GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 401 - 425 of 499 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Cell surface interactions at the vascular wall
  • C05D9.3
  • C18E9.7
  • C54G4.4
  • F14E5.2
  • cfh-1
  • pat-2
Caenorhabditis elegans
Platelet degranulation
  • C03F11.3
  • C05D9.3
  • C18E9.7
  • C27B7.7
  • C28G1.2
  • C32B5.13
  • C32B5.7
  • C54G4.4
  • CELE_F14B4.1
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F21C10.7
  • CELE_F26H9.2
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_F47B7.2
  • CELE_K02E7.10
  • CELE_K07E8.6
  • CELE_R07E3.1
  • CELE_R07G3.8
  • CELE_R09F10.1
  • CELE_T22A3.6
  • CELE_Y113G7B.15
  • CELE_Y51A2D.8
  • CELE_Y71H2AM.25
  • CELE_Y71H2AR.2
  • CELE_ZK973.11
  • R07B1.3
  • act-1
  • act-2
  • act-3
  • act-4
  • aex-6
  • aipl-1
  • aldo-1
  • aldo-2
  • apl-1
  • atn-1
  • cal-5
  • cdc-37
  • cdh-10
  • cet-1
  • cfh-1
  • chil-10
  • daf-7
  • dbl-1
  • deb-1
  • famp-1
  • fln-1
  • igdb-1
  • igdb-2
  • iglr-1
  • lan-2
  • ldp-1
  • lin-49
  • lmp-1
  • lmp-2
  • lron-6
  • manf-1
  • moma-1
  • mrp-6
  • ola-1
  • ooc-5
  • ost-1
  • pat-2
  • pat-3
  • pvf-1
  • rab27
  • rme-2
  • scav-2
  • scav-3
  • scav-4
  • scav-6
  • slfl-5
  • sod-1
  • sparc
  • spp-10
  • spp-8
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-3
  • srp-6
  • srp-7
  • srp-8
  • tag-196
  • tag-210
  • tag-225
  • tag-329
  • timp-1
  • tln-1
  • tor-1
  • tor-2
  • tsp-11
  • tsp-7
  • unc-112
  • unc-129
  • unc-18
  • uncp-18
  • vig-1
Caenorhabditis elegans
COPI-mediated anterograde transport
  • C50C3.2/C50C3.3
  • C54G4.4
  • CELE_F11A10.6
  • CELE_Y42H9AR.1
  • CELE_Y59A8B.25
  • CELE_Y59A8B.8
  • arc-1
  • arf-1
  • arf-1.1
  • arf-1.2
  • arf-3
  • arf-5
  • arl-4
  • arl-6
  • arp-1
  • arp-11
  • cap-1
  • cap-2
  • cfh-1
  • cgo-2
  • cog-2
  • cogc-1
  • cogc-2
  • cogc-3
  • cogc-4
  • cogc-5
  • cogc-6
  • cogc-8
  • copa-1
  • copb-1
  • copb-2
  • copd-1
  • cope-1
  • copg-1
  • copz-1
  • dhc-1
  • dlc-1
  • dlc-2
  • dlc-3
  • dlc-4
  • dlc-5
  • dlc-6
  • dli-1
  • dnc-1
  • dnc-2
  • dnc-4
  • dnc-5
  • dnc-6
  • dyci-1
  • erd-2
  • erd-2.1
  • erd-2.2
  • gbf-1
  • golg-2
  • gos-28
  • gosr-1
  • gosr-2.1
  • gs28
  • ldlc
  • memb-1
  • nbet-1
  • nsf-1
  • phi-34
  • rab-1
  • sel-9
  • sma-1
  • snap-1
  • spc-1
  • syn-3
  • syx-5
  • tmed-10
  • tmed-3
  • unc-70
  • uso-1
  • ykt-6
Caenorhabditis elegans
RHOV GTPase cycle
  • C09G1.4
  • CELE_T24B8.7
  • CELE_Y53F4B.1
  • aap-1
  • cdc-42
  • chc-1
  • chw-1
  • gap
  • gap-3
  • git-1
  • hum-7
  • let-99
  • lev-11
  • magu-4
  • max-2
  • nck-1
