GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 426 - 450 of 499 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
RNA Polymerase II Transcription Termination
  • C49H3.4
  • CELE_K07A1.15
  • CELE_Y53G8AR.6
  • CELE_Y57G11A.5
  • K07C5.6
  • RBM8
  • Y14
  • aly-3
  • casc-3
  • cbp-20
  • cbp-80
  • cdl-1
  • cfim-1
  • cfim-2
  • clpf-1
  • cpf-1
  • cpf-2
  • cpsf-1
  • cpsf-2
  • cpsf-3
  • cpsf-4
  • eif-4A3
  • fipp-1
  • hel-1
  • mag-1
  • mog-1
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • pabp-2
  • pap-1
  • pcf-11
  • pfs-2
  • prp-17
  • rnp-4
  • rnp-5
  • rsp-2
  • rsp-3
  • rsp-4
  • rsp-6
  • rsp-7
  • rsr-1
  • smg-4
  • snr-1
  • snr-2
  • snr-5
  • snr-6
  • snr-7
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-4
  • suf-1
  • symk-1
  • thoc-1
  • thoc-2
  • thoc-3
  • thoc-5
  • thoc-7
  • uaf-1
  • uaf-2
  • znf-236
Caenorhabditis elegans
Signaling by BMP
  • CELE_F35B12.10
  • aka-1
  • cem-1
  • cem-2
  • cem-3
  • cet-1
  • daf-14
  • daf-4
  • daf-7
  • dbl-1
  • let-70
  • sma-2
  • sma-3
  • sma-4
  • sma-6
  • tag-68
  • ubc-2
  • unc-129
Caenorhabditis elegans
Calnexin/calreticulin cycle
  • cnx-1
  • crt-1
  • pdi-3
Caenorhabditis elegans
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+
  • kin-11
  • pkc-2
Caenorhabditis elegans
Erythrocytes take up oxygen and release carbon dioxide
  • abts-4
  • cah-3
  • cah-5
  • cah-6
  • rhr-1
Caenorhabditis elegans
Serotonin Neurotransmitter Release Cycle
  • aex-4
  • cat-1
  • cpx-1
  • lan-2
  • rab-3
  • ric-4
  • rimb-1
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • snn-1
  • snt-1
  • syd-2
  • tag-168
  • tag-81
  • unc-10
  • unc-13
  • unc-18
  • unc-64
  • vamp-7
Caenorhabditis elegans
RHO GTPases activate PKNs
  • CELE_F55C10.5
  • CELE_W04B5.5
  • cdc-25.1
  • cdc-25.2
  • cdc-25.3
  • cdc-25.4
  • ced-10
  • ftt-1
  • ftt-2
  • gsp-1
  • mel-11
  • par-5
  • pkn-1
  • rac-1
  • rho-1
  • rhoa
Caenorhabditis elegans
Degradation of beta-catenin by the destruction complex
  • C14C10.5
  • C44H4.6
  • CELE_F35G12.12
  • R03D7.5
  • apr-1
  • cul-1
  • gsk-3
  • hmp-2
  • kin-19
  • let-92
  • lin-19
  • paa-1
  • pas-1
  • pas-2
  • pas-3
  • pas-4
  • pas-5
  • pas-6
  • pbs-1
  • pbs-2
  • pbs-3
  • pbs-4
  • pbs-5
  • pbs-7
  • pptr-1
  • pptr-2
  • pry-1
  • psmd-9
  • psme-3
  • rbx-1
  • rpn-1
  • rpn-10
  • rpn-11
