GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 226 - 250 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Fatty acyl-CoA biosynthesis
  • Acac
  • Acaca
  • Acly
  • Acsvl1
  • Cbr4
  • Cln1
  • Facvl1
  • Fasn
  • Fatp2
  • Hsd17b8
  • Morc2
  • Ppt
  • Ppt1
  • Ppt2
  • Rpp14
  • Scd2
  • Slc27a2
  • Vlacs
  • Vlcs
Rattus norvegicus (Norway rat)
BBSome-mediated cargo-targeting to cilium
  • Arl6
  • Bbs1
  • Bbs2
  • Bbs4
  • Bbs7
  • Bbs9
  • Gpr24
  • Lztfl1
  • Mchr1
  • Rab3ip
  • Rabin3
  • Rabin8
  • Slc1
  • Smo
  • Smoh
  • Sstr3
  • Ttc8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides
  • Ctns
  • Eaac1
  • Eaat1
  • Eaat2
  • Eaat3
  • Eaat4
  • Glt1
  • Slc1a1
  • Slc1a2
  • Slc1a3
  • Slc1a6
  • Slc1a7
  • Slc25a26
  • Slc32a1
  • Vgat
  • Viaat
Rattus norvegicus (Norway rat)
Activation of the phototransduction cascade
  • CNCG2
  • CNCG3L
  • CNCG4
  • Cncg
  • Cncg1
  • Cnga1
  • Cngb1
  • Gnat1
  • Gnb1
  • Gngt1
  • Pde6a
  • Pde6b
  • Pde6g
  • RCNC2
  • Rho
Rattus norvegicus (Norway rat)
Neurofascin interactions
  • Ank1
  • Nfasc
  • Sdcbp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Deposition of new CENPA-containing nucleosomes at the centromere
  • Cenpc
  • Cenpc1
  • Cenph
  • Cenpi
  • Cenpk
  • Cenpl
  • Cenpm
  • Cenpn
  • Cenpo
  • Cenpp
  • Cenpq
  • Cenpr
  • Cenpt
  • Cenpu
  • Cenpw
  • Cug2
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • Fshprh1
  • H2ab3
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac4
  • H2afb3
  • H2afx
  • H2aj
  • H2ax
  • H2az2
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Hjurp
  • Itgb3bp
  • Knl1
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120097726
  • LOC679342
  • LOC681185
  • LOC684797
  • Lrpr1
  • Mis18a
  • Mis18bp1
  • Mlf1ip
  • Npm1
  • Nrif3
  • Oip5
  • Rbbp4
  • Rbbp7
  • Rsf1
  • Ruvbl1
  • Smarca5
  • Th2b
  • Tip49
  • Tip49a
Rattus norvegicus (Norway rat)
Processing of SMDT1
  • Afg3l2
  • Bcap37
  • Cbara1
  • Efha1
  • Maip1
  • Mcu
  • Mcub
  • Micu1
  • Micu2
  • Micu3
  • Mppa
  • Mppb
  • Parl
  • Phb
  • Phb1
  • Phb2
  • Pmpca
  • Pmpcb
  • Psarl
  • Smdt1
  • Smhs2
  • Spg7
  • Stoml2
  • Yme1l1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein
  • Alg1
  • Alg12
  • Alg13
  • Alg14
  • Alg2
  • Alg3
  • Alg6
  • Alg8
  • Alg9
  • Dpagt1
  • Mpdu1
Rattus norvegicus (Norway rat)
DAP12 signaling
  • Ash
  • B2m
  • Btk
  • Cd94
