GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 76 - 100 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit
  • AABR07029195.1
  • AABR07031505.1
  • AABR07060610.1
  • AABR07064810.1
  • AABR07071986.1
  • AABR07072260.1
  • Arbp
  • ENSRNOG00000068086
  • Eif5b
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • If2
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  • LOC100361060
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  • LOC100361933
  • LOC100910714
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  • LOC120103572
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  • RGD1562402
  • RGD1563956
  • RGD1564606
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  • Rp2
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  • Rpl23al1
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  • Rpl27a
  • Rpl27al3
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  • Rpl30
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  • Rpl32
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  • Rpl34-ps1
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  • Rpl36al-ps5
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  • Rpl36l3
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  • Rpl37l4
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  • Rplp2
  • Rps10
  • Rps11
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  • Rps14
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  • Rps15a
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  • Rps3
  • Rps3a
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  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
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  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Uba80
  • Ubbl1
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
  • AABR07029195.1
  • AABR07031505.1
  • AABR07060610.1
  • AABR07064810.1
  • AABR07071986.1
  • AABR07072260.1
  • Arbp
  • ENSRNOG00000068086
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • LOC100360645
  • LOC100361060
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • LOC100910714
  • LOC102550668
  • LOC103692829
  • LOC108348180
  • LOC108351255
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  • LOC120094652
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  • LOC120099964
  • LOC120103572
  • Lamr1
  • RGD1562402
  • RGD1563956
  • RGD1564606
  • Rig
  • Rp2
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  • Rpl10
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  • Rpl23
  • Rpl23al1
  • Rpl24
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  • Rpl30
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  • Rpl32
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  • Rpl34-ps1
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  • Rpl35al8
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  • Rpl36al-ps5
  • Rpl36al1
  • Rpl36l3
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  • Rpl38
  • Rpl39
  • Rpl39l1
  • Rpl3l
  • Rpl4
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  • Rpl5
  • Rpl6
  • Rpl7
  • Rpl7a
  • Rpl8
  • Rpl9
  • Rpl9l2
  • Rplp0
  • Rplp1
  • Rplp2
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
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  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
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  • Rps20
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  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
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  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
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  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Srp14
  • Srp19
  • Srp54
  • Srp68
  • Srp72
  • Srp9
  • Uba80
  • Ubbl1
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
RMTs methylate histone arginines
  • AABR07029195.1
  • Actl6a
  • Actl6b
  • Arid1a
  • Arid1b
  • Baf190a
  • Baf57
  • Baf60b
  • Brg1
  • Carm1
  • Ccnd1
  • Cdk4
  • Coprs
  • Dnmt3a
  • ENSRNOG00000062927
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac25
  • H2ac4
  • H2aj
  • H3c13
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist2h3c2
  • Hist3h2a
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Hrmt1l2
  • Hrmt1l3
  • LOC120097726
  • Mep50
  • Pbrm1
  • Prmt1
  • Prmt3
  • Prmt4
  • Prmt5
  • Prmt7
  • RGD1565675
  • Rbbp7
  • Rps2
  • Smarca2
  • Smarca4
  • Smarcb1
  • Smarcc1
  • Smarcc2
  • Smarcd1
  • Smarcd2
  • Smarcd3
  • Smarce1
  • Snf2b
  • Snf2l4
  • Wdr5
  • Wdr77
Rattus norvegicus (Norway rat)
Protein methylation
  • AABR07029195.1
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Camkmt
  • Clnmt
  • EEF1AKMT1
  • Eef1a
