GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 676 - 700 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Nicotinate metabolism
  • Bst1
  • Cd38
  • Mnadk
  • Nadk
  • Nadk2
  • Nadkd1
  • Nadsyn1
  • Nmnat1
  • Nmnat2
  • Nmnat3
  • Nmrk1
  • Nrk1
  • Nt5
  • Nt5e
  • Nte
  • Qns1
  • Qprt
Rattus norvegicus (Norway rat)
HDL clearance
  • Amn
  • Apoa1
  • Cubn
  • Hbp
  • Hdlbp
  • Ifcr
  • Scarb1
Rattus norvegicus (Norway rat)
SUMOylation of DNA replication proteins
  • Aaas
  • Aik2
  • Aim1
  • Airk2
  • Ark2
  • Aurkb
  • Birc5
  • Cdca8
  • Gp210
  • Incenp
  • LOC683983
  • Mrnp41
  • Ndc1
  • Npap60
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup153
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup210
  • Nup214
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup42
  • Nup43
  • Nup50
  • Nup53
  • Nup54
  • Nup58
  • Nup62
  • Nup84
  • Nup85
  • Nup88
  • Nup93
  • Nup98
  • Nupl1
  • Nupl2
  • Pcna
  • Pcnt1
  • Pias3
  • Pias4
  • Pom121
  • Pom210
  • Rae1
  • Ranbp2
  • Rangap1
  • Smt3a
  • Smt3h2
  • Stk1
  • Stk12
  • Stk5
  • Sumo1
  • Sumo2
  • Sumo3
  • Tmem48
  • Top-2
  • Top1
  • Top2
  • Top2a
  • Top2b
  • Tpr
  • Ubce9
  • Ube2i
Rattus norvegicus (Norway rat)
Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins
  • Aqp1
  • Aqp2
  • Aqp3
  • Aqp4
  • Avp
  • Avpr2
  • Chip28
  • Gnas
  • Gnas1
  • Gnb1
  • Gnb2
  • Gnb3
  • Gnb4
  • Gnb5
  • Gng10-ps1
  • Gng11
  • Gng12
  • Gng3
  • Gng4
  • Gng5
  • Gng5-ps4
  • Gng7
  • Gng8
  • Gng9
  • Gngt1
  • Gngt11
  • Gngt5
  • Gngt7
  • Gngt9
  • Myo5b
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Prkar1a
  • Prkar1b
  • Prkar2a
  • Prkar2b
  • Rab11
  • Rab11a
  • Rab11fip2
Rattus norvegicus (Norway rat)
HCN channels
  • Hcn1
  • Hcn2
  • Hcn3
  • Hcn4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Axonal growth inhibition (RHOA activation)
  • Arha
  • Arha2
  • Arhgdia
  • Lingo1
  • Mag
  • Mcf2
  • Ngfr
  • Nogo
  • Omg
  • Rhoa
  • Rtn4
  • Tnfrsf16
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of very long-chain fatty acyl-CoAs
  • Acs1
  • Acs2
  • Acs3
  • Acs4
  • Acs5
  • Acsbg1
  • Acsbg2
  • Acsf3
  • Acsl1
  • Acsl2
  • Acsl3
  • Acsl4
  • Acsl5
  • Acsl6
  • ELOVL1
  • ELOVL3
  • Edh17b3
  • Elovl1
  • Elovl2
  • Elovl3
  • Elovl5
  • Elovl6
  • Elovl7
  • Face
  • Facl2
  • Facl3
  • Facl4
  • Facl5
  • Facl6
  • Gpsn2
  • Grlacs
  • Hacd1
  • Hacd3
  • Hacd4
  • Hsd17b12
  • Hsd17b3
  • LOC100365676
  • Lce
  • Ssc2
  • Tecr
  • Tecrl
Rattus norvegicus (Norway rat)
Clearance of dopamine
  • Maoa
  • Slc6a3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Signaling by Hippo
  • Amot
  • Amotl1
  • Amotl2
  • Casp3
  • Cpp32
  • Dvl2
  • LOC100361515
  • Lats1
  • Lats2
  • Mob1a
  • Mob1b
  • Mobk1b
  • Mobkl1b
  • Mst2
  • Nphp4
  • Sav1
  • Stk3
  • Stk4
  • Tjp1
  • Tjp2