  • Dap12
  • Fyn
  • Grap2
  • Grb2
  • Hras
  • Hras1
  • Klrc1
  • Klrd1
  • Klrk1
  • Kras
  • Kras2
  • Lat
  • Lck
  • Lcp2
  • Nkg2d
  • Nkrp2
  • Nras
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Plcg1
  • Plcg2
  • Rac
  • Rac1
  • Shc1
  • Sos1
  • Syk
  • Trem2
  • Tyrobp
  • Vav2
  • Vav3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interconversion of nucleotide di- and triphosphates
  • Ak1
  • Ak2
  • Ak3l1
  • Ak4
  • Ak5
  • Ak6
  • Ak7
  • Ak8
  • Ak9
  • Akd2
  • Cinap
  • Cmpk
  • Cmpk1
  • Ctps1
  • Ctps2
  • Dctd
  • Dtymk
  • Dut
  • Dutp
  • Glrx
  • Glrx1
  • Grx
  • Gsr
  • Guk1
  • Nme1
  • Nme2
  • Nme3
  • Nudt13
  • RGD1559879
  • Rrm1
  • Rrm2
  • Rrm2b
  • Trxr1
  • Txn
  • Txn1
  • Txnrd1
  • Tyms
Rattus norvegicus (Norway rat)
PDH complex synthesizes acetyl-CoA from PYR
  • Dlat
  • Dld
  • LOC311254
  • Pdha1
  • Pdha1l1
  • Pdha2
  • Pdhb
  • Pdhx
Rattus norvegicus (Norway rat)
GABA receptor activation
  • Arhgef9
  • Gabra-1
  • Gabra-2
  • Gabra-3
  • Gabra-5
  • Gabra-6
  • Gabra1
  • Gabra2
  • Gabra3
  • Gabra4
  • Gabra5
  • Gabra6
  • Gabrb-1
  • Gabrb-2
  • Gabrb-3
  • Gabrb1
  • Gabrb2
  • Gabrb3
  • Gabrg2
  • Gabrg3
  • Gabrq
  • Gabrr1
  • Gabrr2
  • Gabrr3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Abacavir transmembrane transport
  • Oct1
  • Oct2
  • Oct3
  • Slc22a1
  • Slc22a2
  • Slc22a3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Hedgehog 'off' state
  • Adcy1
  • Adcy10
  • Adcy2
  • Adcy3
  • Adcy4
  • Adcy5
  • Adcy6
  • Adcy7
  • Adcy8
  • Adcy9
  • Dhc1b
  • Dlp4
  • Dnch2
  • Dnchc2
  • Dync2h1
  • Fuz
  • Gli1
  • Gli2
  • Gli3
  • Gpr161
  • Ift122
  • Ift140
  • Ift172
  • Ift52
  • Ift57
  • Ift88
  • Intu
  • Kif3a
  • Kif7
  • LOC100364088
  • Mks1
  • Ofd1
  • Pdzd6
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Prkar1a
  • Prkar1b
  • Prkar2a
  • Prkar2b
  • Ptch
  • Ptch1
  • Rpgrip1l
  • Sac
  • Slb
  • Smo
  • Smoh
  • Sufu
  • Ttc21b
  • Tulp3
  • Wdr19
  • Wdr35
Rattus norvegicus (Norway rat)
Activated NTRK2 signals through FRS2 and FRS3
  • Ash
  • Bdnf
  • Frs2
  • Grb2
  • Nt4
  • Ntf4
  • Ntf5
  • Ntrk2
  • Sos1
  • Trkb
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interleukin-10 signaling
  • Il-10
  • Il10
  • Il10ra
  • Il10rb
  • Jak1
  • Stat3
  • Tyk2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Signaling by ERBB2
  • Btc
  • Cdc37
