GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 576 - 600 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Azathioprine ADME
  • Abcc4
  • Abcc5
  • Cnt2
  • Cnt3
  • Ent1
  • Ent2
  • Gmps
  • Gsta1
  • Gsta2
  • Gsta3
  • Gsta5
  • Gsta6
  • Gstm2
  • Gstyc1
  • Gstyc2
  • Guk1
  • Hprt
  • Hprt1
  • Impdh1
  • Impdh2
  • Mrp4
  • Mrp5
  • Nme1
  • Nme2
  • Nudt15
  • Rac
  • Rac1
  • Slc28a2
  • Slc28a3
  • Slc29a1
  • Slc29a2
  • Spnt
  • Tpmt
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
  • Xdh
Rattus norvegicus (Norway rat)
Dermatan sulfate biosynthesis
  • Bcan
  • Behab
  • Bgn
  • Caleb
  • Chst14
  • Cspg2
  • Cspg3
  • Cspg4
  • Cspg5
  • Dcn
  • Dse
  • Dsel
  • Ncan
  • Ng2
  • Ngc
  • Ust
  • Vcan
Rattus norvegicus (Norway rat)
activated TAK1 mediates p38 MAPK activation
  • Csbp1
  • Csbp2
  • ENSRNOG00000067007
  • Ikbkg
  • Irak1
  • Irak2
  • Map2k3
  • Map2k6
  • Map3k7
  • Map3k7ip2
  • Mapk11
  • Mapk14
  • Mapkapk2
  • Mapkapk3
  • Mkk6
  • Nemo
  • Nod1
  • Nod2
  • Ripk2
  • Tab1
  • Tab2
  • Tab3
  • Traf6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Peptide hormone biosynthesis
  • Bdp
  • Nec-1
  • Nec1
  • Pcsk1
  • Pomc
  • Pomc2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Cell-extracellular matrix interactions
  • Abpl
  • Actp
  • Fblim1
  • Fermt2
  • Fln2
  • Flna
  • Flnc
  • ILK1
  • ILK2
  • Ilk
  • Lims1
  • Lims2
  • Parva
  • Parvb
  • Vasp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Potassium transport channels
  • Kab-2
  • Kcnj1
  • Kcnj10
  • Kcnj16
  • Romk1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Presynaptic function of Kainate receptors
  • Glur7
  • Grik3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle
  • Bzrap1
  • Cplx1
  • Maoa
  • Oct1
  • Oct2
  • Ppfia1
  • Ppfia2
  • Ppfia3
  • Ppfia4
  • Rab3a
  • Rbp1
  • Rim1
  • Rims1
  • Sap
  • Slc18a2
  • Slc22a1
  • Slc22a2
  • Snap
  • Snap25
  • Stx1a
  • Stxbp1
  • Svat
  • Syb2
  • Syt1
  • Tspoap1
  • Unc13b
  • Unc13h2
  • Unc18a
  • Vamp2
  • Vmat2
Rattus norvegicus (Norway rat)
WNT5A-dependent internalization of FZD4
  • Adtab
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Arrb2
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltb
  • Cltc
  • Dvl2
  • Fzd4
  • LOC100361515
  • Pkca
  • Pkcb
  • Pkcc
  • Pkcg
  • Prkca
  • Prkcb
  • Prkcb1
  • Prkcc
  • Prkcg
  • Wnt-5a
  • Wnt5a
Rattus norvegicus (Norway rat)
NGF-stimulated transcription
  • Chd4
  • Creb-1
  • Creb1
  • Egr-2
  • Egr2
  • Krox-20
  • Krox20
  • Nab2
  • Sgk
  • Sgk1
  • Srf
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of PIPs at the early endosome membrane
  • Inpp4a
  • Inpp4b
  • Inpp5f
  • Mtm1
  • Mtmr12
  • Mtmr2
  • Mtmr4
  • Pi4k2a
  • Pi4k2b
  • Pi4kii
  • Pik3c2a
  • Pik3c3
  • Pik3r4
  • Pikfyve
  • Pip3ap
  • Vac14
