GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1 - 25 of 499 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Formation of the cornified envelope
  • bar-1
  • cdh-4
  • hmp-2
  • jac-1
  • pvl-1
  • spy-1
  • vab-9
  • wrm-1
Caenorhabditis elegans
Signaling by ERBB2
  • CELE_F14B4.1
  • cdc-37
  • daf-21
  • kin-7
  • let-23
  • rme-2
  • src-1
Caenorhabditis elegans
eNOS activation
  • akt-1
  • akt-2
  • cal-5
  • daf-21
  • glb-14
Caenorhabditis elegans
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors
  • acr-12
  • acr-2
  • acr-20
  • acr-21
  • acr-22
  • acr-23
  • acr-24
  • acr-25
  • acr-3
  • acr-4
  • acr-5
  • acr-6
  • acr-8
  • deg-3
  • des-2
  • lev-1
  • lev-7
  • lev-8
  • lgc-10
  • lgc-11
  • lgc-12
  • lgc-3
  • lgc-30
  • lgc-31
  • lgc-4
  • lgc-5
  • lgc-6
  • lgc-7
  • lgc-8
  • lgc-9
  • pbo-6
  • unc-29
  • unc-38
  • unc-63
Caenorhabditis elegans
SEMA3A-Plexin repulsion signaling by inhibiting Integrin adhesion
  • frm-3
  • mab-20
  • plx-1
  • ppk-1
  • sema-1a
  • smp-1
  • smp-2
  • src-1
  • tln-1
Caenorhabditis elegans
Aflatoxin activation and detoxification
  • C06A6.4
  • C53D5.5
  • CELE_H14N18.4
  • CELE_T03D8.6
  • CELE_T19H12.6
  • CELE_Y7A9A.1
  • CELE_Y97E10AR.2
  • cyp-23A1
  • cyp-23a1
  • cyp-33A1
  • cyp-33B1
  • cyp-33C1
  • cyp-33C11
  • cyp-33C12
  • cyp-33C2
  • cyp-33C3
  • cyp-33C4
  • cyp-33C5
  • cyp-33C6
  • cyp-33C7
  • cyp-33C8
  • cyp-33C9
  • cyp-33D1
  • cyp-33D3
  • cyp-33E1
  • cyp-33E2
  • cyp-33E3
  • cyp-33a1
  • cyp-33b1
  • cyp-33c1
  • cyp-33c11
  • cyp-33c12
  • cyp-33c2
  • cyp-33c3
  • cyp-33c4
  • cyp-33c5
  • cyp-33c6
  • cyp-33c7
  • cyp-33c8
  • cyp-33c9
  • cyp-33d1
  • cyp-33d3
  • cyp-33e1
  • cyp-33e2
  • cyp-33e3
  • cyp-34A1
  • cyp-34A10
  • cyp-34A2
  • cyp-34A5
  • cyp-34A6
  • cyp-34A7
  • cyp-34A8
  • cyp-34A9
  • cyp-34a1
  • cyp-34a10
  • cyp-34a2
  • cyp-34a4
  • cyp-34a5
  • cyp-34a6
  • cyp-34a7
  • cyp-34a8
  • cyp-34a9
  • cyp-35A1
  • cyp-35A2
  • cyp-35A3
  • cyp-35A4
  • cyp-35A5
  • cyp-35B1
  • cyp-35B2
  • cyp-35B3
  • cyp-35C1
  • cyp-35a1
  • cyp-35a2
  • cyp-35a3
  • cyp-35a4
  • cyp-35a5
  • cyp-35b1
  • cyp-35b2
  • cyp-35b3
  • cyp-35c1
  • cyp-35d1
  • cyp-36A1
  • cyp36a1
  • dach-1
  • daf-9
Caenorhabditis elegans
RNA Polymerase II Pre-transcription Events
  • 3L686
  • CELE_F02E9.10
  • F13B12.1
  • T24H10.1
  • TFIIE-alpha
  • TFIIE-beta
  • ama-1
  • cbp-20
  • cbp-80
  • ccnk-1
  • cdc-73
  • cdk-7