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Erbb2
  • Erbb3
  • Ereg
  • Fyn
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • Ndf
  • Neu
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Nrg3
  • Ntak
  • Src
  • Yes1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Prostanoid ligand receptors
  • Crth2
  • Gpr44
  • Ptgdr
  • Ptgdr2
  • Ptgdrl
  • Ptger1
  • Ptger2
  • Ptger3
  • Ptger4
  • Ptgfr
  • Ptgir
  • Tbxa2r
Rattus norvegicus (Norway rat)
G alpha (q) signalling events
  • 5ht1c
  • A4
  • AD1
  • Adra1a
  • Adra1b
  • Adra1c
  • Adra1d
  • Adrbk1
  • Agt
  • Agtr1
  • Agtr1a
  • Anx1
  • Anxa1
  • App
  • Arhgef25
  • At1a
  • Avp
  • Avpr1a
  • B1bkr
  • Bdkrb1
  • Bdkrb2
  • Bkr
  • Blt
  • Brs3
  • Btk
  • Bv8
  • Casr
  • Cck
  • Cckar
  • Cckbr
  • Ccl6
  • Ccl9
  • Chrm-1
  • Chrm-3
  • Chrm-5
  • Chrm1
  • Chrm3
  • Chrm5
  • Cyslt1
  • Cyslt2
  • Cysltr1
  • Cysltr2
  • Duo
  • Edg2
  • Edg7
  • Edn1
  • Edn2
  • Edn3
  • Ednra
  • Ednrb
  • F2
  • F2r
  • F2rl1
  • F2rl2
  • F2rl3
  • Ffar1
  • Ffar2
  • Ffar3
  • Ffar4
  • Fpr2
  • Gaip
  • Gas
  • Gast
  • Gcg
  • Gcgr
  • Geft
  • Ghrl
  • Ghsr
  • Gna11
  • Gna14
  • Gna15
  • Gnaq
  • Gnb1
  • Gnb2
  • Gnb3
  • Gnb4
  • Gnb5
  • Gng10-ps1
  • Gng11
  • Gng12
  • Gng3
  • Gng4
  • Gng5
  • Gng5-ps4
  • Gng7
  • Gng8
  • Gng9
  • Gngt1
  • Gngt11
  • Gngt5
  • Gngt7
  • Gngt9
  • Gnrh
  • Gnrh1
  • Gnrhr
  • Gpcr91
  • Gpr120
  • Gpr132
  • Gpr14
  • Gpr143
  • Gpr147
  • Gpr154
  • Gpr17
  • Gpr24
  • Gpr39
  • Gpr4
  • Gpr40
  • Gpr41
  • Gpr43
  • Gpr54
  • Gpr65
  • Gpr66
  • Gpr68
  • Gpr73
  • Gpr73l1
  • Gpr74
  • Gprc1a
  • Gprc1e
  • Gprc2a
  • Gprc6a
  • Grk2
  • Grm1
  • Grm5
  • Grp
  • Grpr
  • Hapip
  • Hcrt
  • Hcrtr1
  • Hcrtr2
  • Hrh1
  • Htr1c
  • Htr2
  • Htr2a
  • Htr2b
  • Htr2c
  • Kalrn
  • Kiss1
  • Kiss1r
  • Kng
  • Kng1
  • Lpa1
  • Lpa3
  • Lpar1
  • Lpar2
  • Lpar3
  • Lpar4
  • Lpar5
  • Lpar6
  • Ltb4r
  • Ltb4r2
  • Ltn
  • Mch
  • Mchr1
  • Mglur1
  • Mglur5
  • Nka
  • Nkna
  • Nknb
  • Nmb
  • Nmbr
  • Nms
  • Nmu
  • Nmur1
  • Nmur2
  • Npff
  • Npff1
  • Npff2
  • Npffr1
  • Npffr2
  • Npgpr
  • Nps
  • Npsr1
  • Ntr2
  • Nts
  • Ntsr
  • Ntsr1
  • Ntsr2
  • O3far1
  • Opn4
  • Ot
  • Otr
  • Ox
  • Oxt
  • Oxtr
  • P2ru1
  • P2ry1
  • P2ry10
  • P2ry2
  • P2ry5
  • P2ry6
  • P2y5
  • P518
  • Par1
  • Par2
  • Par3
  • Par4
  • Pcar1
