GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 151 - 175 of 499 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Unblocking of NMDA receptors, glutamate binding and activation
  • atn-1
  • cal-5
  • dlg-1
  • glr-1
  • glr-2
  • glr-3
  • glr-4
  • glr-5
  • glr-6
  • glr-7
  • let-413
  • nmr-1
  • nmr-2
  • unc-43
Caenorhabditis elegans
Digestion of dietary carbohydrate
  • C50B6.7
  • aagr-1
  • aagr-2
  • cht-1
  • klo-1
Caenorhabditis elegans
VEGFR2 mediated vascular permeability
  • CELE_W04B5.5
  • CeTor
  • akt-1
  • akt-2
  • bar-1
  • cal-5
  • ced-10
  • daf-21
  • hmp-1
  • hmp-2
  • jac-1
  • let-363
  • max-2
  • mlst-8
  • nipi-3
  • pak-1
  • pvl-1
  • rac-1
  • rict-1
  • sinh-1
  • spy-1
  • vav-1
  • wrm-1
Caenorhabditis elegans
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • C33G3.4
  • aman-1
Caenorhabditis elegans
COPII-mediated vesicle transport
  • C28G1.2
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_T10F2.5
  • CELE_Y42H9AR.1
  • CELE_Y59A8B.25
  • CELE_Y59A8B.8
  • CeSec13R
  • cle-1
  • cni-1
  • cnih-2
  • cpz-1
  • glr-1
  • glr-2
  • glr-3
  • glr-4
  • glr-5
  • glr-6
  • glr-7
  • golg-2
  • gosr-2.1
  • ile-1
  • ile-2
  • memb-1
  • nbet-1
  • npp-20
  • nsf-1
  • rab-1
  • sar-1
  • sec-12
  • sec-13
  • sec-16
  • sec-16A.1
  • sec-16A.2
  • sec-16a.2
  • sec-22
  • sec-23
  • sec-24.1
  • sec-24.2
  • sec-31
  • sedl-1
  • sly-1
  • snap-1
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-3
  • srp-6
  • srp-7
  • srp-8
  • syn-3
  • syx-5
  • tbc-20
  • tfg-1
  • trpp-1
  • trpp-10
  • trpp-3
  • trpp-4
  • trpp-5
  • trpp-6
  • trpp-9
  • uso-1
  • ykt-6
Caenorhabditis elegans
Interconversion of polyamines
  • D2023.4
  • hpo-15
Caenorhabditis elegans
PAOs oxidise polyamines to amines
  • hpo-15
Caenorhabditis elegans
Amino acid transport across the plasma membrane
  • glt-1
  • glt-3
  • glt-4
  • glt-5
  • glt-6
  • glt-7
  • skat-1
  • slc-25A29
  • slc-25a29
  • slc-36.1
  • slc-36.2
  • slc-36.3
  • slc-36.4
  • slc-36.5
  • snf-2
  • snf-5
  • snf-7
  • snf-9
Caenorhabditis elegans
RAC1 GTPase cycle
  • C05D9.3
  • CELE_F22G12.5
  • CELE_F23H11.4
  • CELE_F46H5.4
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y105E8A.25
  • CELE_Y57G11C.1147
  • PLD
  • aap-1
  • abi-1
  • abl-1
  • aex-4
  • age-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdc-42
  • ced-10
  • ced-5
  • cgef-1
  • chin-1
  • citk-1
  • citk-2
  • cyk-1
  • cyk-4
  • ect-2
  • ephx-1
  • fozi-1
  • frm-3
  • gap
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gei-1
  • gex-2
  • gex-3
  • git-1
  • glt-1
  • glt-3
  • glt-4
  • glt-5
  • glt-6
  • glt-7
  • gpa-12
  • hum-7
  • kin-18
  • let-341
  • let-99
  • magu-1
  • max-2
  • mrck-1
  • pac-1
  • pak-1
  • pak-2
  • par-6
  • pes-7
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  • pkn-1
  • pld-1
  • rab-7
  • rac-1
  • rga-1
  • rga-2
  • rga-5
  • rga-8
  • rga-9
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  • rhi-1
  • ric-4
  • rlbp-1
  • snb-1
  • sos-1
  • spv-1
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  • sulu
  • syd-1
  • tag-325
  • tag-77
  • tag-81
  • tiam-1
  • toe-2
  • uig-1
  • unc-112
  • unc-73
  • vab-1
  • vang-1
  • vav-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
RAC3 GTPase cycle
  • C05D9.3
  • CELE_F22G12.5
  • CELE_F23H11.4
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y34B4A.4
