GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 626 - 650 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Alpha-defensins
  • Art1
  • Cd4
  • Defa
  • Defa-rs1
  • Defa10
  • Defa11
  • Defa24
  • Defa6
  • Defa8
  • Defa9
  • Defal1
  • Defcr4
  • ENSRNOG00000064390
  • LOC100365995
  • LOC102554637
  • LOC683849
  • Np4
  • Prss1
  • Prss2
  • Prss2l1
  • Prss3
  • Rd5
  • Trp1
  • Try1
  • Try10
  • Try2
  • Try4
  • Try5
  • Tryp1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Choline catabolism
  • Ald7a1
  • Aldh7a1
  • Bhmt
  • Cd92
  • Cdw92
  • Chdh
  • Ctl1
  • Dmgdh
  • Sardh
  • Slc44a1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Caspase-mediated cleavage of cytoskeletal proteins
  • Add1
  • Argbp2
  • Casp3
  • Casp6
  • Casp7
  • Casp8
  • Cpp32
  • Gas2
  • Gsn
  • Mapt
  • Mch2
  • Mtapt
  • Plec
  • Plec1
  • Sorbs2
  • Spna2
  • Spta2
  • Sptan1
  • Tau
  • Vim
Rattus norvegicus (Norway rat)
Miscellaneous transport and binding events
  • Add1
  • Add2
  • Add3
  • Ank
  • Ankh
  • Azgp1
  • Ctns
  • Dmtn
  • Iag2
  • Lrrc5
  • Lrrc8
  • Lrrc8a
  • Lrrc8b
  • Lrrc8c
  • Lrrc8d
  • Lrrc8e
  • Magt1
  • Mrs2
  • Mrs2l
  • Nipa1
  • Nipa2
  • Nipal1
  • Nipal2
  • Nipal3
  • Nipal4
  • Pip
  • Pqlc2
  • Rpt
  • Slc66a1
  • Tusc3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of cytoskeletal remodeling and cell spreading by IPP complex components
  • Actn1
  • Actp
  • Arhgef6
  • Lims1
  • Parva
  • Parvb
  • Pxn
  • Rsu1
  • Tesk1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Termination of O-glycan biosynthesis
  • AC096792.1
  • Muc1
  • Muc13
  • Muc15
  • Muc19
  • Muc2
  • Muc20
  • Muc4
  • Muc5ac
  • Muc5b
  • Muc6
  • Siat1
  • Siat4b
  • Siat4c
  • Siat5
  • Siat6
  • Siat7c
  • Smc
  • St3gal1
  • St3gal2
  • St3gal3
  • St3gal4
  • St6gal1
  • St6galnac2
  • St6galnac3
  • St6galnac4
  • siat7B
Rattus norvegicus (Norway rat)
CS/DS degradation
  • Arsb
  • Bcan
  • Behab
  • Bgn
  • Caleb
  • Cspg2
  • Cspg3
  • Cspg4
  • Cspg5
  • Dcn
  • Hexa
  • Hexb
  • Hyal1
  • Hyal3
  • Ids
  • Idua
  • LOC100363795
  • Ncan
  • Ng2
  • Ngc
  • Vcan
Rattus norvegicus (Norway rat)
Adrenaline signalling through Alpha-2 adrenergic receptor
  • Adra2a
  • Adra2b
  • Adra2c
Rattus norvegicus (Norway rat)
NCAM1 interactions
  • Col4a1
  • Col4a2
  • Col4a3
  • Col4a4
  • Col4a5
  • LOC100911572
  • Ncam
  • Ncam1
  • Siat8b
  • St8sia2
  • St8sia4
  • Stx
Rattus norvegicus (Norway rat)
Sialic acid metabolism
  • Cmas
  • Ctsa
  • Glb1
  • Glcne
  • Gne
  • Hdhd4
  • Nanp
  • Nans
  • Neu1
  • Neu2
  • Neu3
  • Neu4
  • Npl
  • Siat1
  • Siat10
  • Siat4b
  • Siat4c
  • Siat5
  • Siat6
  • Siat7c
  • Siat8b
  • Siat8e
  • Siat9
  • Slc35a1
  • St3gal1
  • St3gal2
  • St3gal3
  • St3gal4
  • St3gal5
  • St3gal6
  • St6gal1
  • St6gal2
  • St6galnac1
  • St6galnac2
  • St6galnac3
  • St6galnac4
  • St6galnac5
  • St6galnac6
  • St8sia1
  • St8sia2
  • St8sia3
  • St8sia4
  • St8sia5
  • St8siav
  • Stx
  • siat7B
Rattus norvegicus (Norway rat)
