GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 126 - 150 of 252 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Glycerophospholipid catabolism
  • enpp6
  • gde1
  • zgc:56068
  • zgc:77135
Danio rerio (zebrafish)
Neutrophil degranulation
  • ARHG
  • Actr1b
  • BIN2
  • C3-1
  • C3-2
  • CH73-203I15.1
  • CH73-211L2.2
  • CHIA
  • COTL1
  • CTSB
  • Capn1
  • DMT1
  • Drgal3
  • Gdi3
  • HMGB1
  • HSP70
  • IQGAP1
  • Ku70
  • LOC100329375
  • LOC110438871
  • LOC555483
  • LOC560210
  • LOC561073
  • LOC565099
  • LOC798290
  • MGC173646
  • MGC174082
  • MIF
  • NDPK-Z2
  • NM23-Z2
  • OTTDARP00000001844
  • OTTDARP00000002003
  • PGI
  • PGRP-SC1a
  • PSMA5
  • Ppgb
  • Psma2
  • R-PTP-beta
  • SI:dZ118J2.7
  • SI:dZ118J2.9
  • Snap
  • Tubb5
  • UBA*01
  • ZFMMP-9
  • abp1
  • acaa1
  • acly
  • aclya
  • acp2
  • actr1
  • actr10
  • actr1b
  • actr2
  • actr2a
  • actr2b
  • ada2a
  • adam8
  • adam8a
  • aga
  • agpat2
  • ahsg
  • ahsg1
  • alad
  • aldh3b1
  • aldh3d1
  • aldoa
  • aldoaa
  • aldoc
  • aldocb
  • alox5b.2
  • alox5b.3
  • ampd3
  • ampd3b
  • anpep
  • anpepb
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  • anx2a
  • anxa2
  • anxa2a
  • aoc1
  • apaf1
  • aprt
  • armc8
  • arp2a
  • arp2b
  • arpc5b
  • asah1b
  • asc
  • asc1
  • atad3
  • atad3b
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  • b2m
  • b4galt1l
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  • bin2l
  • c1s.2
  • c3a.2
  • c3b
  • cab39
  • cand1
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  • cap1
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  • cat
  • catD
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  • cyb5r3
  • cyba
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  • cyfip1
  • cystatin
  • cystm1
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Danio rerio (zebrafish)
VEGFA-VEGFR2 Pathway
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Danio rerio (zebrafish)
ESR-mediated signaling
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Danio rerio (zebrafish)
Keratinization
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  • zfCKII
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Danio rerio (zebrafish)
Miscellaneous transport and binding events
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  • ankhb
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Danio rerio (zebrafish)
Vitamin B2 (riboflavin) metabolism
  • TRAP
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  • acp5a
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Danio rerio (zebrafish)
PCP/CE pathway
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  • daam1l
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  • rac3b
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  • wnt1
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Danio rerio (zebrafish)
TGF-beta receptor signaling in EMT (epithelial to mesenchymal transition)
  • JAM
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  • arhgef18
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  • asip
  • bazooka
  • cb537
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  • f11r
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  • par3
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  • rhoac
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  • tgfbr2b
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Danio rerio (zebrafish)
Collagen chain trimerization
  • alpha2(I)
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  • col2a1a
  • coll2a1
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  • zehn2357
  • zgc:55285
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Danio rerio (zebrafish)
PI3K/AKT activation
  • rhoac
Danio rerio (zebrafish)
PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
  • ARHG
  • EGFR12
  • EGFR15
  • ERK1
  • ER[b]2
  • ER[b]a
  • LOC560360
  • NRG2b
  • akt3b
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  • dob
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  • kita
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  • mapk1
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Danio rerio (zebrafish)
Signaling by LTK
  • alkal1
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  • ltk
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  • wu:fb65b05
Danio rerio (zebrafish)
RHO GTPases Activate Formins
  • actba
  • actbb
  • bact
  • bactin1
  • bactin2
  • bactzf
  • daam1b
  • daam1l
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  • hm:zeh0341
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  • rac1a
  • rhoac
  • sb:cb813
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  • srgap2
  • wu:fa91a03
  • wu:fb01g08
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  • wu:fp54a02
  • zgc:55372
  • zgc:55823
  • zgc:55917
  • zgc:86790
  • zgc:86934
Danio rerio (zebrafish)
Cell surface interactions at the vascular wall
  • ESAM
  • Iclp-1
  • JAM
  • MIF
  • SCN2B
  • cb810
  • cd74a
  • ceacam1
  • cxadr
  • epcam
