cb903
  • cdh1
  • cdh10
  • cdh10a
  • cdh11
  • cdh17
  • cdh2
  • cdh4
  • cdh5
  • cdh6
  • cdhvn
  • fb65d02
  • nectin1b
  • nectin3
  • pac
  • pvrl1b
  • pvrl3l
  • rcad
  • rnasel2
  • rnasel3
  • rnasel4
  • sc:d0664
  • si:ch211-139g14.6
  • vnc
  • wu:fb65d02
  • zgc:103673
  • zgc:136316
Danio rerio (zebrafish)
RHO GTPases Activate Rhotekin and Rhophilins
  • rhoac
  • rhpn2
Danio rerio (zebrafish)
FRS-mediated FGFR2 signaling
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf16
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf18
  • fgf18a
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf7
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr2
  • fj59e07
  • frs3
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
Keratan sulfate biosynthesis
  • B3GNT1
  • CH1073-177A15.1
  • Lum
  • b3gnt1
  • b3gnt2b
  • b3gnt3
  • b3gnt3.4
  • b3gnt7
  • b4galt1l
  • b4galt2
  • b4galt4
  • b4galt5
  • b4galt6
  • b4gat1
  • cb543
  • chst1
  • fk70b01
  • fmoda
  • im:6910494
  • im:7151092
  • kera
  • lum
  • ogn
  • ogna
  • si:ch211-103f16.4
  • si:ch211-261p7.4
  • siat4
  • siat4c
  • ssp1
  • ssp5
  • st3gal1l
  • st3gal2l
  • st3gal4
  • st3gal8
  • wu:fa55h04
  • wu:fc39c01
  • wu:fk30b12
  • wu:fk70b01
  • zgc:101780
  • zgc:111788
  • zgc:113456
  • zgc:113545
  • zgc:113947
  • zgc:154116
  • zgc:158162
  • zgc:55730
  • zgc:86661
Danio rerio (zebrafish)
Acyl chain remodelling of PG
  • aytl2
  • cpla2
  • crls1
  • fc21c12
  • fj66b10
  • lpcat1
  • lpgat1
  • pla2g10
  • pla2g12a
  • pla2g3
  • pla2g4
  • pla2g4a
  • si:dkey-30h14.2
  • wu:fc21c12
  • wu:fj66b10
  • zgc:112278
  • zgc:162119
  • zgc:85909
Danio rerio (zebrafish)
NGF processing
  • PCSK5
  • furin
  • furina
  • ngf
  • ngfb
  • pcsk5
  • pcsk5b
  • si:dkey-281a24.5
  • zgc:165659
Danio rerio (zebrafish)
SHC-mediated cascade:FGFR1
  • dob
  • fb18e12
  • fc89b01
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf-8
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf17
  • fgf17b
  • fgf2
  • fgf20a
  • fgf22
  • fgf23
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf5
  • fgf6b
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgfr1
  • fgfr1a
  • fj59e07
  • grb2
  • grb2a
  • grb2b
  • hrasb
  • hrasl
  • id:ibd5158
  • kl
  • nras
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • sos1
  • wu:fb05c08
  • wu:fb18e12
  • wu:fb34e06
  • wu:fc89b01
  • wu:fd11d03
  • wu:fj59e07
  • zgc:103549
  • zgc:109774
  • zgc:110734
  • zgc:158274
  • zgc:194535
  • zgc:73077
Danio rerio (zebrafish)
FGFR2b ligand binding and activation
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-3
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf10a
  • fgf22
  • fgf3
  • fgf7
  • fgfr2
  • si:dkey-21e2.2
  • si:dkeyp-74c5.3
  • wu:fd11d03
  • zgc:109774
Danio rerio (zebrafish)
Signaling by ALK
  • alk
  • alkal1
  • alkal2b
  • cb518
  • fb79b05
  • fj33b02
  • fj46f04
  • fj48a12
  • mdk
  • mdk2
  • mdkb
  • pik3ca
  • pik3cb
  • pik3r1
  • pik3r2
  • plcg1
  • plei2
  • ptn
  • wu:fb65b05
  • wu:fb79b05
  • wu:fj33b02
  • wu:fj46f04
  • wu:fj48a12
  • wu:fj57a05
  • zHBNF
  • zgc:111787
Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024