  • rpn-12
  • rpn-2
  • rpn-3
  • rpn-5
  • rpn-6.1
  • rpn-7
  • rpn-8
  • rpn-9
  • rpt-1
  • rpt-2
  • rpt-3
  • rpt-4
  • rpt-5
  • rpt-6
  • sgg-1
  • skr-1
  • ubia
  • ubib
  • ubl-1
  • ubq-1
  • ubq-2
Caenorhabditis elegans
Inositol transporters
  • hmit-1.3
Caenorhabditis elegans
Synthesis, secretion, and inactivation of Glucagon-like Peptide-1 (GLP-1)
  • dpf-2
Caenorhabditis elegans
Signaling by ROBO receptors
  • C03H12.1
  • gpn-1
  • lon-2
  • sax-3
  • slt-1
Caenorhabditis elegans
Heme signaling
  • C25G4.17
  • clec-185
  • slc-46A
  • slc-46a
  • slcr-46.1
  • slcr-46.2
  • slcr-46.3
  • vem-1
Caenorhabditis elegans
Phospholipase C-mediated cascade: FGFR1
  • egl-15
  • egl-17
  • klo-1
  • klo-2
  • let-756
Caenorhabditis elegans
Calcitonin-like ligand receptors
  • seb-2
Caenorhabditis elegans
Acetylcholine regulates insulin secretion
  • kin-11
  • pkc-2
Caenorhabditis elegans
MHC class II antigen presentation
  • CELE_Y16B4A.2
  • F37H8.5
  • cpl-1
  • cpr-9
  • ctsa-1
  • ctsa-1.1
  • ctsa-1.2
  • ctsa-2
  • ctsa-3.1
  • ctsa-3.2
  • ctsa-4.1
  • ctsa-4.2
  • drd-7
  • tag-196
Caenorhabditis elegans
mRNA Capping
  • ama-1
  • cbp-20
  • cbp-80
  • cdk-7
  • cel-1
  • gtf-2F1
  • gtf-2F2
  • gtf-2H1
  • gtf-2H2C
  • gtf-2H3
  • gtf-2H4
  • gtf-2H5
  • gtf-2f1
  • gtf-2f2
  • gtf-2h1
  • gtf-2h3
  • mnat-1
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • rpb-1
  • rpb-10
  • rpb-11
  • rpb-12
  • rpb-2
  • rpb-3
  • rpb-4
  • rpb-5
  • rpb-6
  • rpb-7
  • rpb-8
  • rpb-9
  • spt-5
  • tag-72
  • xpb-1
  • xpd-1
Caenorhabditis elegans
Vitamin B1 (thiamin) metabolism
  • folt-1
  • folt-2
  • folt-3
  • hpo-12
  • tag-330
  • tpk-1
Caenorhabditis elegans
Chk1/Chk2(Cds1) mediated inactivation of Cyclin B:Cdk1 complex
  • cdc-25.1
  • cdc-25.2
  • cdc-25.3
  • cdc-25.4
  • chkr-1
  • ftt-1
  • ftt-2
  • par-5
Caenorhabditis elegans
Detoxification of Reactive Oxygen Species
  • ctl-3
  • cyc-2.1
  • cyc-2.2
  • gpx-3
  • gpx-5
  • gsr-1
  • gst-1
  • ndx-4
  • prdx-2
  • prdx-3
  • prdx-6
  • prx2
  • sdm-1
  • sod-1
  • sod-2
  • tag-56
  • trx-1
  • trx-2
  • trxr-1
  • trxr-2
Caenorhabditis elegans
Neurofascin interactions
  • sax-7
Caenorhabditis elegans
Neutrophil degranulation
  • B0546.3
  • C01B10.9
  • C03B1.13
  • C03F11.3
  • C05D9.3
  • C07A12.7
  • C25G4.17
  • C27A2.12
  • C27C7.5
  • C28G1.2
  • C33G3.4
  • C35A11.4