  • CELE_Y57G11C.1147
  • aap-1
  • abi-1
  • abl-1
  • aex-4
  • cav-1
  • cav-2
  • cdc-42
  • cdh-4
  • ced-10
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  • cyk-4
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  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
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  • gex-3
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  • magu-1
  • max-2
  • ocrl-1
  • pac-1
  • pak-1
  • pak-2
  • rab-7
  • rac-1
  • rga-1
  • rga-5
  • rga-6
  • rga-8
  • rhi-1
  • ric-4
  • snb-1
  • srgp-1
  • sulu
  • syd-1
  • tag-325
  • tag-81
  • tiam-1
  • toe-2
  • unc-112
  • unc-73
  • vab-1
  • vang-1
  • vav-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides
  • ctns-1
  • glt-1
  • glt-3
  • glt-4
  • glt-5
  • glt-6
  • glt-7
  • slc-25A26
  • slc-25a26
  • unc-47
Caenorhabditis elegans
Astrocytic Glutamate-Glutamine Uptake And Metabolism
  • gln-1
  • gln-2
  • gln-3
  • gln-5
  • gln-6
  • glt-1
  • glt-3
  • glt-4
  • glt-5
  • glt-6
  • glt-7
Caenorhabditis elegans
Synthesis of Leukotrienes (LT) and Eoxins (EX)
  • C53D5.5
  • CELE_H14N18.4
  • CELE_T03D8.6
  • CELE_T19H12.6
  • CELE_Y7A9A.1
  • CELE_Y97E10AR.2
  • ltah-1.1
  • mrp-1
Caenorhabditis elegans
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • AC3.5
  • C28G1.2
  • CELE_F02D8.4
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F41C6.4
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_F49B2.6
  • CELE_R03G8.6
  • CELE_T06A4.1
  • CELE_T06A4.3
  • CELE_T12E12.6
  • CELE_W01A8.6
  • CELE_Y18H1A.9
  • CELE_Y42A5A.1
  • CELE_Y53F4B.20
  • CELE_Y59C2A.1
  • CELE_Y67D8C.9
  • CELE_ZC434.9
  • T16G12.1
  • acn-1
  • anp-1
  • asp-1
  • asp-10
  • asp-12
  • asp-13
  • asp-14
  • asp-15
  • asp-16
  • asp-17
  • asp-18
  • asp-19
  • asp-2
  • asp-3
  • asp-4
  • asp-5
  • asp-6
  • asp-7
  • asp-8
  • asp-9
  • cest-1
  • cest-1.1
  • cest-1.2
  • cest-12
  • cest-13
  • cest-16
  • cest-17
  • cest-19
  • cest-2.1
  • cest-2.2
  • cest-2.3
  • cest-24
  • cest-26
  • cpz-1
  • ges-1
  • hrg-7
  • nep-1
  • nep-10
  • nep-11
  • nep-12
  • nep-13
  • nep-16
  • nep-17
  • nep-18
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  • nep-20
  • nep-21
  • nep-22
  • nep-23
  • nep-24
  • nep-25
  • nep-26
  • nep-3
  • nep-4
  • nep-6
  • nep-8
  • nep-9
  • pam-1
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-3
  • srp-6
  • srp-7
  • srp-8
  • suro-1
  • vha-20
Caenorhabditis elegans
Erythrocytes take up carbon dioxide and release oxygen
  • abts-4
  • cah-3
  • cah-5
  • cah-6
  • rhr-1
Caenorhabditis elegans
Erythrocytes take up oxygen and release carbon dioxide
  • abts-4
  • cah-3
  • cah-5
  • cah-6
  • rhr-1
Caenorhabditis elegans
Regulation of IGF Activity by IGFBP
  • B0524.2
  • C16E9.1
  • C18E9.7
  • C28G1.2
  • CELE_D1054.1
  • CELE_F07F6.7
  • CELE_F07F6.8
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_F47B7.2
  • CELE_M04D5.1
  • CELE_W01A8.8
  • CELE_Y64G10A.7
  • CELE_ZK1307.8
  • W03G11.3
  • Y71H2AM.10
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  • dbl-1
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  • sdn-1
  • sparc
  • srp-1
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  • srp-7
  • srp-8
  • sup-17
  • tag-225
  • tag-320
  • timp-1
  • unc-129
Caenorhabditis elegans
Post-translational protein phosphorylation
  • B0524.2
  • C16E9.1
  • C18E9.7
  • C28G1.2
  • CELE_D1054.1