  • Eef1a1
  • Eef1akmt1
  • Eef2
  • Eef2kmt
  • Etfb
  • Etfbkmt
  • Fam86a
  • Hrmt1l3
  • Hsc70
  • Hsc73
  • Hspa8
  • Kin
  • LOC102553119
  • Mettl20
  • Mettl21a
  • Mettl22
  • N6AMT2
  • Prmt3
  • Rps2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ribosomal scanning and start codon recognition
  • AABR07029195.1
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S12
  • EIF3S5
  • EIF3S6IP
  • Eif1a
  • Eif2a
  • Eif2g
  • Eif2s1
  • Eif2s2
  • Eif2s3
  • Eif2s3x
  • Eif3a
  • Eif3b
  • Eif3c
  • Eif3d
  • Eif3e
  • Eif3f
  • Eif3g
  • Eif3h
  • Eif3i
  • Eif3j
  • Eif3k
  • Eif3l
  • Eif3m
  • Eif3s1
  • Eif3s10
  • Eif3s2
  • Eif3s3
  • Eif3s4
  • Eif3s6
  • Eif3s7
  • Eif3s8
  • Eif3s9
  • Eif4a1
  • Eif4a2
  • Eif4e
  • Eif4g1
  • Eif4h
  • Eif5
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • Int6
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • Lamr1
  • Rig
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
  • Rps13
  • Rps14
  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
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  • Rps19
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  • Rps20
  • Rps21
  • Rps23
  • Rps24
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  • Rps26
  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
  • Rps26l6
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
  • Rps29
  • Rps3
  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Uba80
  • Ubcep1
  • Wbscr1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Translation initiation complex formation
  • AABR07029195.1
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S12
  • EIF3S5
  • EIF3S6IP
  • Eif1a
  • Eif2a
  • Eif2g
  • Eif2s1
  • Eif2s2
  • Eif2s3
  • Eif2s3x
  • Eif3a
  • Eif3b
  • Eif3c
  • Eif3d
  • Eif3e
  • Eif3f
  • Eif3g
  • Eif3h
  • Eif3i
  • Eif3j
  • Eif3k
  • Eif3l
  • Eif3m
  • Eif3s1
  • Eif3s10
  • Eif3s2
  • Eif3s3
  • Eif3s4
  • Eif3s6
  • Eif3s7
  • Eif3s8
  • Eif3s9
  • Eif4a1
  • Eif4a2
  • Eif4e
  • Eif4g1
  • Eif4h
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • Int6
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • Lamr1
  • Pabp1
  • Pabpc1
  • Rig
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
  • Rps13
  • Rps14
  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
  • Rps17
  • Rps18
  • Rps19
  • Rps2
  • Rps20
  • Rps21
  • Rps23
  • Rps24
  • Rps25
  • Rps26
  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
  • Rps26l6
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
  • Rps29
  • Rps3
  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
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  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Uba80
  • Ubcep1
  • Wbscr1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex
  • AABR07029195.1
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S12
  • EIF3S5
  • EIF3S6IP
  • Eif1a
  • Eif2a
  • Eif2g
  • Eif2s1
  • Eif2s2
  • Eif2s3
  • Eif2s3x
  • Eif3a
  • Eif3b
  • Eif3c
  • Eif3d
  • Eif3e
  • Eif3f
  • Eif3g
  • Eif3h
  • Eif3i
  • Eif3j
  • Eif3k
  • Eif3l
  • Eif3m
  • Eif3s1
  • Eif3s10
  • Eif3s2
  • Eif3s3
  • Eif3s4
  • Eif3s6
  • Eif3s7
  • Eif3s8
  • Eif3s9
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • Int6
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • Lamr1
  • Rig
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
  • Rps13
  • Rps14
  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
  • Rps17
  • Rps18
  • Rps19
  • Rps2
  • Rps20
  • Rps21
  • Rps23
  • Rps24
  • Rps25
  • Rps26
  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
  • Rps26l6
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
  • Rps29
  • Rps3
  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Uba80
  • Ubcep1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Amino acids regulate mTORC1
  • AABR07029605.1
  • Aif1
  • Atp6b2
  • Atp6c
  • Atp6l
  • Atp6s14
  • Atp6v0b
  • Atp6v0c
  • Atp6v0d1
  • Atp6v0d2
  • Atp6v0e
  • Atp6v0e1
  • Atp6v0e2
  • Atp6v1a
  • Atp6v1b1
  • Atp6v1b2
  • Atp6v1c1
  • Atp6v1c2
  • Atp6v1d
  • Atp6v1e1
  • Atp6v1e2
  • Atp6v1f
  • Atp6v1g1
  • Atp6v1g2
  • Atp6v1g3
  • Atp6v1h
  • Atpl
  • BMT2
  • Bat1a
  • Bhd
  • Bmt2
  • Castor1
  • Castor2
  • Cdk2ap1-ps2
  • Cdk2ap1-ps3
  • Cdk2ap1-ps4
  • Cdk2ap1-ps5
  • Cdk2ap1-ps6
  • Depdc5
  • Dsr1
  • E230034O05Rik
  • ENSRNOG00000066475
  • Flcn
  • Fnip1
  • Fnip2
  • Frap1
  • Gatsl3
  • Gbl
  • Itfg2
  • Kics2
  • LOC224733l-3
  • LOC224733l-4
  • LOC224733l-5
  • LOC224733l-6
  • LOC224733l-7
  • LOC224733l-8
  • LOC500034
  • Lamtor1
  • Lamtor3
  • Lamtor4
  • Lamtor5
  • Lst1
  • Lst8
  • Map2k1ip1
  • Mios
  • Mlst8
  • Mtor
  • Nprl2
  • Nprl3
  • RGD1565498
  • RT1-CE12
  • RT1-CE3