  • Vps34
Rattus norvegicus (Norway rat)
RAB geranylgeranylation
  • Chm
  • Chml
  • Ggta
  • Ggtb
  • Prl2
  • Ptp4a2
  • Rab1
  • Rab10
  • Rab11
  • Rab11a
  • Rab11b
  • Rab12
  • Rab13
  • Rab14
  • Rab15
  • Rab16
  • Rab17
  • Rab18
  • Rab19
  • Rab1A
  • Rab1b
  • Rab2
  • Rab20
  • Rab21
  • Rab22a
  • Rab23
  • Rab26
  • Rab27
  • Rab27a
  • Rab27b
  • Rab29
  • Rab2a
  • Rab2b
  • Rab30
  • Rab31
  • Rab33a
  • Rab33b
  • Rab34
  • Rab35
  • Rab36
  • Rab37
  • Rab38
  • Rab39a
  • Rab3a
  • Rab3b
  • Rab3c
  • Rab3d
  • Rab4
  • Rab40b
  • Rab40c
  • Rab43
  • Rab44
  • Rab4a
  • Rab4b
  • Rab5a
  • Rab5b
  • Rab5c
  • Rab6
  • Rab6a
  • Rab6b
  • Rab7
  • Rab7a
  • Rab7b
  • Rab7l1
  • Rab8
  • Rab8a
  • Rab8b
  • Rab9
  • Rab9a
  • Rab9b
  • Rabggta
  • Rabggtb
  • Rep1
Rattus norvegicus (Norway rat)
PI Metabolism
  • Tnfaip8
  • Tnfaip8l1
  • Tnfaip8l2
  • Tnfaip8l3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phase 2 - plateau phase
  • Akap9
  • Cach2
  • Cacn2
  • Cacna1c
  • Cacna2d2
  • Cacnb1
  • Cacnb2
  • Cacng4
  • Cacng6
  • Cacng7
  • Cacng8
  • Cacnl1a1
  • Cacnlb1
  • Cacnlb2
  • Cchl1a1
  • Kcna9
  • Kcne1l
  • Kcne2
  • Kcne3
  • Kcne4
  • Kcne5
  • Kcnq1
  • Kvlqt1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interleukin-7 signaling
  • Baf190a
  • Brg1
  • Brwd1
  • H3c13
  • Hist2h3c2
  • Il7
  • Il7r
  • Irs-1
  • Irs1
  • Irs2
  • Jak1
  • Jak3
  • Mgf
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Smarca4
  • Snf2b
  • Snf2l4
  • Stat3
  • Stat5a
  • Stat5b
  • Tslp
Rattus norvegicus (Norway rat)
FRS-mediated FGFR3 signaling
  • Ash
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf23
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf7a
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr3
  • Frs2
  • Frs3
  • Grb2
  • Hras
  • Hras1
  • Kras
  • Kras2
  • Nras
  • Ptpn11
  • Snt2
  • Sos1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains
  • AABR07044416.1
  • Arrb2-ps
  • Cbp
  • Cd247
  • Cd3d
  • Cd3e
  • Cd3g
  • Cd4
  • Csk
  • DA1
  • Db2
  • ENSRNOG00000065769
  • ENSRNOG00000065908
  • ENSRNOG00000065955
  • ENSRNOG00000070909
  • H2-Ea
  • Hla-dma
  • Hla-dmb
  • LOC100911800
  • Lck
  • Pag
  • Pag1
  • Psmb9
  • Ptpn22
  • Ptprc
  • Ptprj
  • RT1-Ba
  • RT1-Bb
  • RT1-DOb
  • RT1-Da
  • RT1-Db1
  • RT1-Db2
  • RT1-Ha
  • RT1-Hb-ps1
  • T3d
  • Tap1
  • Tap2
  • Tesb
  • Trbv16
Rattus norvegicus (Norway rat)
alpha-linolenic acid (ALA) metabolism
  • Abcd1
  • Acaa1
  • Acaa1b
  • Acot8
  • Acox
  • Acox1
  • Acs1
  • Acsl1
  • Acsl2
  • ELOVL1
  • ELOVL3
  • Edh17b4
  • Elovl1
  • Elovl2
  • Elovl3
  • Elovl5
  • Facl2
  • Fads1
  • Fads2
  • Fadsd6
  • Hsd17b4
  • Pte1
  • Scp-2
  • Scp2
  • Ssc2
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHOBTB3 ATPase cycle
  • Ccne
  • Ccne1