  • C36E8.4
  • C39H7.4
  • C49C3.10
  • C53D6.7
  • C54G4.4
  • CELE_F07A5.4
  • CELE_F10D11.6
  • CELE_F11C7.2
  • CELE_F11D5.5
  • CELE_F11D5.7
  • CELE_F11F1.1
  • CELE_F11G11.5
  • CELE_F13B12.2
  • CELE_F13H10.6
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F20H11.4
  • CELE_F21F3.2
  • CELE_F26G1.1
  • CELE_F41C6.4
  • CELE_F43D2.6
  • CELE_F44E2.10
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_F46A8.3
  • CELE_F46A8.4
  • CELE_F46A8.5
  • CELE_F46A8.8
  • CELE_F47B7.2
  • CELE_F47E1.2
  • CELE_F47E1.4
  • CELE_F47G9.6
  • CELE_F48E3.2
  • CELE_F49F1.10
  • CELE_F49F1.11
  • CELE_F49F1.18
  • CELE_F49F1.9
  • CELE_F52E1.2
  • CELE_F53B1.8
  • CELE_F53H8.3
  • CELE_F58D5.2
  • CELE_H20J04.9
  • CELE_H27A22.1
  • CELE_H40L08.1
  • CELE_K02G10.5
  • CELE_K03B8.6
  • CELE_K08F9.1
  • CELE_K08H10.6
  • CELE_K09C4.1
  • CELE_K09C4.4
  • CELE_K09C4.5
  • CELE_M04G7.2
  • CELE_M6.11
  • CELE_R05F9.6
  • CELE_R11H6.5
  • CELE_T10B10.8
  • CELE_T13H5.1
  • CELE_T21B6.3
  • CELE_T22F3.12
  • CELE_T28F4.3
  • CELE_W08E12.7
  • CELE_Y105E8B.9
  • CELE_Y106G6D.4
  • CELE_Y106G6E.1
  • CELE_Y106G6H.14
  • CELE_Y16B4A.2
  • CELE_Y32F6B.1
  • CELE_Y37A1A.3
  • CELE_Y38H6C.8
  • CELE_Y39B6A.41
  • CELE_Y39E4B.5
  • CELE_Y42H9AR.2
  • CELE_Y43F4B.5
  • CELE_Y48G8AL.15
  • CELE_Y50D7A.10
  • CELE_Y51B9A.9
  • CELE_Y57G11C.33
  • CELE_Y70G10A.3
  • CELE_Y71G12B.31
  • CELE_Y71H2AM.12
  • CELE_ZK616.65
  • CELE_ZK829.9
  • F09E5.3
  • F25G6.8
  • F33D4.4
  • PLD
  • R04B3.2
  • R07B1.3
  • R09B5.11
  • R09H10.3
  • SC
  • T19B4.3
  • T22D1.3
  • W03G11.3
  • ZK652.6
  • ZK686.3
  • ZK697.8
  • aagr-1
  • aagr-2
  • abt-1
  • acl-2
  • acly-1
  • acp-5
  • acp-6
  • acp-7
  • acr-12
  • acr-2
  • acr-3
  • acr-6
  • acr-8
  • acs-20
  • acs-22
  • adm-1
  • adm-2
  • aex-1
  • aex-4
  • aex-6
  • agl-1
  • aldo-1
  • aldo-2
  • alh-4
  • aman-1
  • ampd-1
  • amph-1
  • anp-1
  • apa-2
  • aph-2
  • apy-1
  • argn-1
  • arl-8
  • arp-1
  • arp-11
  • arp-2
  • arx-2
  • arx-7
  • asah-1
  • atad-3
  • atg-7
  • bar-1
  • ben-1
  • bgal-1
  • bgal-2
  • cal-5
  • cand-1
  • cas-1
  • cct-2
  • cct-8
  • cctb
  • cdc-48.2
  • cdd-2
  • cdh-4
  • cdk-12
  • cdtl-7
  • ced-10
  • ced-5
  • cfh-1
  • chat-1
  • cht-1
  • cht-3
  • cht-4
  • chtl-1
  • cku-70
  • cku-80
  • clec-149
  • clec-185
  • clec-196
  • clec-199
  • clec-202
  • clec-204