  • pac-1
  • pak-1
  • pak-2
  • par-6
  • pes-7
  • pix-1
  • spc-1
  • tag-325
  • tmy-1
  • toe-2
  • txl
  • txl-1
  • unc-70
  • vab-1
  • vab-10
  • vang-1
Caenorhabditis elegans
Regulation of KIT signaling
  • CELE_F59F5.3
  • ddr-2
  • kin-11
  • kin-36
  • let-341
  • pkc-2
  • sem-5
  • sli-1
  • sos-1
  • svh-4
Caenorhabditis elegans
FLT3 Signaling
  • CELE_F59F5.3
  • akt-1
  • akt-2
  • daf-16
  • ddr-2
  • kin-36
  • let-341
  • let-60
  • lin-34
  • sem-5
  • sos-1
  • svh-4
Caenorhabditis elegans
Signaling by PDGF
  • C16E9.1
  • C18H7.1
  • C29A12.6
  • CELE_F31F7.2
  • CELE_F59F5.3
  • CELE_K09E2.1
  • CELE_R193.2
  • CELE_T19D12.4
  • CELE_T22A3.6
  • ddr-2
  • kin-36
  • kpc-1
  • pvf-1
  • svh-4
Caenorhabditis elegans
Signaling by SCF-KIT
  • CELE_F59F5.3
  • aap-1
  • age-1
  • ced-10
  • ddr-2
  • kin-36
  • let-341
  • let-60
  • lin-34
  • rac-1
  • sem-5
  • sos-1
  • svh-4
  • vav-1
Caenorhabditis elegans
RAF/MAP kinase cascade
  • C50C3.2/C50C3.3
  • CELE_F11E6.8
  • CELE_F14B4.1
  • CELE_F59F5.3
  • CELE_R05G6.10
  • CELE_T22A3.6
  • aap-1
  • age-1
  • ddr-2
  • egl-15
  • egl-17
  • kin-32
  • kin-36
  • kin-7
  • klo-1
  • klo-2
  • let-23
  • let-341
  • let-60
  • let-756
  • lin-34
  • mpk-1
  • ptp-3
  • pvf-1
  • pxf-1
  • ra-gef
  • rgef-1
  • rgl-1
  • rme-2
  • sem-5
  • sma-1
  • sos-1
  • spc-1
  • src-1
  • sur-1
  • svh-2
  • svh-4
  • unc-70
Caenorhabditis elegans
Downstream signal transduction
  • CELE_F59F5.3
  • CELE_T12G3.2
  • aap-1
  • age-1
  • ced-2
  • ddr-2
  • gap-3
  • kin-36
  • let-341
  • let-60
  • lin-34
  • nck-1
  • pvf-1
  • sem-5
  • sos-1
  • src-1
  • sta-1
  • sta-2
  • stat-b
  • svh-4
Caenorhabditis elegans
Integrin cell surface interactions
  • C05D9.3
  • C18E9.7
  • CELE_F59F5.3
  • clb-1
  • clb-2
  • ddr-2
  • emb-9
  • ina-1
  • kin-36
  • let-2
  • pat-2
  • pat-3
  • rig-5
  • rig-6
  • svh-4
  • ttn-1
Caenorhabditis elegans
VEGFA-VEGFR2 Pathway
  • C05D9.3
  • C49C3.10
  • CELE_F08H9.3
  • CELE_F08H9.4
  • CELE_F11E6.8
  • CELE_F12F6.1
  • CELE_F13B12.6
  • CELE_F21F3.2
  • CELE_F59F5.3
  • CELE_Y106G6D.4
  • CELE_Y106G6E.1
  • CELE_Y51B9A.9
  • CELE_ZK1128.7
  • aap-1
  • age-1
  • cdc-42
  • ced-10
  • ddr-2
  • gap-3
  • gska-3
  • gskl-2
  • hsp-12.1
  • hsp-12.2
  • hsp-12.3
  • hsp-12.6
  • hsp-16
  • hsp-16.1
  • hsp-16.11
  • hsp-16.2
  • hsp-16.41
  • hsp-16.48
  • hsp-16.49
  • hsp-17
  • hsp-43
  • hsp12-2
  • hsp16-1a
  • hsp16-1b
  • hsp16-2
  • hsp16-41
  • hsp16-48
  • hsp16-48a
  • hsp16-48b
  • hsp16-49
  • kin-1
  • kin-32
  • kin-36
  • let-502
  • mak-1
  • mak-2
  • max-2
  • nck-1
  • pak-1
  • pat-2