  • CELE_F07F6.7
  • CELE_F07F6.8
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_F47B7.2
  • CELE_M04D5.1
  • CELE_W01A8.8
  • CELE_Y64G10A.7
  • CELE_ZK1307.8
  • W03G11.3
  • Y71H2AM.10
  • anoh-2
  • apl-1
  • atgl-1
  • calu-1
  • cet-1
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  • daf-7
  • dbl-1
  • dnj-7
  • egl-17
  • enpl-1
  • famk-1
  • lec-2
  • nid-1
  • nucb-1
  • ost-1
  • pdi-1
  • pdi-2
  • pdi-6
  • sdn-1
  • sparc
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-3
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  • srp-7
  • srp-8
  • sup-17
  • tag-225
  • tag-320
  • timp-1
  • unc-129
Caenorhabditis elegans
RHOB GTPase cycle
  • C07B5.4
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y105E8A.25
  • aap-1
  • aex-4
  • ani-2
  • bar-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdh-10
  • cgef-1
  • cyk-1
  • cyk-4
  • daam-1
  • ect-2
  • ephx-1
  • gck-4
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gei-1
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  • hum-7
  • inft-2
  • let-502
  • let-99
  • osg-1
  • pes-7
  • pkn-1
  • pvl-1
  • rga-1
  • rga-5
  • rhgf-1
  • rhi-1
  • rho-1
  • rhoa
  • ric-4
  • snb-1
  • spy-1
  • sto-2
  • tag-81
  • toe-2
  • unc-73
  • vang-1
  • vav-1
  • wrm-1
  • zoo-1
Caenorhabditis elegans
Bicarbonate transporters
  • abts-1
  • abts-4
Caenorhabditis elegans
Postmitotic nuclear pore complex (NPC) reformation
  • CeSec13R
  • npp-10
  • npp-15
  • npp-18
  • npp-2
  • npp-20
  • npp-23
  • npp-5
  • npp-6
  • nup133
  • ran-1
  • ran-2
  • ran-3
  • sec-13
  • smo-1
  • smt3
  • srap-1
  • sumo
  • ubc-9
Caenorhabditis elegans
RAC2 GTPase cycle
  • C05D9.3
  • CELE_F22G12.5
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y57G11C.1147
  • CELE_Y67A10A.7
  • CELE_Y71H2AM.12
  • PLD
  • aap-1
  • abi-1
  • age-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdc-42
  • cdh-4
  • ced-10
  • ced-5
  • cgef-1
  • cyk-1
  • cyk-4
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gex-2
  • gex-3
  • git-1
  • gop-3
  • kin-18
  • let-99
  • magu-1
  • max-2
  • mtx-1
  • pak-1
  • pak-2
  • pes-7
  • pld-1
  • rab-7
  • rac-1
  • rac-2
  • rga-1
  • rga-5
  • rga-8
  • rhi-1
  • snb-1
  • sulu
  • syd-1
  • tiam-1
  • toe-2
  • unc-73
  • vab-1
  • vang-1
  • vav-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
RHOU GTPase cycle
  • CELE_T24B8.7
  • aap-1
  • cdc-42
  • chc-1
  • chw-1
  • gap-3
  • git-1
  • hgrs-1
  • hum-8
  • itsn-1
  • kin-32
  • let-99
  • magu-4
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  • nck-1
  • pak-1
  • pak-2
  • par-6
  • pes-7
  • pix-1
  • pqn-19
  • sem-5
  • spc-1
  • srgp-1
  • stam-1
  • toe-2
  • txl
  • txl-1
  • unc-70
  • vab-1
  • vab-10
  • vang-1
  • wwp-1
Caenorhabditis elegans
RHOV GTPase cycle
  • C09G1.4
  • CELE_T24B8.7
  • CELE_Y53F4B.1
  • aap-1
  • cdc-42
  • chc-1
  • chw-1
  • gap
  • gap-3
  • git-1
  • hum-7
  • let-99
  • lev-11
  • magu-4
  • max-2
  • nck-1
  • pac-1
  • pak-1
  • pak-2
  • par-6
  • pes-7
  • pix-1
  • spc-1
  • tag-325
  • tmy-1
  • toe-2
  • txl
  • txl-1
  • unc-70
  • vab-1
  • vab-10
  • vang-1
Caenorhabditis elegans
Ephrin signaling
  • ced-10
  • efn-2
  • efn-3
  • efn-4
  • gap-3
  • git-1
  • mab-26
  • max-2
  • mlc-4
  • nck-1
  • pak-1
  • pix-1
  • rac-1
  • src-1
  • vab-1
  • vab-2
Caenorhabditis elegans

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024