  • clec-224
  • clec-266
  • clec-45
  • clec-47
  • clec-86
  • clec-87
  • clec-88
  • clec-91
  • clp-1
  • clp-3
  • clp-4
  • clp-6
  • clp-7
  • clpr-1
  • clpr-3
  • clpr-4
  • cof-2
  • copb-1
  • cpg-5
  • cpg-6
  • cpi-2
  • cpl-1
  • cpr-9
  • cpz-1
  • ctl-3
  • ctsa-1
  • ctsa-1.1
  • ctsa-1.2
  • ctsa-2
  • ctsa-3.1
  • ctsa-3.2
  • ctsa-4.1
  • ctsa-4.2
  • cubn-1
  • cyk-1
  • daf-21
  • deb-1
  • dep-1
  • dhc-1
  • dlc-1
  • dlc-2
  • dlc-3
  • dlc-4
  • dlc-5
  • dlc-6
  • dli-1
  • dnj-14
  • dnj-7
  • dpf-5
  • drd-7
  • dylt-1
  • eak-5
  • eak-6
  • eef-2
  • eel-1
  • eft-3
  • eft-4
  • erp-44.1
  • fdgt-2
  • fgt-1
  • frm-8
  • ftn-1
  • ftn-2
  • gana-1
  • gck-4
  • gdi-1
  • gex-2
  • gex-3
  • gie
  • gpi-1
  • gska-3
  • gskl-2
  • gsnl-1
  • gst-1
  • gyg-1
  • gyg-2
  • heh-1
  • hex-1
  • hmg-1.2
  • hmp-2
  • hpo-28
  • hsp-1
  • hsp70a
  • hxk-1
  • hxk-2
  • hxk-3
  • ia2
  • ida-1
  • idh-1
  • imb-1
  • inft-2
  • istr-1
  • jac-1
  • kin-10
  • kin-22
  • kin-5
  • laf-1
  • lbp-9
  • lec-1
  • lec-10
  • lec-11
  • lec-2
  • lec-3
  • lec-4
  • lec-5
  • lec-6
  • lec-7
  • lec-8
  • lec-9
  • let-413
  • let-502
  • let-60
  • lev-1
  • lev-7
  • lev-8
  • lin-34
  • lin-41
  • lmp-1
  • lmp-2
  • lmtr-2
  • lmtr-3
  • lon-1
  • ltah-1.1
  • lyst-1
  • mboa-2
  • mif-1
  • mlt-8
  • mop-25.1
  • mop-25.2
  • mop-25.3
  • mpk-1
  • mth-1
  • mth-2
  • ncl-1
  • ndk-1
  • nduc-2
  • nep-1
  • nep-10
  • nep-11
  • nep-12
  • nep-13
  • nep-16
  • nep-17
  • nep-18
  • nep-2
  • nep-20
  • nep-21
  • nep-22
  • nep-23
  • nep-24
  • nep-25
  • nep-26
  • nep-3
  • nep-4
  • nep-6
  • nep-8
  • nep-9
  • nhl-1
  • npr-14
  • npr-32
  • nprt-1
  • ostb-1
  • pas-2
  • pas-5
  • pat-2
  • pat-3
  • pbs-2
  • pcp-5
  • pdxk-1
  • pes-7
  • pfk-1.1
  • pfk-1.2
  • pges-2
  • phi-28
  • pho-1
  • pho-10
  • pho-11
  • pho-12
  • pho-13
  • pho-14
  • pho-4
  • pho-5
  • pho-6
  • pho-7
  • pho-8
  • pho-9
  • pld-1
  • pmk-1
  • pmk-2
  • pmk-3
  • pnp-1
  • prdx-6
  • ptp-2
  • ptp-3
  • pvl-1
  • pxn-1
  • pxn-2
  • pyk-1
  • pyk-2
  • rab-10
  • rab-14
  • rab-18
  • rab-3
  • rab-37
  • rab-5
  • rab-6.2
  • rab-7
  • rab27
  • rac-1
  • rac-2
  • rap-1
  • rap-2
  • rap-3
  • rdy-1
  • rho-1
  • rhoa
  • ric-4
  • rme-8
  • rnst-2
  • rog-1
  • rpn-1
  • rpn-11
  • rpn-2
  • rpn-3
  • rpn-5
  • rpn-6.1
  • rpn-7