  • Ww45
  • Wwc1
  • Wwtr1
  • Yap
  • Yap1
  • Yap65
  • Ywhab
  • Ywhae
Rattus norvegicus (Norway rat)
Formation of annular gap junctions
  • Ap2m1
  • Clta
  • Cltb
  • Cltc
  • Cxn-43
  • Dab2
  • Dnm
  • Dnm1
  • Dnm2
  • Doc2
  • Dyn2
  • Gja1
Rattus norvegicus (Norway rat)
GABA synthesis, release, reuptake and degradation
  • Cplx1
  • Dnajc5
  • Gad1
  • Gad2
  • Gad65
  • Gad67
  • Hsc70
  • Hsc73
  • Hspa8
  • Rab3a
  • Rim1
  • Rims1
  • Sap
  • Slc32a1
  • Snap
  • Snap25
  • Stx1a
  • Stxbp1
  • Syb2
  • Syt1
  • Unc18a
  • Vamp2
  • Vgat
  • Viaat
Rattus norvegicus (Norway rat)
Telomere Extension By Telomerase
  • Acd
  • Ankrd28
  • Ccna1
  • Ccna2
  • Cdk2
  • Cdkn2
  • Dkc1
  • Gar1
  • LOC100360065
  • Nap57
  • Nola1
  • Nop10
  • Pif1
  • Pot1
  • Ppp6c
  • Ppp6r3
  • Ppp6r3-ps1
  • Ppv
  • Rap1
  • Rtel1
  • Saps3-ps1
  • Shq1
  • Tcab1
  • Terf2
  • Terf2ip
  • Tert
  • Wdr79
  • Wrap53
Rattus norvegicus (Norway rat)
APC/C:Cdh1 mediated degradation of Cdc20 and other APC/C:Cdh1 targeted proteins in late mitosis/early G1
  • Aik
  • Aik2
  • Aim1
  • Airk1
  • Airk2
  • Anapc1
  • Anapc15
  • Anapc16
  • Anapc2
  • Anapc4
  • Anapc5
  • Anapc7
  • Ark1
  • Ark2
  • Aura
  • Aurka
  • Aurkb
  • Ayk1
  • Btak
  • Cdc16
  • Cdc20
  • Cdc23
  • Cdc26
  • Cdc27
  • Fzr1
  • Iak1
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • LOC100366017
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Plk
  • Plk1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Pttg
  • Pttg1
  • Rb-1
  • Rb1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Skp2
  • Stk1
  • Stk12
  • Stk15
  • Stk5
  • Stk6
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ube2c
  • Ube2d1
  • Ube2e1
  • Ube2s
Rattus norvegicus (Norway rat)
Erythrocytes take up oxygen and release carbon dioxide
  • Ae1
  • Aqp1
  • Ca1
  • Ca2
  • Ca4
  • Car1
  • Chip28
  • Hba-a1
  • Hba1
  • Hbb
  • Rh50
  • Rhag
  • Slc4a1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Erythropoietin activates RAS
  • Ash
  • Crkl
  • Epo
  • Epor
  • Grb2
  • Irs2
  • Jak2
  • Lyn
  • Rapgef1
  • Shc1
  • Vav
  • Vav1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Chylomicron remodeling
  • Apoa1
  • Apoa2
  • Apoa4
  • Apoa5
  • Apob
  • Apoc2
  • Apoc3
  • Apoe
  • Gpihbp1
  • Lpl
  • Rap3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Reuptake of GABA
  • Gabt1
  • Gabt2
  • Gabt3
  • Gat-1
  • Gat-2
  • Gat-3
  • Gat-b
  • Gat1
  • Slc6a1
  • Slc6a11
  • Slc6a12
  • Slc6a13
Rattus norvegicus (Norway rat)
RET signaling
  • Artn
  • Ash
  • Bmk1
  • Dok1
  • Dok2
  • Dok4
  • Dok5
  • Dok6
  • Enigma
  • Erk5
  • Frs2
  • Gab1
  • Gab2
  • Gdnf
  • Gdnfra
  • Gfra1
  • Gfra2
  • Gfra3
  • Gfra4
  • Grb10
  • Grb2
  • Grb7
  • Irs2
  • Lim1
  • Mapk7
  • Nrtn
  • Nshc
  • Pdlim7
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3cd