  • RT1-CE5
  • RT1-CE6
  • RT1-CE8
  • RT1-CE9
  • Raft1
  • Rheb
  • Rptor
  • RragB
  • Rraga
  • Rragc
  • Rragc_predicted
  • Rragd
  • SAMTOR
  • Sacm2l-ps3
  • Sacm2l-ps4
  • Sacm2l-ps5
  • Sacm2l-ps6
  • Sacm2l-ps7
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Sesn1
  • Sesn2
  • Sh3bp4
  • Slc38a9
  • Szt2
  • Tcirg1
  • Tnf
  • Vat2
  • Vatf
  • Wdr24
  • Wdr59
Rattus norvegicus (Norway rat)
KEAP1-NFE2L2 pathway
  • AABR07034438.1
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Cul3
  • Inrf2
  • Keap1
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Map1alc3
  • Map1lc3
  • Map1lc3b
  • Mecl1
  • Mss1
  • Mul1
  • Nfe2l2
  • Npl4
  • Nploc4
  • Nrf2
  • Pkcl
  • Prkci
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Rbx1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sesn1
  • Sesn2
  • Sqstm1
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Trim21
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ufd1
  • Ufd1l
  • Vcp
  • Zip
Rattus norvegicus (Norway rat)
Scavenging of heme from plasma
  • AABR07034730.2
  • AABR07058479.1
  • AABR07060971.1
  • AABR07061001.1
  • AABR07065782.1
  • AABR07065808.1
  • AABR07065812.2
  • AABR07065813.1
  • Alb
  • Ambp
  • Apoa1
  • Apol11a
  • Apol2
  • Apol7a
  • Apol7b
  • Apol9a
  • Cd163
  • ENSRNOG00000062324
  • ENSRNOG00000062682
  • ENSRNOG00000062762
  • ENSRNOG00000062853
  • ENSRNOG00000062915
  • ENSRNOG00000062976
  • ENSRNOG00000063148
  • ENSRNOG00000063329
  • ENSRNOG00000063340
  • ENSRNOG00000063341
  • ENSRNOG00000063422
  • ENSRNOG00000063550
  • ENSRNOG00000063572
  • ENSRNOG00000063707
  • ENSRNOG00000063791
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Rattus norvegicus (Norway rat)
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Rattus norvegicus (Norway rat)
Role of LAT2/NTAL/LAB on calcium mobilization
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Rattus norvegicus (Norway rat)
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  • Igkv2-112l1
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  • Igll1
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  • Ikbkg
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  • LOC100365500
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  • LOC102551948
  • LOC690813
  • Lyn
  • Malt1
  • Map3k7
  • Map3k7ip2
  • Nemo
  • Pkcq
  • Prkcq
  • RGD1561722
  • RGD1564696
  • Tab1
  • Tab2
  • Tab3
  • Traf6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of Complement cascade
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  • AABR07060971.1
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  • Cpn2
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  • F2
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  • LOC100365500
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  • Mcp
  • RGD1561722
  • RGD1564696
  • Serping1
  • Tapa1
  • r-gsp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Initial triggering of complement
  • AABR07034730.2
  • AABR07060971.1
  • AABR07061001.1
  • AABR07065782.1
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  • C1qa
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  • Crarf
  • ENSRNOG00000062324
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Rattus norvegicus (Norway rat)
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  • Syk
Rattus norvegicus (Norway rat)
Fc epsilon receptor (FCERI) signaling
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  • RGD1561722
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  • Syk
Rattus norvegicus (Norway rat)
SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription
  • AABR07035338.1
  • Ccnc
  • Ccnk
  • Ccnt1
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  • Cdk8
  • Cdk9
  • E2f4
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  • Erk1
  • Erk2
  • Fur
  • Furin
  • LOC100360645
  • MGC112830
  • Madh2
  • Madh3
  • Madh4
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  • Mapk
  • Mapk1
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  • Pcsk3
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  • Prkm3
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  • Rnf111
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  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
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  • Wwtr1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glycogen breakdown (glycogenolysis)
  • AABR07037995.1
  • Agl
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Gaa
  • Gyg
  • Gyg1
  • Lgp
  • Pgm1
  • Phka1
  • Phka2
  • Phkb
  • Phkg
  • Phkg1
  • Phkg2
  • Pygl
  • Pygm
Rattus norvegicus (Norway rat)

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Last updated: August 19, 2024