  • pat-3
  • pmk-1
  • pmk-2
  • pmk-3
  • rac-1
  • rho-1
  • rhoa
  • sip-1
  • src-1
  • svh-2
  • svh-4
  • vav-1
Caenorhabditis elegans
PI3K/AKT Signaling
  • CELE_F11E6.8
  • CELE_F14B4.1
  • CELE_F59F5.3
  • CELE_T22A3.6
  • CELE_W04B5.5
  • CELE_Y71H2AM.12
  • CeTor
  • aap-1
  • age-1
  • akt-1
  • akt-2
  • cash-1
  • ced-10
  • ddr-2
  • egl-15
  • egl-17
  • kin-36
  • kin-7
  • klo-1
  • klo-2
  • let-23
  • let-363
  • let-756
  • mlst-8
  • nipi-3
  • pvf-1
  • rac-1
  • rac-2
  • rict-1
  • rme-2
  • sem-5
  • sgk-1
  • sinh-1
  • src-1
  • svh-2
  • svh-4
Caenorhabditis elegans
PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
  • CELE_F11E6.8
  • CELE_F14B4.1
  • CELE_F59F5.3
  • CELE_T22A3.6
  • CELE_Y71H2AM.12
  • aap-1
  • age-1
  • akt-1
  • akt-2
  • cash-1
  • ced-10
  • ddr-2
  • egl-15
  • egl-17
  • kin-36
  • kin-7
  • klo-1
  • klo-2
  • let-23
  • let-756
  • let-92
  • paa-1
  • ppk-1
  • ppk-2
  • pptr-1
  • pptr-2
  • pvf-1
  • rac-1
  • rac-2
  • rme-2
  • sem-5
  • src-1
  • svh-2
  • svh-4
Caenorhabditis elegans
LDL clearance
  • CELE_F16F9.4
  • CELE_T09B9.1
  • ap50
  • apa-2
  • apb-1
  • aps-2
  • cest-26
  • chc-1
  • clic-1
  • dpy-23
  • gldi-2
  • heh-1
  • mboa-1
  • nceh-1
  • ncr-2
  • npc-2
  • trcs-1
Caenorhabditis elegans
Synthesis of PC
  • C06H2.2
  • CELE_T28D6.7
  • CELE_Y18H1A.11
  • F08C6.2
  • abhd-3.1
  • abhd-3.2
  • ace-1
  • cept-1
  • cept-2
  • cest-1
  • cest-1.1
  • cest-1.2
  • cest-12
  • cest-13
  • cest-16
  • cest-17
  • cest-19
  • cest-2.1
  • cest-2.2
  • cest-2.3
  • cest-24
  • cest-26
  • cha-1
  • chtl-1
  • cka-1
  • cka-2
  • ckb-1
  • ckb-2
  • ckb-3
  • ckb-4
  • ges-1
  • kin-10
  • kin-3
  • kin-5
  • lpin-1
Caenorhabditis elegans
Activation of G protein gated Potassium channels
  • eat-11
  • gbb-1
  • gbb-2
  • gbp-2
  • gpb-1
  • gpb-2
  • gpc-1
  • gpc-2
  • irk-1
  • irk-2
  • irk-3
  • irk-4
Caenorhabditis elegans
Inhibition of voltage gated Ca2+ channels via Gbeta/gamma subunits
  • eat-11
  • gbb-1
  • gbb-2
  • gbp-2
  • gpb-1
  • gpb-2
  • gpc-1
  • gpc-2
  • irk-1
  • irk-2
  • irk-3
  • irk-4
Caenorhabditis elegans
Phase 4 - resting membrane potential
  • B0310.1
  • irk-1
  • irk-2
  • irk-3
  • irk-4
  • sup-9
  • twk-1
  • twk-11
  • twk-14
  • twk-18
  • twk-20
  • twk-21
  • twk-22
  • twk-24
  • twk-25
  • twk-26
  • twk-31
  • twk-33
  • twk-34
  • twk-35
  • twk-36
  • twk-39
  • twk-42
  • twk-44
  • twk-45
  • twk-46
  • twk-49
  • twk-8
Caenorhabditis elegans
RNA Polymerase II Transcription Termination
  • C49H3.4
  • CELE_K07A1.15
  • CELE_Y53G8AR.6
  • CELE_Y57G11A.5
  • K07C5.6