  • cdk-9
  • cit-1.1
  • cit-1.2
  • ctr-9
  • eaf-1
  • elb-1
  • elc-1
  • ell-1
  • emb-5
  • fcp-1
  • fust-1
  • gtf-2A2
  • gtf-2E1
  • gtf-2E2
  • gtf-2F1
  • gtf-2F2
  • gtf-2H1
  • gtf-2H2C
  • gtf-2H3
  • gtf-2H4
  • gtf-2H5
  • gtf-2e1
  • gtf-2e2
  • gtf-2f1
  • gtf-2f2
  • gtf-2h1
  • gtf-2h3
  • hmg-4
  • leo-1
  • mnat-1
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • pafo-1
  • pqn-51
  • rpb-1
  • rpb-10
  • rpb-11
  • rpb-12
  • rpb-2
  • rpb-3
  • rpb-4
  • rpb-5
  • rpb-6
  • rpb-7
  • rpb-8
  • rpb-9
  • spt-16
  • spt-4
  • spt-5
  • taf-1
  • taf-10
  • taf-11
  • taf-11.3
  • taf-12
  • taf-13
  • taf-2
  • taf-3
  • taf-4
  • taf-5
  • taf-6.1
  • taf-7.1
  • taf-7.2
  • taf-9
  • tbp
  • tbp-1
  • tceb-3
  • tpr-3
  • ttb-1
  • xpb-1
  • xpd-1
Caenorhabditis elegans
Regulation of KIT signaling
  • CELE_F59F5.3
  • ddr-2
  • kin-11
  • kin-36
  • let-341
  • pkc-2
  • sem-5
  • sli-1
  • sos-1
  • svh-4
Caenorhabditis elegans
Zinc influx into cells by the SLC39 gene family
  • hke-4.2
  • tag-140
  • zipt-1
  • zipt-15
  • zipt-16
  • zipt-2.4
  • zipt-7.2
Caenorhabditis elegans
Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC)
  • C16C8.14
  • C16C8.16
  • C16C8.20
  • C37A2.7
  • CELE_W01D2.1
  • CELE_Y37E3.8
  • cbp-20
  • cbp-80
  • erfa-1
  • erfa-3
  • etf-1
  • ifg-1
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • pab-1
  • rla-0
  • rla-1
  • rpa-0
  • rpa-1
  • rpl-1
  • rpl-10
  • rpl-10a
  • rpl-11.2
  • rpl-12
  • rpl-13
  • rpl-14
  • rpl-15
  • rpl-16
  • rpl-17
  • rpl-18
  • rpl-19
  • rpl-2
  • rpl-20
  • rpl-21
  • rpl-22
  • rpl-23
  • rpl-24.1
  • rpl-25.2
  • rpl-26
  • rpl-27
  • rpl-28
  • rpl-29
  • rpl-3
  • rpl-30
  • rpl-31
  • rpl-32
  • rpl-33
  • rpl-35
  • rpl-36
  • rpl-36.A
  • rpl-37a
  • rpl-38
  • rpl-39
  • rpl-4
  • rpl-41
  • rpl-43
  • rpl-5
  • rpl-6
  • rpl-7
  • rpl-7A
  • rpl-8
  • rpl-9
  • rps-0
  • rps-1
  • rps-10
  • rps-11
  • rps-12
  • rps-13
  • rps-14
  • rps-15
  • rps-16
  • rps-17
  • rps-18
  • rps-19
  • rps-2
  • rps-20
  • rps-21
  • rps-22
  • rps-23
  • rps-24
  • rps-25
  • rps-26
  • rps-27
  • rps-28
  • rps-29
  • rps-3
  • rps-4
  • rps-5
  • rps-6
  • rps-7
  • rps-8
  • rps-9
  • smg-2
  • ubl-1
Caenorhabditis elegans
Glycogen synthesis
  • CC8.2
  • CELE_R05F9.6
  • CELE_T04A8.7
  • CELE_T10B10.8
  • gsy-1
  • gyg-1
  • gyg-2
  • rml-1
Caenorhabditis elegans
KSRP (KHSRP) binds and destabilizes mRNA
  • C06G4.1