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Pkr1
  • Pkr2
  • Plcb1
  • Plcb2
  • Plcb3
  • Plcb4
  • Pmch
  • Ppox
  • Prok1
  • Prok2
  • Prokr1
  • Prokr2
  • Ptafr
  • Ptger1
  • Ptgfr
  • Qrfp
  • Qrfprl
  • RGD1560028
  • Rgs1
  • Rgs13
  • Rgs16
  • Rgs17
  • Rgs18
  • Rgs19
  • Rgs2
  • Rgs21
  • Rgs3
  • Rgs4
  • Rgs5
  • Rgsl1
  • Rgsr
  • Scyc1
  • Senr
  • Serpina8
  • Slc1
  • Srl
  • Tac1
  • Tac1r
  • Tac2
  • Tac2r
  • Tac3
  • Tac3r
  • Tacr1
  • Tacr2
  • Tacr3
  • Tbxa2r
  • Tgr1
  • Trh
  • Trhr
  • Trio
  • Urp
  • Uts2
  • Uts2b
  • Uts2d
  • Uts2r
  • XCR1
  • Xcl1
  • Xcr1
Rattus norvegicus (Norway rat)
FGFR1c and Klotho ligand binding and activation
  • Fgf23
  • Fgfr1
  • Flg
  • Kl
Rattus norvegicus (Norway rat)
Hormone ligand-binding receptors
  • Cga
  • Cga1
  • Fshb
  • Fshr
  • Gnrh
  • Gnrh1
  • Gnrhr
  • Gpa2
  • Gpb5
  • Gpha2
  • Gphb5
  • Lhb
  • Lhcgr
  • Tshb
  • Tshr
  • Zsig51
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of PI
  • Cdipt
  • Cds
  • Cds1
  • Nir2
  • Pis1
  • Pitpnm
  • Pitpnm1
  • Pitpnm2
  • Pitpnm3
Rattus norvegicus (Norway rat)
GPVI-mediated activation cascade
  • Arha
  • Arha2
  • Arhb
  • Cdc42
  • Clec1b
  • Fce1g
  • Fcer1g
  • Fyn
  • G6b
  • Gp6
  • Lat
  • Lck
  • Lcp2
  • Lyn
  • Mpig6b
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Pdpn
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3cg
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Pik3r5
  • Pik3r6
  • Plcg2
  • Ptph6
  • Ptpn11
  • Ptpn6
  • Rac
  • Rac1
  • Rac2
  • Rhoa
  • Rhob
  • Rhog
  • Syk
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glycosphingolipid biosynthesis
  • A4galt
  • B3galnt1
  • B3galt3
  • B3galt4
  • B3gnt5
  • B4galnt1
  • B4galt5
  • B4galt6
  • Cerk
  • Cgt
  • Fta
  • Ftb
  • Fut1
  • Fut2
  • Gal3st1
  • Galgt
  • Galgt1
  • Sec1
  • Siat4b
  • Siat5
  • Siat6
  • Siat8e
  • Siat9
  • St3gal2
  • St3gal3
  • St3gal5
  • St6galnac5
  • St6galnac6
  • St8sia5
  • St8siav
  • Ugcg
  • Ugt4
  • Ugt8
Rattus norvegicus (Norway rat)
G alpha (s) signalling events
  • Adrb2
  • Adrb2r
  • Adrbk1
  • Adrbk2
  • Arrb1
  • Arrb2
  • Dpde1
  • Gprk5
  • Gprk6
  • Grk2
  • Grk3
  • Grk5
  • Grk6
  • Pde10a
  • Pde11a
  • Pde1a
  • Pde1b
  • Pde1b1
  • Pde2a
  • Pde3a
  • Pde3b
  • Pde4a
  • Pde4c
  • Pde4d
  • Pde7a
  • Pde7b
  • Pde8a
  • Pde8b
  • RNPDE8A
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024