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Pkacb
  • Pkca
  • Plcg1
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Prkca
  • Prosap2
  • Pspn
  • Ptpn11
  • Rap1gap
  • Ret
  • Retl1
  • Shank3
  • Shc1
  • Shc3
  • Shcc
  • Sos1
  • Src
  • Trnr1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transport of the SLBP independent Mature mRNA
  • Aaas
  • Alyref
  • Cbp20
  • Cbp80
  • Eif4e
  • Gp210
  • LOC683983
  • Mrnp41
  • Ncbp1
  • Ncbp2
  • Ndc1
  • Npap60
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup153
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup210
  • Nup214
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup42
  • Nup43
  • Nup50
  • Nup53
  • Nup54
  • Nup58
  • Nup62
  • Nup84
  • Nup85
  • Nup88
  • Nup93
  • Nup98
  • Nupl1
  • Nupl2
  • Nxf1
  • Pcnt1
  • Pom121
  • Pom210
  • Rae1
  • Ranbp2
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Tap
  • Tmem48
  • Tpr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interleukin-33 signaling
  • Fit1
  • Il1rap
  • Il1rl1
  • Il33
Rattus norvegicus (Norway rat)
NRAGE signals death through JNK
  • Abr
  • Akap13
  • Arhgef1
  • Arhgef10
  • Arhgef10l
  • Arhgef11
  • Arhgef12
  • Arhgef15
  • Arhgef16
  • Arhgef17
  • Arhgef19
  • Arhgef2
  • Arhgef25
  • Arhgef26
  • Arhgef3
  • Arhgef33
  • Arhgef37
  • Arhgef38
  • Arhgef39
  • Arhgef5
  • Arhgef6
  • Arhgef7
  • Arhgef9
  • Bad
  • Bcl2l11
  • Bim
  • Bod
  • Duo
  • Ect2
  • Ehsh1
  • Fgd1
  • Fgd2
  • Fgd3
  • Fgd4
  • Geft
  • Gna13
  • Grf2
  • Hapip
  • Itsn
  • Itsn1
  • Jnk1
  • Kalrn
  • LOC687105
  • Lsc
  • Mapk8
  • Mcf2
  • Mcf2l
  • Net1
  • Ngef
  • Obscn
  • Ost
  • Pak3bp
  • Pixb
  • Plekhg2
  • Plekhg5
  • Prex1
  • Prkm8
  • RGD1565043
  • Rac
  • Rac1
  • Rasgrf2
  • Rt13
  • Sos1
  • Sos2
  • Tech
  • Tiam1
  • Tiam2
  • Trio
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
Rattus norvegicus (Norway rat)
CREB3 factors activate genes
  • Creb3
  • Creb3l3
  • Crebrf
  • Mbtps1
  • S1p
  • Ski1
Rattus norvegicus (Norway rat)
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
  • Adamts1
  • Adamts10
  • Adamts12
  • Adamts13
  • Adamts14
  • Adamts15
  • Adamts16
  • Adamts17
  • Adamts18
  • Adamts19
  • Adamts2
  • Adamts20
  • Adamts3
  • Adamts4
  • Adamts5
  • Adamts6
  • Adamts7
  • Adamts8
  • Adamts9
  • Adamtsl1
  • Adamtsl2
  • Adamtsl3
  • Adamtsl4
  • Adamtsl5
  • B3glct
  • Pofut2
  • Rpesp
  • Sbspon
  • Sema5a
  • Sema5b
  • Spon1
  • Spon2
  • Sponf
  • Sspo
  • Thbs1
  • Thbs2
  • Thsd1
  • Thsd4
  • Thsd7a
  • Thsd7b
Rattus norvegicus (Norway rat)
RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of myeloid cells
  • Aml1
  • Cbfa2
  • Cbfb
  • Cbp
  • Crebbp
  • Runx1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol
  • AABR07029195.1
  • AABR07031505.1
  • AABR07060610.1
  • AABR07064810.1