  • Cul3
  • Hgs
  • Hrs
  • Hrs2
  • Htr7
  • Lrrc41
  • Rab9
  • Rab9a
  • Rab9b
  • Rhobtb3
  • Vhl
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ribosomal scanning and start codon recognition
  • AABR07029195.1
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S12
  • EIF3S5
  • EIF3S6IP
  • Eif1a
  • Eif2a
  • Eif2g
  • Eif2s1
  • Eif2s2
  • Eif2s3
  • Eif2s3x
  • Eif3a
  • Eif3b
  • Eif3c
  • Eif3d
  • Eif3e
  • Eif3f
  • Eif3g
  • Eif3h
  • Eif3i
  • Eif3j
  • Eif3k
  • Eif3l
  • Eif3m
  • Eif3s1
  • Eif3s10
  • Eif3s2
  • Eif3s3
  • Eif3s4
  • Eif3s6
  • Eif3s7
  • Eif3s8
  • Eif3s9
  • Eif4a1
  • Eif4a2
  • Eif4e
  • Eif4g1
  • Eif4h
  • Eif5
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • Int6
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • Lamr1
  • Rig
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
  • Rps13
  • Rps14
  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
  • Rps17
  • Rps18
  • Rps19
  • Rps2
  • Rps20
  • Rps21
  • Rps23
  • Rps24
  • Rps25
  • Rps26
  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
  • Rps26l6
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
  • Rps29
  • Rps3
  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Uba80
  • Ubcep1
  • Wbscr1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Biosynthesis of electrophilic ω-3 PUFA oxo-derivatives
  • Alox5
  • Cox-2
  • Cox2
  • Ptgs2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Leukotriene receptors
  • Blt
  • Cyslt1
  • Cyslt2
  • Cysltr1
  • Cysltr2
  • Gpr17
  • Ltb4r
  • Ltb4r2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Complex I biogenesis
  • AABR07056686.1
  • Acad9
  • Ecsit
  • Hrpap20
  • Ip13
  • LOC100363268
  • LOC100911483
  • LOC103691107
  • LOC120101567
  • LOC684509
  • Mt-nd1
  • Mt-nd2
  • Mt-nd3
  • Mt-nd4
  • Mt-nd5
  • Mt-nd6
  • Mtnd1
  • Mtnd4
  • Mtnd5
  • Mtnd6
  • Nd1
  • Nd2
  • Nd3
  • Nd4
  • Nd5
  • Nd6
  • Ndufa10
  • Ndufa11
  • Ndufa12
  • Ndufa13
  • Ndufa2
  • Ndufa3-ps3
  • Ndufa5
  • Ndufa6
  • Ndufa8
  • Ndufa9
  • Ndufab1
  • Ndufaf1
  • Ndufaf2
  • Ndufaf3
  • Ndufaf4
  • Ndufaf5
  • Ndufaf6
  • Ndufaf7
  • Ndufb10
  • Ndufb11
  • Ndufb2
  • Ndufb3
  • Ndufb4l5
  • Ndufb5
  • Ndufb6
  • Ndufb7
  • Ndufb8
  • Ndufc1
  • Ndufs1
  • Ndufs2
  • Ndufs3
  • Ndufs4
  • Ndufs5
  • Ndufs5-ps2
  • Ndufs6
  • Ndufs7
  • Ndufs8
  • Ndufv1
  • Ndufv2
  • Ndufv3
  • Nubpl
  • Timmdc1
  • Tmem126b
  • Tmem186
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nuclear events mediated by NFE2L2
  • Cbp
  • Crebbp
  • Ep300
  • Nfe2l2
  • Nrf2
Rattus norvegicus (Norway rat)
MET activates RAP1 and RAC1
  • Ash
  • Crk
  • Crkl
  • Crko
  • Dock7
  • Gab1
  • Grb2
  • Hgf
  • Krev1
  • Met
  • Rac
  • Rac1
  • Rap1a
  • Rap1b
  • Rapgef1
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024