Adrenoceptors
  • Adra1a
  • Adra1b
  • Adra1c
  • Adra1d
  • Adra2a
  • Adra2b
  • Adra2c
  • Adrb1
  • Adrb1r
  • Adrb2
  • Adrb2r
  • Adrb3
  • Adrb3r
Rattus norvegicus (Norway rat)
Cargo concentration in the ER
  • Areg
  • Cd59
  • Cnih1
  • Cnih2
  • Cnih3
  • Col7a1
  • Ctsc
  • Ctsy
  • Ctsz
  • Ergic53
  • Ergl
  • F8
  • Folr1
  • GluA1
  • Glur1
  • Gosr2
  • Gria1
  • Gs27
  • Lman1
  • Lman1l
  • Lman2
  • Mcfd2
  • Mia2
  • Mia3
  • Preb
  • Rnp24
  • Sar1b
  • Sdgf
  • Sdnsf
  • Sec12
  • Sec22b
  • Sec22l1
  • Sec23a
  • Sec24a
  • Sec24b
  • Sec24c
  • Sec24d
  • Serpina1
  • Stx5
  • Stx5a
  • Tgfa
  • Tmed10
  • Tmed2
  • Tmp21
Rattus norvegicus (Norway rat)
COPII-mediated vesicle transport
  • AABR07042915.1
  • Ankrd28
  • Areg
  • Bet1
  • Cd59
  • Cnih1
  • Cnih2
  • Cnih3
  • Col7a1
  • Csnk1d
  • Ctsc
  • Ctsy
  • Ctsz
  • Erg1
  • Ergic53
  • Ergl
  • F8
  • Folr1
  • GluA1
  • Glur1
  • Golga2
  • Gorasp1
  • Gosr2
  • Grasp65
  • Gria1
  • Gs27
  • Hckid
  • LOC100909916
  • Lman1
  • Lman1l
  • Lman2
  • Lztr2
  • Mcfd2
  • Napa
  • Napb
  • Napg
  • Nsf
  • Ppp6c
  • Ppp6r3
  • Ppp6r3-ps1
  • Ppv
  • Preb
  • RGD1564492
  • Ra410
  • Rab1
  • Rab1A
  • Rab1b
  • Rgpr
  • Rnp24
  • Saps3-ps1
  • Sar1b
  • Sbdn
  • Scfd1
  • Sdgf
  • Sdnsf
  • Sec12
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Sec16a
  • Sec16b
  • Sec22a
  • Sec22b
  • Sec22c
  • Sec22l1
  • Sec22l2
  • Sec23a
  • Sec23ip
  • Sec24a
  • Sec24b
  • Sec24c
  • Sec24d
  • Sec31a
  • Sec31l1
  • Serpina1
  • Sly1
  • Snap
  • Snapa
  • Snapb
  • Stx17
  • Stx5
  • Stx5a
  • Stxbp1l2
  • Tfg
  • Tgfa
  • Tmed10
  • Tmed2
  • Tmp21
  • Trappc1
  • Trappc10
  • Trappc2
  • Trappc2l
  • Trappc2ll1
  • Trappc3
  • Trappc4
  • Trappc5
  • Trappc6a
  • Trappc6b
  • Trappc9
  • Uso1
  • Vap1
  • Vdp
  • Ykt6
Rattus norvegicus (Norway rat)
O-linked glycosylation of mucins
  • A4gnt
  • AC096792.1
  • B3gnt2
  • B3gnt3
  • B3gnt4
  • B3gnt5
  • B3gnt6
  • B3gnt7
  • B3gnt8
  • B3gnt9
  • B3gntl1
  • B4galt5
  • B4galt6
  • C1galt1
  • C1galt1c1
  • Chst4
  • Galnt1
  • Galnt10
  • Galnt11
  • Galnt12
  • Galnt13
  • Galnt15
  • Galnt16
  • Galnt17
  • Galnt18
  • Galnt2
  • Galnt5
  • Galnt6
  • Galnt7
  • Galnt9
  • Galntl5
  • Galntl6
  • Gcnt1
  • Gcnt3
  • Gcnt4
  • Gcnt7
  • LOC102550196
  • Muc1
  • Muc13
  • Muc15
  • Muc19
  • Muc2
  • Muc20
  • Muc4
  • Muc5ac
  • Muc5b
  • Muc6
  • Qtgal
  • Smc
  • gcnt
Rattus norvegicus (Norway rat)
N-Glycan antennae elongation
  • B4galt2
  • B4galt3
  • B4galt4
  • B4galt5
  • B4galt6
  • Mgat4a
  • Mgat4b
  • Mgat4c
  • Mgat5
  • Siat1
  • Siat4c
  • Siat8b
  • St3gal4
  • St6gal1
  • St8sia2
  • St8sia3
  • Stx
Rattus norvegicus (Norway rat)
N-glycan trimming and elongation in the cis-Golgi
  • Gnt1
  • Manea
  • Mgat1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Reactions specific to the complex N-glycan synthesis pathway
  • Chst10
  • Fuca
  • Fuca1
  • Fut8
  • Gnt2
  • Man2a1
  • Man2a2
  • Mana2
