GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 601 - 625 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
Vasopressin-like receptors
  • Avp
  • Avpr1a
  • Avpr2
  • Ot
  • Otr
  • Oxt
  • Oxtr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transport of organic anions
  • Avp
  • Bsat1
  • Matr1
  • Mct8
  • Oatp1a4
  • Oatp1b2
  • Oatp1c1
  • Oatp2
  • Oatp2b1
  • Oatp3a1
  • Oatp4a1
  • Oatp4c1
  • Oatpd
  • Oatpe
  • Oatpf
  • Pgt2
  • SLC16A2
  • Slc21a10
  • Slc21a11
  • Slc21a12
  • Slc21a14
  • Slc21a2
  • Slc21a20
  • Slc21a5
  • Slc21a9
  • Slco1a4
  • Slco1b2
  • Slco1c1
  • Slco2a1
  • Slco2b1
  • Slco3a1
  • Slco4a1
  • Slco4c1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Arachidonic acid metabolism
  • Awat1
  • Cpla2
  • Faah
  • Faah1
  • Pla2g4
  • Pla2g4a
Rattus norvegicus (Norway rat)
The retinoid cycle in cones (daylight vision)
  • Awat2
  • Bcp
  • Gcp
  • Opn1mw
  • Opn1sw
  • Rbp3
  • Rlbp1
Rattus norvegicus (Norway rat)
TCF dependent signaling in response to WNT
  • Axin
  • Axin1
  • Axin2
  • Catnb
  • Ctnnb1
  • LOC100360645
  • Rnf146
  • Rps27a
  • Ryk
  • Tnks
  • Tnks2
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Usp34
  • Wnt-5a
  • Wnt1
  • Wnt3
  • Wnt3a
  • Wnt5a
Rattus norvegicus (Norway rat)
Degradation of AXIN
  • Axin
  • Axin1
  • Axin2
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rnf146
  • Rps27a
  • Smurf2
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Tnks
  • Tnks2
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Acyl chain remodelling of PC
  • Aytl1
  • Aytl1a
  • Aytl2
  • Cpla2
  • Grcc3f
  • H-rev107
  • Hrasls3
  • Hrev107
  • Lpcat1
  • Lpcat2
  • Lpcat2a
  • Lpcat3
  • Lpcat4
  • Mboat2
  • Mboat5
  • Oact2
  • Oact5
  • Phlpb
  • Pla2g10
  • Pla2g12a
  • Pla2g16
  • Pla2g1b
  • Pla2g2a
  • Pla2g2d
  • Pla2g2f
  • Pla2g3
  • Pla2g4
  • Pla2g4a
  • Pla2g4b
  • Pla2g4c
  • Pla2g4d
  • Pla2g4e
  • Pla2g4f
  • Pla2g5
  • Pla2g6
  • Pla2r1
  • Plaat3
  • Plb1
  • Plbd1
  • Pnpla8
  • Pnpla9
  • Rlp-3
  • Tmem86b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of ornithine decarboxylase (ODC)
  • Azin1
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Nmor1
  • Nqo1
  • Oaz
  • Oaz1
  • Oaz2
  • Oaz3
  • Oazi
  • Oazin
  • Odc
  • Odc1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
Rattus norvegicus (Norway rat)
Na+/Cl- dependent neurotransmitter transporters
  • B0at1
  • B0at3
  • Cgat
  • Gabt1
  • Gabt2
  • Gabt3
  • Gat-1
  • Gat-2
  • Gat-3
  • Gat-b
  • Gat1
  • Glyt2
  • Ntt73
  • Oct1
  • Oct2
  • Prot
  • Sit1
  • Slc18a1
  • Slc18a2
  • Slc22a1
  • Slc22a2
  • Slc6a1
  • Slc6a11
  • Slc6a12
  • Slc6a13
  • Slc6a14
  • Slc6a15
  • Slc6a18
  • Slc6a19
  • Slc6a2
  • Slc6a20
  • Slc6a3
  • Slc6a5
  • Slc6a6
  • Slc6a7
  • Slc6a9
  • Svat
  • Vmat1
  • Vmat2
  • Xtrp2
  • Xtrp3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Lewis blood group biosynthesis
  • B3galt1
  • B3galt2
  • B3galt4
  • B3galt5
  • B4galnt2
  • Ftb
  • Fut10
  • Fut11
  • Fut2
  • Fut4
  • Fut7
  • Fut9
  • Rfuc-t
  • Sec1
  • Siat10
  • Siat4c
  • Siat6
  • St3gal3
  • St3gal4
  • St3gal6
  • St6galnac6
Rattus norvegicus (Norway rat)
N-Glycan antennae elongation
  • B4galt2
  • B4galt3
  • B4galt4
  • B4galt5
  • B4galt6
  • Mgat4a
  • Mgat4b
  • Mgat4c
  • Mgat5
  • Siat1
  • Siat4c
  • Siat8b
  • St3gal4
  • St6gal1
  • St8sia2
  • St8sia3
  • Stx
Rattus norvegicus (Norway rat)
BH3-only proteins associate with and inactivate anti-apoptotic BCL-2 members
  • Bad
  • Bcl2l1
  • Bcl2l11
  • Bclx
  • Bid
  • Bim
  • Blc2l
  • Bod
  • Noxa
  • Pmaip1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Activation of BAD and translocation to mitochondria
  • Bad
  • Cna2
  • Cnb
  • Msfs1
  • Ppp3cc
  • Ppp3r1
  • Sfn
  • Ywhab
  • Ywhae
  • Ywhag
  • Ywhah
  • Ywhaq
  • Ywhaz