  • rpn-8
  • rpn-9
  • rpt-1
  • rpt-5
  • rsef-1
  • sax-7
  • scav-2
  • scav-3
  • scav-4
  • scav-6
  • scl-1
  • scl-10
  • scl-11
  • scl-12
  • scl-13
  • scl-14
  • scl-15
  • scl-17
  • scl-18
  • scl-2
  • scl-20
  • scl-21
  • scl-27
  • scl-3
  • scl-5
  • scl-6
  • scl-7
  • scl-8
  • scl-9
  • scm-1
  • sdf-9
  • sft-4
  • slcf-2
  • smf-1
  • smf-2
  • smf-3
  • snap-29
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • sng-1
  • sorb-1
  • spc-1
  • spp-10
  • spp-8
  • spv-1
  • spy-1
  • src-1
  • src-2
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-3
  • srp-6
  • srp-7
  • srp-8
  • sto-2
  • sul-3
  • sup-17
  • sur-1
  • surf-4
  • tag-120
  • tag-225
  • tag-275
  • tag-282
  • tag-312
  • tag-325
  • tag-81
  • tat-1
  • tat-2
  • tbb-1
  • tbb-2
  • tbb-6
  • tbc-10
  • timp-1
  • tli-1
  • tpa-1
  • trpp-1
  • tsp-12
  • tsp-15
  • tsp-19
  • tsp-20
  • tsp-4
  • tsp-5
  • tsp-6
  • tsp-7
  • ttm-5
  • ubr-4
  • unc-101
  • unc-122
  • unc-29
  • unc-32
  • unc-38
  • unc-63
  • unc-71
  • vamp-7
  • vap-1
  • vap-2
  • vem-1
  • vha-14
  • vha-2
  • vha-20
  • vha-3
  • vha-5
  • vha-6
  • vha-7
  • vpr-1
  • wrm-1
  • xbx-6
  • zmp-1
  • zmp-2
  • zmp-3
  • zmp-5
  • zmp-6
Caenorhabditis elegans
Platelet degranulation
  • C03F11.3
  • C05D9.3
  • C18E9.7
  • C27B7.7
  • C28G1.2
  • C32B5.13
  • C32B5.7
  • C54G4.4
  • CELE_F14B4.1
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F21C10.7
  • CELE_F26H9.2
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_F47B7.2
  • CELE_K02E7.10
  • CELE_K07E8.6
  • CELE_R07E3.1
  • CELE_R07G3.8
  • CELE_R09F10.1
  • CELE_T22A3.6
  • CELE_Y113G7B.15
  • CELE_Y51A2D.8
  • CELE_Y71H2AM.25
  • CELE_Y71H2AR.2
  • CELE_ZK973.11
  • R07B1.3
  • act-1
  • act-2
  • act-3
  • act-4
  • aex-6
  • aipl-1
  • aldo-1
  • aldo-2
  • apl-1
  • atn-1
  • cal-5
  • cdc-37
  • cdh-10
  • cet-1
  • cfh-1
  • chil-10
  • daf-7
  • dbl-1
  • deb-1
  • famp-1
  • fln-1
  • igdb-1
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Caenorhabditis elegans
Phosphate bond hydrolysis by NTPDase proteins
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Caenorhabditis elegans
Postmitotic nuclear pore complex (NPC) reformation
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  • ubc-9
Caenorhabditis elegans

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Last updated: August 19, 2024