  • Mgat2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of Prostaglandins (PG) and Thromboxanes (TX)
  • Akr1c1
  • Akr1c21
  • Cbr
  • Cbr1
  • Cox-1
  • Cox-2
  • Cox1
  • Cox2
  • Cyp5
  • Cyp5a1
  • Cyp8
  • Cyp8b1
  • Gsts
  • Hpgds
  • Hsd17b5
  • Pgds
  • Pges
  • Pig12
  • Ptgds
  • Ptgds2
  • Ptges
  • Ptges2
  • Ptges3
  • Ptgis
  • Ptgs1
  • Ptgs2
  • Tbxas1
  • Tebp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Fructose biosynthesis
  • Akr1b1
  • Akr1b4
  • Aldr1
  • Sdh1
  • Sord
Rattus norvegicus (Norway rat)
Formation of xylulose-5-phosphate
  • Akr1a1
  • Alr
  • Cry
  • Cryl1
  • Dcxr
  • Glb
  • Sdh1
  • Sord
  • Xylb
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glutathione conjugation
  • AC097845.1
  • Akr1a1
  • Alr
  • Esd
  • Gst12
  • Gsta1
  • Gsta2
  • Gsta3
  • Gsta5
  • Gsta6
  • Gstk1
  • Gstm1
  • Gstm2
  • Gstm3
  • Gstm4
  • Gstm5
  • Gstm7
  • Gsto1
  • Gsto2
  • Gstp1
  • Gsts
  • Gstt1
  • Gstt2
  • Gstyc1
  • Gstyc2
  • Gstz1
  • Hpgds
  • Mgst1
  • Mgst2
  • Mgst3
  • Mgst3l1
  • Pgds
  • Ptgds2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Metabolism of serotonin
  • Aldh2
  • Maoa
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phase I - Functionalization of compounds
  • Aada
  • Aadac
  • Abp1
  • Ahr
  • Ahrr
  • Aldd
  • Aldh3
  • Aldh3a1
  • Aoc1
  • Aoc3
  • Arnt
  • Arnt2
  • Bphl
  • Cbr3
  • Ces1d
  • Ces2b
  • Ces3
  • Cmbl
  • Cyb5b
  • Cyb5m
  • Cyb5r3
  • Cyp2b21
  • Cyp3a-1
  • Cyp3a-2
  • Cyp3a1
  • Cyp3a11
  • Cyp3a13
  • Cyp3a18
  • Cyp3a2
  • Cyp3a62
  • Cyp3a9
  • Dia1
  • Eph-1
  • Ephx1
  • LOC679149
  • Marc2
  • Mg87
  • Mosc2
  • Mtarc2
  • Nqo2
  • Omb5
Rattus norvegicus (Norway rat)
RND1 GTPase cycle
  • Aldh3a2
  • Aldh4
  • Ankrd26
  • Arhgap35
  • Arhgap5
  • Arms
  • Cav
  • Cav1
  • Ccdc88a
  • Cpd
  • Depdc1b
  • Dlg5
  • Dsp
  • Dst
  • Epha2
  • Epsti1
  • Fam135a
  • Fam83b
  • Flot2
  • Frs2
  • Frs3
  • Grb7
  • Grlf1
  • Hop
  • Kidins220
  • Kif14
  • Muc13
  • P190A
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pkp4
  • Plekhg5
  • Plxna1
  • Ptpn13
  • RGD1310313
  • Rasal2
  • Rbm39
  • Rbmx
  • Rbmxrt
  • Reg1
  • Rnd1
  • Rras2
  • Scg10
  • Scgn10
  • Snt2
  • Soc
  • Stip1
  • Stmn2
  • Tech
  • Tfrc
  • Tmem59
  • Trfr
  • Trp
  • Txnl1
  • Ubxd5
  • Ubxn11
  • Vangl1
  • Vangl2
  • Wdr6
  • p190ARHOGAP
Rattus norvegicus (Norway rat)
RND2 GTPase cycle
  • Aldh3a2
  • Aldh4
  • Ankrd26
  • Arhgap1
  • Arhgap35
  • Arhgap5
  • Arms
  • Bltp3b
  • Cav
  • Cav1
  • Ckap4
  • Depdc1b
  • Dlg5
  • Dsg1
  • Dst
  • Epha2
  • Fam83b
  • Fbp17
  • Fnbp1
  • Frs2
  • Frs3
  • Golga3
  • Grlf1
  • Kidins220
  • Kif14
  • Ktn1
  • Muc13
  • Nisch
  • Nudc
  • P190A
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pkp4
  • Plxnd1
  • Prag1
  • Pragmin
  • Ptpn13
  • Rbm39
  • Rbmx
  • Rbmxrt
  • Rnd2
  • Scrib
  • Snt2
  • Soc
  • Tfrc
  • Tnfaip1
  • Trfr
  • Trp
  • Txnl1
  • Ubxd5
  • Ubxn11
  • Uhrf1bp1l
  • Vangl1
  • Vangl2
  • Wdr6
  • p190ARHOGAP
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024