  • akt-1
  • akt-2
  • ftt-1
  • ftt-2
  • fubl-1
  • fubl-2
  • fubl-3
  • fubl-4
  • fubp-3.1
  • fubp-3.2
  • fubp-3.3
  • fubp-3.4
  • par-5
Caenorhabditis elegans
pre-mRNA splicing
  • C16C10.4
  • C47E8.4
  • CELE_K01G5.8
  • CELE_T23G11.4
  • CELE_Y18H1A.2
  • CELE_Y57G11A.5
  • CELE_Y66D12A.8
  • CELE_ZK616.1
  • E01A2.2
  • F37A4.2
  • K07C5.6
  • R05D3.8
  • R07E5.1
  • RBM8
  • T27F2.1
  • Y14
  • acin-1
  • aly-3
  • ama-1
  • bcas-2
  • bud-31
  • cacn-1
  • casc-3
  • cbp-20
  • cbp-80
  • ccdc-12
  • ccdc-55
  • cdc-5L
  • cdc-5l
  • cey-1
  • cey-2
  • cey-3
  • cey-4
  • ctnb-1
  • cwc-15
  • cyn-10
  • cyn-12
  • cyn-15
  • cyn-4
  • cyp-10
  • cyp-4
  • ddx-15
  • ddx-17
  • ddx-35
  • ddx-46
  • eftu-2
  • eif-4A3
  • emb-4
  • fust-1
  • gad-1
  • gtf-2F1
  • gtf-2F2
  • gtf-2f1
  • gtf-2f2
  • hel-1
  • hrp-1
  • hrp-2
  • hrpf-1
  • hrpf-2
  • hrpk-1
  • hrpl-1
  • hrpr-1
  • hrpu-1
  • hsp-1
  • hsp70a
  • isy-1
  • let-504
  • let-858
  • mag-1
  • mog-1
  • mog-2
  • mog-3
  • mog-5
  • mog-6
  • mtr-4
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • pes-4
  • phf-5
  • plrg-1
  • pnn-1
  • pqbp-1.1
  • prcc-1
  • prp-17
  • prp-18
  • prp-19
  • prp-8
  • ptb-1
  • rbm-17
  • rbm-22
  • rbm-5
  • rbp-1
  • rnp-2
  • rnp-4
  • rnp-5
  • rnp-6
  • rpb-1
  • rpb-10
  • rpb-11
  • rpb-12
  • rpb-2
  • rpb-3
  • rpb-4
  • rpb-5
  • rpb-6
  • rpb-7
  • rpb-8
  • rpb-9
  • rsp-2
  • rsp-3
  • rsp-4
  • rsp-6
  • rsp-7
  • rsp-8
  • rsr-1
  • sacy-1
  • sap-1
  • sap-140
  • scaf-6
  • sde-2
  • sel-13
  • sig-7
  • smg-4
  • snr-1
  • snr-2
  • snr-3
  • snr-4
  • snr-5
  • snr-6
  • snr-7
  • snrp-200
  • snrp-40.1
  • snrp-40.2
  • sqd-1
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-4
  • syf-1
  • syf-2
  • syf-3
  • tag-65
  • tofu-2
  • yju-2
Caenorhabditis elegans
PTK6 Regulates Proteins Involved in RNA Processing
  • CELE_Y47G6A.5
  • nipi-4
  • nono-1
  • trk-1
Caenorhabditis elegans
Activation of G protein gated Potassium channels
  • eat-11
  • gbb-1
  • gbb-2
  • gbp-2
  • gpb-1
  • gpb-2
  • gpc-1
  • gpc-2
  • irk-1
  • irk-2
  • irk-3
  • irk-4
Caenorhabditis elegans
FGFR2b ligand binding and activation
  • egl-15
  • egl-17
  • let-756
Caenorhabditis elegans
DCC mediated attractive signaling
  • cdc-42
  • ced-10
  • ced-5
  • ceh-6
  • kin-32
  • nck-1
  • rac-1
  • src-1
  • unc-40
  • unc-73
Caenorhabditis elegans
Acyl chain remodelling of PS
  • C03H5.4
  • C07E3.9
  • C31H1.5