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nuclear Envelope Breakdown
  • Baf
  • Banf1
  • Emd
  • L2bp1
  • Rbm39
  • Vrk1
  • Vrk2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Formation of the beta-catenin:TCF transactivating complex
  • Baf190a
  • Bcl9
  • Bcl9l
  • Brg1
  • Catnb
  • Cbp
  • Cdc73
  • Crebbp
  • Ctnnb1
  • Ep300
  • Esp2
  • Esp3
  • Grg4
  • Hdac1
  • Hrpt2
  • Htatip
  • Kat5
  • Lef1
  • Leo1
  • Pygo1
  • Pygo2
  • Ruvbl1
  • Smarca4
  • Snf2b
  • Snf2l4
  • Tcf7
  • Tcf7l1
  • Tcf7l2
  • Tert
  • Tip49
  • Tip49a
  • Tip60
  • Tip60b
  • Tle1
  • Tle2
  • Tle3
  • Tle4
  • Trrap
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interleukin-7 signaling
  • Baf190a
  • Brg1
  • Brwd1
  • H3c13
  • Hist2h3c2
  • Il7
  • Il7r
  • Irs-1
  • Irs1
  • Irs2
  • Jak1
  • Jak3
  • Mgf
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Smarca4
  • Snf2b
  • Snf2l4
  • Stat3
  • Stat5a
  • Stat5b
  • Tslp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Chromatin modifying enzymes
  • Baf190a
  • Brg1
  • Brwd1
  • H3c13
  • Hist2h3c2
  • Pad1
  • Pad2
  • Pad3
  • Pad4
  • Padi1
  • Padi2
  • Padi3
  • Padi4
  • Padi6
  • Pdi
  • Pdi1
  • Pdi2
  • Pdi3
  • Pdi4
  • Smarca4
  • Snf2b
  • Snf2l4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Downregulation of TGF-beta receptor signaling
  • Bambi
  • LOC100360645
  • Madh2
  • Madh3
  • Madh7
  • Mtmr4
  • Pmepa1
  • Rps27a
  • Smad2
  • Smad3
  • Smad7
  • Smurf2
  • Strap
  • Tgfb1
  • Tgfbr1
  • Tgfbr2
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Unrip
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of bile acids and bile salts
  • Bar
  • Ch25h
  • Cyp7
  • Cyp7a1
  • Cyp7b1
  • Fxr
  • Ncoa1
  • Ncoa2
  • Nr1h4
  • Nr2b1
  • Orp1
  • Osbp
  • Osbpl1a
  • Osbpl2
  • Osbpl3
  • Osbpl6
  • Osbpl7
  • Osbpl9
  • Rip14
  • Rxra
  • Tif2
Rattus norvegicus (Norway rat)
SUMOylation of transcription cofactors
  • Bars
  • Cap1
  • Casp8ap2
  • Cbx2
  • Cbx4
  • Cbx8
  • Ctbp1
  • Ctbp3
  • Daxx
  • Ddx17
  • Ddx5
  • Ep300
  • Mbd1
  • Miz1
  • Mkl1
  • Mrtfa
  • Ncoa1
  • Npm1
  • Nrip1
  • Park7
  • Phc1
  • Phc2
  • Phc3
  • Pias1
  • Pias2
  • Pias3
  • Pias4
  • Piasx
  • Ring1
  • Ring1b
  • Rnf1
  • Rnf2
  • Safb
  • Safb1
  • Scml2
  • Sin3a
  • Smt3a
  • Smt3h2
  • Sumo1
  • Sumo2
  • Sumo3
  • Topors
  • Ubce9
  • Ube2i
  • Uhrf2
  • Zfp131
Rattus norvegicus (Norway rat)
Repression of WNT target genes
  • Bars
  • Ctbp1
  • Ctbp2
  • Ctbp3
  • Esp2
  • Esp3
  • Grg4
  • Lef1
  • Tcf7
  • Tcf7l1
  • Tcf7l2
  • Tle1
  • Tle2
  • Tle3
  • Tle4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Downregulation of ERBB2 signaling
  • Batk
  • Btc
  • Cdc37
  • Ctk
  • Cul5
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Erbb2
  • Erbb3
  • Ereg
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • LOC100360645
  • Matk
  • Ndf
  • Neu
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Nrg3
  • Ntak
  • Ptpn12
  • Ptpn18
  • Rps27a
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Vacm1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Chondroitin sulfate biosynthesis
  • Bcan
  • Behab
  • Bgn
  • Caleb
  • Chpf
  • Chpf2
  • Chst11
  • Chst12
  • Chst13
  • Chst15
  • Chst3
  • Chst7
  • Chst9
  • Chsy1
  • Chsy3
  • Csgalnact1
  • Csgalnact2
  • Cspg2
  • Cspg3
  • Cspg4
  • Cspg5
  • Dcn
  • Galnac4s6st
  • Ncan
  • Ng2
  • Ngc
  • Vcan
Rattus norvegicus (Norway rat)
Dermatan sulfate biosynthesis
  • Bcan
  • Behab
  • Bgn
  • Caleb
  • Chst14
  • Cspg2
  • Cspg3
  • Cspg4
  • Cspg5
  • Dcn
  • Dse
  • Dsel
  • Ncan
  • Ng2
  • Ngc
  • Ust
  • Vcan
Rattus norvegicus (Norway rat)
Apoptotic execution phase
  • Bcap31
  • Casp8
  • Dlp1
  • Dnm1l
  • Drp1
  • Mst3
  • Stk24
  • Stk3
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024