  • AABR07071986.1
  • AABR07072260.1
  • Arbp
  • Bms1
  • Bop1
  • Bud23
  • Bysl
  • Cirh1a
  • Ck1e-2
  • Crlz1
  • Csnk1d
  • Csnk1e
  • Dcaf13
  • Ddx21
  • Ddx21a
  • Ddx47
  • Ddx49
  • Ddx52
  • Def
  • Dhx37
  • Diexf
  • Dis3
  • ENSRNOG00000068086
  • Emg1
  • Eri1
  • Exosc1
  • Exosc10
  • Exosc2
  • Exosc3
  • Exosc4
  • Exosc5
  • Exosc6
  • Exosc7
  • Exosc8
  • Exosc9
  • Fau
  • Fbl
  • Fcf1
  • Fte-1
  • Fte1
  • Ftsj3
  • Gnl3
  • Hckid
  • Imp4
  • Isg20l2
  • LOC100360645
  • LOC100361060
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • LOC100910714
  • LOC102550668
  • LOC102551819
  • LOC103692829
  • LOC108351255
  • LOC120093247
  • LOC120094652
  • LOC120097744
  • LOC120099964
  • LOC120103572
  • LOC360830
  • LOC679140
  • Lamr1
  • Las1l
  • Ltv1
  • Mnar
  • Mphosph10
  • Mphosph6
  • Mtrex
  • Nap65
  • Ncl
  • Nhp2l1
  • Nip7
  • Nob1
  • Nob1p
  • Noc4l
  • Nol11
  • Nol5
  • Nol6
  • Nol9
  • Nop14
  • Nop5
  • Nop56
  • Nop58
  • Ns
  • Nuc
  • Pdcd11
  • Peachy
  • Pelp1
  • Pes1
  • Pno1
  • Pwp2
  • RGD1310899
  • RGD1310899_predicted
  • RGD1562402
  • RGD1563956
  • RGD1564606
  • Rcl1
  • Rig
  • Riok1
  • Riok3
  • Rok1
  • Rp2
  • Rpl1
  • Rpl10
  • Rpl10a
  • Rpl10l
  • Rpl10l1
  • Rpl11
  • Rpl12
  • Rpl12-ps2
  • Rpl12l2
  • Rpl13
  • Rpl13a
  • Rpl14
  • Rpl15
  • Rpl17
  • Rpl18
  • Rpl18a
  • Rpl19
  • Rpl21
  • Rpl21-ps26
  • Rpl21l2
  • Rpl21l3
  • Rpl21l5
  • Rpl22
  • Rpl23
  • Rpl23al1
  • Rpl24
  • Rpl26
  • Rpl27
  • Rpl27a
  • Rpl27al3
  • Rpl28
  • Rpl29
  • Rpl3
  • Rpl30
  • Rpl31
  • Rpl32
  • Rpl34
  • Rpl34-ps1
  • Rpl34l1
  • Rpl34l2
  • Rpl35
  • Rpl35al8
  • Rpl36a
  • Rpl36al-ps5
  • Rpl36al1
  • Rpl36l3
  • Rpl37
  • Rpl37l4
  • Rpl38
  • Rpl39
  • Rpl39l1
  • Rpl3l
  • Rpl4
  • Rpl44
  • Rpl5
  • Rpl6
  • Rpl7
  • Rpl7a
  • Rpl8
  • Rpl9
  • Rpl9l2
  • Rplp0
  • Rplp1
  • Rplp2
  • Rpp14
  • Rpp25
  • Rpp30
  • Rpp38
  • Rpp40
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
  • Rps13
  • Rps14
  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
  • Rps17
  • Rps18
  • Rps19
  • Rps2
  • Rps20
  • Rps21
  • Rps23
  • Rps24
  • Rps25
  • Rps26
  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
  • Rps26l6
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
  • Rps29
  • Rps3
  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • Rrp36
  • Rrp7a
  • Rrp9
  • S27-1
  • Sas10
  • Senp3
  • Snu13
  • Tbl3
  • Tex10
  • Thex1
  • Tsr1
  • Uba80
  • Ubbl1
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Utp11
  • Utp11l
  • Utp14a
  • Utp15
  • Utp18
  • Utp20
  • Utp25
  • Utp3
  • Utp4
  • Utp6
  • Wbscr22
  • Wdr12
  • Wdr18
  • Wdr3
  • Wdr36
  • Wdr43
  • Wdr46
  • Wdr75
  • Xrn2
  • ZH10
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

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Last updated: August 19, 2024