  • CELE_Y69A2AL.2
  • LPT-1
  • clec-148
  • clec-161
  • clec-178
  • clec-48
  • clec-49
  • clec-50
  • clec-51
  • clec-52
  • clec-53
  • clec-89
  • mboa-3
  • mboa-6
  • obr-3
Caenorhabditis elegans
Regulation of insulin secretion
  • C03B1.13
  • C35A11.4
  • CELE_F11D5.5
  • CELE_F11D5.7
  • CELE_F13B12.2
  • CELE_F48E3.2
  • CELE_F53H8.3
  • CELE_K08F9.1
  • CELE_K08H10.6
  • CELE_K09C4.1
  • CELE_K09C4.4
  • CELE_K09C4.5
  • CELE_Y37A1A.3
  • CELE_Y39B6A.41
  • CELE_Y39E4B.5
  • CELE_Y61A9LA.1
  • CELE_ZK829.9
  • R09B5.11
  • ccb-1
  • ccb-2
  • egl-19
  • fdgt-2
  • fgt-1
  • slcf-2
  • unc-2
  • unc-36
  • unc-72
Caenorhabditis elegans
Drug-mediated inhibition of ERBB2 signaling
  • cdc-37
  • daf-21
  • kin-7
  • let-23
Caenorhabditis elegans
Synthesis of very long-chain fatty acyl-CoAs
  • CELE_R10E4.9
  • acs-13
  • acs-17
  • acs-4
  • art-1
  • dhs-5
  • elo-1
  • elo-2
  • elo-3
  • elo-4
  • elo-5
  • elo-6
  • elo-7
  • elo-8
  • elo-9
  • hpo-8
Caenorhabditis elegans
RAC2 GTPase cycle
  • C05D9.3
  • CELE_F22G12.5
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y57G11C.1147
  • CELE_Y67A10A.7
  • CELE_Y71H2AM.12
  • PLD
  • aap-1
  • abi-1
  • age-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdc-42
  • cdh-4
  • ced-10
  • ced-5
  • cgef-1
  • cyk-1
  • cyk-4
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gex-2
  • gex-3
  • git-1
  • gop-3
  • kin-18
  • let-99
  • magu-1
  • max-2
  • mtx-1
  • pak-1
  • pak-2
  • pes-7
  • pld-1
  • rab-7
  • rac-1
  • rac-2
  • rga-1
  • rga-5
  • rga-8
  • rhi-1
  • snb-1
  • sulu
  • syd-1
  • tiam-1
  • toe-2
  • unc-73
  • vab-1
  • vang-1
  • vav-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
Antigen activates B Cell Receptor (BCR) leading to generation of second messengers
  • dec-4
  • itr-1
  • lfe-1
  • stim-1
  • trp-2
Caenorhabditis elegans
Heme degradation
  • CELE_F21G4.1
  • abcx-1
  • lbp-5
  • lbp-6
  • lbp-7
  • lbp-8
  • mrp-1
  • mrp-2
  • mrp-3
  • mrp-4
  • mrp-7
  • mrp-8
  • wht-5
Caenorhabditis elegans
EPH-ephrin mediated repulsion of cells
  • CELE_K03B8.6
  • ap50
  • apa-2
  • apb-1
  • aph-1
  • aph-2
  • aps-2
  • ced-10
  • chc-1
  • clic-1
  • dpy-23
  • dyn-1
  • efn-2
  • efn-3
  • efn-4
  • mab-26
  • pen-1
  • pen-2
  • rac-1
  • sel-12
  • src-1
  • tiam-1
  • vab-1
  • vab-2
  • vav-1
  • zmp-1
  • zmp-2
  • zmp-3
  • zmp-5
  • zmp-6
Caenorhabditis elegans

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024