  • RBM8
  • Y14
  • aly-3
  • casc-3
  • cbp-20
  • cbp-80
  • cdl-1
  • cfim-1
  • cfim-2
  • clpf-1
  • cpf-1
  • cpf-2
  • cpsf-1
  • cpsf-2
  • cpsf-3
  • cpsf-4
  • eif-4A3
  • fipp-1
  • hel-1
  • mag-1
  • mog-1
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • pabp-2
  • pap-1
  • pcf-11
  • pfs-2
  • prp-17
  • rnp-4
  • rnp-5
  • rsp-2
  • rsp-3
  • rsp-4
  • rsp-6
  • rsp-7
  • rsr-1
  • smg-4
  • snr-1
  • snr-2
  • snr-5
  • snr-6
  • snr-7
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-4
  • suf-1
  • symk-1
  • thoc-1
  • thoc-2
  • thoc-3
  • thoc-5
  • thoc-7
  • uaf-1
  • uaf-2
  • znf-236
Caenorhabditis elegans
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA
  • CELE_Y57G11A.5
  • CELE_ZK616.1
  • R05D3.8
  • ama-1
  • cbp-20
  • cbp-80
  • cey-1
  • cey-2
  • cey-3
  • cey-4
  • cfim-1
  • cfim-2
  • clpf-1
  • cpf-1
  • cpf-2
  • cpsf-1
  • cpsf-2
  • cpsf-3
  • cpsf-4
  • fipp-1
  • fust-1
  • gtf-2F1
  • gtf-2F2
  • gtf-2f1
  • gtf-2f2
  • hrp-1
  • hrp-2
  • hrpf-1
  • hrpf-2
  • hrpk-1
  • hrpl-1
  • hrpr-1
  • hrpu-1
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • pabp-2
  • pap-1
  • pcf-11
  • pes-4
  • pfs-2
  • ptb-1
  • rbm-5
  • rbp-1
  • rpb-1
  • rpb-10
  • rpb-11
  • rpb-12
  • rpb-2
  • rpb-3
  • rpb-4
  • rpb-5
  • rpb-6
  • rpb-7
  • rpb-8
  • rpb-9
  • rsp-2
  • rsp-3
  • rsp-4
  • rsp-6
  • rsp-7
  • rsp-8
  • sqd-1
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-4
  • suf-1
  • symk-1
  • tofu-2
Caenorhabditis elegans
CDK-mediated phosphorylation and removal of Cdc6
  • C14C10.5
  • CELE_F35G12.12
  • CELE_T07F10.5
  • CELE_T24A6.1
  • cdc-6
  • cdk-2
  • cya-1
  • cye-1
  • pas-1
  • pas-2
  • pas-3
  • pas-4
  • pas-5
  • pas-6
  • pbs-1
  • pbs-2
  • pbs-3
  • pbs-4
  • pbs-5
  • pbs-7
  • psmd-9
  • psme-3
  • rpn-1
  • rpn-10
  • rpn-11
  • rpn-12
  • rpn-2
  • rpn-3
  • rpn-5
  • rpn-6.1
  • rpn-7
  • rpn-8
  • rpn-9
  • rpt-1
  • rpt-2
  • rpt-3
  • rpt-4
  • rpt-5
  • rpt-6
  • ubia
  • ubib
  • ubl-1
  • ubq-1
  • ubq-2
Caenorhabditis elegans
Cyclin A:Cdk2-associated events at S phase entry
  • CELE_T07F10.5
  • CELE_T24A6.1
  • akt-1
  • akt-2
  • cdc-25.1
  • cdc-25.2
  • cdc-25.3
  • cdc-25.4
  • cdk-2
  • cki-2
  • cya-1
Caenorhabditis elegans
p53-Dependent G1 DNA Damage Response
  • CELE_T07F10.5
  • CELE_T24A6.1
  • cdk-2
  • cki-2
  • cya-1
  • cye-1
Caenorhabditis elegans
DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence
  • CELE_T07F10.5
  • CELE_T24A6.1
  • cdk-2
  • cki-2
  • cya-1
  • cye-1
Caenorhabditis elegans

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Last updated: August 19, 2024