  • esam
  • esama
  • f11r
  • f11r.1
  • hm:zeh0068
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  • itgb1b.1
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  • jam3b
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  • jamc
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  • selp
  • selplg
  • si:ch211-260g14.4
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  • wu:fk94e07
  • zeh0068
  • zgc:103642
  • zgc:110304
  • zgc:77119
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Danio rerio (zebrafish)
Condensation of Prophase Chromosomes
  • LOC100150038
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  • SMC2L1
  • cb267
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  • zeh1628
  • zgc:112234
  • zgc:154147
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  • zgc:55326
  • zgc:55549
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Danio rerio (zebrafish)
Ovarian tumor domain proteases
  • cdc48
  • drp53
  • esr
  • esr1
  • fa11a08
  • fb17f04
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  • fc83f12
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  • fk90e11
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  • otub1a
  • otub1l
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  • pten
  • ptenb
  • rhoac
  • rnf128
  • rnf128a
  • si:bz1g13.4
  • tp53
  • traf3
  • traf6
  • ube2d1
  • ube2d1b
  • vcp
  • wu:fa11a08
  • wu:fb17f04
  • wu:fb57h05
  • wu:fb73f10
  • wu:fc16h06
  • wu:fc83f12
  • wu:fd16b10
  • wu:fk90e11
  • yod1
  • zgc:73096
  • zgc:77843
  • zgc:85911
  • zgc:92367
  • zgc:92685
  • zranb1
  • zranb1b
Danio rerio (zebrafish)
Disassembly of the destruction complex and recruitment of AXIN to the membrane
  • CAV1
  • LRP6
  • ZG06
  • Zfz8b
  • Zwnt[a]
  • axin
  • axin1
  • cav1
  • cb383
  • dvl2
  • fz10
  • fz2
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  • fzd1
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  • fzd8c
  • ik:tdsubc_1e1
  • int-1
  • lrp5
  • lrp6
  • sb:eu471
  • wnt-1
  • wnt-8
  • wnt-8b
  • wnt1
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  • wnt3 l
  • wnt3a
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  • wnt8
  • wnt8a
  • wnt8b
  • wnt[a]
  • wu:fb70g09
  • wu:fc05d12
  • wu:fc07c04
  • wu:fd02c05
  • wu:fo71e09
  • wu:fp54a02
  • xx:tdsubc_1e1
  • zfz2
  • zfzA
  • zg02
  • zg03
  • zg05
  • zg08
  • zg10
  • zgc:194774
  • zgc:55372
Danio rerio (zebrafish)
FGFR1c ligand binding and activation
  • GIPC
  • TIP-2
  • anos1a
  • anos1b
  • anosmin-1a
  • anosmin-1b
  • dob
  • fc89b01
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  • fgf1
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  • fgfr1
  • fgfr1a
  • gipc1
  • id:ibd5158
  • kal1.1
  • kal1.2
  • kal1a
  • kal1b
  • rgs19ip1
  • si:ch73-18k18.1
  • tgfbr3
  • wu:fb05c08
  • wu:fc89b01
  • wu:fl91z45
  • zgc:194535
Danio rerio (zebrafish)
LDL clearance
  • LOC565099
  • cbe
  • ces2
  • ces2a
  • im:6908784
  • ldlr
  • ldlra
  • nceh1a
  • npc2
  • npc2.2
  • si:dkey-21p1.4
  • si:dkey-38l12.2
  • soat1
  • zgc:153863
  • zgc:193713
  • zgc:193725
  • zgc:92416
Danio rerio (zebrafish)
Macroautophagy
  • Atg12
  • GABARAPL2
  • KM0005
  • MAP1-LC3A
  • MAP1-LC3B
  • MAP1-LC3C
  • Map1lc3
  • RRAGB
  • ambra1b
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  • atg4cl
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  • chmp2a
  • chmp2ba
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  • chmp6
  • chmp6l
  • chmp7
  • dlc-1
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  • frap1
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  • gabarapa
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  • gbl
  • im:7153729
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  • lst8
  • map1lc3a
  • map1lc3b
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  • mg:bb02b03
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  • rptor
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  • rragc
  • rragca
  • sb:cb130
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  • zgc:100934
  • zgc:110812
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  • zgc:77094
  • zgc:86888
  • zgc:92228
  • zgc:92319
Danio rerio (zebrafish)
Synthesis of 5-eicosatetraenoic acids
  • fk84f07
  • pon1
  • pon2
  • wu:fk84f07
  • zgc:77556
  • zgc:91887
Danio rerio (zebrafish)
Digestion
  • alp3
  • alpi
  • alpi.1
  • alpi.2
  • fb68b10
  • im:7149588
  • si:ch211-262h13.1
  • si:ch211-262h13.2
  • wu:fa95f04
  • wu:fb68b10
  • zgc:110409
  • zgc:110794
Danio rerio (zebrafish)
Trafficking and processing of endosomal TLR
  • UNC93B1
  • lrrc33
  • nrros
  • unc93b1
Danio rerio (zebrafish)
Apoptotic cleavage of cell adhesion proteins
  • E-cad
  • casp3
  • casp3a
  • cdh1
  • ctnnb1
  • dsg2
  • dsg2.1
  • dsga
  • dspa
  • ocln
  • oclna
  • wu:fd23h10
  • wu:fi13c01
  • zgc:100890
  • zgc:113992
  • zgc:56359
Danio rerio (zebrafish)

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Last updated: August 19, 2024